Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5940
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5940, 540 aa
1>>>pF1KB5940 540 - 540 aa - 540 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1543+/-0.000934; mu= 14.2451+/- 0.056
mean_var=86.9243+/-17.710, 0's: 0 Z-trim(106.5): 96 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.137564
statistics sampled from 8914 (9020) to 8914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 ( 540) 3671 738.9 3.6e-213
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 536) 1952 397.7 1.8e-110
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 594) 1952 397.7 1.9e-110
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 532) 1708 349.3 6.6e-96
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 555) 1708 349.3 6.9e-96
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 447) 1197 247.8 1.9e-65
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 548) 1133 235.2 1.5e-61
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10 ( 666) 585 126.5 9.9e-29
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 ( 644) 533 116.1 1.2e-25
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 (1250) 533 116.3 2.2e-25
>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 (540 aa)
initn: 3671 init1: 3671 opt: 3671 Z-score: 3940.6 bits: 738.9 E(32554): 3.6e-213
Smith-Waterman score: 3671; 99.8% identity (100.0% similar) in 540 aa overlap (1-540:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
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CCDS22 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSR
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPFTSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PTNYGFCFKPNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PTNYGFCFKPNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 HGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 HGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
490 500 510 520 530 540
>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (536 aa)
initn: 1749 init1: 610 opt: 1952 Z-score: 2096.9 bits: 397.7 E(32554): 1.8e-110
Smith-Waterman score: 1952; 54.7% identity (78.5% similar) in 543 aa overlap (1-540:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
:..::.. :: : . : . .: :... . : . : . . ..
CCDS43 MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 AADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDET
:. : ...: . . .:.::::::::: ::. .: ... :: .::.::: :
CCDS43 AVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWG
:..... .:.::::.::::. :.: .::.:::: :: ::.:.:: .::::::..: :.
CCDS43 SKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIH
. :.:. ::::::::::::::: ::::.::.. ..:: : ::.:: ::.::. :::.
CCDS43 MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKH
::::.:: :::::::.: ::::::: :::::::::::::..... .:.:. .::.:..
CCDS43 GFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGR
.:::..:.:.::::. . ..:..::::.::.::::.::.::::::: ::::: : : :
CCDS43 NAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-R
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTH
.. : .:.::.::::::::::::: .::::::.:: :.:.::: ::::.. :..
CCDS43 KALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNIL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVL
:: . :. ... :::.: ::: .:::.:..:.: :::::::.::.::::::::.:::
CCDS43 GSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCAR
.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.:.:.::::::.:::::::::::::::.: :
CCDS43 TLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIR
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 IAL
.::
CCDS43 VAL
>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (594 aa)
initn: 1749 init1: 610 opt: 1952 Z-score: 2096.2 bits: 397.7 E(32554): 1.9e-110
Smith-Waterman score: 1952; 54.7% identity (78.5% similar) in 543 aa overlap (1-540:59-594)
10 20 30
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
:..::.. :: : . : . .
CCDS43 DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB5 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
: :... . : . : . . .. :. : ...: . . .:.:::::::::
CCDS43 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 PITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
::. .: ... :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS43 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
::: :: ::.:.:: .::::::..: :. . :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS43 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
:.. ..:: : ::.:: ::.::. :::.::::.:: :::::::.: ::::::: :::
CCDS43 VTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTK
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
::::::::::..... .:.:. .::.:...:::..:.:.::::. . ..:..::::.:
CCDS43 GTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
:.::::.::.::::::: ::::: : : :.. : .:.::.::::::::::::: .:
CCDS43 QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-RKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
:::::.:: :.:.::: ::::.. :.. :: . :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS43 VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
:..:.: :::::::.::.::::::::.:::.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.
CCDS43 ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540
pF1KB5 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
:.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS43 TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
570 580 590
>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (532 aa)
initn: 1035 init1: 535 opt: 1708 Z-score: 1835.3 bits: 349.3 E(32554): 6.6e-96
Smith-Waterman score: 1708; 49.6% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (28-540:22-532)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDGTRG
:. : : .: : :. : .: :
CCDS11 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVIKVY
..:. .: ::::::::::: : : .:.. :.:. :: .:.:::
CCDS11 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
::: . :...: . ::: ::..:. . : ..:..: : : ::...:: .:::: :.::
CCDS11 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
. : . .... ::::.::::.::. : .:::.::: ... :: ...: ::...
CCDS11 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
..:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..::
CCDS11 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
:.: .: ::..::: :::: .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS11 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
. . . : . :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. :::::
CCDS11 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
::. : .: .: . ::::.: ::: .:::.:.:::: :::::::.::::.:: :
CCDS11 HRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 PKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKL
:. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::: :
CCDS11 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB5 KHYCARIAL
.: :.:.::
CCDS11 RHCCTRVAL
530
>>CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (555 aa)
initn: 1035 init1: 535 opt: 1708 Z-score: 1835.0 bits: 349.3 E(32554): 6.9e-96
Smith-Waterman score: 1708; 49.6% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (28-540:45-555)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDG
:. : : .: : :. : .:
CCDS56 VKPLSCSDAMELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TRGCAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVI
: ..:. .: ::::::::::: : : .:.. :.:. :: .:.
CCDS56 GRKLREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVV
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELV
:::::: . :...: . ::: ::..:. . : ..:..: : : ::...:: .:::: :
CCDS56 KVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB5 IEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFL
.:: . : . .... ::::.::::.::. : .:::.::: ... :: ...: ::
CCDS56 VEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 SSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIY
.....:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..:
CCDS56 NAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQ
: :.: .: ::..::: :::: .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.
CCDS56 VVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRK
::.. . . : . :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. ::::
CCDS56 NYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDS
: ::. : .: .: . ::::.: ::: .:::.:.:::: :::::::.::::.:
CCDS56 KTNHRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRES
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 QSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLP
: ::. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::
CCDS56 QRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILP
490 500 510 520 530 540
530 540
pF1KB5 CKLKHYCARIAL
: :.: :.:.::
CCDS56 CLLRHCCTRVAL
550
>>CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (447 aa)
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10 20 30 40 50
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:. : : .: : :. : .: :
CCDS82 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVIKVY
..:. .: ::::::::::: : : .:.. :.:. :: .:.:::
CCDS82 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
::: . :...: . ::: ::..:. . : ..:..: : : ::...:: .:::: :.::
CCDS82 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
. : . .... ::::.::::.::. : .:::.::: ... :: ...: ::...
CCDS82 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
..:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..::
CCDS82 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
:.: .: ::..::: :::: .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS82 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
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pF1KB5 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
. . . : . :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. :::::
CCDS82 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
::. ...: :.:
CCDS82 HRLSLPMPASGTSLSAACSWSGRVSGTPRALSSLCATCRK
410 420 430 440
>>CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (548 aa)
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10 20 30
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
:..::.. :: : . : . .
CCDS47 DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB5 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
: :... . : . : . . .. :. : ...: . . .:.:::::::::
CCDS47 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 PITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
::. .: ... :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS47 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
::: :: ::.:.:: .::::::..: :. . :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS47 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
:.. ..:: : ::.::
CCDS47 VTWCQQSNG--SQTQLLQ------------------------------------------
270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
::::::..... .:.:. .::.:...:::..:.:.::::. . ..:..::::.:
CCDS47 ----EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
:.::::.::.::::::: ::::: : : :.. : .:.::.::::::::::::: .:
CCDS47 QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-RKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
:::::.:: :.:.::: ::::.. :.. :: . :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS47 VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
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450 460 470 480 490 500
pF1KB5 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
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CCDS47 ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
:.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS47 TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
520 530 540
>>CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10 (666 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KB5 APAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFP---ELCCSPITSVLSA
::.: : :.:. : . .. :
CCDS31 AASLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADPVLDLPLPPPPPEPLSQEEEEAQAKADKIKLA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 DLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLP
: . :: :.::. .:.....: : :::: . :. :.: . .: :.: :
CCDS31 LEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYP
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 HIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM-VSFATET
.. .:: .:::: :.::::.: . :::. : .. :: ::::. :. .. . . ::
CCDS31 ELQIERFFEDHENVVEVLSDWTRDTENKILFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNRGKKESKET
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 NGEISP----TQILQMFLSSSTY-PEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGT
: ... . . . : ..: ::..: :. ::.::::::. ::.:: ::.:. ::
CCDS31 NEKMNAKNKESLLEESFCGTSIIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGK
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320
pF1KB5 SKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFK-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQS
.: : : : .: : .:: . : :. :::.: : .: :. . .:.:: .. ..
CCDS31 TKTSRDLACFIQFENVNIYYGTQHKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDTRT
350 360 370 380 390 400
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pF1KB5 RTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVI
. :: .::. ::: ::.::.. ...: .:.
CCDS31 LNQWVMGIRIAKYGKTLYDNYQRAV-AKAGLASRWTNLGTVNAAAPAQPSTGPKTGTTQP
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pF1KB5 ENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEA
CCDS31 NGQIPQATHSVSAVLQEAQRHAETSKDKKPALGNHHDPAVPRAPHAPKSSLPPPPPVRRS
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pF1KB5 DVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITA
: . :: ::.:. :..:... : :.
CCDS23 IAGKPSHLLTKEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTV
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pF1KB5 RDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKN
:.: . :. :.: . .:.: : . .. .:: .:::: ..: : :: . .::: : .
CCDS23 RQVLDNLMDKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMER
350 360 370 380 390 400
200 210 220 230 240
pF1KB5 YAKYEFFKNPM-YFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS-TYPEIHGFLHAKEQGK
:: .::::. :.. .. .. .. : :. . . : .:: : :::.: : :..::
CCDS23 IEKYALFKNPQNYLLGKKETAEMADRNKEV---LLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGK
410 420 430 440 450 460
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pF1KB5 KSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCF
::::: ::.:: ::.:. :: .: : : : .. . ..: . ..:. :::.: . .
CCDS23 KSWKKRYFLLRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVL
470 480 490 500 510 520
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 K-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC---SSQS
: :. . .:.:: .. .. ::..::. ::: :::.::.. . . .: :
CCDS23 KHPQIQKKSQYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLS
530 540 550 560 570 580
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pF1KB5 ISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASS
: ..: : .: . . :.....
CCDS23 SSSIKSGSSSSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEES
590 600 610 620 630 640
>>CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 (1250 aa)
initn: 224 init1: 224 opt: 533 Z-score: 569.3 bits: 116.3 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 533; 34.5% identity (63.8% similar) in 293 aa overlap (101-387:264-553)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 DVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITA
: . :: ::.:. :..:... : :.
CCDS23 DLTHQGQPITEEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTV
240 250 260 270 280 290
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:.: . :. :.: . .:.: : . .. .:: .:::: ..: : :: . .::: : .
CCDS23 RQVLDNLMDKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMER
300 310 320 330 340 350
200 210 220 230 240
pF1KB5 YAKYEFFKNPM-YFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS-TYPEIHGFLHAKEQGK
:: .::::. :.. .. .. .. : :. . . : .:: : :::.: : :..::
CCDS23 IEKYALFKNPQNYLLGKKETAEMADRNKEV---LLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGK
360 370 380 390 400 410
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCF
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CCDS23 KSWKKRYFLLRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVL
420 430 440 450 460 470
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 K-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC---SSQS
: :. . .:.:: .. .. ::..::. ::: :::.::.. . . .: :
CCDS23 KHPQIQKKSQYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLS
480 490 500 510 520 530
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pF1KB5 ISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASS
: ..: : .: . . :.....
CCDS23 SSSIKSGSSSSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEES
540 550 560 570 580 590
540 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]