Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5920
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5920, 532 aa
1>>>pF1KB5920 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4621+/-0.000929; mu= 0.2056+/- 0.056
mean_var=223.7605+/-45.737, 0's: 0 Z-trim(113.8): 42 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.085740
statistics sampled from 14326 (14363) to 14326 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 532) 3668 466.5 3.5e-131
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 555) 3668 466.5 3.6e-131
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 447) 2929 375.0 1e-103
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 536) 1755 229.8 6e-60
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 594) 1755 229.9 6.5e-60
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 ( 540) 1708 224.0 3.4e-58
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 548) 1134 153.0 8.1e-37
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10 ( 666) 490 73.4 9.1e-13
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 ( 644) 484 72.7 1.5e-12
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 (1250) 484 72.9 2.5e-12
>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (532 aa)
initn: 3668 init1: 3668 opt: 3668 Z-score: 2468.6 bits: 466.5 E(32554): 3.5e-131
Smith-Waterman score: 3668; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 LILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
490 500 510 520 530
>>CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (555 aa)
initn: 3668 init1: 3668 opt: 3668 Z-score: 2468.4 bits: 466.5 E(32554): 3.6e-131
Smith-Waterman score: 3668; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:24-555)
10 20 30
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MGKWRPGQGHTTGSVKPLSCSDAMELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 EVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 DLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVAD
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 VNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 YGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 EAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLV
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRG
490 500 510 520 530 540
520 530
pF1KB5 ILPCLLRHCCTRVAL
:::::::::::::::
CCDS56 ILPCLLRHCCTRVAL
550
>>CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (447 aa)
initn: 2924 init1: 2924 opt: 2929 Z-score: 1975.7 bits: 375.0 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 2929; 97.9% identity (98.2% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
:::: : ::.:
CCDS82 LSAACS----W-SGRVSGTPRALSSLCATCRK
430 440
>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (536 aa)
initn: 1804 init1: 587 opt: 1755 Z-score: 1189.7 bits: 229.8 E(32554): 6e-60
Smith-Waterman score: 1908; 54.1% identity (80.2% similar) in 536 aa overlap (1-532:14-536)
10 20 30 40
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLI
:. : : ... : . :: . .: .: ..:.::::. :
CCDS43 MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPR-QRVQRSQPVHI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 PTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVK
.. :.:.::.. :..:::.:::::::::.: : :.: :.: : : .:. . ::
CCDS43 LAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PGS---LPPSQAAAKQDVK
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVV
:.::::. . ::. : ::: .:..:: ..: ..:..: ::: ::::.::: ::::: ::
CCDS43 VFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLN
.:... ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : ... : :. .:.:::::
CCDS43 QVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQQSN-G-SQTQLLQNFLN
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 AGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYV
..: :::::::... :.: ::... ::::::: :::::::.::::: .::...::..
CCDS43 SSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFS
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKN
. ::: :. ::: :.:.::::.:: : ::..:.::::.::::..::::.:::. ::.:
CCDS43 LIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQN
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 YQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKK
:. :.:. : . : :.::.:.:.::::::::..::::::: :: :.::::..::::.
CCDS43 YRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKR
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
... :. : ..::..::::: :::::::::::.:.: ::::::::::.:.:: :
CCDS43 STRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSN
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
:..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.::.:::.:.:::.:.::: :
CCDS43 PKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKL
470 480 490 500 510 520
530
pF1KB5 RHCCTRVAL
.: : ::::
CCDS43 KHHCIRVAL
530
>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (594 aa)
initn: 1804 init1: 587 opt: 1755 Z-score: 1189.1 bits: 229.9 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 1908; 54.1% identity (80.2% similar) in 536 aa overlap (1-532:72-594)
10 20 30
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
:. : : ... : . :: . .:
CCDS43 LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KB5 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
.: ..:.::::. : .. :.:.::.. :..:::.:::::::::.: : :.: :.
CCDS43 QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PG
110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
: : : .:. . :::.::::. . ::. : ::: .:..:: ..: ..:..: :::
CCDS43 S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
::::.::: ::::: ::.:... ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. :
CCDS43 HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
... : :. .:.:::::..: :::::::... :.: ::... ::::::: :::::::.
CCDS43 QSN-G-SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
::::: .::...::.. . ::: :. ::: :.:.::::.:: : ::..:.::::.:::
CCDS43 PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENP
:..::::.:::. ::.::. :.:. : . : :.::.:.:.::::::::..:::::::
CCDS43 WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 REALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIG
:: :.::::..::::.... :. : ..::..::::: :::::::::::.:.:
CCDS43 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 QQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLL
::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.::.
CCDS43 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
510 520 530 540 550 560
510 520 530
pF1KB5 QLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS43 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
570 580 590
>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 (540 aa)
initn: 1035 init1: 535 opt: 1708 Z-score: 1158.3 bits: 224.0 E(32554): 3.4e-58
Smith-Waterman score: 1708; 50.0% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (22-532:28-540)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
:. : : .: : :. : .: :
CCDS22 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDGTRG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB5 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
..:. .: ::::::::::: : : .: :: :.:. :: .:.:::
CCDS22 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPFTS-VL----SA-DLFPKANSRKKQVIKVY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
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CCDS22 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
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CCDS22 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
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CCDS22 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
:.: .: ::..::: :::: .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS22 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
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CCDS22 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 HRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
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CCDS22 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
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470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
:. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::: :
CCDS22 PKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKL
480 490 500 510 520 530
530
pF1KB5 RHCCTRVAL
.: :.:.::
CCDS22 KHYCARIAL
540
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10 20 30
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
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CCDS47 LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
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40 50 60 70 80
pF1KB5 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
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CCDS47 QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PG
110 120 130 140 150
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pF1KB5 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
: : : .:. . :::.::::. . ::. : ::: .:..:: ..: ..:..: :::
CCDS47 S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
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CCDS47 HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
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210 220 230 240 250 260
pF1KB5 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
: :: .: ..
CCDS47 ----------------------------QSNGSQTQLL--------------------QE
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270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
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CCDS47 PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
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330 340 350 360 370 380
pF1KB5 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENP
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CCDS47 WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
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390 400 410 420 430 440
pF1KB5 REALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIG
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CCDS47 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
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pF1KB5 QQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLL
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CCDS47 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
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pF1KB5 QLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS47 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
530 540
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pF1KB5 PLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGL
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CCDS31 SLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADPVLDLP-LPPPPPEPLSQEEEEAQAKADKIKLAL
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pF1KB5 --LPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPH
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CCDS31 EKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYPE
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: .:: .::::.:::: . : .....: .. :: .::. :.... .: .
CCDS31 LQIERFFEDHENVVEVLSDWTRDTENKILFLEKEEKYAVFKN-PQNFYLDNRGKKESKET
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pF1KB5 LDAHTGISHEDLIQNFLNAGSF--PEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGT
. .. ..:.:... . . :. ::..: : :. .:.: ::: . .:: ::.:: ::
CCDS31 NEKMNAKNKESLLEESFCGTSIIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGK
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pF1KB5 SKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQS
.: : : . .. :.: :: . : :::. : .: .... . .. .: .: ..
CCDS31 TKTSRDLACFIQFENVNIYYGTQHKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDTRT
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. :. ..:. ::: :: :::.: .. : ::. . .. . . . .
CCDS31 LNQWVMGIRIAKYGKTLYDNYQRAVAKAGLASRWTNLGTVNAAAPAQPSTGPKTGTTQPN
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: . ...:..:.::: . .. . :: :. . :. :
CCDS31 GQIPQATHSVSAVLQEAQRHAETSKDK----KPALGNHHDPAVPRAPHAPKSSLPPPPPV
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pF1KB5 RLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRF
CCDS31 RRSSDTSGSPATPLKAKGTGGGGLPAPPDDFLPPPPPPPPLDDPELPPPPPDFMEPPPDF
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pF1KB5 QRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFK
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CCDS23 DKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFK
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pF1KB5 SSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCF
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CCDS23 NPQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCG--SSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFL
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pF1KB5 LRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGH
:: ::.:: :: .: : : .... ::: . :. : :::. . .: ....
CCDS23 LRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKS
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pF1KB5 KGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHP---SCLGSPPLRSASD
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CCDS23 QYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSS
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pF1KB5 NTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQ
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CCDS23 SSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSK
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>>CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 (1250 aa)
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pF1KB5 ELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLV
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CCDS23 ITEEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLM
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pF1KB5 QRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFK
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CCDS23 DKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFK
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200 210 220 230 240 250
pF1KB5 SSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCF
. . :. .: .. : . . :. . . .. . :::.: : :. .:.: ::. . .
CCDS23 NPQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCG--SSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFL
370 380 390 400 410
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 LRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGH
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CCDS23 LRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKS
420 430 440 450 460 470
320 330 340 350 360
pF1KB5 KGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHP---SCLGSPPLRSASD
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CCDS23 QYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSS
480 490 500 510 520 530
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pF1KB5 NTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQ
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CCDS23 SSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMN
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532 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]