Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5776, 766 aa
1>>>pF1KB5776 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0357+/-0.00104; mu= 3.5337+/- 0.061
mean_var=269.8502+/-61.465, 0's: 0 Z-trim(112.1): 667 B-trim: 756 in 1/51
Lambda= 0.078075
statistics sampled from 12079 (12888) to 12079 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7 ( 766) 5139 593.0 5.8e-169
CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 609) 2341 277.8 3.7e-74
CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3 ( 648) 1797 216.5 1.1e-55
CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 606) 1781 214.7 3.6e-55
CCDS59164.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 186) 614 82.7 5.8e-16
CCDS61250.1 KSR2 gene_id:283455|Hs108|chr12 ( 921) 595 81.3 7.9e-15
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 512 71.7 3.5e-12
CCDS58532.1 KSR1 gene_id:8844|Hs108|chr17 ( 762) 514 72.1 3.8e-12
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 506 71.0 5.3e-12
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 506 71.0 5.4e-12
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 503 70.7 7.1e-12
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 501 70.5 8.3e-12
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 499 70.2 9.3e-12
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 499 70.2 9.3e-12
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 486 68.8 2.7e-11
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 482 68.3 3.6e-11
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 481 68.2 3.8e-11
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 481 68.2 3.8e-11
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 481 68.2 3.9e-11
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 481 68.2 3.9e-11
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 484 68.8 4.8e-11
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 481 68.5 6.1e-11
>>CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7 (766 aa)
initn: 5139 init1: 5139 opt: 5139 Z-score: 3146.9 bits: 593.0 E(32554): 5.8e-169
Smith-Waterman score: 5139; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAALSGGGGGGAEPGQALFNGDMEPEAGAGAGAAASSAADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEH
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CCDS58 MAALSGGGGGGAEPGQALFNGDMEPEAGAGAGAAASSAADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 AVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNIN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 NRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB5 LPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
730 740 750 760
>>CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX (609 aa)
initn: 2289 init1: 1587 opt: 2341 Z-score: 1444.9 bits: 277.8 E(32554): 3.7e-74
Smith-Waterman score: 2341; 60.4% identity (79.9% similar) in 618 aa overlap (147-748:9-600)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 MDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPI--VRVFLPNKQRTVVPARCG
.: :.. . :.:.::::::::: .: :
CCDS75 MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDG
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
..: ::: ::: .::: .::.:::. :.: .::: :. : :::: :::::.::::
CCDS75 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
:::::::::.::::::: :.::.:::::::::::::.::..:: .::... . :.:
CCDS75 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMST-NRQQPSRF
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340
pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGS----SPSA-PASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQ--PFR
. : . :. :..:: .:: : .. . :: .::: . :. ::
CCDS75 Y--HSV-QD--------LSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQ---GPSPRTQHCDPEHFPF-
160 170 180 190 200
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVH-INTIEPVNIDDLIR--DQGFRGDG-GSTTGLSATPP
:: : :: ::.:.:::: ..: :.. ..::. :.: :. :: : ..::
CCDS75 PAPA---NAPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPMD-SNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPR
210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 AS-LPGSLTNVKAL--QKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVG
.: :.:... . .:::. :::::: . .:....:.:: :::. ::.: ... .
CCDS75 GSPSPASVSSGRKSPHSKSPAEQRERKSLA--DDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLL
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 QRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYS
.:::.::::::..:.::::::::.:.:. :: .: ::::::. :::::::::::::::.
CCDS75 KRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFM
320 330 340 350 360 370
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSN
:.: .::.::::::::::::::. .:.:.:..:::.::::::::::::::.:::::::::
CCDS75 TRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSN
380 390 400 410 420 430
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 NIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
:::::: ::::::::::::::.::::.. .:: :::.:::: ::::::: ::::::::::
CCDS75 NIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVY
440 450 460 470 480 490
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 AFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKK
:.:.::::::::.::::.:. :::::::::::::::::::. :::::::.::...::: .
CCDS75 AYGVVLYELMTGSLPYSHIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQ
500 510 520 530 540 550
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 RDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGY
:.::::::::::.:::: ::::::.::::::::.:. :... : ::
CCDS75 REERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRT--QADE--LPACLLSAARLVP
560 570 580 590 600
pF1KB5 GAFPVH
>>CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3 (648 aa)
initn: 2298 init1: 1666 opt: 1797 Z-score: 1113.4 bits: 216.5 E(32554): 1.1e-55
Smith-Waterman score: 2368; 56.5% identity (78.1% similar) in 672 aa overlap (97-755:5-647)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTVTSSSSS
: ....:: :. :.: ..::
CCDS26 MEHIQGAWKTISNGFGFK-------DAVFDGSSC
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALM
.. .... . .: .. . : . .:::::::::::: .: :....: : :::
CCDS26 ISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALK
30 40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MRGLIPECCAVYRI---QDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFF
.::: ::::::.:. . :.: . :.:: . : ::::.:. :..::::::::.::::.
CCDS26 VRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFL
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLD--LLFVSKFFEHHPIP
:::::.:.:.:..::::::::::::..:::.:: :::..... ::: .. . .:
CCDS26 KLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTIGDSGVP
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRD
:: : . : : : .: . : : : .. . .....::.
CCDS26 ---------ALPSLTMRRMRESVSRMP---VSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQ
210 220 230 240 250
370 380 390 400 410
pF1KB5 RSSSAPNVH-INTIEPVN---IDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQ
::.:.:::: ..: ::. :.: ::... ...: ..::..: : . ..
CCDS26 RSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHS---ESASPSALSSSPNNLSPTGWSQ----P
260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KSPGP-QRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKW
:.: : :::: :.....:... :.:::: ::: ... .. :::::::::::::::
CCDS26 KTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKW
310 320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 HGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSS
:::::::.:.:. :::.:.:::.:::.:::::::::::::::: :: .::::::::::::
CCDS26 HGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSS
370 380 390 400 410 420
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFG
::.:::. ::::.:..::::::::::::::::::.:::::.::::::::: :::::::::
CCDS26 LYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
430 440 450 460 470 480
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 LATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPY
:::::::::::.: :: .::.::::::::::::.::.:::::::..::::::::::.:::
CCDS26 LATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPY
490 500 510 520 530 540
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 SNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIEL
:.::::::::::::::: ::::::. .:::::::::.:.:.:: ..:::::::::.::::
CCDS26 SHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIEL
550 560 570 580 590 600
720 730 740 750 760
pF1KB5 LARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACA---SPKTPIQAGGYGAFPVH
: .:::::.::::::::.::. .:::.. ::. ::. :.
CCDS26 LQHSLPKINRSASEPSLHRAA-HTEDIN--ACTLTTSPRLPVF
610 620 630 640
>>CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX (606 aa)
initn: 2289 init1: 1587 opt: 1781 Z-score: 1104.0 bits: 214.7 E(32554): 3.6e-55
Smith-Waterman score: 2335; 60.0% identity (79.3% similar) in 618 aa overlap (147-748:9-597)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 MDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPI--VRVFLPNKQRTVVPARCG
.: :.. . :.:.::::::::: .: :
CCDS35 MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDG
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
..: ::: ::: .::: .::.:::. :.: .::: :. : :::: :::::.::::
CCDS35 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
:::::::::.::::::: :.::.:::::::::::::.::..:: .::... :
CCDS35 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQF----
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340
pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGS----SPSA-PASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQ--PFR
.: . . :..:: .:: : .. . :: .::: . :. ::
CCDS35 --YHSVQD---------LSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQ---GPSPRTQHCDPEHFPF-
160 170 180 190
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVH-INTIEPVNIDDLIR--DQGFRGDG-GSTTGLSATPP
:: : :: ::.:.:::: ..: :.. ..::. :.: :. :: : ..::
CCDS35 PAPA---NAPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPMD-SNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPR
200 210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 AS-LPGSLTNVKAL--QKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVG
.: :.:... . .:::. :::::: . .:....:.:: :::. ::.: ... .
CCDS35 GSPSPASVSSGRKSPHSKSPAEQRERKSLA--DDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLL
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 QRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYS
.:::.::::::..:.::::::::.:.:. :: .: ::::::. :::::::::::::::.
CCDS35 KRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFM
320 330 340 350 360 370
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSN
:.: .::.::::::::::::::. .:.:.:..:::.::::::::::::::.:::::::::
CCDS35 TRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSN
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pF1KB5 NIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
:::::: ::::::::::::::.::::.. .:: :::.:::: ::::::: ::::::::::
CCDS35 NIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVY
440 450 460 470 480 490
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 AFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKK
:.:.::::::::.::::.:. :::::::::::::::::::. :::::::.::...::: .
CCDS35 AYGVVLYELMTGSLPYSHIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQ
500 510 520 530 540 550
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 RDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGY
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CCDS35 REERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRT--QADE--LPACLLSAARLVP
560 570 580 590 600
pF1KB5 GAFPVH
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pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
..: ::: ::: .::: .::.:::. :.: .::: :. : :::: :::::.::::
CCDS59 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
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pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
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CCDS59 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQFYHSV
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pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHR
CCDS59 QDLSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQGPR
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: : : ... . : : : .. :..:..:
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: :..:. :.: :. .. : : : .:. .
CCDS61 KLKCHNKCTKEAPPCHLLIIHRGDPARLVRTESVPCDINNPLRKPPRYSDLHISQTLPKT
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pF1KB5 -----EHHPIPQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPAD
.: :.: . : .. . :..:.::.:: : : : .. : :.:..:.
CCDS61 NKINKDHIPVPYQPDSSSNPSSTTSSTPSSPA-----P-----PLPPSATP-PSPLHPSP
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360 370 380 390 400
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. :.: . .: . . . : : . . . :. ....: : :.
CCDS61 QCTRQQKNFNLPASHYYKYKQQFIFPDVVP--VPETPTRAPQVILHPVTSNP--ILEGNP
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: .... : . . . .. : .: ..: ... :. :. ..:.:: :.
CCDS61 LLQIEVEPTSENEEVHDEAEESEDDFEEMNLSLLSARSFPRKASQTSIFLQEWDIPFEQL
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFM
.:. ::.: :: ::.:.:::.::...... . .::.::: :: . :.::: :..:::
CCDS61 EIGELIGKGRFGQVYHGRWHGEVAIRLIDIERDNEDQLKAFKREVMAYRQTRHENVVLFM
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pF1KB5 GYS-TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRD
: . :.:::.:. :.: .:: .. . ... : .::.. ..:: :::::.:.:.:
CCDS61 GACMSPPHLAIITSLCKGRTLYSVVRDAKIVLDVNKTRQIAQEIVKGMGYLHAKGILHKD
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pF1KB5 LKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWM---APEVIRM------
:::.:.: ... : : :::: .... ..... ..: . :. :::.::.
CCDS61 LKSKNVF-YDNGKVVITDFGLFSISGVLQAGRREDKLRIQNGWLCHLAPEIIRQLSPDTE
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pF1KB5 QDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPK
.:: :.: .:::.:.: . ::: . . :... . . ::...: : ..:.::.. . :
CCDS61 EDKLPFSKHSDVFALGTIWYELHAREWPFKT-QPAEAIIWQMGTG-MKPNLSQI--GMGK
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pF1KB5 AMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYA
.. .. : ...::: : ... .: .::: .: :.:
CCDS61 EISDILLFCWAFEQEERPTFTKLMDMLE----KLPKRNRRLSHPGHFWKSAEL
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pF1KB5 CASPKTPIQAGGYGAFPVH
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pF1KB5 PGSLTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSG
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pF1KB5 SFGTVYKGKWHGD--VAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQ
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CCDS50 QFGEVWMGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPE---SFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEP
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pF1KB5 LAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETK-FEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIF
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CCDS50 IYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANIL
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pF1KB5 LHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGS---ILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
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CCDS50 VGNGLICKIADFGLA----RLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALY---GRFTIKSDVW
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pF1KB5 AFGIVLYELMT-GQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKK
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CCDS50 SFGILLTELVTKGRVPYPGMNNRE-VLEQVERGYRMP----CPQDCPISLHELMIHCWKK
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CCDS50 DPEERPTFEYLQSFLEDYFTATEPQYQPGENL
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.. : ::... .:::. . :. : : : .:: .: : .:
CCDS58 AASLPWPPGSSQLGRAGNSAQGPRSISVSALPASDSPTPSFSEGLSDTCIPLHASGRLTP
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. .: : : .: .. . : : : .:... :.: .. : .
CCDS58 RAL-HSFITPPTTPQLR-----RHTKLKPPR---TPPPPSRKVFQ---LLPSFPTLTRSK
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pF1KB5 DGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVE---VLENVPLT-THNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQ
. :.. . :.: . . : : ... :. :: : :.... : :.: ..
CCDS58 SHESQLGNRIDDVSSMRFDLSHGSPQMVRRDIGLSVTHRFSTKSWLS-QVCHVCQKSMIF
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: .:. : : :..:. :.: : ....: .... . . .:.. . .. : :
CCDS58 GVKCKHCRLKCHNKCTKEAP-AC----RISFLPLTRLRRTESVPSDINNPVDRAAEPHFG
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CCDS58 TLPKALTKKEHPPAMNHLDSSSNPSSTTSSTPSSPAPFPTSSNPSSATTPPNPSPGQRDS
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. : ... . : :: :. .... .. . .... :.: : . :.
CCDS58 RFNFPAAYFIHHRQQFIFPVPSAGHCWKCLLIAESLKENAFNISAFAHAAPLPEAADGTR
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pF1KB5 ------TNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTL-----------GRRDSS-----D
..: ... . . : .: . .:.... : .:. :. .
CCDS58 LDDQPKADVLEAHEAEAEEPEAGKSEAEDDEDEVDDLPSSRRPWRGPISRKASQTSVYLQ
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pF1KB5 DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKT
.:.:: :. .:. ::.: .: :..:.:::.::...:.. . . ..:. ::.:: :.:
CCDS58 EWDIPFEQVELGEPIGQGRWGRVHRGRWHGEVAIRLLEMDGHNQDHLKLFKKEVMNYRQT
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pF1KB5 RHVNILLFMGYSTKP-QLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYL
:: :..:::: .: .:::.:..:.: .:. .. .:.... : .::.. .:: ::
CCDS58 RHENVVLFMGACMNPPHLAIITSFCKGRTLHSFVRDPKTSLDINKTRQIAQEIIKGMGYL
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pF1KB5 HAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWM---APEV
:::.:.:.::::.:.: ... : : :::: ... ... .::. : :. :::.
CCDS58 HAKGIVHKDLKSKNVF-YDNGKVVITDFGLFGISGVVREGRRENQLKLSHDWLCYLAPEI
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pF1KB5 IRM------QDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDL
.: .:. :.: .:::::: : :::.. . : .: . . :...: : .
CCDS58 VREMTPGKDEDQLPFSKAADVYAFGTVWYELQARDWPLKN-QAAEASIWQIGSG---EGM
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pF1KB5 SKVRSNCP--KAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRA
..: .. : ...... : .::: : .. .: .:::..: :.:
CCDS58 KRVLTSVSLGKEVSEILSACWAFDLQERPSFSLLMDMLE----KLPKLNRRLSHPGHFWK
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pF1KB5 GFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
CCDS58 SAEL
760
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CCDS47 RKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDFDPVH-GDVIKHYKIRSLDNG---
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CCDS47 GYYISPRITFPCISDMIKHYQKQADGLCRRLEKACISPKPQKPW-------DKDAWEIPR
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CCDS47 ESIKLVKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLK---PGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDK
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CCDS47 LVRLYAVVTREEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERK
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. ....:::..:::.:::..: :..:: . .: : .. ...:: : .:. ::: .
CCDS47 GCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNAD-VMTALSQGYRMP---RVE-NCPDEL
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pF1KB5 KRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACA
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CCDS47 YDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP
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pF1KB5 KSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRG-DGGSTT
.. . ..::. :.:. .:. :.:
CCDS61 RKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDFDPVH-GDVIKHYKIRSLDNG---
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pF1KB5 GLSATPPASLPGSLTNVKALQKSPGP--QRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPD
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CCDS61 GYYISPRITFPCISDMIKHYQKQADGLCRRLEKACISPKPQKPW-------DKDAWEIPR
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pF1KB5 GQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGD--VAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVN
.: . .:.:.:.:: :. : .... :::: :. : ...::: .:..... .: .
CCDS61 ESIKLVKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLK---PGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDK
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pF1KB5 ILLFMGYSTKPQ-LAIVTQWCEGSSLYHHLHIIET-KFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAK
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CCDS61 LVRLYAVVTREEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERK
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pF1KB5 SIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDK
. :::::.. :... :.: ::.::::: : . . : . : : :::.: .
CCDS61 NYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARVIEDNEYTAR-EGAKFPIKWTAPEAINF---
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pF1KB5 NPYSFQSDVYAFGIVLYELMT-GQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAM
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CCDS61 GCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNAD-VMTALSQGYRMP---RVE-NCPDEL
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CCDS61 YDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP
480 490 500 510
766 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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