Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5768
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5768, 760 aa
1>>>pF1KB5768 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5969+/-0.00112; mu= 18.0463+/- 0.067
mean_var=68.7051+/-13.711, 0's: 0 Z-trim(102.5): 33 B-trim: 2 in 1/47
Lambda= 0.154732
statistics sampled from 6942 (6966) to 6942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33311.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 ( 760) 5173 1164.7 0
CCDS77480.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 ( 735) 4411 994.5 0
CCDS2216.1 DPP4 gene_id:1803|Hs108|chr2 ( 766) 2829 641.4 1.6e-183
CCDS33278.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 789) 1619 371.3 3.3e-102
CCDS46400.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 796) 1619 371.3 3.3e-102
CCDS54388.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 800) 1619 371.3 3.3e-102
CCDS54389.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 ( 746) 1602 367.5 4.4e-101
CCDS75682.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 801) 1536 352.8 1.3e-96
CCDS75684.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 803) 1536 352.8 1.3e-96
CCDS75683.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 865) 1536 352.8 1.4e-96
CCDS78291.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7 ( 758) 1326 305.9 1.6e-82
CCDS10210.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15 ( 882) 515 124.9 5.6e-28
CCDS10207.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15 ( 898) 515 124.9 5.7e-28
CCDS45928.1 DPP9 gene_id:91039|Hs108|chr19 ( 892) 499 121.3 6.7e-27
>>CCDS33311.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 (760 aa)
initn: 5173 init1: 5173 opt: 5173 Z-score: 6236.4 bits: 1164.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5173; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEEYPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEEYPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 YGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 TERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB5 QVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSD
730 740 750 760
>>CCDS77480.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2 (735 aa)
initn: 4406 init1: 4406 opt: 4411 Z-score: 5317.3 bits: 994.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4951; 96.7% identity (96.7% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTM-------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEEYPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEEYPG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGR
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 YGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQ
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVY
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 TERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNA
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760
pF1KB5 QVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSD
700 710 720 730
>>CCDS2216.1 DPP4 gene_id:1803|Hs108|chr2 (766 aa)
initn: 2522 init1: 1387 opt: 2829 Z-score: 3408.4 bits: 641.4 E(32554): 1.6e-183
Smith-Waterman score: 2829; 51.6% identity (80.6% similar) in 767 aa overlap (1-758:1-765)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMC-IVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFP
::: :...:. .:.:. .. .:: . . .. .. .. :: : :..:. : .
CCDS22 MKTPWKVLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTDDATADSRKTYTLTDYLKNTYRLKLYSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNAS--NYGLSPDRQFVYLESD
::: .:::... .:::...: : :.: ..: : :. . : .:..::: ::. :: .
CCDS22 RWISDHEYLYKQ-ENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 YSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPG
: : ::.::::.: ::::.. ... ...: :.. ::::: :::::..:.::.: .:.
CCDS22 YVKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYS
: ..::..:.:. :.::: :::::::.... :::::::: :::::.::::..:.: ::
CCDS22 LPSYRITWTGKEDIIYNGITDWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YYGDE--QYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQ---EVPVPAMIASSDYY
.:.:: :::.:. .::::::: ::.:..:...: . : .. .:: . .:.:
CCDS22 FYSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFV
. .::.:.::. ::::.:.:: ::..:::. :. :.: ...::: : :::.: :
CCDS22 LCDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 STPVFSYDAISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSS
: : :. :. :.:::.:...::.:: :.. .. ::.: ::.:.: .:.: :.: :
CCDS22 SEPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYIS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NEFEEYPGRRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIP
::.. .:: ::.:.:....: . :..:.: ::::::..::: :::: : : :::.:
CCDS22 NEYKGMPGGRNLYKIQLSDYT-KVTCLSCELNPERCQYYSVSFSKEAKYYQLRCSGPGLP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ISTLHDGRTDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSK
. :::.. .:. ...::.:. :.. :.:.:.:.... . ..: .::.:::::.::.::
CCDS22 LYTLHSSVNDKGLRVLEDNSALDKMLQNVQMPSKKLDFIILNETKFWYQMILPPHFDKSK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 KYPLLIQVYGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKL
:::::..::.:::::.. .:: .:: .:::: :....: ::::...::::...:. :.:
CCDS22 KYPLLLDVYAGPCSQKADTVFRLNWATYLASTENIIVASFDGRGSGYQGDKIMHAINRRL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GVYEVEDQITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSS
:..:::::: :.:.: .:::.:.::::::::::::::.:..:.::.:.:::::::::::
CCDS22 GTFEVEDQIEAARQFSKMGFVDNKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 WEYYASVYTERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQ
:::: ::::::.::::: .:::.::.:::::.::: :..:.:::::::::::::::.:::
CCDS22 WEYYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KB5 IAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHGL-SGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSD
:.::::.. ::::::::.:..::. :. . .:.::::.::.::::::
CCDS22 ISKALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLP
720 730 740 750 760
>>CCDS33278.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2 (789 aa)
initn: 1490 init1: 632 opt: 1619 Z-score: 1948.4 bits: 371.3 E(32554): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1619; 34.0% identity (66.1% similar) in 768 aa overlap (10-756:27-774)
10 20 30
pF1KB5 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMC-------IVLRPSRVHNSEE
:.: :.:..::.: :.: :... :: :
CCDS33 MRKVESRGEGGREELGSNSPPQRNWKGIAI-ALLVILVVCSLITMSVILLTPDELTNSSE
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 NTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPNWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMK
. :.:.:.. : . ::. . ...: ..... ::::. . .: : :.
CCDS33 TR---LSLEDLFRKDFVLHDPEARWINDTDVVYKSENGHVIKLNIETNATTLLLENTTFV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 SVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGN--ELPRPI-QYL
. .:: ...::: ..: : : .....:::::.: ::.. . : . : :. . ::
CCDS33 TFKASRHSVSPDLKYVLLAYDVKQIFHYSYTASYVIYNIHTREVWELNPPEVEDSVLQYA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 CWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALW
:. :..: :...:::: . . ...: .:.:. ::::: ::.::::.: .. : :
CCDS33 AWGVQGQQLIYIFENNIYYQPDIKSSSLRLTSSGKEEIIFNGIADWLYEEELLHSHIAHW
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 WSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYGDEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPA
:::.:. ::. .::. .:... . ::. . :::::: ::........ :.
CCDS33 WSPDGERLAFLMINDSLVPTMVIPRFTGALYPKGKQYPYPKAGQVNPTIKLYVVNLYGPT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCP
.. :. : . : .::.. . ::.. .. ..::.:.::.:.:..:. : :
CCDS33 HT--LELMPPDSFKSREYYITMVKWVSNTKTVVRWLNRAQNISILTVCETT----TGACS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB5 KTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYDAISYYKIFSDKDG----YKHIHY--IKDTVENA
: : .. : . :::: :. ... :.: ..:. . :.. :.
CCDS33 KKYEMTSDT---WLSQQ-NEEPVFSRDGSKFFMTVPVKQGGRGEFHHVAMFLIQSKSEQI
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 I--QITSGKWEAINIF---RVTQDSLFYSSNEFEEYPGRRNIYRISIGSYPPSKKCVTCH
..:::.::.:.:. ..:: : :. : : :..: : . ...:..:.
CCDS33 TVRHLTSGNWEVIKILAYDETTQKIYFLST---ESSPRGRQLYSASTEGLL-NRQCISCN
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CCDS75 GPTH--DLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLC----DATTG
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