Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5741
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5741, 799 aa
1>>>pF1KB5741 799 - 799 aa - 799 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5301+/-0.0015; mu= 10.8821+/- 0.089
mean_var=216.7396+/-42.399, 0's: 0 Z-trim(106.6): 128 B-trim: 47 in 2/49
Lambda= 0.087117
statistics sampled from 8958 (9077) to 8958 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 5624 721.1 1.7e-207
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 3122 406.6 7.9e-113
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 2746 359.4 1.3e-98
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 2609 342.1 2e-93
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 2439 320.7 5.1e-87
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2309 304.5 4.6e-82
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 2050 271.8 2.6e-72
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2043 271.0 5.3e-72
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 1803 240.9 6.3e-63
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1629 219.0 2.4e-56
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1475 200.0 2.8e-50
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1475 200.1 2.8e-50
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1475 200.1 2.8e-50
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 476 73.7 6e-13
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 476 73.7 6.6e-13
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 476 73.8 7e-13
>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa)
initn: 5624 init1: 5624 opt: 5624 Z-score: 3838.5 bits: 721.1 E(32554): 1.7e-207
Smith-Waterman score: 5624; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (1-799:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI
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CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TSRCDLRANLVKNGCGGEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TSRCDLRANLVKNGCGGEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCNGSG
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CCDS30 TASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCNGSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEF
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CCDS30 TYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 CRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 MTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPIST
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB5 HTVDFTFNKFNKSYNGTVD
:::::::::::::::::::
CCDS30 HTVDFTFNKFNKSYNGTVD
790
>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa)
initn: 2942 init1: 2122 opt: 3122 Z-score: 2139.1 bits: 406.6 E(32554): 7.9e-113
Smith-Waterman score: 3122; 55.7% identity (78.8% similar) in 788 aa overlap (2-782:5-781)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPR-LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKE--DF
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CCDS11 MRARPR-PRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GSPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQE
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CCDS11 GSPR-----CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSS-QVTQVSPQR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTS
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CCDS11 IALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NFRLGFGSFVDKDISPFSY-TAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE
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CCDS11 NLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPC--YDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL
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CCDS11 EVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI
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CCDS11 VQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK
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CCDS11 PGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPN
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CCDS11 CMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCP-QEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCN
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CCDS11 SHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDI
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CCDS11 QCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 STCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGK
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CCDS11 DTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 -PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLR
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CCDS11 LHDENTCNRYCRDEIES-VKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVE
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMAS
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CCDS11 EPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTAN
710 720 730 740 750 760
780 790
pF1KB5 NPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
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CCDS11 NPLYKEATSTFTNITYRGT
770 780
>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa)
initn: 2627 init1: 853 opt: 2746 Z-score: 1883.7 bits: 359.4 E(32554): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 2746; 49.5% identity (76.9% similar) in 757 aa overlap (28-780:23-768)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI
:. :.: .::.:::: :.::::..:.: : ..
CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPSGV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 TSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLR
::: :::. .:: . ::.:.:. ..:.. ::: : . . :..:..:: . ..::
CCDS22 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSV-GRQKNSSDIVQIAPQSLILKLR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGF
:: :.:..:::.:::::::::::::: :: :::..:. ::..:..:: ::::::::::
CCDS22 PGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRV
::::.: .::: :.:. .::: . : :.:.:::.:.::::. .. ::: :..:..
CCDS22 GSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQ
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CCDS22 SANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 CHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEI
:::. :::. :. ..::... : .::..::. ::::::... ::.:.. ::::.:: .
CCDS22 CHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIG
:. :: ::.::::.::. .::.::: : . : ::: ::: :..:. . :.:: .:.:
CCDS22 LQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCN-G
::::: :... : :...:.. ..:::. :.::. :. .:.: :. .: ::..:. :
CCDS22 DTASFSVTVNIPHCE-RRSRHII-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFES
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CCDS22 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 EFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRD
.:.::::.:.::::::.:.::.::.:.:.: :::: :..:. :. :::.:. ..: ..:
CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSED
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCH
: .:: :: :.::.: ::.::: : ::.:::: : :..::.:.:: : .:. .. :
CCDS22 GVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE-CV
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 SLCR--DEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGN
. :. .:. . . :: .: : . ..:.. : . ::. . . : .: .
CCDS22 DKCKLAGATISEEEDFSKDG--SVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPK
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 TPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRK
:: :.:.: .:::.:..:: ::::::..:::.: :::..:::.:... ..:::::
CCDS22 PPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRG
710 720 730 740 750 760
780 790
pF1KB5 PISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
::
CCDS22 STSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
770 780
>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa)
initn: 2490 init1: 853 opt: 2609 Z-score: 1790.9 bits: 342.1 E(32554): 2e-93
Smith-Waterman score: 2609; 49.1% identity (76.4% similar) in 733 aa overlap (52-780:5-726)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIE
..: : .. ::: :::. .:: . ::
CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 SPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDL
.:.:. ..:.. ::: : . . :..:..:: . ..:::: :.:..:::.:::::::
CCDS74 NPVSQVEILKNKPLSV-GRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 YYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTN
::::::: :: :::..:. ::..:..:: ::::::::::::::.: .::: :.:. .:
CCDS74 YYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIAN
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 PCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCK
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CCDS74 PCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCK
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pF1KB5 LLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRS
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CCDS74 EVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCE-RRSRH
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CCDS74 II-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCE
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CCDS74 C--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHK
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CCDS74 ASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQA-REECVDKCKLAGATISEEEDFSKDG-
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CCDS74 LLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLS
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pF1KB5 VD
CCDS74 TDC
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CCDS74 HLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNN
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CCDS74 FHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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CCDS71 TS--ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ
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CCDS71 PKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENG
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CCDS71 CVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSAC
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CCDS71 DCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCR
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CCDS71 AFNKGEKKD-TCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNG
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CCDS71 KMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS63 GSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKI
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pF1KB5 SRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQ
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CCDS63 DTASFSVTVNIPHCE-RRSRHII-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
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pF1KB5 SGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFES
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CCDS63 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
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pF1KB5 EFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRD
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CCDS63 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCG-------------------------DFS----KD
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pF1KB5 GQI-CSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTC
:.. :: .:. :::
CCDS63 GSVSCSLQGEN----------------------------------ECL------------
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pF1KB5 HSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNT
::. .. :.: ::. . . : .: .
CCDS63 --------ITF---LITTDNE-----------------------GKTIIHSINEKDCPKP
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pF1KB5 PNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKP
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CCDS63 PNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGS
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pF1KB5 ISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
::
CCDS63 TSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWC
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CCDS88 VLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQ--PAPSCQKCILSHPSCAWC
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pF1KB5 SKEDF-GSPRSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVI
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CCDS88 KQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQ---GARGEGAT
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CCDS88 QLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVR
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CCDS88 KEQQQLNWKQDSNPLYKSAITT-TINPRFQEADSPTL
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CCDS13 DSI--RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQK------QLSPQKVTL
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CCDS13 G-PFGKNCSAACPGLQLS--NNPVKGRT----CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYV
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CCDS13 DESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN-
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CCDS13 NDNPLFKSATTTVMNPKFAES
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CCDS53 SGGSRSERCDIVSNLISKGCSVDSIEYP--SVHVI--IPTENEIN-------TQVTPGEV
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CCDS53 SIQLRPGAEANFMLKVHPLKKYPVDLYYLVDVSASMHNNIEKLNSVGNDLSRKMAFFSRD
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CCDS53 FRLGFGSYVDKTVSPYISIHPERIHNQCSDYNL--DCMPPHGYIHVLSLTENITEFEKAV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]