Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5711, 785 aa
1>>>pF1KB5711 785 - 785 aa - 785 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1139+/-0.00113; mu= 16.0009+/- 0.068
mean_var=78.5094+/-15.443, 0's: 0 Z-trim(103.5): 198 B-trim: 26 in 1/46
Lambda= 0.144748
statistics sampled from 7317 (7523) to 7317 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 1.720
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs109|chr18 ( 785) 5105 1076.4 0
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs109|chr18 ( 630) 4023 850.4 0
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs109|chr18 ( 801) 3250 689.1 7.9e-198
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs109|chr16 ( 799) 3211 680.9 2.2e-195
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs109|chr5 ( 788) 3185 675.5 9.4e-194
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs109|chr5 ( 790) 3180 674.4 2e-193
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs109|chr5 ( 790) 3179 674.2 2.3e-193
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs109|chr5 ( 789) 3122 662.3 8.6e-190
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs109|chr5 ( 794) 3088 655.2 1.2e-187
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs109|chr16 ( 796) 3063 650.0 4.4e-186
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs109|chr20 ( 828) 2667 567.3 3.6e-161
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs109|chr16 ( 670) 2654 564.6 2e-160
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs109|chr18 ( 772) 2607 554.8 2e-157
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs109|chr14 ( 781) 2549 542.7 9e-154
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs109|chr16 ( 693) 2409 513.4 5.1e-145
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs109|chr5 ( 754) 2196 468.9 1.3e-131
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs109|chr5 ( 575) 2188 467.2 3.4e-131
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs109|chr5 ( 574) 2187 467.0 3.9e-131
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs109|chr16 ( 784) 1785 383.1 9.6e-106
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs109|chr14 ( 819) 1665 358.1 3.5e-98
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs109|chr18 ( 490) 1577 339.6 7.5e-93
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs109|chr16 ( 814) 1341 290.4 8.1e-78
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs109|chr20 ( 842) 1211 263.3 1.2e-69
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs109|chr20 ( 916) 1211 263.3 1.3e-69
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs109|chr18 ( 875) 1173 255.3 3.1e-67
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs109|chr18 ( 906) 1173 255.3 3.2e-67
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs109|chr18 ( 847) 938 206.3 1.8e-52
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs109|chr18 ( 901) 938 206.3 1.9e-52
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs109|chr18 ( 896) 909 200.2 1.3e-50
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs109|chr18 ( 840) 897 197.7 6.8e-50
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs109|chr18 ( 894) 897 197.7 7.2e-50
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs109|chr16 ( 784) 891 196.4 1.5e-49
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs109|chr16 ( 674) 767 170.5 8.3e-42
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs109|chr16 ( 713) 767 170.5 8.7e-42
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs109|chr16 ( 760) 767 170.5 9.2e-42
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs109|chr18 (1118) 709 158.5 5.7e-38
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs109|chr20 ( 832) 681 152.6 2.5e-36
CCDS4317.1 FAT2 gene_id:2196|Hs109|chr5 (4349) 673 151.2 3.5e-35
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs109|chr18 (1040) 639 143.9 1.4e-33
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs109|chr18 (1059) 639 143.9 1.4e-33
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs109|chr16 ( 821) 615 138.8 3.5e-32
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs109|chr18 ( 999) 616 139.0 3.7e-32
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs109|chr16 ( 882) 605 136.7 1.6e-31
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs109|chr16 ( 732) 602 136.1 2.1e-31
CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs109|chr16 ( 829) 602 136.1 2.3e-31
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs109|chr22 (3014) 588 133.4 5.6e-30
CCDS43375.1 PCDH1 gene_id:5097|Hs109|chr5 (1060) 564 128.2 7.1e-29
CCDS4267.1 PCDH1 gene_id:5097|Hs109|chr5 (1237) 564 128.2 8.2e-29
CCDS75350.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs109|chr5 ( 878) 559 127.1 1.2e-28
CCDS4263.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs109|chr5 ( 944) 559 127.1 1.3e-28
>>CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs109|chr18 (785 aa)
initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105 Z-score: 5759.1 bits: 1076.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5105; 99.7% identity (100.0% similar) in 785 aa overlap (1-785:1-785)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLGKVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKLGKVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RAQALDRLTNEPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQVTATDA
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAQALDRLTNKPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQVTATDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKDMVGQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKDMVGQNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGANAEMEYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGANAEMEYK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLSLGPFSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLSLGPFSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TTTVKIIVEDVDEPPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNSPVRYSIDRNTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTTVKIIVEDVDEPPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNSPVRYSIDRNTD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LERYFNIDANSGVITTAKSLDRETNAIHNITVLAMESQNPSQVGRGYVAITILDINDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LERYFNIDANSGVITTAKSLDRETNAIHNITVLAMESQNPSQVGRGYVAITILDINDNAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDATNNHNFSLKDNKDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDATNNHNFSLKDNKDNT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTSTLTIRVCDCDADGVAQTCNAEAYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTNTLTIRVCDCDADGVAQTCNAEAYV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 LPAGLSTGALIAILACVLTLLVLILLIVTMRRRKKEPLIFDEERDIRENIVRYDDEGGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPAGLSTGALIAILACVLTLLVLILLIVTMRRRKKEPLIFDEERDIRENIVRYDDEGGGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 EDTEAFDMAALRNLNVIRDTKTRRDVTPEIQFLSRPAFKSIPDNVIFREFIWERLKEADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDTEAFDMAALRNLNVIRDTKTRRDVTPEIQFLSRPAFKSIPDNVIFREFIWERLKEADV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 DPGAPPYDSLQTYAFEGNGSVAESLSSLDSISSNSDQNYDYLSDWGPRFKRLADMYGTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DPGAPPYDSLQTYAFEGNGSVAESLSSLDSISSNSDQNYDYLSDWGPRFKRLADMYGTGQ
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 ESLYS
:::::
CCDS11 ESLYS
>>CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs109|chr18 (630 aa)
initn: 4023 init1: 4023 opt: 4023 Z-score: 4539.4 bits: 850.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4023; 99.7% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLGKVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKLGKVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEY
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70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RAQALDRLTNEPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQVTATDA
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RAQALDRLTNKPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQVTATDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKDMVGQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKDMVGQNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGANAEMEYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGANAEMEYK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLSLGPFSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLSLGPFSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TTTVKIIVEDVDEPPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNSPVRYSIDRNTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TTTVKIIVEDVDEPPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNSPVRYSIDRNTD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LERYFNIDANSGVITTAKSLDRETNAIHNITVLAMESQNPSQVGRGYVAITILDINDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LERYFNIDANSGVITTAKSLDRETNAIHNITVLAMESQNPSQVGRGYVAITILDINDNAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDATNNHNFSLKDNKDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDATNNHNFSLKDNKDNT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTSTLTIRVCDCDADGVAQTCNAEAYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTNTLTIRVCDCDADGVAQTCNAEAYV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 LPAGLSTGALIAILACVLTLLVLILLIVTMRRRKKEPLIFDEERDIRENIVRYDDEGGGE
:::::::::::::::::::::
CCDS82 LPAGLSTGALIAILACVLTLLGRYCFQGLL
610 620 630
>>CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs109|chr18 (801 aa)
initn: 3251 init1: 2896 opt: 3250 Z-score: 3665.4 bits: 689.1 E(33420): 7.9e-198
Smith-Waterman score: 3250; 63.1% identity (83.9% similar) in 785 aa overlap (1-780:14-795)
10 20 30 40
pF1KB5 MKLG-KVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRS-KPYFQSGRSRT
. :: .. : ...: . : . :.:: : :: :: ..::
CCDS11 MWTSGRMSNAKNWLGLGMSLYFWGLMDLTTTVLSDTPTPQGELEALLSDKP--QS-HQRT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 KRSWVWNQFFVLEEYMGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIH
::::::::::::::: :.:::::::::::.:.::::::::::::::. .: ::..:::::
CCDS11 KRSWVWNQFFVLEEYTGTDPLYVGKLHSDMDRGDGSIKYILSGEGAGIVFTIDDTTGDIH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ATKRLDREEQAYYTLRAQALDRLTNEPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEM
: .::::::.: :::::::::: :..:.::::::.::::::::::::::::::.: ::::
CCDS11 AIQRLDREERAQYTLRAQALDRRTGRPMEPESEFIIKIQDINDNEPKFLDGPYVATVPEM
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SPVGTSVVQVTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQ
:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::. :::::.::: :::::::.
CCDS11 SPVGTSVIQVTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVDSKTGVIRTALMNMDREAKEY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 YLLVIQAKDMVGQNGGLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIK
: ..:::::: :: :::.:::.:..::.::::::::::.. ::..: :: :..:.:.:.
CCDS11 YEVIIQAKDMGGQLGGLAGTTTVNITLSDVNDNPPRFPQKHYQMSVLESAPISSTVGRVF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 AADADIGANAEMEYKIVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAAN
: : : : ::::.: :::::: : ::.: . : ::::..: :.::.: ::::..:.::
CCDS11 AKDLDEGINAEMKYTIVDGDGADAFDISTDPNFQVGIITVKKPLSFESKKSYTLKVEGAN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KDADPRFLSLGPFSDTTTVKIIVEDVDEPPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPD
. :::.::::.:::::.: :::::::::: .: .:: : . .:. : ..:.:::
CCDS11 PHLEMRFLNLGPFQDTTTVHISVEDVDEPPVFEPGFYFVEVPEDVAIGTTIQIISAKDPD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 SSNSPVRYSIDRNTDLERYFNIDANSGVITTAKSLDRETNAIHNITVLAMESQNPSQVGR
.:. .::::::..: :.: .: ..:.. ::. :::: . ::::::::: .::::::
CCDS11 VTNNSIRYSIDRSSDPGRFFYVDITTGALMTARPLDREEFSWHNITVLAMEMNNPSQVGS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 GYVAITILDINDNAPEFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDA
:.: .::.::::::: ::. :::::. ::.:: .::::.:.: ::..::.::. .:
CCDS11 VPVTIKVLDVNDNAPEFPRFYEAFVCENAKAGQLIQTVSAVDQDDPRNGQHFYYSLAPEA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TNNHNFSLKDNKDNTASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTSTLTIRVCDC
.:: ::...::.:::: :::::.:::.:::::..:::.:.:::.: ::::.::::.::.:
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: :: ...:. :::.::..:: :::::::::...::::.:::..:::..:.: :.:.:..
CCDS11 DDDGHVMSCSPEAYMLPVSLSRGALIAILACIFVLLVLVLLILSMRRHRKQPYIIDDEEN
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650 660 670 680 690 700
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CCDS11 IHENIVRYDDEGGGEEDTEAFDIAAMWNPREAQAGAAPKTRQDMLPEIESLSRYVPQTCA
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: . .. .: :::.: :::.:::::: :::.:::: :::::.: .:.:.:..:.:
CCDS11 VNSTVHSYVLAKLYEADMDLWAPPFDSLQTYMFEGDGSVAGSLSSLQSATSDSEQSFDFL
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770 780
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CCDS11 TDWGPRFRKLAELYGASEGPAPLW
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20 30 40 50 60 70
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CCDS10 EPPVFSSPTYLLEVHENAALNSVIGQVTARDPDITSSPIRFSIDRHTDLERQFNINADDG
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CCDS10 ILACIILLLVIVVLFVTLRRHKNEPLIIKDDEDVRENIIRYDDEGGGEEDTEAFDIATLQ
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CCDS10 NPDGINGFLPRKDIKPDLQFMPRQGLAPVPNGVDVDEFINVRLHEADNDPTAPPYDSIQI
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CCDS10 YGYEGRGSVAGSLSSLESTTSDSDQNFDYLSDWGPRFKRLGELYSVGESDKET
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CCDS38 VGTSVVQVTATDADDPSYGNSARVIYSILQGQPYFSVEPETGIIRTALPNMNRENREQYQ
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CCDS38 QGNMQSCSAEALLLPAGLSTGALIAILLCIIILLVIVVLFAALKRQRKKEPLILSKE-DI
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CCDS38 RDNIVSYNDEGGGEEDTQAFDIGTLRNPAAIEEKKLRRDIIPETLFIPRRT-PTAPDNTD
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CCDS38 VRDFINERLKEHDLDPTAPPYDSLATYAYEGNDSIAESLSSLESGTTEGDQNYDYLREWG
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CCDS38 PRFNKLAEMYGGGESDKDS
770 780
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CCDS38 SDQDRGDGSLKYILSGDGAGDLFIINENTGDIQATKRLDREEKPVYILRAQAINRRTGRP
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CCDS38 YSILQGQPYFSVESETGIIKTALLNMDRENREQYQVVIQAKDMGGQMGGLSGTTTVNITL
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CCDS38 ITDQETQEGIITVKKLLDFEKKKVYTLKVEASNPYVEPRFLYLGPFKDSATVRIVVEDVD
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CCDS38 EPPVFSKLAYILQIREDAQINTTIGSVTAQDPDAARNPVKYSVDRHTDMDRIFNIDSGNG
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CCDS38 SIFTSKLLDRETLLWHNITVIATEINNPKQSSRVPLYIKVLDVNDNAPEFAEFYETFVCE
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CCDS38 KAKADQLIQTLHAVDKDDPYSGHQFSFSLAPEAASGSNFTIQDNKDNTAGILTRKNGYNR
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CCDS38 HEMSTYLLPVVISDNDYPVQSSTGTVTVRVCACDHHGNMQSCHAEALIHPTGLSTGALVA
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CCDS38 ILLCIVILLVTVVLFAALRRQRKKEPLIISKE-DIRDNIVSYNDEGGGEEDTQAFDIGTL
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CCDS38 RNPEAIEDNKLRRDIVPEALFLPRRT-PTARDNTDVRDFINQRLKENDTDPTAPPYDSLA
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CCDS38 TYAYEGTGSVADSLSSLESVTTDADQDYDYLSDWGPRFKKLADMYGGVDSDKDS
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CCDS38 MKITSTSCICPVLVCLCFVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQF
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CCDS38 FVLEEHMGPDPQYVGKLHSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQ
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pF1KB5 QAYYTLRAQALDRLTNEPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQ
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CCDS38 KTHYVLHAQAIDRRTNKPLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQ
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pF1KB5 VTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKD
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CCDS38 VTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKD
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pF1KB5 MVGQNGGLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGAN
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CCDS38 MAGQVGGLSGSTTVNITLTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSN
250 260 270 280 290 300
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pF1KB5 AEMEYKIVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLS
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CCDS38 ADMTYSIINGDGMGIFSISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSH
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CCDS38 LGPFKDATMLKIIVGDVDEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYF
370 380 390 400 410 420
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CCDS38 LYGEIESERTT
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CCDS38 NPEAREDSKLRRDVMPETIFQIR---RTVPLWENIDVQDFIHRRLKENDADPSAPPYDSL
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CCDS38 ATYAYEGNDSIADSLSSLESLTADCNQDYDYLSDWGPRFKKLADMYG-GDDSDRD
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CCDS38 STGALIAILLCIVILLAIVVLYVALRRQKKKDTLMTSKEDIRDNVIHYDDEGGGEEDTQA
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CCDS38 KVT
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CCDS10 DREERAQYTLMAQAVDRDTNRPLEPPSEFIVKVQDINDNPPEFLHETYHANVPERSNVGT
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CCDS10 SVIQVTASDADDPTYGNSAKLVYSILEGQPYFSVEAQTGIIRTALPNMDREAKEEYHVVI
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CCDS10 QAKDMGGHMGGLSGTTKVTITLTDVNDNPPKFPQSVYQMSVSEAAVPGEEVGRVKAKDPD
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CCDS10 KFISNGPFKDTVTVKISVEDADEPPMFLAPSYIHEVQENAAAGTVVGRVHAKDPDAANSP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]