Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5697
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5697, 660 aa
1>>>pF1KB5697 660 - 660 aa - 660 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6654+/-0.000923; mu= 17.4324+/- 0.055
mean_var=76.9584+/-14.886, 0's: 0 Z-trim(106.5): 61 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.146200
statistics sampled from 8931 (8992) to 8931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 4703 1002.0 0
CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 4369 931.5 0
CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 4193 894.4 0
CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 1901 411.0 2.9e-114
CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 705 158.6 1.8e-38
CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 ( 267) 657 148.3 1.3e-35
CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 658 148.7 1.8e-35
CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 638 144.5 3.3e-34
CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 637 144.3 3.9e-34
CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 628 142.4 1.4e-33
CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 594 135.2 2e-31
CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 574 131.0 3.8e-30
CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 ( 513) 556 127.2 5.7e-29
CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 533 122.4 1.9e-27
CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 514 118.4 3.3e-26
CCDS46512.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 ( 657) 509 117.3 6.7e-26
CCDS2400.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2176) 509 117.6 1.8e-25
CCDS77522.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2240) 509 117.6 1.8e-25
CCDS77523.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2265) 509 117.7 1.9e-25
CCDS77525.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2267) 509 117.7 1.9e-25
CCDS42813.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2296) 509 117.7 1.9e-25
CCDS46510.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2330) 509 117.7 1.9e-25
CCDS2399.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2355) 509 117.7 1.9e-25
CCDS77526.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2446) 509 117.7 2e-25
CCDS42814.1 FN1 gene_id:2335|Hs108|chr2 (2477) 509 117.7 2e-25
CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 494 114.2 5.4e-25
CCDS12708.1 ELSPBP1 gene_id:64100|Hs108|chr19 ( 223) 458 106.3 4.7e-23
CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 ( 261) 454 105.5 9.7e-23
CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 ( 488) 431 100.8 4.7e-21
CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 ( 603) 421 98.8 2.4e-20
CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 351 84.0 7.1e-16
CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 508) 346 82.9 1.2e-15
CCDS7647.1 MMP21 gene_id:118856|Hs108|chr10 ( 569) 326 78.7 2.5e-14
CCDS58333.1 SEL1L gene_id:6400|Hs108|chr14 ( 301) 266 65.9 9.4e-11
CCDS61146.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 305) 266 65.9 9.5e-11
>>CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (660 aa)
initn: 4703 init1: 4703 opt: 4703 Z-score: 5359.2 bits: 1002.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4703; 100.0% identity (100.0% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEALMARGALTGPLRALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPKTDKELAVQYLNTFYGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEALMARGALTGPLRALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPKTDKELAVQYLNTFYGC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNFFPRKPKWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNFFPRKPKWD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 IRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 WIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
610 620 630 640 650 660
>>CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (610 aa)
initn: 4369 init1: 4369 opt: 4369 Z-score: 4979.0 bits: 931.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4369; 99.8% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (51-660:1-610)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 GCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPKTDKELAVQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKF
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 FGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETV
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 DDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 VGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCS
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTT
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 EDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTAN
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 YDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKG
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 IQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 LPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAV
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660
pF1KB5 VDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
580 590 600 610
>>CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (584 aa)
initn: 4193 init1: 4193 opt: 4193 Z-score: 4778.7 bits: 894.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4193; 100.0% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (77-660:1-584)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 KELAVQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEG
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 APCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 APCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 HAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTP
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 EICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEA
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 PQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGD
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 KFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLK
520 530 540 550 560 570
650 660
pF1KB5 SVKFGSIKSDWLGC
::::::::::::::
CCDS76 SVKFGSIKSDWLGC
580
>>CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 (707 aa)
initn: 2044 init1: 1228 opt: 1901 Z-score: 2164.8 bits: 411.0 E(32554): 2.9e-114
Smith-Waterman score: 2106; 46.7% identity (68.7% similar) in 696 aa overlap (9-644:2-686)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEALMARGALTGPLR-ALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPK-TDKELAVQYLNTFY
.: :: .: .::: .. : .. ::::. . ::..:: .:: :
CCDS13 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYR-Y
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GCPK------ESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
: . :: .: .: .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::.. ..
CCDS13 GYTRVAEMRGESKSL---GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQT
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
: :: ...::: : .:. :: ..:::::::: .:: :::: :.:... .:::.:.
CCDS13 FEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:::::
CCDS13 FGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
:.:::.:.:. :..:: :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:. :::.:.::.
CCDS13 CHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSEGAPCVF
::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::: :::: : :::
CCDS13 FPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGL
::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS13 PFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB5 EHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-----------------LG
.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
CCDS13 DHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCP
410 420 430 440 450 460
460 470 480
pF1KB5 TGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFDGIAQIR
::: :: ::. : . :. .: ::.::.:
CCDS13 TGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FDAIAEIG
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYW
.....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: .: ::.: . :
CCDS13 NQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVW
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 IYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKM-DP
.:..... : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: ..::.. :: .: ::
CCDS13 VYTGASVL-G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-VKAQMVDP
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
. . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..:
CCDS13 RSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDIL
650 660 670 680 690 700
CCDS13 QCPED
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10 20 30 40 50
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: : :. .:. .: : : : :.. . : ..: .:: ..:
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10 20 30 40
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: ::. . . :..::.:::: :: ::.::...:.::::: :::..:: ::
CCDS83 TNLAGILKENAAS-SMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFP
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: ::.: ..::::..::::. :. :: .::.:::::::: :.:.::: :::::.::
CCDS83 RTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFG
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:::: ::::: .::::::: :: . :::.:::::: ::
CCDS83 IKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWT--------------------
170 180 190 200
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pF1KB5 FPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFP
:..
CCDS83 -------------------------SSS--------------------------------
210
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CCDS83 ------------------------------------------------------------
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.::.:::::::::::..::.::
CCDS83 --------------------------------------KGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHS
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.:::::: :::::: ..: : .::..::: ::: . : : :.: : ::. : .
CCDS83 KDPGALMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPG-DED----PNPK-HPKTPDKCDPS
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pF1KB5 IVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKA
. .:.:...::: ..:::::.:: . :.. .:. .::::::..:::.:: :...
CCDS83 LSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR-LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLI
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 VFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYN
.: : ..: .. . .:::: .. :::: .:....:: .. . :: .:.:.. :::.
CCDS83 FIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYD
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pF1KB5 EVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGS
.... :: .:.:: . . .: :..::: . .:. :::.: .. : . :.
CCDS83 DTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDKVDAVYE--KNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMP
410 420 430 440 450 460
660
pF1KB5 IKSDWLGC
CCDS83 ANSILWC
470
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: .:: . ::: . : : : . : .. . . : : .::. ::
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.:. : :. ::.:::::::: :: :.. .:: :.::::: ::::.:..:: .:::
CCDS83 DSETKNANSLEAKLKEMQKFFGLPITGMLNSRVIEIMQKPRCGVPDVAEYSLFPNSPKWT
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.. .::::..:: :: ::: ..:...:. ::.: .. : :::::.:.: :::
CCDS83 SKVVTYRIVSYTRDLPHITVDRLVSKALNMWGKEIPLHFRKVVWGTADIMIGFARGAHGD
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.::::: . ::::::::::.:::.:::.:: :: :
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CCDS83 SDPNAVMYPTYGNGDPQNFKLSQDDIKGIQKLYGKRSNSRKK
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.: : : . :. .:. .::...: :.
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.. ::. ...::::.:: :: ::..:.:.::::::: :::... :: :
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:: :...::::..::::: ..::.: .:..:: .:::: :::...:::::::.:. :
CCDS83 KWRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVRE
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::: ::::: ..::::.::: :..::.:::::: ::
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::
CCDS83 -----------------------------KD-----------------------------
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:.: :
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::::::::.::..:: :: .
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::: :.: : ::::::::.::: ::: :: . : :.: : :: :
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pF1KB5 QDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEE
. ::... .::::..:::: .:: . .: : ...::: :: .::.::. ...
CCDS83 PALSFDAVSTLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHL-ISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKD
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. .: ::..: .. .. :::. . .::.:: :...:::.. ....:::.:. ::.::
CCDS83 LVFIFKGNQFWAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWR
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pF1KB5 YNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKF
..: ...:.::::: ::. . .: ...::: .. : ::: :. :... .. : ..
CCDS83 FDEKRNSMEPGFPKQIAEDFPGIDSKIDAV--FEEFGFFYFFTGSSQLEFDPNAKKVTH-
420 430 440 450 460
660
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..::. ::.:
CCDS83 -TLKSNSWLNC
470
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..:.:: :::. .:. :. . : ::.
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pF1KB5 --LKK---MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRI
.:: ::::.:: :: :: .:.:.::::::: :::.... :: ::: :...::::
CCDS83 LIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRI
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pF1KB5 IGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKD
..::::: ..::.:. .:..:: .:::: :::...:::::::.:. :::: : :::
CCDS83 VNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPG
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pF1KB5 GLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCT
::::. :: :. :: :::::: ::
CCDS83 HSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWT----------------------------------
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pF1KB5 DTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTE
CCDS83 ------------------------------------------------------------
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pF1KB5 GRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGR
:: .
CCDS83 ------------EDAS--------------------------------------------
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pF1KB5 SDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIY-TY
: .::::::::.::..:: :: . ::: :.: ..
CCDS83 -------------------------GTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLYNSF
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pF1KB5 TK--NFRLSQDDIKGIQELYGASP-DIDLGTGPTPTL--GPVTPEICKQDIVFDGIAQIR
:. .:::::::..::: ::: : . . :: .. : : : . ::.:. .:
CCDS83 TELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDAISTLR
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pF1KB5 GEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWI
:: .:::::..:: .: :. : ::: :: .::.::. ... . .: :::.:
CCDS83 GEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISA-FWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFWA
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pF1KB5 YSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGF
.. .. :::. . .::.:: ....::: . ...::::.::.::.::..: ...:. ::
CCDS83 IRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQGF
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pF1KB5 PKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC
:.:::: . .. ..::: ::. : :::.:. .... .. . : ...:: :
CCDS83 PRLIADDFPGVEPKVDAV--LQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNA-RMVTHILKSNSWLHC
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:. ..:::: . : . ... .:: ::. .:
CCDS83 MKVLPASGLAVFLIMALKFSTAAPSLVAASPR--TWRNNYRLAQAYLDKYY-T
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pF1KB5 PKESCNL--FVLKDT------LKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
::. .. .: . . .:..: :::: :: :::.:.....::::: :::::: .
CCDS83 NKEGHQIGEMVARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPDVANYRL
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pF1KB5 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
:: .::: :: .:::: :::... :: : :.:.::...:: : ::..:::::::.
CCDS83 FPGEPKWKKNTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSFVRINSGEADIMIS
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pF1KB5 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
: .:::.::::: : :::::::: :.:::.:::. : ::.: .
CCDS83 FENGDHGDSYPFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTMGTN--------------
180 190 200 210
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pF1KB5 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
CCDS83 ------------------------------------------------------------
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pF1KB5 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFP
CCDS83 ------------------------------------------------------------
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pF1KB5 FTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLE
:..:: :::::::::.::
CCDS83 -----------------------------------------GFNLFTVAAHEFGHALGLA
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pF1KB5 HSQDPGALMAPIYTYTKN---FRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLG--TGP-TPTLGPVTP
:: ::.::: : : : :: :.: .::.:::: ::: . :: : : .: : :
CCDS83 HSTDPSALMYPTYKY-KNPYGFHLPKDDVKGIQALYGPRK-VFLGKPTLPHAPHHKPSIP
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 EICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEA
..: .. ::..... :...::::..:: . . : ... .:.: ..::.::.
CCDS83 DLCDSSSSFDAVTMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSFPQLMSNVDAAYEV
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 PQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGD
.. : :: : .::: . .. : :. . ..:.: ::..::: . .:: .:.::
CCDS83 AERGTAYFFKGPHYWITRGFQMQ-GPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGD
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 KFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLK
... :.: :.::. .:: . .... ..::.:.:.: . :::.: : ....
CCDS83 EYYSYDERKRKMEKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAVELNG--YIYFFSGPKTYKYDTEKED
420 430 440 450 460 470
650 660
pF1KB5 SVKFGSIKSD-WLGC
:. .::. :.::
CCDS83 VVSV--VKSSSWIGC
480
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pF1KB5 MEALMARGALTGPLRALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPKTDKELAVQYLNTFYGC
:: ::. .:.. :. . . :.. .. .::. :::
CCDS73 MKFLLILLLQATASGALPLNS--STSLEKNNVLFGERYLEKFYGL
10 20 30 40
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pF1KB5 -----P----KESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYN
: : : :: .:. ...::.:.:: ::.:: .:.: :. :::: ::: ..
CCDS73 EINKLPVTKMKYSGNL--MKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFR
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