FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5688, 695 aa
1>>>pF1KB5688 695 - 695 aa - 695 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4406+/-0.00102; mu= 6.4721+/- 0.061
mean_var=217.3980+/-42.800, 0's: 0 Z-trim(110.5): 47 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.086985
statistics sampled from 11640 (11680) to 11640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 695) 4603 591.1 1.8e-168
CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 522) 2511 328.5 1.6e-89
CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 751) 2511 328.6 2.1e-89
CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 761) 2511 328.6 2.1e-89
CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 763) 2092 276.0 1.4e-73
CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 695) 1916 253.9 5.8e-67
CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 660) 1860 246.8 7.3e-65
CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 639) 1629 217.8 3.8e-56
CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 752) 1287 175.0 3.6e-43
CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 746) 989 137.6 6.4e-32
CCDS33523.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 751) 989 137.6 6.5e-32
CCDS46639.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 714) 959 133.8 8.5e-31
CCDS13576.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 770) 959 133.8 9e-31
CCDS32997.1 APLP1 gene_id:333|Hs108|chr19 ( 651) 802 114.1 6.8e-25
>>CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (695 aa)
initn: 4603 init1: 4603 opt: 4603 Z-score: 3138.0 bits: 591.1 E(32554): 1.8e-168
Smith-Waterman score: 4603; 100.0% identity (100.0% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB5 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
670 680 690
>>CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (522 aa)
initn: 2511 init1: 2511 opt: 2511 Z-score: 1720.8 bits: 328.5 E(32554): 1.6e-89
Smith-Waterman score: 3051; 75.1% identity (75.1% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
:::::::::::::::
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLV---------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
CCDS44 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
CCDS44 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 --------PPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
140 150 160 170 180
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
190 200 210 220 230 240
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
250 260 270 280 290 300
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
310 320 330 340 350 360
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
370 380 390 400 410 420
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
430 440 450 460 470 480
670 680 690
pF1KB5 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
490 500 510 520
>>CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (751 aa)
initn: 4588 init1: 2510 opt: 2511 Z-score: 1718.7 bits: 328.6 E(32554): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 4347; 92.2% identity (92.3% similar) in 727 aa overlap (25-695:25-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EITHDVK-----------------------------------------------------
:::::::
CCDS44 EITHDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVC
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ---VPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVG
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVD
670 680 690 700 710 720
670 680 690
pF1KB5 PMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
730 740 750
>>CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (761 aa)
initn: 4388 init1: 2510 opt: 2511 Z-score: 1718.6 bits: 328.6 E(32554): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 4280; 92.0% identity (92.2% similar) in 716 aa overlap (36-695:46-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 TAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLCRLGPGRGRAFFKWRCLPASVDRGNPLWALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEAD
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHD
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VK--------------------------------------------------------VP
:: .:
CCDS58 VKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKAMIP
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKA
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPR
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLS
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPF
560 570 580 590 600 610
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEE
620 630 640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 RESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTP
680 690 700 710 720 730
670 680 690
pF1KB5 EERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
740 750 760
>>CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (763 aa)
initn: 3712 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 1434.4 bits: 276.0 E(32554): 1.4e-73
Smith-Waterman score: 4199; 90.5% identity (90.6% similar) in 727 aa overlap (1-659:1-727)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EITHDVK-----------------------------------------------------
:::::::
CCDS84 EITHDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVC
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ---VPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KAMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590
pF1KB5 PFHPFPALPENE------------GSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PFHPFPALPENEDTQPELYHPMKKGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690
pF1KB5 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
:::::::
CCDS84 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
730 740 750 760
>>CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (695 aa)
initn: 1541 init1: 1214 opt: 1916 Z-score: 1315.6 bits: 253.9 E(32554): 5.8e-67
Smith-Waterman score: 2230; 51.1% identity (75.6% similar) in 709 aa overlap (15-694:5-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
: ::::.. :: :: . .::: .::::::::::.::
CCDS13 MLPGLALLLLAAWTARALEV-----PTDGNAGL---LAEPQIAMFCGRLN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .
CCDS13 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 KQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQG
::::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: ..
CCDS13 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYK
.:..::::::::.:.:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . :: : .
CCDS13 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SEFPTEADLEDFTEAAVDE--DDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDG
.. :. :. .:. .: ::::.:.:.:: :. . :. : : ..
CCDS13 DKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTT
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TMSDKEITHDVKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKK
: . . . . :.:: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .
CCDS13 TTTTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRM
:::::: ::::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.
CCDS13 EWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVM
:::::..:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..::::
CCDS13 ALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVM
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KB5 THLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------D
:::.:: :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :.: :
CCDS13 THLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGND
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 QFTASISETPVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAE
. :..:: . :. :..: : ... :.: : :: ::: : . . :.
CCDS13 ALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPA----AD
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 EKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLL
. . . .. :. .: .:: : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.
CCDS13 RGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLM
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 VIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLE
: .:.:::::::.::::.:.:: .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..:
CCDS13 VGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFE
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 QMQI
:::
CCDS13 QMQN
>>CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (660 aa)
initn: 1500 init1: 1173 opt: 1860 Z-score: 1277.9 bits: 246.8 E(32554): 7.3e-65
Smith-Waterman score: 2174; 51.3% identity (76.6% similar) in 670 aa overlap (54-694:1-659)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 TAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFET
::::.::::.:.:.:::. ::.:::.:..:
CCDS56 MFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 KEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSD
:: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::::.. :: :..:::::::::
CCDS56 KEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSD
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 VLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYV
.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. .:..::::::::.:.:.:.:.:
CCDS56 ALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFV
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB5 CCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDE--DD
::: .. .:.. . :::. . . :: : ... :. :. .:. .: ::
CCDS56 CCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDD
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 EDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKVPPTPLPTND-
::.:.:.:: :. . :. : : .. : . . . . :.:: : : :
CCDS56 EDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTTTTTTESVEEVVRVPTTAASTPDA
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQH
:: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: ::::::::.....:::
CCDS56 VDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQH
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 FQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQAL
:: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..:::. ::::..... :
CCDS56 FQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNML
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 RRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYV
..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.:: :: ::::::::.:: :
CCDS56 KKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAV
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530
pF1KB5 AQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISETPVDVR---VSSEES
:.:::.:.:::::... :.: : . :..:: . :. :..: :
CCDS56 AEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFS
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 -EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVK
... :.: : :: ::: : . .:.. . . .. :. .: .::
CCDS56 LDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 EMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYG
: . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.::
CCDS56 -MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYT
570 580 590 600 610
660 670 680 690
pF1KB5 TISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
.: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..::::
CCDS56 SIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
620 630 640 650 660
>>CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (639 aa)
initn: 1269 init1: 942 opt: 1629 Z-score: 1121.4 bits: 217.8 E(32554): 3.8e-56
Smith-Waterman score: 1943; 50.2% identity (75.4% similar) in 631 aa overlap (93-694:19-638)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQ
:.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::
CCDS46 MLPGLALLLLAAWTARALEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQ
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 CKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. .
CCDS46 CKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTN
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYKSE
:..::::::::.:.:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . :: : ...
CCDS46 LHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDK
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FPTEADLEDFTEAAVDE--DDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTM
:. :. .:. .: ::::.:.:.:: :. . :. : : .. :
CCDS46 VVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTTTT
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SDKEITHDVKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEW
. . . . :.:: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .::
CCDS46 TTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREW
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMAL
:::: ::::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.::
CCDS46 EEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLAL
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTH
:::..:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..::::::
CCDS46 ENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTH
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510
pF1KB5 LHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQF
:.:: :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :.: : .
CCDS46 LRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDAL
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 TASISETPVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEK
:..:: . :. :..: : ... :.: : :: ::: : . . :..
CCDS46 MPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPA----ADRG
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 VINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVI
. . .. :. .: .:: : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.:
CCDS46 LTTRPGSGLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVG
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 AVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQM
.:.:::::::.::::.:.:: .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..:::
CCDS46 GVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQM
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 QI
:
CCDS46 QN
>>CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (752 aa)
initn: 1812 init1: 1181 opt: 1287 Z-score: 888.6 bits: 175.0 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 2119; 49.2% identity (72.1% similar) in 728 aa overlap (47-694:29-751)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTG
.::::::::::.::::.:.:.:::. ::.:
CCDS56 MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKSR--FVTPFKCL
::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::::.. :: :..::
CCDS56 TKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQ
:::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. .:..::::::::.:.
CCDS56 VGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDK
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KB5 FHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLE
:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . : :: : .: :..:
CCDS56 FRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVE
180 190 200 210 220 230
250 260 270
pF1KB5 DFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED-----------------------RD--------
. :: :::::: :::.:: :. :.
CCDS56 E-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAET
240 250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KB5 ---------YYYDTFKGD---------DYNEEN-PTEP------GSDGTMSDKEITHD--
.:.:. .: :..: :: :: ..: . :..
CCDS56 GPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAMSQSLLKTTQEPL
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ----VKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
::.: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .::::::
CCDS56 ARDPVKLPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAE
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
::::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::.
CCDS56 RQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYI
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
.:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.::
CCDS56 TALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVI
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
:: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :. :.. : :.: .. .
CCDS56 YERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEP---RISYGNDALM
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KB5 PPFHPFHP-FPALPEN-EGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIF
: . . :: : : : : .::. :..:. ... .: ...:. .
CCDS56 PSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENE-GSGLTNIKTEEISEVKM
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 NAE--RVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTI
.:: . .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.:: .:
CCDS56 DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSI
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690
pF1KB5 SHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
::.:::: .:::::::.:::..::::::::..::::
CCDS56 HHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
720 730 740 750
>>CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (746 aa)
initn: 1911 init1: 925 opt: 989 Z-score: 686.5 bits: 137.6 E(32554): 6.4e-32
Smith-Waterman score: 2124; 48.2% identity (71.9% similar) in 745 aa overlap (30-694:8-745)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
:. .:. . .....:. .::::::::::.::
CCDS56 MDQLEDLLVLFINYVPTDGNAGL-LAEPQIAMFCGRLN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .
CCDS56 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB5 KQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQG
::::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: ..
CCDS56 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEE
.:..::::::::.:.:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . : :
CCDS56 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270
pF1KB5 DYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED-----------------
: : .: :..:. :: :::::: :::.:: :.
CCDS56 DKVVEVAEEEEVAEVEE-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTE
220 230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KB5 ------RD-----------------YYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDV-
:. .:.:. .: :. .... .: :
CCDS56 SVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVC
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 --KVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQA
.: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: ::
CCDS56 GSAIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQA
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAAL
::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..::
CCDS56 KNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITAL
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEER
:. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.:: ::
CCDS56 QAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYER
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520
pF1KB5 RNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISET
::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :.: : . :..::
CCDS56 MNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTET
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 PVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNK
. :. :..: : ... :.: : :: ::: : . .:.. . . ..
CCDS56 KTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGS
580 590 600 610 620 630
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 VDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATV
:. .: .:: : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.::::
CCDS56 GLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATV
640 650 660 670 680 690
650 660 670 680 690
pF1KB5 IVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
:::.::::.:.:: .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..::::
CCDS56 IVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
700 710 720 730 740
695 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 04:04:39 2016 done: Fri Nov 4 04:04:40 2016
Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]