Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5678
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5678, 778 aa
1>>>pF1KB5678 778 - 778 aa - 778 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4518+/-0.00137; mu= -7.3141+/- 0.082
mean_var=397.2435+/-81.173, 0's: 0 Z-trim(111.4): 86 B-trim: 129 in 1/50
Lambda= 0.064350
statistics sampled from 12303 (12382) to 12303 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 5454 521.4 2.2e-147
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 5347 511.5 2.3e-144
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 1493 153.6 1.1e-36
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 1493 153.6 1.1e-36
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 1493 153.6 1.1e-36
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 1331 138.7 4.6e-32
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 1331 138.8 5.8e-32
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 1208 127.1 8.5e-29
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 1147 121.6 6e-27
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 1120 118.7 1.5e-26
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 1120 119.0 2.7e-26
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 830 92.1 3.7e-18
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 830 92.1 3.7e-18
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 741 84.0 1.6e-15
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 704 80.5 1.4e-14
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 689 78.6 1.6e-14
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 676 77.4 3.8e-14
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 602 70.6 4.6e-12
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 593 69.8 9.1e-12
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 577 68.3 2.4e-11
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 567 67.4 4.6e-11
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 565 67.3 6.1e-11
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 560 66.7 6.9e-11
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 560 66.7 7.2e-11
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 554 66.1 1e-10
>>CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX (778 aa)
initn: 5454 init1: 5454 opt: 5454 Z-score: 2759.4 bits: 521.4 E(32554): 2.2e-147
Smith-Waterman score: 5454; 100.0% identity (100.0% similar) in 778 aa overlap (1-778:1-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAASPQSSQPPTAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAASPQSSQPPTAN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQAHNAKDVPNTQPKAAFKSQNATPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQAHNAKDVPNTQPKAAFKSQNATPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPNAAYDFSQAATTGELAANKSEMAFKAQNATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANSRPKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPNAAYDFSQAATTGELAANKSEMAFKAQNATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANSRPKTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQADIETDPGISEPDGATAQTSADGSQAQNLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQADIETDPGISEPDGATAQTSADGSQAQNLES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB5 GDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
730 740 750 760 770
>>CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX (834 aa)
initn: 5347 init1: 5347 opt: 5347 Z-score: 2705.3 bits: 511.5 E(32554): 2.3e-144
Smith-Waterman score: 5347; 100.0% identity (100.0% similar) in 763 aa overlap (16-778:72-834)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TLCDPPYSQLRDPPAVLSCYCTPLGASPAPAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQA
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 TAAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQAHNAKDVPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TAAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQAHNAKDVPN
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 TQPKAAFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAANKSEMAFKAQNATTKVGPNATYNFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TQPKAAFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAANKSEMAFKAQNATTKVGPNATYNFSQ
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQADIETDPGISEPDGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQADIETDPGISEPDGAT
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 AQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQ
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 NPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPAWQNPVAWQNPVIWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPAWQNPVAWQNPVIWP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWP
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQP
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 RDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFG
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 IQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEA
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 LRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKM
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 KVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPW
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 SWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGTASANF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGTASANF
770 780 790 800 810 820
770
pF1KB5 AANFGAIGFFWVE
:::::::::::::
CCDS35 AANFGAIGFFWVE
830
>>CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX (739 aa)
initn: 1781 init1: 1457 opt: 1493 Z-score: 772.3 bits: 153.6 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 1516; 41.1% identity (60.6% similar) in 771 aa overlap (8-764:63-711)
10 20 30
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQIS
: :: .. : .. .: :::.::.:..
CCDS48 GNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 EAPPTNQATAAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQA
.:. ::: . . .. ..:. : ...::::: .::. :. . :
CCDS48 PETLANE-TAARAANVARAAASNRAA--RAAAAAAR--TAFSQVVASHR---------VA
100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB5 HNAKDVPNTQPKA-AFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAA-------NKSEMAFKAQ
. .::: . : ..:. ::. : :. . :: .:...:: .:. . ::
CCDS48 TPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAPEAPATSAQSQTGSPAQ
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 NATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQ
.:.:. ::... :::. : .. .::.: : . ::. :: .. . ::
CCDS48 EAATE-GPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDF------TQPAGVSGMAF--
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 ADIETDPGISEPDGATAQTSA-DGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRA
: ..: : :: .: .: .: .:: . .
CCDS48 ------PRPKRP--APAQEAATEGPSA-------------------------ASGVPQTG
250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQT
: : .: : ::.. ..: .: : .: :: .: . :...
CCDS48 P---GREVAATRPKTTKSG-----KALAKT--RWVEP---QNVVAAAAAKAKMATSI---
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 PPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQT
:.: : .. : .. : : .:
CCDS48 ----------------PEP---------------EGAAA---ATAQHSAEPWARMGGKRT
330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 PPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNL
. . .... . : .:: : :. : .: : : .
CCDS48 KKSKHLDDEYESSEEERETP--AVPPTWR-------------ASQPSLTVRAQLAPRPPM
350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDV
: .. :.. ::.:.::::::::::::::.::: :.::::..::.:.:::: .
CCDS48 APR-SQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEH
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 YPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILG
.::::::: ..:::::::.:::::::::::::. : .: : .:: :::::.:.:::::::
CCDS48 FPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPP
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:::::::.:...::::::
CCDS48 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPP
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 EYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARA
:::::::::. ::::::.::::::. :.::::.: :.:.::.:.:. ..:. :: .:::
CCDS48 EYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARA
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 EARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQ-----NAR
. :..:.:::::. : ::::::. :::::::.::::: :.::::.::::::: :
CCDS48 QMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRA
640 650 660 670 680 690
750 760 770
pF1KB5 SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
.: :: : .: ::..
CCDS48 NRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ
700 710 720 730
>>CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX (739 aa)
initn: 1781 init1: 1457 opt: 1493 Z-score: 772.3 bits: 153.6 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 1516; 41.1% identity (60.6% similar) in 771 aa overlap (8-764:63-711)
10 20 30
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQIS
: :: .. : .. .: :::.::.:..
CCDS35 GNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 EAPPTNQATAAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQA
.:. ::: . . .. ..:. : ...::::: .::. :. . :
CCDS35 PETLANE-TAARAANVARAAASNRAA--RAAAAAAR--TAFSQVVASHR---------VA
100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB5 HNAKDVPNTQPKA-AFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAA-------NKSEMAFKAQ
. .::: . : ..:. ::. : :. . :: .:...:: .:. . ::
CCDS35 TPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAPEAPATSAQSQTGSPAQ
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 NATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQ
.:.:. ::... :::. : .. .::.: : . ::. :: .. . ::
CCDS35 EAATE-GPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDF------TQPAGVSGMAF--
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 ADIETDPGISEPDGATAQTSA-DGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRA
: ..: : :: .: .: .: .:: . .
CCDS35 ------PRPKRP--APAQEAATEGPSA-------------------------ASGVPQTG
250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQT
: : .: : ::.. ..: .: : .: :: .: . :...
CCDS35 P---GREVAATRPKTTKSG-----KALAKT--RWVEP---QNVVAAAAAKAKMATSI---
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 PPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQT
:.: : .. : .. : : .:
CCDS35 ----------------PEP---------------EGAAA---ATAQHSAEPWARMGGKRT
330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 PPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNL
. . .... . : .:: : :. : .: : : .
CCDS35 KKSKHLDDEYESSEEERETP--AVPPTWR-------------ASQPSLTVRAQLAPRPPM
350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDV
: .. :.. ::.:.::::::::::::::.::: :.::::..::.:.:::: .
CCDS35 APR-SQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEH
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 YPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILG
.::::::: ..:::::::.:::::::::::::. : .: : .:: :::::.:.:::::::
CCDS35 FPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPP
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:::::::.:...::::::
CCDS35 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPP
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 EYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARA
:::::::::. ::::::.::::::. :.::::.: :.:.::.:.:. ..:. :: .:::
CCDS35 EYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARA
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 EARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQ-----NAR
. :..:.:::::. : ::::::. :::::::.::::: :.::::.::::::: :
CCDS35 QMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRA
640 650 660 670 680 690
750 760 770
pF1KB5 SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
.: :: : .: ::..
CCDS35 NRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ
700 710 720 730
>>CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX (741 aa)
initn: 1781 init1: 1457 opt: 1493 Z-score: 772.3 bits: 153.6 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 1516; 41.1% identity (60.6% similar) in 771 aa overlap (8-764:63-711)
10 20 30
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQIS
: :: .. : .. .: :::.::.:..
CCDS14 GNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 EAPPTNQATAAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPNGVYDFSQA
.:. ::: . . .. ..:. : ...::::: .::. :. . :
CCDS14 PETLANE-TAARAANVARAAASNRAA--RAAAAAAR--TAFSQVVASHR---------VA
100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB5 HNAKDVPNTQPKA-AFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAA-------NKSEMAFKAQ
. .::: . : ..:. ::. : :. . :: .:...:: .:. . ::
CCDS14 TPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAPEAPATSAQSQTGSPAQ
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 NATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQ
.:.:. ::... :::. : .. .::.: : . ::. :: .. . ::
CCDS14 EAATE-GPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDF------TQPAGVSGMAF--
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 ADIETDPGISEPDGATAQTSA-DGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRA
: ..: : :: .: .: .: .:: . .
CCDS14 ------PRPKRP--APAQEAATEGPSA-------------------------ASGVPQTG
250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQT
: : .: : ::.. ..: .: : .: :: .: . :...
CCDS14 P---GREVAATRPKTTKSG-----KALAKT--RWVEP---QNVVAAAAAKAKMATSI---
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 PPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQT
:.: : .. : .. : : .:
CCDS14 ----------------PEP---------------EGAAA---ATAQHSAEPWARMGGKRT
330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 PPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNL
. . .... . : .:: : :. : .: : : .
CCDS14 KKSKHLDDEYESSEEERETP--AVPPTWR-------------ASQPSLTVRAQLAPRPPM
350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDV
: .. :.. ::.:.::::::::::::::.::: :.::::..::.:.:::: .
CCDS14 APR-SQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEH
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 YPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILG
.::::::: ..:::::::.:::::::::::::. : .: : .:: :::::.:.:::::::
CCDS14 FPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPP
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:::::::.:...::::::
CCDS14 VIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPP
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 EYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARA
:::::::::. ::::::.::::::. :.::::.: :.:.::.:.:. ..:. :: .:::
CCDS14 EYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARA
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 EARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQ-----NAR
. :..:.:::::. : ::::::. :::::::.::::: :.::::.::::::: :
CCDS14 QMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRA
640 650 660 670 680 690
750 760 770
pF1KB5 SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
.: :: : .: ::..
CCDS14 NRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
700 710 720 730 740
>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034 aa)
initn: 1353 init1: 1322 opt: 1331 Z-score: 689.1 bits: 138.7 E(32554): 4.6e-32
Smith-Waterman score: 1331; 61.9% identity (81.5% similar) in 336 aa overlap (443-775:24-354)
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQ
: . : : : .: : : :::::.::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGR---RP--APPRDVAILQ
10 20 30 40
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEID
::::::::::..:: ::.:::::.::::.:.:: . .::::::: ..::: : ..:::::
CCDS59 ERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEID
50 60 70 80 90 100
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 KEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLR
:. ::::::: :: ::::::::::::::::.:::.:::::::.:::::.::.:::.:::
CCDS59 KQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLR
110 120 130 140 150 160
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 PGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIA
::::: :.:..:::.: ::::::::.:.::::: ::::::.:::::::::::::::.:
CCDS59 PGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFAC
170 180 190 200 210 220
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEF
.:::.::.::..:. ::.. ..: .:.::::::::::..::::.:::.:::.:::...
CCDS59 RVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDI
230 240 250 260 270 280
720 730 740 750 760
pF1KB5 ELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTF---AGPIIGPGGTASANFAANF
. :: .: :: .. :::. : . :: ..:: . .: :. : . :: .: .
CCDS59 DCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAP
290 300 310 320 330 340
770
pF1KB5 GAIGFFWVE
.. : :
CCDS59 SSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSF
350 360 370 380 390 400
>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431 aa)
initn: 1400 init1: 1322 opt: 1331 Z-score: 687.3 bits: 138.8 E(32554): 5.8e-32
Smith-Waterman score: 1365; 38.9% identity (61.8% similar) in 790 aa overlap (15-775:33-751)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEA--PP-
:.:.. :::.:::.::. : . : : ::
CCDS43 RRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDPPV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB5 --------TNQAT----AAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPN
:..: . :.: . :.:::.: . .:: .... : .
CCDS43 VNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIA-------TNKPKITWQALNLPV----
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 GVYDFSQAHNAKDVPNTQPKAAFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAANKSE---MAF
. ..::: . .: ::: . : .: :: : . :. : . . : . .
CCDS43 -ITQISQALPTTEVTNTQAS----SVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQL
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KB5 KAQNATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANS-------RPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQN
:. . :. : . :. . ::. :.: .:: :: . ..:: .. :...
CCDS43 KSPLQVLKL-PVISQNIHAPI-ANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSL
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 VNQA-KMATSQADIETDPGISEPDGATAQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVE
. : . ::.:..: .. . . .:. .:. .:.:.. ...: . :..:. :::
CCDS43 AATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKK-ASKARKTIAKVI--NTDTEHIEALNVT
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 ENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPP
. .. . . . .: .: .....: .. . . ..::: : . ::. :
CCDS43 DAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSV--SEISEAPLATQIVT---NQALAATLR
290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 ARQSPPARQTPPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPP
.... ::. : . : .. . :: . : : :
CCDS43 VKRGSRARK---AATKARATESQT--PNADQGAQAKI---------------ASAQTNVS
340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 GWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPD
. .: :. . :. : :. . : : . .:
CCDS43 ALET----QVAAAVQALAD-----DYL--AQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGD------
380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 WQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEML
: . : : : .: : : :::::.::::::::::::..:: ::.:::::.::
CCDS43 ---ERSGSNYRRIPWGR---RP--APPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDML
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 RDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTP
::.:.:: . .::::::: ..::: : ..::::::. ::::::: :: :::::::::::
CCDS43 RDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTP
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 KLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLD
:::::.:::.:::::::.:::::.::.:::.:::::::: :.:..:::.: ::::::::.
CCDS43 KLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLE
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 YRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALD
:.::::: ::::::.:::::::::::::::.: .:::.::.::..:. ::.. ..:
CCDS43 YKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAA
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 AAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARY
.:.::::::::::..::::.:::.:::.:::.... :: .: :: .. :::. : . ::
CCDS43 VAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARA
660 670 680 690 700 710
740 750 760 770
pF1KB5 HQNARSRFPQTF---AGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
..:: . .: :. : . :: .: . .. : :
CCDS43 QENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSN
720 730 740 750 760 770
CCDS43 TASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSF
780 790 800 810 820 830
>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX (606 aa)
initn: 1352 init1: 759 opt: 1208 Z-score: 630.5 bits: 127.1 E(32554): 8.5e-29
Smith-Waterman score: 1224; 60.6% identity (80.4% similar) in 327 aa overlap (449-771:257-571)
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKL
: . . ..::.: : :::::::: ::: :
CCDS14 RRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQGRANDL
230 240 250 260 270 280
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 VKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLY
::::. :: ::.:::::.::.:::.::::::::::::: . ::: ::::::::::..:::
CCDS14 VKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLY
290 300 310 320 330 340
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 ILISTPESL-AGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRH
::.:: : :::::::::.::::::.:.:..:::::::.::::.::.:::.:::::..:
CCDS14 ILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGIHH
350 360 370 380 390 400
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 PLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKR
:.::..::.: :::::::::: ::::::::::::.::::::.::::::::.: .:::.
CCDS14 SLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKK
410 420 430 440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIG--DEAVSGPWSWDDIEFELL
::..:.::. :: . : : :::::.:::: :.::::: .: ..:: .::
CCDS14 DPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWD-------
470 480 490 500 510
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 TWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNAR-SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGF
:.:.: ::.. . :. . .:. : .: :. . ...:::. ...:.:
CCDS14 ----EADIG-PWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGAS
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 FWVE
CCDS14 LTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
580 590 600
>>CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (962 aa)
initn: 1173 init1: 1142 opt: 1147 Z-score: 597.2 bits: 121.6 E(32554): 6e-27
Smith-Waterman score: 1147; 62.1% identity (83.0% similar) in 282 aa overlap (497-775:1-282)
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 DVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGI
::::.:.:: . .::::::: ..::: : .
CCDS59 MLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
10 20 30
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 QLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEAL
.::::::. ::::::: :: ::::::::::::::::.:::.:::::::.:::::.::.:
CCDS59 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
40 50 60 70 80 90
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 RKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMK
::.:::::::: :.:..:::.: ::::::::.:.::::: ::::::.:::::::::::::
CCDS59 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
100 110 120 130 140 150
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 VLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWS
::.: .:::.::.::..:. ::.. ..: .:.::::::::::..::::.:::.:::.
CCDS59 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
160 170 180 190 200 210
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 WDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTF---AGPIIGPGGTASA
:::.... :: .: :: .. :::. : . :: ..:: . .: :. : . ::
CCDS59 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
220 230 240 250 260 270
770
pF1KB5 NFAANFGAIGFFWVE
.: . .. : :
CCDS59 SFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAH
280 290 300 310 320 330
>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 1151 init1: 1116 opt: 1120 Z-score: 590.2 bits: 118.7 E(32554): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 1120; 69.6% identity (86.6% similar) in 247 aa overlap (443-689:24-265)
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PPDWPLPTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQ
: . : : : .: : : :::::.::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGR---RP--APPRDVAILQ
10 20 30 40
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEID
::::::::::..:: ::.:::::.::::.:.:: . .::::::: ..::: : ..:::::
CCDS59 ERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEID
50 60 70 80 90 100
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 KEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLR
:. ::::::: :: ::::::::::::::::.:::.:::::::.:::::.::.:::.:::
CCDS59 KQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLR
110 120 130 140 150 160
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 PGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIA
::::: :.:..:::.: ::::::::.:.::::: ::::::.:::::::::::::::.:
CCDS59 PGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFAC
170 180 190 200 210 220
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEF
.:::.::.::..:. ::.. ..: .:.::::::::
CCDS59 RVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLINCSSPSHGAKVH
230 240 250 260 270 280
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 ELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAI
CCDS59 PWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM
290 300
778 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:45:40 2016 done: Thu Nov 3 22:45:40 2016
Total Scan time: 4.370 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]