Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5677, 337 aa
1>>>pF1KB5677 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9777+/-0.000805; mu= 13.3687+/- 0.049
mean_var=82.6127+/-16.460, 0's: 0 Z-trim(109.4): 57 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.141108
statistics sampled from 10817 (10875) to 10817 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 2275 472.5 2.1e-133
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 1565 328.0 6.8e-90
CCDS74295.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 240) 1077 228.6 4.1e-60
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 981 209.1 4.3e-54
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 981 209.2 5e-54
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 981 209.2 5.4e-54
CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 654 142.5 4.3e-34
CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 ( 397) 623 136.3 4.2e-32
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 413 93.4 2e-19
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 413 93.5 2.6e-19
CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 397) 413 93.5 3.1e-19
CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 426) 413 93.5 3.3e-19
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 376 85.9 4.2e-17
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 376 85.9 4.8e-17
CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16 ( 412) 371 85.0 1.2e-16
CCDS7316.2 DNAJB12 gene_id:54788|Hs108|chr10 ( 409) 370 84.8 1.4e-16
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 361 82.9 3.8e-16
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 348 80.2 1.9e-15
CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7 ( 223) 343 79.1 3.7e-15
CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 453) 347 80.1 3.8e-15
CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 480) 347 80.1 4e-15
CCDS45317.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 370) 335 77.6 1.7e-14
CCDS34035.1 DNAJB14 gene_id:79982|Hs108|chr4 ( 379) 313 73.1 4e-13
CCDS4214.1 DNAJC18 gene_id:202052|Hs108|chr5 ( 358) 307 71.9 8.8e-13
CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3 ( 358) 290 68.5 9.7e-12
CCDS45678.1 DNAJC7 gene_id:7266|Hs108|chr17 ( 438) 281 66.7 4.1e-11
CCDS45677.1 DNAJC7 gene_id:7266|Hs108|chr17 ( 494) 281 66.7 4.5e-11
CCDS13546.1 DNAJC5 gene_id:80331|Hs108|chr20 ( 198) 270 64.2 9.9e-11
CCDS6183.1 DNAJC5B gene_id:85479|Hs108|chr8 ( 199) 270 64.3 1e-10
>>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa)
initn: 2275 init1: 2275 opt: 2275 Z-score: 2508.5 bits: 472.5 E(32554): 2.1e-133
Smith-Waterman score: 2275; 99.7% identity (99.7% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 REIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMGGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 REIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMGGGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDH
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CCDS68 ISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGLPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB5 PKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
310 320 330
>>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa)
initn: 1150 init1: 1150 opt: 1565 Z-score: 1727.3 bits: 328.0 E(32554): 6.8e-90
Smith-Waterman score: 1565; 66.0% identity (84.9% similar) in 344 aa overlap (1-335:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
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CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPGAEEKFKEIAEAYDVLSDPRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 REIYDQFGEEGLKGG--AGGTDG--QGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRM
:::.:..:::::::. .::. : .: .: ::::::::: :: :::: :::. :::.:
CCDS12 REIFDRYGEEGLKGSGPSGGSGGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDTFFGQRN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GGGRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYP-----RDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEI
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CCDS12 G----EEGMDID-DPFSGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHDLRVSLEEI
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADI
::::::.::::.:::: ::.: :.::::::::.::: :::::::::.:::.: :.:::::
CCDS12 YSGCTKKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRR
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CCDS12 VFVLKDKPHNIFKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB5 RIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
.. : :::.::.:..::::.::::: ::. : ..:. ::.. ::
CCDS12 KVPGEGLPLPKTPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI
300 310 320 330 340
>>CCDS74295.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (240 aa)
initn: 1051 init1: 1051 opt: 1077 Z-score: 1192.7 bits: 228.6 E(32554): 4.1e-60
Smith-Waterman score: 1077; 64.6% identity (84.0% similar) in 243 aa overlap (98-335:2-239)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMGGGRDSEEMEI
:: :::: :::. :::.: : : :.:
CCDS74 MFAEFFGGRNPFDTFFGQRNG----EEGMDI
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DGDPFSAFGFSMNGYP-----RDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKIS
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CCDS74 D-DPFSGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKIS
30 40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDHPK
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CCDS74 HKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNI
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGLPFPK
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CCDS74 FKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRRKVPGEGLPLPK
150 160 170 180 190 200
310 320 330
pF1KB5 NPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
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CCDS74 TPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI
210 220 230 240
>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa)
initn: 1563 init1: 894 opt: 981 Z-score: 1084.7 bits: 209.1 E(32554): 4.3e-54
Smith-Waterman score: 1552; 63.8% identity (83.9% similar) in 348 aa overlap (1-337:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
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CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 REIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGR----RM
: .:::.:::::: :.: . :..:.:.::::::::::::.::::::::.:::. :
CCDS35 RGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB5 GGGRDSEEMEIDGD--PFSAFG-FSMNGYPRD-RNS---VGPSRLKQDPPVIHELRVSLE
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CCDS35 FSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPA
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CCDS35 EIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGM
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CCDS35 DIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKPGT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KB5 RRRIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
.:. : :::::: : :::::..::.: ::: .. .....:..::: :
CCDS35 VKRLRGEGLPFPKVPTQRGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQILKQHLPCS
310 320 330 340
>>CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (420 aa)
initn: 1563 init1: 894 opt: 981 Z-score: 1083.4 bits: 209.2 E(32554): 5e-54
Smith-Waterman score: 1552; 63.8% identity (83.9% similar) in 348 aa overlap (1-337:73-420)
10 20 30
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALK
:::::: :::: .::....:::::::.:::
CCDS47 QLEPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 FHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTF
.:::::: :.:::::::.::::.:::::::: .:::.:::::: :.: . :..:.:.:::
CCDS47 YHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTF
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140
pF1KB5 HGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGR----RMGGGRDSEEMEIDGD--PFSAFG-FSMNGYP
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CCDS47 HGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLS
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190
pF1KB5 RD-RNS---VGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKI
: : . . : : :::::.::::::::::: : ::::::.:.::: :::. :.::::
CCDS47 RGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKI
230 240 250 260 270 280
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLR
: : ::.: :::::::::.::: ::..:::::::..::: : .:.:::.:..:.: :::.
CCDS47 LHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLK
290 300 310 320 330 340
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 EALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEFEVSFP
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CCDS47 EALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKPGTVKRLRGEGLPFPKVPTQRGDLIVEFKVRFP
350 360 370 380 390 400
320 330
pF1KB5 DTISSSSKEVLRKHLPAS
: .. .....:..::: :
CCDS47 DRLTPQTRQILKQHLPCS
410 420
>>CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (462 aa)
initn: 1563 init1: 894 opt: 981 Z-score: 1082.8 bits: 209.2 E(32554): 5.4e-54
Smith-Waterman score: 1552; 63.8% identity (83.9% similar) in 348 aa overlap (1-337:115-462)
10 20 30
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALK
:::::: :::: .::....:::::::.:::
CCDS47 QLEPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALK
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 FHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTF
.:::::: :.:::::::.::::.:::::::: .:::.:::::: :.: . :..:.:.:::
CCDS47 YHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTF
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140
pF1KB5 HGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGR----RMGGGRDSEEMEIDGD--PFSAFG-FSMNGYP
:::::::::.::::::::.:::. : .: : ..:..: : ::.::: :..::
CCDS47 HGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KB5 RD-RNS---VGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKI
: : . . : : :::::.::::::::::: : ::::::.:.::: :::. :.::::
CCDS47 RGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKI
270 280 290 300 310 320
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLR
: : ::.: :::::::::.::: ::..:::::::..::: : .:.:::.:..:.: :::.
CCDS47 LHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLK
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 EALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEFEVSFP
::::::..:.::.::: ::. ::..::: .:. : :::::: : :::::..::.: ::
CCDS47 EALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKPGTVKRLRGEGLPFPKVPTQRGDLIVEFKVRFP
390 400 410 420 430 440
320 330
pF1KB5 DTISSSSKEVLRKHLPAS
: .. .....:..::: :
CCDS47 DRLTPQTRQILKQHLPCS
450 460
>>CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1077 init1: 623 opt: 654 Z-score: 725.5 bits: 142.5 E(32554): 4.3e-34
Smith-Waterman score: 1004; 46.1% identity (72.3% similar) in 336 aa overlap (1-334:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
::.::: .::: ... : .::.:::. ::: :: :.. :.. : :...::::.::::: :
CCDS82 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 REIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGG--TFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMGG
: :::.::::::::: :. : :.::: :. .: ::::.::: ::
CCDS82 RGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFF------
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKR
:.: :.: . :: ...: : . :::: : ..: .:::... ::::.
CCDS82 --DAEGSEVDLN----FG-GLQGR-------GVK--KQDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKK
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDK
.::::. :: :: : .::::::..: : ..::.::: .:::. :: :::::.::.:.:
CCDS82 IKISRRVLNEDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGL
::.:.:...:.... : : .:: :...: ::: : . . .:::..: . ... : :.
CCDS82 LHPRFRRENDNLFFVNPIPLGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGM
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pF1KB5 PFPKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
:.:..: ..:::.: :...:: .. ..:..::. :
CCDS82 PLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPTRLTPQKKQMLRQALLT
280 290 300 310
>>CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 (397 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS65 KKRELYDKGGEQAIKEG-----GAGGGF-----GSPMDIFDMFFGGGGRMQRERRGKNVV
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. . . . ..:. . .. . : . : . .. : :.. :..: :
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...... : .: .: .:.. . . . .::. : ::: ..: :: :.: ::::
CCDS65 MVQQIQSVCME--CQGHGERISPKDRCKSCNGRKIVREKKILEVHIDKGMKDGQKITFHG
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CCDS65 EGDQEPGLEPGDIIIVLDQKDHAVFTRRGEDLFMCMDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIV
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.. . .::: : . ... :.:. . : ..: :.:::.:.::.. .: .. .:.: :
CCDS65 ITSHPGQIVKHGDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVNFPENGFLSPDKLSLLEKLL
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PAS
:
CCDS65 PERKEVEETDEMDQVELVDFDPNQERRRHYNGEAYEDDEHHPRGGVQCQTS
350 360 370 380 390
>>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (241 aa)
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10 20 30 40 50
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: ::: : : : :. . :. :::: .:.:
CCDS47 EDFFGNRRGP-RGSRS-RGTGSFFSAF----SGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLT
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170 180 190 200 210 220
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CCDS47 SFSSTSFGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGKE
180 190 200 210 220 230
>>CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 274 init1: 200 opt: 413 Z-score: 460.2 bits: 93.5 E(32554): 2.6e-19
Smith-Waterman score: 433; 51.3% identity (69.7% similar) in 152 aa overlap (4-143:3-148)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKN--KSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDP
::: .::... :: ::::::::: :::.::::: .. .::.:::.::::::::::
CCDS59 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDA
10 20 30 40 50
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pF1KB5 KKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTF-HGDPHATFAAFFGGSNPF---------
:::.:::..:.:::.::.:: . . :.. : .: .: :::: .::
CCDS59 KKRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 EIFFGRRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSL
: ::: : : : :. . :. :::: .:.:
CCDS59 EDFFGNRRGP-RGSRS-RGTGSFFSAF----SGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGRKEGTKITFPREGDETPNSIP
CCDS59 SFSSTSFGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]