Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5676
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5676, 806 aa
1>>>pF1KB5676 806 - 806 aa - 806 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7325+/- 0.001; mu= 13.7638+/- 0.061
mean_var=94.1788+/-18.721, 0's: 0 Z-trim(106.6): 58 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.132159
statistics sampled from 9038 (9096) to 9038 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 3.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 5315 1024.2 0
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 1812 356.3 1.3e-97
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 1045 210.0 1.5e-53
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 759 155.6 5.4e-37
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 745 152.9 3.6e-36
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 703 144.7 3.1e-34
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 689 142.0 1.8e-33
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 689 142.0 1.9e-33
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 681 140.5 4.9e-33
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 681 140.5 5.8e-33
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 678 139.9 8e-33
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 674 139.3 2.5e-32
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 665 137.5 7e-32
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 665 137.5 7.7e-32
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 665 137.6 7.9e-32
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 665 137.6 8.7e-32
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 654 135.3 1.8e-31
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 654 135.4 2e-31
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 643 133.3 9.7e-31
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 640 132.7 1.3e-30
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 641 133.0 1.9e-30
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 636 132.0 2.4e-30
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 635 131.9 6.3e-30
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 635 131.9 6.6e-30
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 584 122.1 3.2e-27
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 584 122.1 3.3e-27
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 584 122.1 3.5e-27
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 554 116.3 1.2e-25
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 544 114.4 4.2e-25
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 540 113.7 1e-24
CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 540 113.7 1.1e-24
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 522 110.2 7.8e-24
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 499 105.9 2.1e-22
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 499 105.9 2.2e-22
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 495 105.0 2.3e-22
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 483 102.8 2.2e-21
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 478 101.9 3.5e-21
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 421 91.0 7.9e-18
CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 412 89.2 1.8e-17
CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 354 78.1 2.5e-14
>>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa)
initn: 5315 init1: 5315 opt: 5315 Z-score: 5476.1 bits: 1024.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5315; 100.0% identity (100.0% similar) in 806 aa overlap (1-806:1-806)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLK
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CCDS65 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 INQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 INQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGG
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB5 AGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG
::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG
790 800
>>CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 (893 aa)
initn: 1762 init1: 707 opt: 1812 Z-score: 1865.8 bits: 356.3 E(32554): 1.3e-97
Smith-Waterman score: 1816; 44.9% identity (75.3% similar) in 639 aa overlap (118-738:255-883)
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 VRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGN-LFEVYLKP-----YFLE
:::: . . ... :..: .: .::
CCDS37 ETSSLELSLQLSQLDLEDTQIPTSRSTPYKPIDDRITNKASDVLLDVTQSPGDGSGLMLE
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190
pF1KB5 A-------YRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKV-VETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKRED
.. :.:. :.. : ..:.. .. . . . ... : .. : :
CCDS37 EVTGLKCNFESAREGNEQLTEE-ERLLKFSIGAKCNTDTFYFISSTTRVNFT-EIDKNSK
290 300 310 320 330 340
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 EEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTL
:... .: :: ::: .:: :.:..::::..: :::. :. :::.:::::::::::.
CCDS37 EQDNQFKVTYDMIGGLSSQLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTM
350 360 370 380 390 400
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 IARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKR
::::::::.::. .::::::.::. ::.:..::. : :: :.:::::::::. :::
CCDS37 IARAVANEVGAYVSVINGPEIISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKR
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 EKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRA---HVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIG
: ...:::.:.:..:::::::. ... .:.:..:::::...: :::: ::::.:..::
CCDS37 EGAQNEVEKRVVASLLTLMDGIGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIG
470 480 490 500 510 520
380 390 400 410 420
pF1KB5 IPDATGRLEILQIHTKNM-KLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDL
.:.: ::.::: . . .: ...: :.:: .::.::::: .::.::.: :.:. .
CCDS37 VPNAQDRLDILQKLLRRVPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRR---I
530 540 550 560 570
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKREL
. . . :..: . . .:. :: :... :::.:: ...::.:.: ::::::..: .:
CCDS37 LKKQPNLPDVKVAGLVKITLKDFLQAMNDIRPSAMREIAIDVPNVSWSDIGGLESIKLKL
580 590 600 610 620 630
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 QELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLT
.. :..:..::..:...:. : ::::.::::::.::..:::.::: ::..::::::..
CCDS37 EQAVEWPLKHPESFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAIKGPELMN
640 650 660 670 680 690
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMD
. :::: ::: : ::: .:: ..::::::..: ::...: .:..::::. :.:::::
CCDS37 KYVGESERAVRETFRKARAVAPSIIFFDELDALAVERGSSLG-AGNVADRVLAQLLTEMD
700 710 720 730 740 750
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKD
:. :.: :..:::::: :: :..::::.:..::.:::: .: :.: .... ::...
CCDS37 GIEQLKDVTILAATNRPDRIDKALMRPGRIDRIIYVPLPDAATRREIFKLQFHSMPVSNE
760 770 780 790 800 810
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 VDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVP
:::. : .:...:::... .:..: ::..:.:.... .:. :.. . .:
CCDS37 VDLDELILQTDAYSGAEIVAVCREAALLALEEDIQANLIMKRHFTQALSTVTPR----IP
820 830 840 850 860 870
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 EIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGG
: : .:.
CCDS37 ESLRRFYEDYQEKSGLHTL
880 890
>>CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 (980 aa)
initn: 374 init1: 374 opt: 1045 Z-score: 1074.8 bits: 210.0 E(32554): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 1046; 31.6% identity (61.4% similar) in 712 aa overlap (81-756:290-971)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKY
..:..: ..... . :. : : .
CCDS48 GPLGEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGSIAPEDKGSCSLLPGP--PF
260 270 280 290 300 310
120 130 140 150
pF1KB5 GKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLV---------RGG----
....:. ... . .:: .. : .: . : ...::.. : .:.
CCDS48 ARELHIEIVSSPHYSTNGN-YDGVLYRHF-QIPRVVQEGDVLCVPTIGQVEILEGSPEKL
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KB5 --MRAVEFKVVET------DP-SPYCIVAPDTVIHCEGE---PIKREDEEESLNEVGYDD
: . ::: .: : : : . : .. : :. ::: . .
CCDS48 PRWREMFFKVKKTVGEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSP
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 IGGCRKQLAQIKEMVEL--PLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETG
: : ..:. . : .:. :.. ..:: :::: ::: .. :. .. :
CCDS48 PG----LEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTS---SVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLG
440 450 460 470 480
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 AFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVER-
.. . . .. .: :..:. : .:.. ::.... .: .. :. :: :
CCDS48 LHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGL-GEDARV
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 -RIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEIL
.. .:: : :.. ..:.:.:.: ... :: . . : .:... . :: ::
CCDS48 MAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDL-PADVQTA-FPHELEVPALSEGQRLSIL
550 560 570 580 590 600
390 400 410 420 430
pF1KB5 QIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAAL---CSEAALQAIRKKMDLIDLEDETID
. : .. :...:.: :.: . : : .:: :: :.:: :... : .:
CCDS48 RALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEG
610 620 630 640 650 660
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 AEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETV--VEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYP
.. . .:: :: : . .: ..: ..:.:.:.:.:::..::.:. : .: :
CCDS48 ELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQ-TAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLP
670 680 690 700 710 720
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 VEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESE
.:::. .:..:. : :.:..:::: ::::::::.:.::. .:.:.:::::..:. :.::
CCDS48 LEHPE-LLSLGLRRS-GLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSE
730 740 750 760 770 780
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 ANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKN
::::.: .:: ::::..:::::::.: .:: . ::.::. :::..:.:.:.::. . ..
CCDS48 ENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRS-GDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQD
790 800 810 820 830 840
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 VFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPL-PDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDL-EF
::.::::::::..:::.:::::.:.:... :. :.. .:.: :: . .:.: .
CCDS48 VFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNV
850 860 870 880 890 900
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 LAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRD
: ..:::: .:. : :... ... :. . . ::. . .:
CCDS48 LDCCPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDL---EEGLEPGSSALMLTMED--------
910 920 930 940 950
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 HFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGS
.. : :. . :::.... .:.
CCDS48 LLQAAARL-QPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
960 970 980
>>CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390 aa)
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160 170 180 190 200 210
pF1KB5 GGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQ
: . : . . : .:..:: ...:
CCDS63 RSRNRAINRCLPLNFRKDELKGIYKDRMKIGASLADVDPMQLDSSVRFDSVGGLSNHIAA
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 IKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETG-----AFFFLIN
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CCDS63 LKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKRVAFFMRK
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 GPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLT
: . .:: .:::: .:: :..: . :.:::.::.:..:: : . . ... ::: ::.
CCDS63 GADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLA
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL
::::: .:....:..:::: .:::::::: :::::: ...:: .: :::.:::.. .
CCDS63 LMDGLDSRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWNP
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440
pF1KB5 AD-DVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTM
:. ::..:.. :. :::. ..:.:::: :.:... : .: .. . ..:. ..
CCDS63 KPLDTFLEELAENCVGYCGADIKSICAEAALCALRRRYPQIYTTSEKLQLD-LSSINISA
620 630 640 650 660 670
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 DDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMT
::. :... :.. :
CCDS63 KDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEALQRVFPHAEFRTNKTLD
680 690 700 710 720 730
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pF1KB5 SPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALF
: .:.::: ... .:::: .:: .: .:
CCDS46 AEDLASGILRERVKVGASLADVDPMNIDKSVRFDSIGGLSHHIHALKEMVVFPLLYPEIF
370 380 390 400 410 420
240 250 260 270 280
pF1KB5 KAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETG-----AFFFLINGPEIMSKLAGESESN
. . ..:::: :.::::::::::.:::.::: . . ::. .: . .:: .:::: .
CCDS46 EKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKKVAFFMRKGADCLSKWVGESERQ
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMA
:: :..: :.:::.::.:..:: : . . ... ::: ::.::::: .:....:..
CCDS46 LRLLFDQAYLMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDNRGEIVVIG
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350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTK--NMKLADDVDLEQVANET
:::: .:::::::: :::::: ...:: .: .::::::. : ::.: : ..:..
CCDS46 ATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFNLPDQKARKHILQIHTRDWNPKLSDAF-LGELAEKC
550 560 570 580 590 600
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 HGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSA
:. :::. :::.:::: :.:... : .. .. .: .:.... .:: :... :..
CCDS46 VGYCGADIKALCTEAALIALRRRYPQIYASSHKLQLDV-SSIVLSAQDFYHAMQNIVPAS
610 620 630 640 650 660
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 LRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCG
:
CCDS46 QRAVMSSGHALSPIIRPLLERSFNNILAVLQKVFPHAEISQSDKKEDIETLILEDSEDEN
670 680 690 700 710 720
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pF1KB5 VANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQ
..:: :.. ... ... : .: .. .
CCDS57 PLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHI
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 SNPSALRETVV-----EVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKG
: . ::. : :.::. :.:: .. ..:.:.:. :. ::..:...:. : ::
CCDS57 PLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKG
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 VLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCV
::..:::: :::: :.:.::. .: :: . : ::. . ::. :::.:. :: :.
CCDS57 VLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACL
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 LFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAI
.::::.:.:. :: . . : . ..:.. ......::.. . :. .. :::::: .:::.
CCDS57 IFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPAL
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 LRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQR
.::::::. : . ::: ..:. :.: . :. : .:. .:.::.. . .::.. .: .
CCDS57 MRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTE
340 350 360 370 380 390
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 ACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIR
: .:::
CCDS57 AGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN
400 410 420 430
>>CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (398 aa)
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340 350 360 370 380 390
pF1KB5 KQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTK--NMKLADD
:... . : . :. :: . . : :.
CCDS56 MELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLL
10 20 30 40 50
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 VDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDA-EVMNSLAVTMDDF
. :. .: ..:: . :. .. .: .. . .. :..:: .: . :.. .
CCDS56 REELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRND
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 RWALSQSNPSALRETV----VE-VPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFG
..: . :. . : :: ::. :.: ::::. .:..:... ::.::. : .:
CCDS56 SYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALG
120 130 140 150 160 170
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 MTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKAR
.. ::::.::::: ::::::.:.:.. . .:: ..: ::. ..::. :::.: ::
CCDS56 IAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAR
180 190 200 210 220 230
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 QAAPCVLFFDELDSIAKAR--GGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNR
. :: ..:.::.:::...: ::. ::. ..:.. ..:...::. . ::. .: ::::
CCDS56 EHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDS--EVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNR
240 250 260 270 280
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 PDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGA
::.: :.:::::.:. : .: :.:..:. ::: . :: ... ..:. .:.. : :::
CCDS56 IDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAELMPGASGA
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 DLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARR
.. .: .: :.::
CCDS56 EVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
350 360 370 380 390
>>CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 681 init1: 656 opt: 689 Z-score: 714.1 bits: 142.0 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 689; 35.8% identity (67.9% similar) in 346 aa overlap (366-701:30-373)
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 KQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTK--NMKLADD
:... . : . :. :: . . : :.
CCDS11 MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLL
10 20 30 40 50
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 VDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDA-EVMNSLAVTMDDF
. :. .: ..:: . :. .. .: .. . .. :..:: .: . :.. .
CCDS11 REELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRND
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 RWALSQSNPSALRETV----VE-VPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFG
..: . :. . : :: ::. :.: ::::. .:..:... ::.::. : .:
CCDS11 SYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALG
120 130 140 150 160 170
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 MTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKAR
.. ::::.::::: ::::::.:.:.. . .:: ..: ::. ..::. :::.: ::
CCDS11 IAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAR
180 190 200 210 220 230
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 QAAPCVLFFDELDSIAKAR--GGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNR
. :: ..:.::.:::...: ::. ::. ..:.. ..:...::. . ::. .: ::::
CCDS11 EHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDS--EVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNR
240 250 260 270 280 290
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 PDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGA
::.: :.:::::.:. : .: :.:..:. ::: . :: ... ..:. .:.. : :::
CCDS11 IDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAELMPGASGA
300 310 320 330 340 350
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 DLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARR
.. .: .: :.::
CCDS11 EVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
360 370 380 390 400
>>CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 (367 aa)
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pF1KB5 IFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCR
:. . .:. . :. . : ::::
CCDS81 YVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLD
60 70 80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLIN
.:. .::: ::::: :: .. .:.:::.:..:::::::::::.:.::::.:.: :. .
CCDS81 NQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVV
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320
pF1KB5 GPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTH--GEVE-RRIVSQ
: :...: :.. . .:. :. ::..::.:.::::.:::. :: .. :: : .: . .
CCDS81 GSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 LLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKN
::. .::. .:. : :. :::: ...:::: : ::.::.... .:: . .:.::::.
CCDS81 LLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSR
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 MKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAV
: ::::: :... :::. :.:.::.:.:.:.. . ::
CCDS81 MTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 TMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFG
CCDS81 EGTPEGLYL
360
>>CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 (440 aa)
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pF1KB5 IFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCR
:. . .:. . :. . : ::::
CCDS32 YVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLD
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLIN
.:. .::: ::::: :: .. .:.:::.:..:::::::::::.:.::::.:.: :. .
CCDS32 NQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVV
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320
pF1KB5 GPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTH--GEVE-RRIVSQ
: :...: :.. . .:. :. ::..::.:.::::.:::. :: .. :: : .: . .
CCDS32 GSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLE
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 LLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKN
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CCDS32 LLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSR
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 MKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAV
: ::::: :... :::. :.:.::.:.:.:.. . ::
CCDS32 MTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQ
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 TMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFG
CCDS32 EGTPEGLYL
440
806 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:58:20 2016 done: Thu Nov 3 17:58:20 2016
Total Scan time: 3.560 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]