Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5666, 967 aa
1>>>pF1KB5666 967 - 967 aa - 967 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5131+/-0.00108; mu= 20.1828+/- 0.066
mean_var=65.8430+/-12.865, 0's: 0 Z-trim(102.2): 29 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.158059
statistics sampled from 6805 (6825) to 6805 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10356.1 ANPEP gene_id:290|Hs108|chr15 ( 967) 6426 1475.0 0
CCDS4124.1 LVRN gene_id:206338|Hs108|chr5 ( 990) 1964 457.5 5.8e-128
CCDS9004.1 TRHDE gene_id:29953|Hs108|chr12 (1024) 1822 425.2 3.3e-118
CCDS3691.1 ENPEP gene_id:2028|Hs108|chr4 ( 957) 1380 324.4 6.9e-88
CCDS82149.1 NPEPPS gene_id:9520|Hs108|chr17 ( 915) 1285 302.7 2.2e-81
CCDS45721.1 NPEPPS gene_id:9520|Hs108|chr17 ( 919) 1285 302.7 2.2e-81
CCDS47250.1 ERAP1 gene_id:51752|Hs108|chr5 ( 941) 1231 290.4 1.1e-77
CCDS4085.1 ERAP1 gene_id:51752|Hs108|chr5 ( 948) 1231 290.4 1.2e-77
CCDS43346.1 LNPEP gene_id:4012|Hs108|chr5 (1011) 1209 285.4 3.9e-76
CCDS4087.1 LNPEP gene_id:4012|Hs108|chr5 (1025) 1209 285.4 4e-76
CCDS4086.1 ERAP2 gene_id:64167|Hs108|chr5 ( 960) 1051 249.3 2.6e-65
>>CCDS10356.1 ANPEP gene_id:290|Hs108|chr15 (967 aa)
initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426 Z-score: 7909.9 bits: 1475.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6426; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
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CCDS10 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
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CCDS10 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHP
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CCDS10 EFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLI
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CCDS10 KDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYL
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CCDS10 TYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYSKG
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CCDS10 GADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYSKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRDIM
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CCDS10 ASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRDIM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 NRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDY
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CCDS10 NRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 WLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQ
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CCDS10 WLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
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CCDS10 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYNEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
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CCDS10 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
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CCDS10 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
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CCDS10 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 LIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQ
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CCDS10 LIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQ
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 WFTENSK
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CCDS10 WFTENSK
>>CCDS4124.1 LVRN gene_id:206338|Hs108|chr5 (990 aa)
initn: 1231 init1: 689 opt: 1964 Z-score: 2410.8 bits: 457.5 E(32554): 5.8e-128
Smith-Waterman score: 1991; 35.6% identity (65.8% similar) in 1006 aa overlap (2-966:6-990)
10 20 30 40
pF1KB5 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQE-----------KNKNANSSP
..:::.:.....: : .: . .. .:...:.. .. .:.:::
CCDS41 MGPPSSSGFYVSRAVALLLAGLVAALLLALAVLAALYGHCERVPPSELPGLRDLEAESSP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB5 VASTTPSASATTNPASATTLDQSKA---------WNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPN
:. : .:.:: : . . :.. ::: : : : . : : : :.
CCDS41 PLRQKPTP--TPKPSSARELAVTTTPSNWRPPGPWDQLRLPPWLVPLHYDLELWPQLRPD
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 D--RGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVG----GSQPPDI
. : : : .. : ::. ...:: . .. . . :.: : : .
CCDS41 ELPAGSLPFTGRVNITVRCTVATSRLLLHSLFQDCERAEVRGPLSPGTGNATVGRVP--V
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB5 DKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDL-AGFYRSEYMEGNVRKVVAT
: . .. :::.:..:. : :.::.. : : . .:: :.. . : . . :... .
CCDS41 DDVWFALDTEYMVLELSEPLKPGSSYELQLSFSGLVKEDLREGLFLNVYTDQGERRALLA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 TQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPK-GPSTPLPEDPN---WN
.:.. . :: ::::::::.:: ::::.:: . .::::: :: : : :: : :.
CCDS41 SQLEPTFARYVFPCFDEPALKATFNITMIHHPSYVALSNM-PKLGQSEK--EDVNGSKWT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 VTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPIL
:: : :::.: :::.::.. ..:.:.. . : :::::: .::: : .:.:::.::::.
CCDS41 VTTFSTTPHMPTYLVAFVICDYDHVNR-TERGKEIRIWARKDAIANGSADFALNITGPIF
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 NFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTV
.:. .. : :::.: :.::.:. :::::::. . :..::..: .. . .: . :
CCDS41 SFLEDLFNISYSLPKTDIIALPSFDNHAMENWGLMIFDESGLLLEPKDQLTEKKTLISYV
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 IAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMA
..::..:::::::::..:::..::::::::: :. .: .: .... : .. ..
CCDS41 VSHEIGHQWFGNLVTMNWWNNIWLNEGFASYFEFEVINYFNPKLPRNEIFFSNILHNILR
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLH
: .. .. . ...: ..:.:::: ..::::::. :::: ::.: .: ..: :::.
CCDS41 EDHALVTRAVAMKVENFKT-SEIQELFDIFTYSKGASMARMLSCFLNEHLFVSALKSYLK
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 TFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRS-IQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQE
::.:.:. .:: :.: :....: . ::.:...::. :: : ::::::...:::...::
CCDS41 TFSYSNAEQDDLWRHFQMAIDDQSTVILPATIKNIMDSWTHQSGFPVITLNVSTGVMKQE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 HFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDVRAQ---NDLFSTSGNEWVL
: :. .: : . : .::::: :..: : :: : .. . : : ..::.
CCDS41 PFYLENIKNRTLLTS-NDTWIVPILWIKNGTTQPLVWL-DQSSKVFPEMQVSDSDHDWVI
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 LNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQIINDAFNLASAHKVPVTLALN
::::.:::::::::. .:.:.. ::..: .:::::.: :.:.:::.:.. . . . ::.
CCDS41 LNLNMTGYYRVNYDKLGWKKLNQQLEKDPKAIPVIHRLQLIDDAFSLSKNNYIEIETALE
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730
pF1KB5 NTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRS--EVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNN
: .: :: . . :...: .: :. . . ..:. .: :: :... .. . ..
CCDS41 LTKYLAEEDEIIVWHTVLVNLVTRDLVSEVNIYDIYSLLKRYLLKRLNLIWNIY---STI
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 WREIPENLMDQYNEVNAIS----TACSNGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRST
:: :.:.: . .. ::: :. .: .. . :: .:...:.:. .: ....
CCDS41 IRENVLALQDDYLALISLEKLFVTACWLGLEDCLQLSKELFAKWVDHPENEIPYP-IKDV
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800 810 820 830 840 850
pF1KB5 VYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIR
: : .:: :...:::. . . :.: .: .: :..:::. ::::::. :... . .
CCDS41 VLCYGIALGSDKEWDILLNTYTNTTNKEEKIQLAYAMSCSKDPWILNRYMEYAISTSPFT
830 840 850 860 870 880
860 870 880 890 900 910
pF1KB5 KQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYEL
... :. : .... .:. .. ::. .::. . . : :. :. ::: .. : .:. ..
CCDS41 SNE-TNIIEVVASSEVGRYVAKDFLVNNWQAVSKRY--GTQSLINLIYTIGRTVTTDLQI
890 900 910 920 930 940
920 930 940 950 960
pF1KB5 QQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWFTENSK
.:.:: .. : ..: :.... :.: : . ... :. .:.
CCDS41 VELQQFFSNMLEEHQRIRVHANLQTIKNE--NLKNKKLSARIA-AWLRRNT
950 960 970 980 990
>>CCDS9004.1 TRHDE gene_id:29953|Hs108|chr12 (1024 aa)
initn: 1670 init1: 599 opt: 1822 Z-score: 2235.6 bits: 425.2 E(32554): 3.3e-118
Smith-Waterman score: 1959; 35.2% identity (66.7% similar) in 947 aa overlap (34-962:95-1018)
10 20 30 40 50
pF1KB5 GFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSS---PVASTTPSASATT-NP
: ..:..:... : :. . : ..:. .:
CCDS90 FDECGASATPGADGGPSGFPERGGNGSLPGSARRNHHAGGDSWQPEAGGVASPGTTSAQP
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 ASATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDV
: . . :.. :: . ::: : . : .. ..:.: .:...:..::
CCDS90 PSEEEREPWEPWTQLRLSGHLKPLHYNLMLTAFMEN-----FTFSGEVNVEIACRNATRY
130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMD
...:.... : .. . :. : . : :. ::: :. .: . .:..
CCDS90 VVLHASRVAVEKVQ---LAEDRAFGAVP--VAGFFLYPQTQVLVVVLNRTLDAQRNYNLK
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIH
... . ..: ::.:: :. . :. ...::.. . :::.::::::: .:: :.:.. :
CCDS90 IIYNALIENELLGFFRSSYVLHGERRFLGVTQFSPTHARKAFPCFDEPIYKATFKISIKH
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 PKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVL
.:::: : : . :. .: . .: :: :::: ::. . .: : : ...::.
CCDS90 QATYLSLSNM-P--VETSVFEEDGWVTDHFSQTPLMSTYYLAWAICNFTYRETTTKSGVV
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGL
.:..:::.:: : :::::..: ...:. .. .:: ::: : ...: .:::::::
CCDS90 VRLYARPDAIRRGSGDYALHITKRLIEFYEDYFKVPYSLPKLDLLAVPKHPYAAMENWGL
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VTYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEY
. :. .:.:: :: : :. ::.::. :::::.::: ::.:.::.:::: : :.
CCDS90 SIFVEQRILLDPSVSSISYLLDVTMVIVHEICHQWFGDLVTPVWWEDVWLKEGFAHYFEF
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LGADYAEPTWNLKDLMVLNDV-YRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYS
.:.:: : ::.. :.:: ..:: .:.::::::.: .:. ..:...:: :.:.
CCDS90 VGTDYLYPGWNMEKQRFLTDVLHEVMLLDGLASSHPVS---QEVLQATDIDRVFDWIAYK
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRD
:::...:::..:....::..:: .:: : :. .::. :.::.. :. . .....
CCDS90 KGAALIRMLANFMGHSVFQRGLQDYLTIHKYGNAARNDLWNTLSEALK-RNGKY-VNIQE
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IMNRWTLQMGFPVITVDTSTGT-----LSQEHFLLD--PDSNVTRPSEFNYVWIVPITSI
.:..::::::.::::. .: . ..:.::. : ... . .. .:.: .:.: .
CCDS90 VMDQWTLQMGYPVITILGNTTAENRIIITQQHFIYDISAKTKALKLQNNSYLWQIPLTIV
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640
pF1KB5 RDGRQQQD----YWLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQ
.:.. . :. . .. . . . :.: :.: :::.::::: .::: . ::
CCDS90 VGNRSHVSSEAIIWVSNKSEHHRITYLDKGSWLLGNINQTGYFRVNYDLRNWRLLIDQLI
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 RDHSAIPVINRAQIINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKL
:.: .. : ::: .:.:::.:: : .: .. :. .: ::....::.:: .: .
CCDS90 RNHEVLSVSNRAGLIDDAFSLARAGYLPQNIPLEIIRYLSEEKDFLPWHAASRALYPLDK
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 MFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYNEV--NAISTACSNGV
..:: : :. ...:. :::. .:.. ::. . :..:. ..: ::: :
CCDS90 LLDRMENYNIFNEYILKQVATTYIKLGWPKNNFNGSLVQASYQHEELRREVIMLACSFGN
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 PECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEA
.:....: :...:. . : : : :.:. :::.... :. :.: : .:...: :.:
CCDS90 KHCHQQASTLISDWI-SSNRNRIPLNVRDIVYCTGVSLLDEDVWEFIWMKFHSTTAVSEK
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CCDS45 P---SAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV
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