Result of FASTA (omim) for
pF1KB5649
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5649, 739 aa
1>>>pF1KB5649 739 - 739 aa - 739 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4008+/-0.000544; mu= 19.5950+/- 0.034
mean_var=70.8511+/-14.934, 0's: 0 Z-trim(106.1): 82 B-trim: 387 in 1/55
Lambda= 0.152371
statistics sampled from 14141 (14198) to 14141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16
Scan time: 9.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000103 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60671 ( 739) 4777 1060.4 0
XP_016864680 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60 ( 739) 4777 1060.4 0
NP_998778 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 2142 481.2 6.3e-135
NP_071325 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 2142 481.2 6.3e-135
NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exc ( 764) 1296 295.2 6.5e-79
XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chlo ( 764) 1296 295.2 6.5e-79
NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b ( 685) 1111 254.5 1e-66
XP_011514472 (OMIM: 604943,613865) PREDICTED: pres ( 744) 1111 254.6 1.1e-66
NP_945350 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform a ( 744) 1111 254.6 1.1e-66
NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Ho ( 780) 1091 250.2 2.4e-65
XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 780) 1091 250.2 2.4e-65
NP_602298 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 740) 991 228.2 9.6e-59
NP_001035544 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 738) 982 226.2 3.8e-58
NP_599025 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 758) 982 226.2 3.8e-58
NP_075062 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 759) 982 226.2 3.9e-58
NP_001269285 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 656) 966 222.6 3.9e-57
NP_439897 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 656) 966 222.6 3.9e-57
NP_599028 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 663) 959 221.1 1.1e-56
NP_996767 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform c ( 516) 919 212.3 4.1e-54
XP_011507424 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 627) 884 204.6 1e-51
XP_011507423 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 702) 884 204.6 1.1e-51
NP_443166 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 791) 884 204.7 1.2e-51
NP_599152 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 887) 884 204.7 1.3e-51
NP_001161434 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 712) 832 193.2 3.1e-48
NP_001268662 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 651) 803 186.8 2.4e-46
NP_001308716 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 653) 798 185.7 5.1e-46
NP_001268661 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 723) 795 185.1 8.8e-46
XP_016865724 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 970) 695 163.2 4.6e-39
NP_443193 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 970) 695 163.2 4.6e-39
NP_001180405 (OMIM: 606766,608480) testis anion tr ( 970) 695 163.2 4.6e-39
XP_016867807 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 754) 689 161.8 9.4e-39
XP_006716088 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 423) 679 159.4 2.7e-38
XP_011507426 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 466) 669 157.3 1.3e-37
NP_602297 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 224) 598 141.5 3.6e-33
NP_001269286 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 355) 543 129.5 2.3e-29
NP_619732 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 865) 539 128.9 8.9e-29
XP_016879996 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 444 107.9 1.3e-22
XP_006721896 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 444 107.9 1.3e-22
XP_016879995 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 677) 444 107.9 1.4e-22
XP_016879994 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 696) 444 107.9 1.4e-22
NP_996768 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform d ( 335) 403 98.7 4.1e-20
NP_775897 (OMIM: 610117) sodium-independent sulfat ( 606) 272 70.1 3.1e-11
NP_001159819 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 272 70.1 3.1e-11
NP_001159820 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 272 70.1 3.1e-11
NP_001159821 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 272 70.1 3.1e-11
XP_011522956 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 259 67.1 1.7e-10
XP_011522955 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 259 67.1 1.7e-10
XP_011522954 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 465) 259 67.1 1.8e-10
XP_011512596 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 944) 257 66.9 4.4e-10
>>NP_000103 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,606718) s (739 aa)
initn: 4777 init1: 4777 opt: 4777 Z-score: 5673.5 bits: 1060.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4777; 99.9% identity (99.9% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSI
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pF1KB5 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
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490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
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pF1KB5 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQIKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
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610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
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670 680 690 700 710 720
pF1KB5 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
:::::::::::::::::::
NP_000 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
730
>>XP_016864680 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,606718 (739 aa)
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Smith-Waterman score: 4777; 99.9% identity (99.9% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
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pF1KB5 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
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pF1KB5 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
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pF1KB5 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
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pF1KB5 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
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pF1KB5 NLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSI
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pF1KB5 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
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pF1KB5 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
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pF1KB5 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
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pF1KB5 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQIKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
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pF1KB5 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
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pF1KB5 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
:::::::::::::::::::
XP_016 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
730
>>NP_998778 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion transpor (701 aa)
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Smith-Waterman score: 2162; 48.4% identity (78.5% similar) in 678 aa overlap (56-719:17-687)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 GIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKA
..::. . ...:.. .: .:.:: .
NP_998 MDESPEPLQQGRGPVPVRRQRPAPRGLREMLKARLWCSCSCSVLCV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 KNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSF
. .. .::. .:: .: .. . :::::::..::.::::.:::::::: .:.:.:::::
NP_998 RALVQDLLPATRWLRQYRPREYLAGDVMSGLVIGIILVPQAIAYSLLAGLQPIYSLYTSF
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 FASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLN
::..::::.:::::.:::::..::::.:..:::::: ::.: .... . : .:.::: .
NP_998 FANLIYFLMGTSRHVSVGIFSLLCLMVGQVVDRELQLAGFDPSQDGLQPG--ANSSTLNG
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 HTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQVGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTIL
.. : ..:::: :....:...:.::: :: ...::::.:::. ::.::. ::: :::
NP_998 SAAMLDCGRDCYAIRVATALTLMTGLYQVLMGVLRLGFVSAYLSQPLLDGFAMGASVTIL
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKTNLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHF
::: :.:::. .:: .: : .. ::. ..:. ..:.::..:: .:: ::: .:::....
NP_998 TSQLKHLLGVRIPRHQGPGMVVLTWLSLLRGAGQANVCDVVTSTVCLAVLLAAKELSDRY
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 KSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSIAGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVD
. .:..:.: ::.:.:.:::.::::.::. ..::.:: ::::::::.::: :. ::.:
NP_998 RHRLRVPLPTELLVIVVATLVSHFGQLHKRFGSSVAGDIPTGFMPPQVPEPRLMQRVALD
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 AIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLV
:.:..... :...::.::::..:::.:.::::. :.: ::..:.:.:::.:::::::.::
NP_998 AVALALVAAAFSISLAEMFARSHGYSVRANQELLAVGCCNVLPAFLHCFATSAALAKSLV
350 360 370 380 390 400
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: .:::.::::.::.: :.:::::..::::..::.:::. . .:.::::::: :::..:
NP_998 KTATGCRTQLSSVVSATVVLLVLLALAPLFHDLQRSVLACVIVVSLRGALRKVWDLPRLW
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFES
.: :...: : . :.::: :::.:: .:.. . :::.:...::. . .. .:.
NP_998 RMSPADALVWAGTAATCMLVSTEAGLLAGVILSLLSLAGRTQRPRTALLARIGDTAFYED
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQTVNPILIKVAWKKAAKRKI--KE
.. ...: .::...::: .:::: ::. : ..::. : : ::.:: .:
NP_998 ATEFEGLVPEPGVRVFRFGGPLYYANKDFFLQSLYSLTGLD-----AGCMAARRKEGGSE
530 540 550 560 570
630 640 650 660 670
pF1KB5 KVVTLGG-IQDE----MSVQLSHDPLE--LHTIVIDCSAIQFLDTAGIHTLKEVRRDYEA
: :: : : .:.. . : .::.::::. . :::.::. ::...:::: :
NP_998 TGVGEGGPAQGEDLGPVSTRAALVPAAAGFHTVVIDCAPLLFLDAAGVSTLQDLRRDYGA
580 590 600 610 620 630
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pF1KB5 IGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKK-----EEENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVP
.::..::: :.: ::: :. : . . ::. :: ::..:. :
NP_998 LGISLLLACCSPPVRDILSRGGFLGEGPGDTAEEEQLFLSVHDAVQTARARHRELEATDA
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 NGLSLSSD
NP_998 HL
700
>>NP_071325 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion transpor (701 aa)
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Smith-Waterman score: 2162; 48.4% identity (78.5% similar) in 678 aa overlap (56-719:17-687)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 GIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKA
..::. . ...:.. .: .:.:: .
NP_071 MDESPEPLQQGRGPVPVRRQRPAPRGLREMLKARLWCSCSCSVLCV
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. .. .::. .:: .: .. . :::::::..::.::::.:::::::: .:.:.:::::
NP_071 RALVQDLLPATRWLRQYRPREYLAGDVMSGLVIGIILVPQAIAYSLLAGLQPIYSLYTSF
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::..::::.:::::.:::::..::::.:..:::::: ::.: .... . : .:.::: .
NP_071 FANLIYFLMGTSRHVSVGIFSLLCLMVGQVVDRELQLAGFDPSQDGLQPG--ANSSTLNG
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.. : ..:::: :....:...:.::: :: ...::::.:::. ::.::. ::: :::
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::: :.:::. .:: .: : .. ::. ..:. ..:.::..:: .:: ::: .:::....
NP_071 TSQLKHLLGVRIPRHQGPGMVVLTWLSLLRGAGQANVCDVVTSTVCLAVLLAAKELSDRY
230 240 250 260 270 280
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. .:..:.: ::.:.:.:::.::::.::. ..::.:: ::::::::.::: :. ::.:
NP_071 RHRLRVPLPTELLVIVVATLVSHFGQLHKRFGSSVAGDIPTGFMPPQVPEPRLMQRVALD
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:.:..... :...::.::::..:::.:.::::. :.: ::..:.:.:::.:::::::.::
NP_071 AVALALVAAAFSISLAEMFARSHGYSVRANQELLAVGCCNVLPAFLHCFATSAALAKSLV
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: .:::.::::.::.: :.:::::..::::..::.:::. . .:.::::::: :::..:
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pF1KB5 SISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFES
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NP_071 RMSPADALVWAGTAATCMLVSTEAGLLAGVILSLLSLAGRTQRPRTALLARIGDTAFYED
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pF1KB5 VSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQTVNPILIKVAWKKAAKRKI--KE
.. ...: .::...::: .:::: ::. : ..::. : : ::.:: .:
NP_071 ATEFEGLVPEPGVRVFRFGGPLYYANKDFFLQSLYSLTGLD-----AGCMAARRKEGGSE
530 540 550 560 570
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pF1KB5 KVVTLGG-IQDE----MSVQLSHDPLE--LHTIVIDCSAIQFLDTAGIHTLKEVRRDYEA
: :: : : .:.. . : .::.::::. . :::.::. ::...:::: :
NP_071 TGVGEGGPAQGEDLGPVSTRAALVPAAAGFHTVVIDCAPLLFLDAAGVSTLQDLRRDYGA
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pF1KB5 IGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKK-----EEENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVP
.::..::: :.: ::: :. : . . ::. :: ::..:. :
NP_071 LGISLLLACCSPPVRDILSRGGFLGEGPGDTAEEEQLFLSVHDAVQTARARHRELEATDA
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 NGLSLSSD
NP_071 HL
700
>>NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exchang (764 aa)
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Smith-Waterman score: 1338; 32.1% identity (69.0% similar) in 714 aa overlap (57-724:23-725)
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pF1KB5 IHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAK
: ..:. . : : . .:. :.::: :::
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pF1KB5 ASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGMV--SNGSTLL
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NP_000 PAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPD--RNATTLGLPNNSNNSSLL
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. ..:. . ....:: ..:. :.:.:....::: .:::..:.:::.:.:. .
NP_000 D--DERV------RVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHV
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::.:: .:::::....: :. .:. ... .. ...: . ::.:: .:. . . ...
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pF1KB5 DAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTL
: ..:....::.. :.. ... :. : . .:::. :.:. ::. . :. :. :.::...
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pF1KB5 WSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFE
: ...: .::..:.. . .:. .:: ..: :... ...::: :: : :. . ......
NP_000 WRKDKYDCLIWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYK
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pF1KB5 SVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQT-VNPILIKVAWKKAAK--RKI
. . : .. :.:::: .:.:. : :. : . .:. : .:: . ::.
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pF1KB5 KEK----------VVTLGGIQD---EMS---VQLSHDPLE--------------------
... . :. :.: :.. ... .:..
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pF1KB5 KE-EENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVPNGLSLSSD
: . ...: ....:. ..:.
NP_000 GEVKSSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVE
710 720 730 740 750 760
>>XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chloride (764 aa)
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Smith-Waterman score: 1338; 32.1% identity (69.0% similar) in 714 aa overlap (57-724:23-725)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 IHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAK
: ..:. . : : . .:. :.::: :::
XP_011 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTF-LDHLKVCCSCSPQKAK
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pF1KB5 NMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFF
..:...:. .::: : ::. .:.:..::. .::. : :..:..::. ::::::.:::
XP_011 RIVLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFF
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pF1KB5 ASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGMV--SNGSTLL
.:::...::::::::: : .: .:.: .:. ..:: : ..: .::. ::.:.::
XP_011 PAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPD--RNATTLGLPNNSNNSSLL
120 130 140 150 160
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pF1KB5 NHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQVGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTI
. ..:. . ....:: ..:. :.:.:....::: .:::..:.:::.:.:. .
XP_011 D--DERV------RVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHV
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pF1KB5 LTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKTNLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEH
:.:: :... :..: . :.. . :: .:.:::. ::.:.:. :::. .::.:..
XP_011 LVSQLKFIFQLTVPSHTDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQR
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 FKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSIAGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAV
::.:: .:::::....: :. .:. ... .. ...: . ::.:: .:. . . ...
XP_011 FKDKLPVPIPIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 DAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTL
: ..:....::.. :.. ... :. : . .:::. :.:. ::. . :. :. :.::...
XP_011 DCFGIAMVAFAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSA
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pF1KB5 VKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQKSVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKM
:.:::: .::..:.. :...:.:.:.:. :. ::::::..... ::.: : .: .. ..
XP_011 VQESTGGKTQIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRL
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: ...: .::..:.. . .:. .:: ..: :... ...::: :: : :. . ......
XP_011 WRKDKYDCLIWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYK
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pF1KB5 SVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQT-VNPILIKVAWKKAAK--RKI
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XP_011 NKKDYYDMYEPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKL
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pF1KB5 KEK----------VVTLGGIQD---EMS---VQLSHDPLE--------------------
... . :. :.: :.. ... .:..
XP_011 QKQGLLQVTPKGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEV
590 600 610 620 630 640
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pF1KB5 ----LHTIVIDCSAIQFLDTAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCK
::....: ::..:::..... :: . ... : ..: .. . ..:. :.
XP_011 PKISLHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFD
650 660 670 680 690 700
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pF1KB5 KE-EENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVPNGLSLSSD
: . ...: ....:. ..:.
XP_011 GEVKSSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVE
710 720 730 740 750 760
>>NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b [Hom (685 aa)
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Smith-Waterman score: 1530; 36.9% identity (69.3% similar) in 681 aa overlap (49-691:20-684)
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pF1KB5 GNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPY--HRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQK
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NP_996 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKD-KVPDSIADKLKQ
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pF1KB5 NCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQE
:.: : .:.: :::. .::: : .:. .:::..::. .:.: .::..:...::.
NP_996 AFTCTPKKIRNIIYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVP
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 PVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGM
:..:::.::. :.: .::::::::.: :.:. :::: .. : . :. .
NP_996 PIFGLYSSFYPVIMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIGGVAVRLV-----------PDDIV
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pF1KB5 VSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQVGFVSVYLSDALLSGF
. .: . : : : . . :. .::...:. : .: . :::..::.. :. ::
NP_996 IPGGVNATNGTEAR----DALRVKVAMSVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGF
160 170 180 190 200 210
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pF1KB5 VTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKTNLCDLITSLLCLLVLL
.:.:. ..::. :::.:.. : .:. :.. . . :..:... :.:.: ..:. . .::
NP_996 TTAAAVHVFTSMLKYLFGVKTKRYSGIFSVVYSTVAVLQNVKNLNVCSLGVGLMVFGLLL
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 PTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSIAGHIPTGFMPPKVPEW
::.::.:: :: ::::.:. .:: .: : .:.:.:: ...: .: :..:: :.
NP_996 GGKEFNERFKEKLPAPIPLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDT
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 NLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTT
.:. : ::::::.:.::..:.:... .:.:::: : .:::. :.:.:: : :.:. :.
NP_996 SLFHLVYVDAIAIAIVGFSVTISMAKTLANKHGYQVDGNQELIALGLCNSIGSLFQTFSI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 SAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQKSVLGVITIVNLRGALR
: .:...::.:.:: .:::.: ...:..:::.:. . :: :: ..::..:.::::.: .
NP_996 SCSLSRSLVQEGTGGKTQLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFM
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 KFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGL
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NP_996 QFSDLPFFWRTSKIELTIWLTTFVSSLFLGLDYGLITAVIIALLTVIYRTQSPSYKVLGK
460 470 480 490 500 510
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]