Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5649
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5649, 739 aa
1>>>pF1KB5649 739 - 739 aa - 739 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1164+/-0.00119; mu= 15.1779+/- 0.071
mean_var=63.9261+/-12.767, 0's: 0 Z-trim(99.9): 37 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.160411
statistics sampled from 5873 (5903) to 5873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4300.1 SLC26A2 gene_id:1836|Hs108|chr5 ( 739) 4777 1115.0 0
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CCDS5748.1 SLC26A3 gene_id:1811|Hs108|chr7 ( 764) 1296 309.4 1.3e-83
CCDS43630.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 ( 685) 1111 266.6 9.1e-71
CCDS5733.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 ( 744) 1111 266.6 9.9e-71
CCDS5746.1 SLC26A4 gene_id:5172|Hs108|chr7 ( 780) 1091 262.0 2.6e-69
CCDS46824.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 740) 991 238.8 2.3e-62
CCDS46826.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 738) 982 236.8 9.5e-62
CCDS46825.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 758) 982 236.8 9.8e-62
CCDS43087.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 759) 982 236.8 9.8e-62
CCDS6254.1 SLC26A7 gene_id:115111|Hs108|chr8 ( 656) 966 233.0 1.1e-60
CCDS6255.1 SLC26A7 gene_id:115111|Hs108|chr8 ( 663) 959 231.4 3.4e-60
CCDS43629.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 ( 516) 919 222.2 1.6e-57
CCDS30990.1 SLC26A9 gene_id:115019|Hs108|chr1 ( 791) 884 214.1 6.9e-55
CCDS30989.1 SLC26A9 gene_id:115019|Hs108|chr1 ( 887) 884 214.1 7.7e-55
CCDS55150.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 ( 712) 832 202.0 2.6e-51
CCDS63627.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 651) 803 195.3 2.5e-49
CCDS63628.1 SLC26A6 gene_id:65010|Hs108|chr3 ( 723) 795 193.5 1e-48
CCDS4813.1 SLC26A8 gene_id:116369|Hs108|chr6 ( 970) 695 170.3 1.2e-41
CCDS8949.2 SLC26A10 gene_id:65012|Hs108|chr12 ( 563) 669 164.3 4.7e-40
CCDS33933.1 SLC26A1 gene_id:10861|Hs108|chr4 ( 224) 598 147.9 1.7e-35
CCDS75765.1 SLC26A7 gene_id:115111|Hs108|chr8 ( 355) 543 135.1 1.8e-31
CCDS4814.1 SLC26A8 gene_id:116369|Hs108|chr6 ( 865) 539 134.2 8.1e-31
CCDS5732.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 ( 335) 403 102.7 9.5e-22
CCDS11771.2 SLC26A11 gene_id:284129|Hs108|chr17 ( 606) 272 72.4 2.3e-12
>>CCDS4300.1 SLC26A2 gene_id:1836|Hs108|chr5 (739 aa)
initn: 4777 init1: 4777 opt: 4777 Z-score: 5968.5 bits: 1115.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4777; 99.9% identity (99.9% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
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CCDS43 MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDREL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLNHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTILTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHFKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVDAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLVKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMWSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFESVSAYKNLQIKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KQTVNPILIKVAWKKAAKRKIKEKVVTLGGIQDEMSVQLSHDPLELHTIVIDCSAIQFLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKKEEENLLFYSVYEAMAFAE
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
:::::::::::::::::::
CCDS43 VSKNQKGVCVPNGLSLSSD
730
>>CCDS33934.1 SLC26A1 gene_id:10861|Hs108|chr4 (701 aa)
initn: 2185 init1: 1452 opt: 2142 Z-score: 2673.2 bits: 505.2 E(32554): 1.4e-142
Smith-Waterman score: 2162; 48.4% identity (78.5% similar) in 678 aa overlap (56-719:17-687)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 GIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKA
..::. . ...:.. .: .:.:: .
CCDS33 MDESPEPLQQGRGPVPVRRQRPAPRGLREMLKARLWCSCSCSVLCV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 KNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSF
. .. .::. .:: .: .. . :::::::..::.::::.:::::::: .:.:.:::::
CCDS33 RALVQDLLPATRWLRQYRPREYLAGDVMSGLVIGIILVPQAIAYSLLAGLQPIYSLYTSF
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 FASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGMVSNGSTLLN
::..::::.:::::.:::::..::::.:..:::::: ::.: .... . : .:.::: .
CCDS33 FANLIYFLMGTSRHVSVGIFSLLCLMVGQVVDRELQLAGFDPSQDGLQPG--ANSSTLNG
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 HTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQVGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTIL
.. : ..:::: :....:...:.::: :: ...::::.:::. ::.::. ::: :::
CCDS33 SAAMLDCGRDCYAIRVATALTLMTGLYQVLMGVLRLGFVSAYLSQPLLDGFAMGASVTIL
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKTNLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEHF
::: :.:::. .:: .: : .. ::. ..:. ..:.::..:: .:: ::: .:::....
CCDS33 TSQLKHLLGVRIPRHQGPGMVVLTWLSLLRGAGQANVCDVVTSTVCLAVLLAAKELSDRY
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 KSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSIAGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAVD
. .:..:.: ::.:.:.:::.::::.::. ..::.:: ::::::::.::: :. ::.:
CCDS33 RHRLRVPLPTELLVIVVATLVSHFGQLHKRFGSSVAGDIPTGFMPPQVPEPRLMQRVALD
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 AIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTLV
:.:..... :...::.::::..:::.:.::::. :.: ::..:.:.:::.:::::::.::
CCDS33 AVALALVAAAFSISLAEMFARSHGYSVRANQELLAVGCCNVLPAFLHCFATSAALAKSLV
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 KESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQKSVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKMW
: .:::.::::.::.: :.:::::..::::..::.:::. . .:.::::::: :::..:
CCDS33 KTATGCRTQLSSVVSATVVLLVLLALAPLFHDLQRSVLACVIVVSLRGALRKVWDLPRLW
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFES
.: :...: : . :.::: :::.:: .:.. . :::.:...::. . .. .:.
CCDS33 RMSPADALVWAGTAATCMLVSTEAGLLAGVILSLLSLAGRTQRPRTALLARIGDTAFYED
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQTVNPILIKVAWKKAAKRKI--KE
.. ...: .::...::: .:::: ::. : ..::. : : ::.:: .:
CCDS33 ATEFEGLVPEPGVRVFRFGGPLYYANKDFFLQSLYSLTGLD-----AGCMAARRKEGGSE
530 540 550 560 570
630 640 650 660 670
pF1KB5 KVVTLGG-IQDE----MSVQLSHDPLE--LHTIVIDCSAIQFLDTAGIHTLKEVRRDYEA
: :: : : .:.. . : .::.::::. . :::.::. ::...:::: :
CCDS33 TGVGEGGPAQGEDLGPVSTRAALVPAAAGFHTVVIDCAPLLFLDAAGVSTLQDLRRDYGA
580 590 600 610 620 630
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pF1KB5 IGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCKK-----EEENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVP
.::..::: :.: ::: :. : . . ::. :: ::..:. :
CCDS33 LGISLLLACCSPPVRDILSRGGFLGEGPGDTAEEEQLFLSVHDAVQTARARHRELEATDA
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pF1KB5 NGLSLSSD
CCDS33 HL
700
>>CCDS5748.1 SLC26A3 gene_id:1811|Hs108|chr7 (764 aa)
initn: 971 init1: 898 opt: 1296 Z-score: 1614.5 bits: 309.4 E(32554): 1.3e-83
Smith-Waterman score: 1338; 32.1% identity (69.0% similar) in 714 aa overlap (57-724:23-725)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 IHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPYHRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQKNCQCSPAKAK
: ..:. . : : . .:. :.::: :::
CCDS57 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTF-LDHLKVCCSCSPQKAK
10 20 30 40 50
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pF1KB5 NMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQEPVYGLYTSFF
..:...:. .::: : ::. .:.:..::. .::. : :..:..::. ::::::.:::
CCDS57 RIVLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFF
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 ASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGMV--SNGSTLL
.:::...::::::::: : .: .:.: .:. ..:: : ..: .::. ::.:.::
CCDS57 PAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPD--RNATTLGLPNNSNNSSLL
120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 NHTSDRICDKSCYAIMVGSTVTFIAGVYQVAMGFFQVGFVSVYLSDALLSGFVTGASFTI
. ..:. . ....:: ..:. :.:.:....::: .:::..:.:::.:.:. .
CCDS57 D--DERV------RVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 LTSQAKYLLGLNLPRTNGVGSLITTWIHVFRNIHKTNLCDLITSLLCLLVLLPTKELNEH
:.:: :... :..: . :.. . :: .:.:::. ::.:.:. :::. .::.:..
CCDS57 LVSQLKFIFQLTVPSHTDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQR
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 FKSKLKAPIPIELVVVVAATLASHFGKLHENYNSSIAGHIPTGFMPPKVPEWNLIPSVAV
::.:: .:::::....: :. .:. ... .. ...: . ::.:: .:. . . ...
CCDS57 FKDKLPVPIPIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVG
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DAIAISIIGFAITVSLSEMFAKKHGYTVKANQEMYAIGFCNIIPSFFHCFTTSAALAKTL
: ..:....::.. :.. ... :. : . .:::. :.:. ::. . :. :. :.::...
CCDS57 DCFGIAMVAFAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSA
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VKESTGCHTQLSGVVTALVLLLVLLVIAPLFYSLQKSVLGVITIVNLRGALRKFRDLPKM
:.:::: .::..:.. :...:.:.:.:. :. ::::::..... ::.: : .: .. ..
CCDS57 VQESTGGKTQIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRL
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 WSISRMDTVIWFVTMLSSALLSTEIGLLVGVCFSIFCVILRTQKPKSSLLGLVEESEVFE
: ...: .::..:.. . .:. .:: ..: :... ...::: :: : :. . ......
CCDS57 WRKDKYDCLIWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYK
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 SVSAYKNLQTKPGIKIFRFVAPLYYINKECFKSALYKQT-VNPILIKVAWKKAAK--RKI
. . : .. :.:::: .:.:. : :. : . .:. : .:: . ::.
CCDS57 NKKDYYDMYEPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKL
530 540 550 560 570 580
630 640
pF1KB5 KEK----------VVTLGGIQD---EMS---VQLSHDPLE--------------------
... . :. :.: :.. ... .:..
CCDS57 QKQGLLQVTPKGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEV
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ----LHTIVIDCSAIQFLDTAGIHTLKEVRRDYEAIGIQVLLAQCNPTVRDSLTNGEYCK
::....: ::..:::..... :: . ... : ..: .. . ..:. :.
CCDS57 PKISLHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFD
650 660 670 680 690 700
710 720 730
pF1KB5 KE-EENLLFYSVYEAMAFAEVSKNQKGVCVPNGLSLSSD
: . ...: ....:. ..:.
CCDS57 GEVKSSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVE
710 720 730 740 750 760
>>CCDS43630.1 SLC26A5 gene_id:375611|Hs108|chr7 (685 aa)
initn: 1636 init1: 1075 opt: 1111 Z-score: 1383.9 bits: 266.6 E(32554): 9.1e-71
Smith-Waterman score: 1530; 36.9% identity (69.3% similar) in 681 aa overlap (49-691:20-684)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GNDSYPSGIHLELQRESSTDFKQFETNDQCRPY--HRILIERQEKSDTNFKEFVIKKLQK
:: : .: :: . .: . . . ::..
CCDS43 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKD-KVPDSIADKLKQ
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 NCQCSPAKAKNMILGFLPVLQWLPKYDLKKNILGDVMSGLIVGILLVPQSIAYSLLAGQE
:.: : .:.: :::. .::: : .:. .:::..::. .:.: .::..:...::.
CCDS43 AFTCTPKKIRNIIYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVP
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 PVYGLYTSFFASIIYFLLGTSRHISVGIFGVLCLMIGETVDRELQKAGYDNAHSAPSLGM
:..:::.::. :.: .::::::::.: :.:. :::: .. : . :. .
CCDS43 PIFGLYSSFYPVIMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIGGVAVRLV-----------PDDIV
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
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. .: . : : : . . :. .::...:. : .: . :::..::.. :. ::
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CCDS46 LKNIFHDFREIEVEVYMAACHSPVVSQLEAGHFFDASITKKHLFASVHDAVTFALQHPRP
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