Result of FASTA (omim) for
pF1KB5648
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5648, 826 aa
1>>>pF1KB5648 826 - 826 aa - 826 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0291+/-0.000449; mu= 7.9930+/- 0.028
mean_var=154.5704+/-31.394, 0's: 0 Z-trim(114.2): 210 B-trim: 17 in 1/52
Lambda= 0.103160
statistics sampled from 23750 (23966) to 23750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 12.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001521 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 826) 5448 823.6 0
NP_001230013 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible fact ( 850) 5371 812.2 0
NP_851397 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 735) 4839 733.0 1.2e-210
NP_001421 (OMIM: 603349,611783) endothelial PAS do ( 870) 1854 288.8 7.2e-77
XP_011531000 (OMIM: 603349,611783) PREDICTED: endo ( 883) 1840 286.7 3.1e-76
XP_016882623 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 711) 1378 217.9 1.3e-55
XP_016882626 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 703) 1376 217.6 1.6e-55
XP_016882624 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 709) 1376 217.6 1.6e-55
XP_016882622 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 749) 1376 217.6 1.7e-55
XP_016882621 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 755) 1376 217.6 1.7e-55
XP_005259212 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 1345 212.9 3.3e-54
XP_005259213 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 1345 212.9 3.3e-54
XP_016882627 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 663) 1345 212.9 3.7e-54
NP_690008 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 669) 1345 213.0 3.7e-54
NP_690007 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 667) 1343 212.7 4.5e-54
XP_016882625 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 707) 1343 212.7 4.8e-54
XP_005259209 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 713) 1343 212.7 4.8e-54
XP_016882630 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 951 154.3 1.6e-36
XP_016882628 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 951 154.3 1.6e-36
XP_016882629 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 951 154.3 1.6e-36
NP_033664 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 s ( 570) 939 152.5 5e-36
NP_005060 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 l ( 667) 939 152.5 5.7e-36
XP_016882631 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 474) 928 150.8 1.3e-35
NP_690009 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 450) 926 150.5 1.6e-35
XP_005259210 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 594) 918 149.4 4.5e-35
NP_071907 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 600) 918 149.4 4.6e-35
XP_011534374 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 481) 916 149.0 4.7e-35
XP_005267157 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 916 149.1 6.9e-35
XP_016866686 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 916 149.1 6.9e-35
NP_005059 (OMIM: 601665,603128) single-minded homo ( 766) 916 149.1 6.9e-35
XP_016883931 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 327) 875 142.8 2.3e-33
XP_011527996 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 566) 679 113.8 2.2e-24
XP_011535374 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 900) 462 81.6 1.7e-14
XP_011535373 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 936) 462 81.6 1.8e-14
XP_011535371 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 966) 462 81.6 1.8e-14
XP_016877072 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 983) 462 81.6 1.9e-14
XP_016877076 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 460 81.3 2e-14
XP_016877075 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 460 81.3 2e-14
XP_016877077 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 460 81.3 2e-14
NP_071406 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 901) 460 81.3 2.1e-14
NP_001159365 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 903) 460 81.3 2.1e-14
XP_011535372 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 918) 460 81.3 2.1e-14
NP_775182 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 920) 460 81.3 2.2e-14
NP_001158221 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 933) 460 81.3 2.2e-14
XP_016877074 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 939) 460 81.3 2.2e-14
XP_011535369 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 950) 460 81.3 2.2e-14
XP_016877073 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 956) 460 81.3 2.2e-14
XP_005268049 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 967) 460 81.3 2.2e-14
XP_005268048 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 969) 460 81.3 2.2e-14
XP_016877071 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 986) 460 81.3 2.3e-14
>>NP_001521 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor 1-al (826 aa)
initn: 5448 init1: 5448 opt: 5448 Z-score: 4392.1 bits: 823.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5448; 100.0% identity (100.0% similar) in 826 aa overlap (1-826:1-826)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 KMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLAC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB5 RLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
790 800 810 820
>>NP_001230013 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor 1 (850 aa)
initn: 5371 init1: 5371 opt: 5371 Z-score: 4330.0 bits: 812.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5371; 99.9% identity (100.0% similar) in 815 aa overlap (12-826:36-850)
10 20 30 40
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELA
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSLENKFVFLKEGLGNSKPEELEEIRIENGRISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 HQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 NTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 PAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 LRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 YVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 PLESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIAS
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 PSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTV
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSS
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 EQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRA
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 LDQVN
:::::
NP_001 LDQVN
850
>>NP_851397 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor 1-al (735 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 3903.0 bits: 733.0 E(85289): 1.2e-210
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 734 aa overlap (1-734:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
370 380 390 400 410 420
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NP_851 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
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NP_851 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
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NP_851 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
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NP_851 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
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NP_851 KMEHDGSLFQAVGII
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: ...:: .. .:.: .: : : . :.. :: . : : .:
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. .: . : . .: .: : .:: : . : : .. ..:: . : .
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: : .: : . :.: ..::.: . ::..:.. . :: .. :
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NP_001 CEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
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: .:.:. :.:..::::: :::::. ::: ..:::: :::::::: .::::
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. . : : : ...:: ... :.: .: : : . :.. ::
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. : : .: . .: . : . .: .: : .:: : . : : .. ..
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:: . : .: : .: : . :.: ..::.: . ::..:.. .
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790 800 810 820
pF1KB5 SGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
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XP_011 YLLPELTRYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
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.:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: : ::: :::::: ..:. : ...::
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.:.. . .. . . .: :: . : :..: : :: :.
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. . : . : .. : :.. ..: .: :: : .: :. .. .
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: . :... :: . : .: . : . :: .. :..
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pF1KB5 EKLFAEDTEAKNPFSTQDTD-LDLEMLAPYIPMDDDFQL---------------------
.:. . : ::.: :::::::::: :::::::
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pF1KB5 -RSFDQLSP--LESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDR
::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:.. . : : ..:.
XP_016 ARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCS---SPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDE
570 580 590 600 610 620
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pF1KB5 MEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPR
: ...: . :::: :
XP_016 DEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLG
630 640 650 660 670 680
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pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
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XP_016 MDWQDHRSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIM
10 20 30 40 50
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::::::::...: ::. . .. :::::.::::::: .::: :.:.::.:..
XP_016 RLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHL
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pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::.:.:: :::.::: ::::.::... :: .. : .. : :.: : :::: :::::::
XP_016 GLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGR
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pF1KB5 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGY--KKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLD
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XP_016 TLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLG
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pF1KB5 SKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKG
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XP_016 RGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKG
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pF1KB5 QVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTE
:..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . ::::....: . . ...::.:::
XP_016 QAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 C-VLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSND
.:.. . .. . . .: :: . : :..: : :: :.
XP_016 QHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPG--------PRILAFLHPP------SL---SEA
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
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. . : . : .. : :.. ..: .: :: : .: :. .. .
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: . :... :: . : .: . : . :: .. :..
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450 460 470 480 490 500
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.:. . : ::.: :::::::::: :::::::
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::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:.. . : : ..:.
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: ...: . :::: :
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..: ::::::::::::::.:.::.:.::: ::. ..::.::::::.:
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. . : . : .. : :.. ..: .: :: : .: :. .. .
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: . :... :: . : .: . : . :: .. :..
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.:. . : ::.: :::::::::: :::::::
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::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:.. . : : ..:.
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: ...: . :::: :
XP_016 DEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLG
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170 180 190 200 210 220
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::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:..
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initn: 1456 init1: 760 opt: 1376 Z-score: 1117.4 bits: 217.6 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1416; 40.3% identity (63.3% similar) in 667 aa overlap (14-646:55-686)
10 20 30 40
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQ
..: ::::::::::::::.:.::.:.:::
XP_016 RNSHPGPGCTASPPAPPGWPFSQRGPGRWSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHT
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170 180 190 200 210 220
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XP_016 ERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLV
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pF1KB5 LICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHA
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XP_016 LICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYV
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XP_016 LDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFL
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VSGIIQHDLIFSLQQTEC-VLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLL
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XP_016 ISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPG--------PRILAFL
390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 APAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPK
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XP_016 HPP------SL---SEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPI----LDGASVAATP----STPL
440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PLRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYC
: .: :. .. .: . :... :: . : .: . :
XP_016 ATRHPQSP-LSADLPDELPVGTENVHRLFTSGK--DTEAVETDLDIAQMRKLKLRLLTTG
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KB5 FYVDSDMVNEF-KLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTD-LDLEMLAPYIPMDDDFQL----
. :: .. :.. .:. . : ::.: :::::::::: :::::::
XP_016 TELRSDGAGTSAKVHPSPRLIL--LPPSCP--PQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASE
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610
pF1KB5 ------------------RSFDQLSP--LESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANA
::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:..
XP_016 QLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCS---SPSRGDPSASS
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KB5 TTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASP
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XP_016 PMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 NRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLF
XP_016 QDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
710 720 730 740 750
826 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:51:01 2016 done: Thu Nov 3 17:51:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]