Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5648
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5648, 826 aa
1>>>pF1KB5648 826 - 826 aa - 826 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8503+/-0.00109; mu= 8.8655+/- 0.065
mean_var=126.9985+/-24.978, 0's: 0 Z-trim(106.6): 60 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.113809
statistics sampled from 9018 (9070) to 9018 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 826) 5448 906.5 0
CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 850) 5371 893.8 0
CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 735) 4839 806.4 0
CCDS1825.1 EPAS1 gene_id:2034|Hs108|chr2 ( 870) 1854 316.4 1.4e-85
CCDS12681.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 669) 1345 232.7 1.6e-60
CCDS12682.1 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 667) 1343 232.4 1.9e-60
CCDS13646.1 SIM2 gene_id:6493|Hs108|chr21 ( 667) 939 166.1 1.8e-40
CCDS42580.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 600) 918 162.6 1.8e-39
CCDS5045.1 SIM1 gene_id:6492|Hs108|chr6 ( 766) 916 162.3 2.8e-39
CCDS9645.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 901) 460 87.5 1.1e-16
CCDS55912.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 903) 460 87.5 1.1e-16
CCDS53892.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 920) 460 87.5 1.1e-16
CCDS53891.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 933) 460 87.5 1.2e-16
>>CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (826 aa)
initn: 5448 init1: 5448 opt: 5448 Z-score: 4839.7 bits: 906.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5448; 100.0% identity (100.0% similar) in 826 aa overlap (1-826:1-826)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 KMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLAC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB5 RLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
790 800 810 820
>>CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (850 aa)
initn: 5371 init1: 5371 opt: 5371 Z-score: 4771.1 bits: 893.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5371; 99.9% identity (100.0% similar) in 815 aa overlap (12-826:36-850)
10 20 30 40
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELA
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSLENKFVFLKEGLGNSKPEELEEIRIENGRISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 HQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 NTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 PAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 LRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 YVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 PLESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIAS
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 PSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTV
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSS
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 EQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRA
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 LDQVN
:::::
CCDS58 LDQVN
850
>>CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (735 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 4300.1 bits: 806.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 734 aa overlap (1-734:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NPESLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 KMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLAC
::::::::::::::
CCDS97 KMEHDGSLFQAVGII
730
>>CCDS1825.1 EPAS1 gene_id:2034|Hs108|chr2 (870 aa)
initn: 1595 init1: 811 opt: 1854 Z-score: 1650.1 bits: 316.4 E(32554): 1.4e-85
Smith-Waterman score: 2122; 45.0% identity (65.7% similar) in 908 aa overlap (9-815:6-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
.::. :::::::::::::: :::::.::::::::.:::::.:::::::::.:
CCDS18 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKA--QMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNK
::.::.::..:::.. . :.. .: ::. .:::::.::. :.:.:::::..:.:..:
CCDS18 RLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGDMIFLSENISK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 YMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNG--LVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLT
.::::: ::::::.:::::::::::.:: :. .:: . ::.:...:.:.::.:::::.:
CCDS18 FMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQ---CGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNI
.::::.:.::::::::::::...:: :. :. ::::.: ..::...:::: :::..
CCDS18 NRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVKVY--NNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHD
.:::::::::::::.::::.:::.:::::.::.:::::::: ::.::::::...::.:..
CCDS18 DIPLDSKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 MFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFS
. :::::..::::::::.:::::.:::.::::: .: :::::.:::::.: : ..:..::
CCDS18 LCTKGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKNDVVFS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB5 LQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTK----VESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTII
..::: ..:: : :...: . . :: .. :: :::.::. :. :::. ::.::
CCDS18 MDQTESLFKP---HLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTPGDAII
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 SLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPA
::::: .:..:: :. ..:: :.. : : ::: .
CCDS18 SLDFG-------NQNFEESSAYGKAILP-PSQ----------PWATE-----LRSHS---
420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 LNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQ-TPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMV
.: : .: : .::.:: . .:: :. .: :::: .: .:.:.
CCDS18 -TQSEAGSL-P-------AFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSSCSTPNSPEDYYTSLDNDL-
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 NEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQD--TDLDLEMLAPYIPMD-DDFQLRSFDQLSPLES
:.:..::::: :::::. ::: ..:::: :::::::: .:::: . . : :
CCDS18 ---KIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAPYIPMDGEDFQL---SPICPEER
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630
pF1KB5 SSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTAN-ATTTTATTDEL-------KTVTKDR-MEDIK
: ...:: .. .:.: .: : : . :.. :: . : : .:
CCDS18 LLAENPQSTPQHCFSA--MTNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQQQLESKKTEPEHRPMSSIF
560 570 580 590 600
640 650 660 670 680
pF1KB5 ILIASPS--PTHIHKETTSATSSPYR-DTQSRTASPNRAG--KGVI--EQTE--KSHPRS
. .: . : . .: .: : .:: : . : : .. ..:: . : .
CCDS18 FDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPTKWAVGDQRTEFLGAAPLG
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730
pF1KB5 PNVLSVALSQRTTVPE--------EELNPKILALQNAQR-KRKMEHDGSLFQAVGIGTLL
: : .: : . :.: ..::.: . ::..:.. . :: .. :
CCDS18 PPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQDLSGG---
670 680 690 700 710 720
740 750 760
pF1KB5 QQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSE-------------------QNGME------------
.: ..:. : :::.:. ... :: :.
CCDS18 -DPPG-GSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVPNDKFTQNPMRGLGHPLRHLPLP
730 740 750 760 770 780
770 780 790
pF1KB5 QKTIILIP----------------------------SDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYD
: . : : .: :::: :.. ::.:: ::
CCDS18 QPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLLGPSFESYLLPELTRYD
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800 810 820
pF1KB5 CEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
::::.:. :: .::::
CCDS18 CEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
850 860 870
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10 20 30 40 50 60
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. . ..: ::::::::::::::.:.::.:.::: ::. ..::.::::::.:
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10 20 30 40 50
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::::::::...: ::. . .. :::::.::::::: .::: :.:.::.:..
CCDS12 RLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHL
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::.:.:: :::.::: ::::.::... :: .. : .. : :.: : :::: :::::::
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:.:.:.::::::.:.::...: .. : ..::. ::::::: ::::...: ::
CCDS12 TLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLG
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pF1KB5 SKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKG
.:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: : ::: :::::: ..:. : ...::
CCDS12 RGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKG
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pF1KB5 QVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTE
:..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . ::::....: . . ...::.:::
CCDS12 QAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTE
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.:.. . ::. ::
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pF1KB5 TETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALK
:.:...:. .: :. : :.:. :.::
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.: : .: . : : . . :: .. .:.:: ...:. .:. . :
CCDS12 ADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSP------LSADLPDELPVGTE
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pF1KB5 LVEKLFA--EDTEA-KNPFS-TQDTD-LDLEMLAPYIPMDDDFQL---------------
:..::. .:::: .. .. .::.: :::::::::: :::::::
CCDS12 NVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLG
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pF1KB5 -------RSFDQLSP--LESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELK
::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:.. . : :
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..:. : ...: . :::: :
CCDS12 QSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLN
580 590 600 610 620 630
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
..: ::::::::::::::.:.::.:.::: ::. ..::.::::::.:
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::::::::...: ::. . .. :::::.::::::: .::: :.:.::.:..
CCDS12 RLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHL
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pF1KB5 GLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGR
::.:.:: :::.::: ::::.::... :: .. : .. : :.: : :::: :::::::
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:.:.:.::::::.:.::...: .. : ..::. ::::::: ::::...: ::
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pF1KB5 SKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKG
.:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: : ::: :::::: ..:. : ...::
CCDS12 RGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKG
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:..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . ::::....: . . ...::.:::
CCDS12 QAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 C-VLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSND
.:.. . ::. ::
CCDS12 QHSRRPIQRG---------------------------------APSQKDT----------
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420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALK
:.:...:. .: :. : :.:. :.::
CCDS12 -------------------PNPGDSLD------TP-----GPRILAFLHPPSLS-EAALA
380 390 400
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pF1KB5 LEPNPE-SLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKL--E
.: : .: . : : . . :: .. .:.:: ...:. .:. . :
CCDS12 ADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSP------LSADLPDELPVGTE
410 420 430 440 450
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:..::. .:::: .. .. .::.: :::::::::: :::::::
CCDS12 NVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLG
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pF1KB5 -------RSFDQLSP--LESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELK
::: ::: :: : ...:. . . . . .:.:.. . : :
CCDS12 AVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCS---SPSRGDPSASSPMAGARKRTLA
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pF1KB5 TVTKDRMEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQT
..:. : ...: . :::: :
CCDS12 QSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLN
580 590 600 610 620 630
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pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
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CCDS13 MKEKSKNAAKTRREKENGEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASII
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70 80 90 100 110
pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIE---------DDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIY
::: :::..: .. : : : . ... :..:::::.:...:: ..:
CCDS13 RLTTSYLKMRAVFPEGLGDAWGQPSRAGPLDGVAKELGSHLLQTLDGFVFVVASDGKIMY
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKG-KEQNTQRSFFLR
::.... ..::.: ::::.:.... :: ::.:: .:: .. : .. .: . .::::::
CCDS13 ISETASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPSDHDEMTAVLTAHQPLHHHLLQEYEIERSFFLR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 MKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHV--YDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIP
:::.:..:. .. . .::.::.:.... : . . . :. .. :: . . .:
CCDS13 MKCVLAKRN--AGLTCSGYKVIHCSGYLKIRQYMLDMSLYDSCYQ---IVGLVAVGQSLP
170 180 190 200 210
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pF1KB5 HPSNI-EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHL
:: : :: : :. :. : :::.:. . : :.::. ::::..:. ...:.. :. : ::
CCDS13 -PSAITEIKLYSNMFMFRASLDLKLIFLDSRVTEVTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDVFHL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQ
.:: ...:::::: ::.:.::::.:::.. :::..:...:.:.::: ::::.. :
CCDS13 RYAHHLLLVKGQVTTKYYRLLSKRGGWVWVQSYATVVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTEIEY
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 HDLIFSLQQTECVLKPVES--SDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAG
..: .::.:. . : .: . .. .: :. . .... ::. .:
CCDS13 KELQLSLEQVSTA-KSQDSWRTALSTSQETRKLVKPKNTKMKTKLRTNPYPPQQYSSFQM
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 DTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSS
CCDS13 DKLECGQLGNWRASPPASAAAPPELQPHSESSDLLYTPSYSLPFSYHYGHFPLDSHVFSS
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pF1KB5 KALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNG
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CCDS42 PSPAASAPTWTRPLSCASPSATCACTASAPQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
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pF1KB5 LVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGY-
: .. : :.: : :::: ::::::::.:.:.::::::.:.::...: .. :
CCDS42 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
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pF1KB5 -KKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELL
..::. ::::::: ::::...: :: .:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.
CCDS42 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
150 160 170 180 190 200
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pF1KB5 GRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQ
: : ::: :::::: ..:. : ...:::..:::::.::. :::.:..:::::. . .. :
CCDS42 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 PQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTEC-VLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKL
. ::::....: . . ...::.::: .:.. .
CCDS42 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRG-----------------------
270 280 290
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pF1KB5 KKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAM
::. :: :.:...:.
CCDS42 ----------APSQKDT-----------------------------PNPGDSLD------
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pF1KB5 SPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPE-SLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQS
.: :. : :.:. :.:: .: : .: . : : . . :: .
CCDS42 TP-----GPRILAFLHPPSLS-EAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLA
320 330 340 350 360
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pF1KB5 SPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKL--ELVEKLFA--EDTEA-KNPFS-TQDTD-LDLEML
. .:.:: ...:. .:. . : :..::. .:::: .. .. .::.: ::::::
CCDS42 TRHPQSP------LSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEML
370 380 390 400 410 420
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pF1KB5 APYIPMDDDFQL----------------------RSFDQLSP--LESSSASPESASPQST
:::: ::::::: ::: ::: :: : ...:. .
CCDS42 APYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLS
430 440 450 460 470 480
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VTVFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTS
. .. .:.:.. . : : ..:. : ...: . :::: :
CCDS42 CSSPSRG---DPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFP
490 500 510 520 530
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pF1KB5 ATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILAL
CCDS42 LSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQ
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
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CCDS50 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASII
10 20 30 40
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pF1KB5 RLTISYLRVRKLLDAG---------DLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIY
::: :::..: .. : . :.. ... :..::::..:.. :: ..:
CCDS50 RLTTSYLKMRVVFPEGLGEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMY
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 ISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLT-HRNGLVKKGKEQNTQRSFFLR
::.... ..::.: ::::.:.... :: ::.:: .:: :. . .: . .::::::
CCDS50 ISETASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB5 MKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQ-PQCG-YKKPPMTCLVLICEPIP
:::.:..:. .. . .::.::.:.... . . .. : : :.. . :: . . .:
CCDS50 MKCVLAKRN--AGLTCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQN---VGLVAVGHSLP
170 180 190 200 210
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