Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5641
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5641, 759 aa
1>>>pF1KB5641 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1238+/-0.00082; mu= 12.1546+/- 0.050
mean_var=109.8124+/-22.465, 0's: 0 Z-trim(111.0): 34 B-trim: 458 in 1/53
Lambda= 0.122391
statistics sampled from 12023 (12046) to 12023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54762.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 759) 5107 912.7 0
CCDS54761.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 758) 5090 909.7 0
CCDS82918.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 737) 2663 481.1 2.7e-135
CCDS43224.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 736) 2299 416.8 6e-116
CCDS31410.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 708) 1610 295.2 2.4e-79
CCDS58114.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 488) 1599 293.2 6.7e-79
CCDS66018.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 710) 1596 292.7 1.3e-78
CCDS66016.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 475) 1585 290.7 3.6e-78
CCDS66017.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 490) 1585 290.7 3.7e-78
CCDS66015.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 451) 1575 288.9 1.2e-77
CCDS54760.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 210) 1402 258.2 9.5e-69
CCDS47279.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 484) 1103 205.6 1.5e-52
CCDS4229.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 486) 1089 203.1 8.6e-52
CCDS4228.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 491) 774 147.5 4.8e-35
CCDS4227.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 493) 590 115.0 2.9e-25
>>CCDS54762.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 (759 aa)
initn: 5107 init1: 5107 opt: 5107 Z-score: 4874.6 bits: 912.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5107; 99.9% identity (100.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS54 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KB5 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
730 740 750
>>CCDS54761.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 (758 aa)
initn: 3297 init1: 3297 opt: 5090 Z-score: 4858.3 bits: 909.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5090; 99.7% identity (99.9% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS54 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS54 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDET-DIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
660 670 680 690 700 710
730 740 750
pF1KB5 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
720 730 740 750
>>CCDS82918.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 (737 aa)
initn: 4434 init1: 2638 opt: 2663 Z-score: 2542.5 bits: 481.1 E(32554): 2.7e-135
Smith-Waterman score: 4884; 97.0% identity (97.1% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS82 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS82 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDET-DIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENE------------
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ---------DLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
640 650 660 670 680 690
730 740 750
pF1KB5 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
700 710 720 730
>>CCDS43224.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 (736 aa)
initn: 4415 init1: 1810 opt: 2299 Z-score: 2195.2 bits: 416.8 E(32554): 6e-116
Smith-Waterman score: 4867; 96.8% identity (97.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-736)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNLRSSHNELLNAEIKHTETKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDPNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS43 NLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQNRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPNRPQSSPEDGQVATVSSSPETKKDHPKTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS43 AKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDET-DIWSDHSFQTDPDLPPGWKRV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQPWSDFAVLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENE------------
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ---------DLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSINSDPEAKCF
350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTVGIWGEGKDMYLILENDML
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQ-DFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
640 650 660 670 680 690
730 740 750
pF1KB5 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
700 710 720 730
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10 20 30 40 50
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:: . .. : :: . : .: : ...::.::::... :
CCDS31 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQAT--
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KNSTPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDP
.. :: ....::: . .: : :: : .:.:.::::.:: ...:
CCDS31 --AVGPK--------DLRSAMG-EGGGPEP----GPANAKWLKEGQNQLRRAAT-AHRDQ
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
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:.: ...: . ..:: :. : : :.... :..:: :: :
CCDS31 NRN------VTLTLAEEASQEP--------EMAPLGP---KGLIHLYSELELSAHNAANR
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KB5 ELE--------QNQGNHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPN--RPQSSPEDGQV
:. :.:: .: :::. :.: . : .. . : . :: .
CCDS31 GLRGPGLIISTQEQGPDEG--EEKAA---GEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLES
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 ATVSSSPETKKDHPKTGAKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWS
. . :.. : :. .:. : ..: : :::.:::.:::: : : .::..: ..:.
CCDS31 VEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWN
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 DHSFQTDPDLPPGWKRVSDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSP
..:.:: ::: :: ::.: .::::::::::::::: : . . :::
CCDS31 PNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWE-PPGRASPSQGS------------
250 260 270 280 290
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pF1KB5 TPENEKQ-PWSDFAVLNGGKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPH
.:..:.: :. :: .: . ....::: . . . .::: : .:: . . .: :
CCDS31 SPQEESQLTWTGFAHGEGFE-DGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPL
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 PDDDDSCSI-NSDPEAKCFAVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDT
:..... :..: :::::::::::::.::.::::.:::::::::::::: ::...:
CCDS31 PQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDP
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
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. : ::::::. : ::.. :.::.:.....::.:::.::::::::::.:::::::::::
CCDS31 MSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKL
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TRILKCHVFRCDTPAKAIATSLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDF
:..::::::::..::: ::::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.:
CCDS31 TQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQVEF
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 PTPKTELVQKFHVQYLGMLPVDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTV
:.::.::::::.: ::: .:: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.
CCDS31 PAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTI
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 ISEKNEEEVLVECRVRFLSFMGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQ
. ...: :: :::::::::..::.::::::::: .: : ::.:::::::...:::::
CCDS31 LHQQTEA-VLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQ
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710 720 730 740 750
pF1KB5 AACMLRYQKCLVARPPSQKVRPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
::::::::::: :: .. : :::.::.::: .:.::: :: .:: :: .. :
CCDS31 AACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
650 660 670 680 690 700
>>CCDS58114.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (488 aa)
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: .:: .:. ..:.:: ::: :: ::.: .
CCDS58 MSAMFSQDFFLAIILQDSSADSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTS
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::: : . :. ::: .:..:.: :. :: .: .
CCDS58 GTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPS--QGS------------SPQEESQLTWTGFAHGEGFE
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pF1KB5 INSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSI-NSDPEAKCFA
....::: . . . .::: : .:: . . .: : :..... :..: ::::
CCDS58 -DGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFA
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTV-GIWGEGKDMYLILENDML
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CCDS58 VRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETL
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pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIAT
.::.:.....::.:::.::::::::::.::::::::::: :..::::::::..::: :::
CCDS58 KLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIAT
220 230 240 250 260 270
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLP
:::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.::.::::::.: ::: .:
CCDS58 SLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVP
280 290 300 310 320 330
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSF
: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.. ...: :: :::::::::
CCDS58 VAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEA-VLGECRVRFLSF
340 350 360 370 380
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 MGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKV
..::.::::::::: .: : ::.:::::::...:::::::::::::::: :: ..
CCDS58 LAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTS
390 400 410 420 430 440
730 740 750
pF1KB5 RPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
: :::.::.::: .:.::: :: .:: :: .. :
CCDS58 CLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
450 460 470 480
>>CCDS66018.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (710 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNL--RSSHNELLNAEIKHTET
:: . .. : :: . : .: : ...::.::::... :
CCDS66 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQAT--
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KNSTPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDP
.. :: ....::: . .: : :: : .:.:.::::.:: ...:
CCDS66 --AVGPK--------DLRSAMG-EGGGPEP----GPANAKWLKEGQNQLRRAAT-AHRDQ
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NKNLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSA-----R
:.: ...: . ..:: :. : : :.... :..:: :: :
CCDS66 NRN------VTLTLAEEASQEP--------EMAPLGP---KGLIHLYSELELSAHNAANR
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KB5 ELE--------QNQGNHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPN--RPQSSPEDGQV
:. :.:: .: :::. :.: . : .. . : . :: .
CCDS66 GLRGPGLIISTQEQGPDEG--EEKAA---GEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLES
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 ATVSSSPETKKDHPKTGAKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWS
. . :.. : :. .:. : ..: : :::.:::.:::: : : .::..: ..:.
CCDS66 VEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWN
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 DHSFQTDPDLPPGWKRVSDIAGTYYWHIPTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSP
..:.:: ::: :: ::.: .::::::::::::::: : . . :::
CCDS66 PNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWE-PPGRASPSQGS------------
250 260 270 280 290
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pF1KB5 TPENEKQ-PWSDFAVLNGGKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPH
.:..:.: :. :: .: . ....::: . . . .::: : .:: . . .: :
CCDS66 SPQEESQLTWTGFAHGEGFE-DGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPL
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 PDDDDSCSI-NSDPEAKCFAVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDT
:..... :..: :::::::::::::.::.::::.:::::::::::::: ::...:
CCDS66 PQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDP
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510
pF1KB5 V-GIWGEGKDMYLILENDMLSLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGR--DFAYVARD
. : ::::::. : ::.. :.::.:.....::.:::.::::::::::.:: ::::::::
CCDS66 MSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRERDFAYVARD
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 KDTRILKCHVFRCDTPAKAIATSLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQV
: :..::::::::..::: ::::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::
CCDS66 KLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQV
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 DFPTPKTELVQKFHVQYLGMLPVDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATV
.::.::.::::::.: ::: .:: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.
CCDS66 EFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATL
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 TVISEKNEEEVLVECRVRFLSFMGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEA
:.. ...: :: :::::::::..::.::::::::: .: : ::.:::::::...:::
CCDS66 TILHQQTEA-VLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEA
600 610 620 630 640
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pF1KB5 VQAACMLRYQKCLVARPPSQKVRPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEM
::::::::::::: :: .. : :::.::.::: .:.::: :: .:: :: ..
CCDS66 VQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHT
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 P
:
CCDS66 P
710
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pF1KB5 NLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSFQTDPDLPPGWKRVSDIAGTYYWHI
:. ..:.:: ::: :: ::.: .:::::::
CCDS66 MTQMRDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHI
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 PTGTTQWERPVSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQ-PWSDFAVLNGGKINSDIWKD
:::::::: : . . ::: .:..:.: :. :: .: . ....:::
CCDS66 PTGTTQWE-PPGRASPSQGS------------SPQEESQLTWTGFAHGEGFE-DGEFWKD
40 50 60 70 80
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pF1KB5 LHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSI-NSDPEAKCFAVRSLGWVE
. . . .::: : .:: . . .: : :..... :..: ::::::::::::
CCDS66 EPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVE
90 100 110 120 130 140
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pF1KB5 MAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTV-GIWGEGKDMYLILENDMLSLVDPMDR
:.::.::::.:::::::::::::: ::...: . : ::::::. : ::.. :.::.:...
CCDS66 MTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQ
150 160 170 180 190 200
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pF1KB5 SVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGR--DFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAIATSLHEIC
..::.:::.::::::::::.:: ::::::::: :..::::::::..::: :::::::::
CCDS66 ALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRERDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEIC
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 SKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGMLPVDKPVG
:::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.::.::::::.: ::: .:: ::::
CCDS66 SKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVG
270 280 290 300 310 320
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pF1KB5 MDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFLSFMGVGKD
.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.. ...: :: :::::::::..::.:
CCDS66 VDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEA-VLGECRVRFLSFLAVGRD
330 340 350 360 370 380
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 VHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPPSQKVRPPPPP
:::::::: .: : ::.:::::::...:::::::::::::::: :: .. : ::
CCDS66 VHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPP
390 400 410 420 430 440
730 740 750
pF1KB5 ADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
:.::.::: .:.::: :: .:: :: .. :
CCDS66 AESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
450 460 470
>>CCDS66017.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (490 aa)
initn: 1043 init1: 566 opt: 1585 Z-score: 1516.6 bits: 290.7 E(32554): 3.7e-78
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETAD-IWSDHSFQTDPDLPPGWKRVSDIA
: .:: .:. ..:.:: ::: :: ::.: .
CCDS66 MSAMFSQDFFLAIILQDSSADSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTS
10 20 30 40
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GTYYWHIPTGTTQWERP-VSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPENEKQ-PWSDFAVLNGGK
::::::::::::::: : . :. ::: .:..:.: :. :: .: .
CCDS66 GTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPS--QGS------------SPQEESQLTWTGFAHGEGFE
50 60 70 80 90
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSI-NSDPEAKCFA
....::: . . . .::: : .:: . . .: : :..... :..: ::::
CCDS66 -DGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFA
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTV-GIWGEGKDMYLILENDML
:::::::::.::.::::.:::::::::::::: ::...: . : ::::::. : ::.. :
CCDS66 VRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETL
160 170 180 190 200 210
490 500 510 520 530
pF1KB5 SLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGR--DFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAKAI
.::.:.....::.:::.::::::::::.:: ::::::::: :..::::::::..::: :
CCDS66 KLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRERDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNI
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 ATSLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYLGM
:::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.::.::::::.: :::
CCDS66 ATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGN
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 LPVDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVRFL
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