Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5626
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5626, 462 aa
1>>>pF1KB5626 462 - 462 aa - 462 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4068+/-0.00086; mu= 14.4139+/- 0.052
mean_var=132.1543+/-25.586, 0's: 0 Z-trim(111.2): 65 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.111566
statistics sampled from 12129 (12189) to 12129 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6086.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 462) 3043 501.1 9.9e-142
CCDS6085.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 640) 2790 460.5 2.3e-129
CCDS55219.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 420) 2653 438.3 7.3e-123
CCDS6084.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 637) 2655 438.8 7.9e-123
CCDS6083.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 645) 2644 437.0 2.7e-122
CCDS75727.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 308) 1982 330.2 1.9e-90
CCDS55218.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 590) 1587 266.8 4.2e-71
CCDS4217.1 NRG2 gene_id:9542|Hs108|chr5 ( 850) 781 137.3 6.1e-32
CCDS47836.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 422) 644 114.9 1.6e-25
CCDS54910.1 NRG2 gene_id:9542|Hs108|chr5 ( 784) 596 107.5 5.3e-23
CCDS6087.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 ( 296) 347 67.0 3.1e-11
>>CCDS6086.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (462 aa)
initn: 3043 init1: 3043 opt: 3043 Z-score: 2658.0 bits: 501.1 E(32554): 9.9e-142
Smith-Waterman score: 3043; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 SERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
430 440 450 460
>>CCDS6085.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (640 aa)
initn: 2869 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2436.1 bits: 460.5 E(32554): 2.3e-129
Smith-Waterman score: 2790; 99.8% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 SERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
:::.
CCDS60 SERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLL
430 440 450 460 470 480
>>CCDS55219.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (420 aa)
initn: 2714 init1: 1406 opt: 2653 Z-score: 2319.2 bits: 438.3 E(32554): 7.3e-123
Smith-Waterman score: 2653; 96.5% identity (97.2% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :: . : . . :::::::
CCDS55 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYV---MASFYKAEELYQ
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460
pF1KB5 SERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
:::
CCDS55 SER
420
>>CCDS6084.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (637 aa)
initn: 2740 init1: 1406 opt: 2655 Z-score: 2318.7 bits: 438.8 E(32554): 7.9e-123
Smith-Waterman score: 2655; 96.2% identity (97.2% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :: . : . . :::::::
CCDS60 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYV---MASFYKAEELYQ
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460
pF1KB5 SERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
:::.
CCDS60 SERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS6083.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (645 aa)
initn: 2688 init1: 1414 opt: 2644 Z-score: 2309.0 bits: 437.0 E(32554): 2.7e-122
Smith-Waterman score: 2644; 94.9% identity (96.3% similar) in 429 aa overlap (1-424:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB5 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQ-----EKA
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :: . : . .. .:
CCDS60 KCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB5 RDSPHSERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
::::::::.
CCDS60 RDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEE
430 440 450 460 470 480
>>CCDS75727.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (308 aa)
initn: 1982 init1: 1982 opt: 1982 Z-score: 1737.3 bits: 330.2 E(32554): 1.9e-90
Smith-Waterman score: 1982; 99.3% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (167-462:13-308)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGEC
..::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MQIPKHISIEDITATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGEC
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 FMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQKRVLTITGICIALLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQKRVLTITGICIALLVV
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 GIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKN
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 VISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSV
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 ENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERHNLIAELRRNKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERHNLIAELRRNKAH
230 240 250 260 270 280
440 450 460
pF1KB5 RSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
290 300
>>CCDS55218.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (590 aa)
initn: 1941 init1: 1264 opt: 1587 Z-score: 1390.1 bits: 266.8 E(32554): 4.2e-71
Smith-Waterman score: 2143; 85.2% identity (87.2% similar) in 398 aa overlap (32-424:11-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 SERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSS
. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MGKGRAGRVGTTALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGND
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLVK
:::::::::::: .:::::::::::::
CCDS55 SASANITIVESN----------------------------------ATSTSTTGTSHLVK
110 120
190 200 210 220 230
pF1KB5 CAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQ-----EKAE
::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :: . : . .. .::
CCDS55 CAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEAE
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGP
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 HHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWS
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYR
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KB5 DSPHSERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSATHLRSSSIPHLGFIL
:::::::.
CCDS55 DSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEER
370 380 390 400 410 420
>>CCDS4217.1 NRG2 gene_id:9542|Hs108|chr5 (850 aa)
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10 20 30 40
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLK
::. ::: :. . :. :.::
CCDS42 LERNQRYIFFLEPTEQPLVFKTAFAPLDTNGKNLKKEVGKILCTDCAT-------RPKLK
190 200 210 220 230 240
50 60 70 80 90
pF1KB5 EMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGK--SELR
.:::: . .: : :.::... . ..:::.:.::::. ..:.:. :. :.:.
CCDS42 KMKSQTGQVGEKQSLKCEAAAGNPQPSYRWFKDGKELNRS---RDIRIKYGNGRKNSRLQ
250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 INKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISV
.::... :.:::.:.. . ::.:.. . . ::
CCDS42 FNKVKVEDAGEYVCEAENILGKDTVRGRL-------------------YV----------
300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 STEGANTSSSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTG
:. :.: .: .: : :: : :..::::: :.... ... : ::: :: :
CCDS42 -----NSVSTTLSSWSG--HARKCNETAKSYCVNGGVCYYIEGINQLS---CKCPNGFFG
330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 ARCTENVPMKV---QNQEKAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLH
:: :..:... . ..:::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..:
CCDS42 QRCLEKLPLRLYMPDPKQKAEELYQKRVLTITGICVALLVVGIVCVVAYCKTKKQRKQMH
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 DRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTS
..:::.. ..: ..:::: :: ::..:... :.:::: ...:...::.::.:: :
CCDS42 NHLRQNMCPAHQNR-SLANGPSHPRLDPEEIQMAD-YISKNVPATDHVIRRETETTFSGS
440 450 460 470 480 490
340 350 360 370 380
pF1KB5 HYTSTAHHSTTVTQTPSH-----SWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTG-GPR
: : .:: .:.: : :: .:: ..::. :.:.: :..::: .:. .::. :
CCDS42 HSCSPSHHCSTATPTSSHRHESHTWSLERSESLTSDSQSGIMLSSVGTSKCNSPACVEAR
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 GRLNGTGGPRECNSFLRHARETP-----DSYRDSPHSERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQ
.: .. . .: :.: : :: ::::::::.
CCDS42 ARRAAAYNLEE----RRRATAPPYHDSVDSLRDSPHSERYVSALTTPARLSPVDFHYSLA
560 570 580 590 600 610
450 460
pF1KB5 LSATHLRSSSIPHLGFIL
CCDS42 TQVPTFEITSPNSAHAVSLPPAAPISYRLAEQQPLLRHPAPPGPGPGPGPGPGPGADMQR
620 630 640 650 660 670
>>CCDS47836.1 NRG1 gene_id:3084|Hs108|chr8 (422 aa)
initn: 970 init1: 642 opt: 644 Z-score: 571.6 bits: 114.9 E(32554): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 907; 75.0% identity (77.0% similar) in 204 aa overlap (22-225:237-406)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLKEMKSQESAAGS
:: : . . ::::::::::::::::::
CCDS47 FFMEPDANSTSRAPAAFRASFPPLETGRNLKKEVSRVLCKRCALPPRLKEMKSQESAAGS
210 220 230 240 250 260
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYM
270 280 290 300 310 320
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTST
:::::::::::::::::::::: .:::
CCDS47 CKVISKLGNDSASANITIVESN----------------------------------ATST
330 340 350
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 STTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :: . :
CCDS47 STTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYS
360 370 380 390 400 410
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QEKAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMN
CCDS47 TSTPFLSLPE
420
>>CCDS54910.1 NRG2 gene_id:9542|Hs108|chr5 (784 aa)
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10 20 30 40
pF1KB5 MSERKEGRGKGKGKKKERGSGKKPESAAGSQSPALPPRLK
::. ::: :. . :. :.::
CCDS54 LERNQRYIFFLEPTEQPLVFKTAFAPLDTNGKNLKKEVGKILCTDCAT-------RPKLK
190 200 210 220 230 240
50 60 70 80 90
pF1KB5 EMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGK--SELR
.:::: . .: : :.::... . ..:::.:.::::. ..:.:. :. :.:.
CCDS54 KMKSQTGQVGEKQSLKCEAAAGNPQPSYRWFKDGKELNRS---RDIRIKYGNGRKNSRLQ
250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 INKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISV
.::... :.:::.:.. . ::.:.. . . ::.::
CCDS54 FNKVKVEDAGEYVCEAENILGKDTVRGRL-------------------YVNSE-------
300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 STEGANTSSSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTG
CCDS54 ------------------------------------------------------------
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 ARCTENVPMKVQNQEKAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRL
::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..:..:
CCDS54 ----------------AEELYQKRVLTITGICVALLVVGIVCVVAYCKTKKQRKQMHNHL
340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 RQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYT
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CCDS54 RQNMCPAHQNR-SLANGPSHPRLDPEEIQMAD-YISKNVPATDHVIRRETETTFSGSHSC
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 STAHHSTTVTQTPSH-----SWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTG-GPRGRL
: .:: .:.: : :: .:: ..::. :.:.: :..::: .:. .::. :.:
CCDS54 SPSHHCSTATPTSSHRHESHTWSLERSESLTSDSQSGIMLSSVGTSKCNSPACVEARARR
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440
pF1KB5 NGTGGPRECNSFLRHARETP-----DSYRDSPHSERHNLIAELRRNKAHRSKCMQIQLSA
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CCDS54 AAAYNLEE----RRRATAPPYHDSVDSLRDSPHSERYVSALTTPARLSPVDFHYSLATQV
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CCDS54 PTFEITSPNSAHAVSLPPAAPISYRLAEQQPLLRHPAPPGPGPGPGPGPGPGADMQRSYD
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462 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:44:07 2016 done: Thu Nov 3 17:44:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]