Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5616
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5616, 788 aa
1>>>pF1KB5616 788 - 788 aa - 788 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6023+/-0.00143; mu= 15.6446+/- 0.086
mean_var=191.9897+/-35.742, 0's: 0 Z-trim(107.1): 130 B-trim: 34 in 1/50
Lambda= 0.092563
statistics sampled from 9235 (9365) to 9235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 5529 752.2 7.2e-217
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 3122 430.8 4.2e-120
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 2896 400.6 5e-111
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 2794 387.0 6.1e-107
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 2621 363.8 5.3e-100
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2408 335.5 2.1e-91
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2065 289.7 1.3e-77
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 2020 283.6 7.6e-76
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 2018 283.4 9.8e-76
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1537 219.6 3.5e-56
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1385 198.8 2.7e-50
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 510 81.6 2.5e-15
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 510 81.6 2.7e-15
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 510 81.7 2.9e-15
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 431 71.2 4.7e-12
>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa)
initn: 5529 init1: 5529 opt: 5529 Z-score: 4007.0 bits: 752.2 E(32554): 7.2e-217
Smith-Waterman score: 5529; 100.0% identity (100.0% similar) in 788 aa overlap (1-788:1-788)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
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CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
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CCDS11 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
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CCDS11 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
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CCDS11 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
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CCDS11 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
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CCDS11 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
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CCDS11 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 TNITYRGT
::::::::
CCDS11 TNITYRGT
>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa)
initn: 3007 init1: 2122 opt: 3122 Z-score: 2269.7 bits: 430.8 E(32554): 4.2e-120
Smith-Waterman score: 3122; 55.7% identity (78.9% similar) in 788 aa overlap (5-781:2-782)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPR-PRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPL
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CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPR-LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKE--DF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GSPR-----CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSS-QVTQVSPQR
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CCDS30 GSPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTS
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CCDS30 IAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPC--YDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNE
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CCDS30 NFRLGFGSFVDKDISPFSY-TAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGI
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CCDS30 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELI
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CCDS30 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKS
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CCDS30 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEK-EKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPN
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CCDS30 CEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCG
: ::: :.::. ::.:.:.::.::..:::.. . . :. : ::.:.:: ::.: :.
CCDS30 SARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRT
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CCDS30 QCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 DTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGA
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CCDS30 STCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KB5 LHDENTCNRYCRDEIES-VKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVE
:..::. ::::. . : . ..:: : ::. :::. : : : :::: : :..
CCDS30 -PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLR
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 EPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTAN
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CCDS30 EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMAS
720 730 740 750 760 770
770 780
pF1KB5 NPLYKEATSTFTNITYRGT
::::.. :: :
CCDS30 NPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
780 790
>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa)
initn: 2296 init1: 921 opt: 2896 Z-score: 2106.7 bits: 400.6 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2896; 51.1% identity (78.6% similar) in 760 aa overlap (31-786:23-775)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
:. :. .:..:: ..:.::::..: . :
CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
: . ::: ::: .: . :: :::....:...::: . .::...:..:: . :.
CCDS22 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
::: .......:::.::::::.::::::: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.
CCDS22 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQS
:::.::.:::::.. .: : . ::: .. ::: ::.::.: ::... :::: ::.:.
CCDS22 GFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDG
.: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::::..:: .:...:..::::: ::::
CCDS22 ISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVG
::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::
CCDS22 LCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKI
.:. ::.:.::::..:: ..::.::::: : :.:::.: : :. .. :.: .:.
CCDS22 LLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNG
:::.:::. ... : ... . . :::::. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:
CCDS22 GDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
::.:.:::: : :: .: .:::.: :. . : :. .: :: ::.: ::::.:: :
CCDS22 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
.:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:.:.::.:.: : ::: :::::: ::.:.: .
CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSED
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
:.:::::: : ::.::: .::. : :::.:::: : :. :. :.::. : ..: :
CCDS22 GVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--C
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKG
:. ...: .: .:: .:.:. ..:..:.. : :. ::.:.. ..: .:::
CCDS22 VDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKP
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 PDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEA
:.: ...:.: ::::::.. : :::::...::::: :::: ::..:::.:..::::. .
CCDS22 PNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGS
710 720 730 740 750 760
780
pF1KB5 TSTFTNITYRGT
:::: :.::.
CCDS22 TSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
770 780
>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa)
initn: 2227 init1: 921 opt: 2794 Z-score: 2033.4 bits: 387.0 E(32554): 6.1e-107
Smith-Waterman score: 2794; 51.6% identity (78.7% similar) in 731 aa overlap (58-786:10-733)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 PNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSE
: : . ::: ::: .: . :: :::.
CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQ
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDL
...:...::: . .::...:..:: . :.::: .......:::.::::::.::::::
CCDS74 VEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 SYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDM
: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.:::.::.:::::.. . :: . ::: ..
CCDS74 SASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVK-TTPEEIANPCSSI
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 KTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRN
::: ::.::.: ::... :::: ::.:..: : :.:::::::::::.:: :::::::
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CCDS74 DSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLV
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pF1KB5 QKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVR
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CCDS74 QNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVL
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:::: : :. :. :.::. : ..: : :. ...: .: .:: .:.:. ..
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CCDS74 VFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLL
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CCDS74 LLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSC
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:.: : ::: :::::: ::.:.: .:.:::::: : ::.::: .::. : :::.:::: :
CCDS74 CVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGD
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CCDS74 TFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRK
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pF1KB5 EFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
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CCDS74 EVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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CCDS71 GMPT-SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQ
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CCDS71 ITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAK-LRNPCTSEQN-CTSPFSYKNVLSLTNKGEVFN
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CCDS71 ELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRN-VTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGG
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CCDS71 GRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI
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CCDS71 VCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACD
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CCDS71 CSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRA
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CCDS71 FNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNN
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CCDS71 EVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKM
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pF1KB5 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
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CCDS71 NAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS88 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA--TQLAPQRVRVTLRPGEP
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CCDS88 QQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFV
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CCDS88 DKTVLPFVS-TVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLD
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.::::::::.::..:.:.::::: .:.:::::.: : : ::.:.:: .:.::.::. :
CCDS88 SPEGGFDAILQAALCQEQIGWRN-VSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDS
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CCDS88 NGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDS
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CCDS88 SNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQ
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pF1KB5 TVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNG
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CCDS88 TVTFWVSLQATHCLPEPHL-LRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPHCSDGQG
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pF1KB5 TFECGVCRCGPGWLGSQCECS-EEDYRPSQQDEC-SPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
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CCDS88 HLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCS--
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CCDS88 --GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPE
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pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
: ::::.:.:.:. : :.. : :: :..:: : : ...:.:: : : : ..:
CCDS88 GGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPL--ATNC
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pF1KB5 NRYC--RDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPK
. : . .. . : : : .. :. . : .:. : .: : .:. :
CCDS88 STACAHTNVTLALAPILDDGW----CKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRV--RPQ-EK
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pF1KB5 GPD-ILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYK
: : ...:. .:.:. .::. .: ..: . :.::.:...::.:. . .: .:::::
CCDS88 GADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYK
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pF1KB5 EATSTFTNITYRGT
: .: : ..
CCDS88 SAITTTINPRFQEADSPTL
780 790
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CCDS63 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
10 20 30 40 50
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pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
: . ::: ::: .: . :: :::....:...::: . .::...:..:: . :.
CCDS63 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
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CCDS63 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]