Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5585
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5585, 325 aa
1>>>pF1KB5585 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3257+/-0.00166; mu= -10.5864+/- 0.092
mean_var=440.2920+/-101.430, 0's: 0 Z-trim(104.7): 259 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.061123
statistics sampled from 7858 (8053) to 7858 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 325) 2173 206.8 1.9e-53
CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 337) 2165 206.1 3.2e-53
CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 ( 337) 2030 194.2 1.2e-49
CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 ( 416) 1575 154.2 1.7e-37
CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 409) 1573 154.0 1.8e-37
CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 415) 1573 154.0 1.9e-37
CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 365) 1165 118.0 1.2e-26
CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 424) 1127 114.7 1.3e-25
CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 423) 1116 113.8 2.6e-25
CCDS4135.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 447) 1116 113.8 2.6e-25
CCDS43355.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 455) 1116 113.8 2.7e-25
CCDS10192.2 CSNK1G1 gene_id:53944|Hs108|chr15 ( 422) 1112 113.4 3.3e-25
CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19 ( 415) 1099 112.2 7.1e-25
CCDS59492.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 348) 997 103.2 3.3e-22
CCDS59493.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 311) 903 94.8 9.5e-20
CCDS34455.1 TTBK1 gene_id:84630|Hs108|chr6 (1321) 583 67.4 7.4e-11
>>CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (325 aa)
initn: 2173 init1: 2173 opt: 2173 Z-score: 1073.1 bits: 206.8 E(32554): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 2173; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
:::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
310 320
>>CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (337 aa)
initn: 2165 init1: 2165 opt: 2165 Z-score: 1069.1 bits: 206.1 E(32554): 3.2e-53
Smith-Waterman score: 2165; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF
310 320 330
>>CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 2030 init1: 2030 opt: 2030 Z-score: 1004.7 bits: 194.2 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 2030; 92.0% identity (97.8% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
:...::::::..::::::::::::::::::.::.:. ::::.:::::::::..:::::::
CCDS93 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEDVAVKLESQKVKHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
:::: ::::::::::..::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::::::::.:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS93 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
: ::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.: :::::::::::::
CCDS93 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLRAMTKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
::::::::::::::::::::: ::
CCDS93 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
310 320 330
>>CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 (416 aa)
initn: 1572 init1: 1572 opt: 1575 Z-score: 786.9 bits: 154.2 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 1575; 75.5% identity (91.6% similar) in 298 aa overlap (10-307:2-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
:. ::.::.: :::::::::::::. ::..:::::.::: :..:::: :
CCDS13 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.::..::::::: :.: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS13 SKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS13 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS13 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::. :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS13 MSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
:: ::.
CCDS13 LKFGAARNPEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573 Z-score: 786.0 bits: 154.0 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (10-309:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
:. ::..:.: :::::::::::::. .:. :::::.::: :..:::: :
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS11 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS11 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS11 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS11 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
:: :.. :
CCDS11 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (415 aa)
initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573 Z-score: 785.9 bits: 154.0 E(32554): 1.9e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (10-309:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
:. ::..:.: :::::::::::::. .:. :::::.::: :..:::: :
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS11 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS11 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS11 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS11 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB5 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
:: :.. :
CCDS11 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (365 aa)
initn: 1165 init1: 1165 opt: 1165 Z-score: 592.1 bits: 118.0 E(32554): 1.2e-26
Smith-Waterman score: 2099; 92.0% identity (92.0% similar) in 352 aa overlap (1-324:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KB5 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNK----------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKCLESPVGKRKRSMTVSTSQDPSFSGLNQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 YFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KB5 DYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKS
310 320 330 340 350 360
CCDS47 NMKGF
>>CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 (424 aa)
initn: 1112 init1: 622 opt: 1127 Z-score: 573.3 bits: 114.7 E(32554): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 1127; 53.8% identity (78.6% similar) in 327 aa overlap (3-318:29-352)
10 20 30
pF1KB5 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLA
..:.:.. ..:: .... .::: :.::.. :.
CCDS59 MENKKKDKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 INITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLG
:. ..: ::.::: .:.: ::: : ..:: : .: :::.. ..: ::..:..:::
CCDS59 KNLYTNEYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]