Result of FASTA (omim) for
pF1KB5551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5551, 680 aa
1>>>pF1KB5551 680 - 680 aa - 680 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61989856 residues in 87180 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5010+/-0.000435; mu= 18.1487+/- 0.027
mean_var=63.8559+/-12.553, 0's: 0 Z-trim(110.3): 44 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.160500
statistics sampled from 18822 (18866) to 18822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 9.990
The best scores are: opt bits E(87180)
NP_000932 (OMIM: 124015,201750,207410,613571) NADP ( 680) 4524 1056.9 0
NP_001137498 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflav ( 606) 1012 243.7 1.6e-63
NP_055249 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflavin ( 597) 946 228.4 6.3e-59
XP_011523164 (OMIM: 145500,163730,611162) PREDICTE ( 931) 925 223.6 2.7e-57
XP_011523162 (OMIM: 145500,163730,611162) PREDICTE (1152) 925 223.6 3.3e-57
XP_011523161 (OMIM: 145500,163730,611162) PREDICTE (1153) 925 223.6 3.3e-57
NP_000616 (OMIM: 145500,163730,611162) nitric oxid (1153) 925 223.6 3.3e-57
XP_016870115 (OMIM: 606073) PREDICTED: NADPH-depen ( 564) 914 221.0 1e-56
XP_011516849 (OMIM: 606073) PREDICTED: NADPH-depen ( 537) 863 209.1 3.5e-53
XP_016870116 (OMIM: 606073) PREDICTED: NADPH-depen ( 555) 860 208.5 5.9e-53
XP_011516847 (OMIM: 606073) PREDICTED: NADPH-depen ( 572) 759 185.1 6.6e-46
XP_016867722 (OMIM: 104300,145500,163729,189800,60 ( 997) 747 182.4 7.4e-45
NP_000594 (OMIM: 104300,145500,163729,189800,60136 (1203) 747 182.4 8.7e-45
XP_016867721 (OMIM: 104300,145500,163729,189800,60 (1203) 747 182.4 8.7e-45
NP_001191143 (OMIM: 163731) nitric oxide synthase, (1098) 661 162.5 7.9e-39
NP_001191142 (OMIM: 163731) nitric oxide synthase, (1098) 661 162.5 7.9e-39
XP_016874836 (OMIM: 163731) PREDICTED: nitric oxid (1434) 661 162.5 1e-38
NP_000611 (OMIM: 163731) nitric oxide synthase, br (1434) 661 162.5 1e-38
NP_001191147 (OMIM: 163731) nitric oxide synthase, (1468) 661 162.5 1e-38
XP_011536700 (OMIM: 163731) PREDICTED: nitric oxid (1468) 661 162.5 1e-38
XP_016874834 (OMIM: 163731) PREDICTED: nitric oxid (1468) 661 162.5 1e-38
XP_016874835 (OMIM: 163731) PREDICTED: nitric oxid (1468) 661 162.5 1e-38
XP_011516850 (OMIM: 606073) PREDICTED: NADPH-depen ( 332) 621 153.0 1.7e-36
NP_001137500 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflav ( 590) 615 151.7 7.4e-36
NP_001137499 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflav ( 521) 607 149.9 2.4e-35
XP_016867881 (OMIM: 611243) PREDICTED: S-adenosyl- ( 638) 312 81.6 1e-14
XP_011514674 (OMIM: 611243) PREDICTED: S-adenosyl- ( 694) 312 81.6 1.1e-14
NP_060734 (OMIM: 611243) S-adenosyl-L-methionine-d ( 732) 312 81.6 1.2e-14
NP_076915 (OMIM: 236270,601634,602568) methionine ( 725) 281 74.4 1.7e-12
NP_002445 (OMIM: 236270,601634,602568) methionine ( 698) 279 74.0 2.3e-12
XP_011523163 (OMIM: 145500,163730,611162) PREDICTE (1129) 261 69.9 6.2e-11
XP_016867723 (OMIM: 104300,145500,163729,189800,60 ( 751) 190 53.4 3.8e-06
XP_006716065 (OMIM: 104300,145500,163729,189800,60 ( 705) 187 52.7 5.9e-06
>>NP_000932 (OMIM: 124015,201750,207410,613571) NADPH--c (680 aa)
initn: 4524 init1: 4524 opt: 4524 Z-score: 5655.7 bits: 1056.9 E(87180): 0
Smith-Waterman score: 4524; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MINMGDSHVDTSSTVSEAVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MINMGDSHVDTSSTVSEAVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEEY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTTNRKLNQGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTTNRKLNQGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKILGADLDVVMSLNNLDEESNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKILGADLDVVMSLNNLDEESNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SWVVEARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SWVVEARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 APFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 EQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQ
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB5 AVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
::::::::::::::::::::
NP_000 AVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
670 680
>>NP_001137498 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflavin o (606 aa)
initn: 718 init1: 311 opt: 1012 Z-score: 1261.5 bits: 243.7 E(87180): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1021; 32.6% identity (63.1% similar) in 623 aa overlap (83-680:6-606)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
..:..:::::::.. ..::...:.: :
NP_001 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
10 20 30
120 130 140 150 160
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
: .. : : ...: :.. ::.: :: :.::: :: ..:. .. . .. :
NP_001 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
. :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .: : . : ..
NP_001 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
.: : . :. . .. :. .. : .: :. .:.:: .
NP_001 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330
pF1KB5 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
.: :::: . .:.... .. . ..: :.:: : : . .:: : . :.:..: :... .
NP_001 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
.:: : : .. :. . . .. .: : :.: ...::::.. :: . . :: . .
NP_001 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
:.: : . ::..:.: . . . :: :: .: : : : :.: .:.: .. :
NP_001 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
.::::: .::. ..: ..::...:. . .:. ..:: . .: :. : . ::..::
NP_001 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
... .: ::::::::::::::: . ::::. : : ..:..::: :.:.
NP_001 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTG-----NFLFFGCRWRDQDFY
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620
pF1KB5 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQS---------HKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGA
.. : .... :: : :::::: .:::::: :.. .:.:.. ::
NP_001 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQPPALFSALQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGA
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 HIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
..:. :.:..: ::......: : :.. .:. :. .:. :.. ..:.
NP_001 YFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
560 570 580 590 600
>>NP_055249 (OMIM: 606073) NADPH-dependent diflavin oxid (597 aa)
initn: 784 init1: 311 opt: 946 Z-score: 1179.1 bits: 228.4 E(87180): 6.3e-59
Smith-Waterman score: 1049; 33.1% identity (64.0% similar) in 614 aa overlap (83-680:6-597)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
..:..:::::::.. ..::...:.: :
NP_055 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
10 20 30
120 130 140 150 160
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
: .. : : ...: :.. ::.: :: :.::: :: ..:. .. . .. :
NP_055 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
. :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .: : . : ..
NP_055 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
.: : . :. . .. :. .. : .: :. .:.:: .
NP_055 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330
pF1KB5 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
.: :::: . .:.... .. . ..: :.:: : : . .:: : . :.:..: :... .
NP_055 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
.:: : : .. :. . . .. .: : :.: ...::::.. :: . . :: . .
NP_055 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
:.: : . ::..:.: . . . :: :: .: : : : :.: .:.: .. :
NP_055 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
.::::: .::. ..: ..::...:. . .:. ..:: . .: :. : . ::..::
NP_055 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
... .: ::::::::::::::: . ::::. : : ..:..::: :.:.
NP_055 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTG-----NFLFFGCRWRDQDFY
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGAHIYVCGDAR
.. : .... :: : :::::: .:::::: :.. .:.:.. ::..:. :.:.
NP_055 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAK
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670 680
pF1KB5 NMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
.: ::......: : :.. .:. :. .:. :.. ..:.
NP_055 SMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
560 570 580 590
>>XP_011523164 (OMIM: 145500,163730,611162) PREDICTED: n (931 aa)
initn: 716 init1: 182 opt: 925 Z-score: 1149.7 bits: 223.6 E(87180): 2.7e-57
Smith-Waterman score: 941; 31.8% identity (60.1% similar) in 651 aa overlap (48-679:285-906)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 AVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMK
: :..:.: ...:...: . .. .
XP_011 HQEMLNYVLSPFYYYQVEAWKTHVWQDEKRRPKRREIP----LKVLVKAVLFACMLMRKT
260 270 280 290 300 310
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 KTGR-NIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEE--YDLADLSSLPEIDNA
..: . ......:: .: .: :. .. . . .:. .: :: : : .
XP_011 MASRVRVTILFATETGKSEALAWDLG------ALFSCAFNPKVVCMDKYRLSCLEE--ER
320 330 340 350 360
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 LVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKR
:.. .:.:.:: :.. . : . ..::::::.. : .: :... .:..
XP_011 LLLVVTSTFGNGDCPGNGEKLKKSLFMLKELNNKFRYAVFGLGSSMYPRFCAFAHDIDQK
370 380 390 400 410 420
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHT
: .:::... .: ::. .. :. : .: : . :.:: : :.. . . . : :
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XP_016 KP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]