FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5523, 2472 aa
1>>>pF1KB5523 2472 - 2472 aa - 2472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0359+/-0.00238; mu= -0.4910+/- 0.141
mean_var=375.3398+/-82.550, 0's: 0 Z-trim(101.9): 150 B-trim: 241 in 1/48
Lambda= 0.066201
statistics sampled from 6637 (6729) to 6637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 7.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2472) 16018 1547.3 0
CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2477) 15998 1545.4 0
CCDS75914.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2452) 9241 900.0 0
CCDS41423.1 SPTA1 gene_id:6708|Hs108|chr1 (2419) 4031 402.4 1.4e-110
CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2155) 1889 197.8 4.9e-49
CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364) 1889 197.9 5.2e-49
CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15 (3674) 1781 187.7 9.2e-46
CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390) 1733 183.0 1.6e-44
CCDS12559.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 (2564) 1344 145.8 2.6e-33
CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2137) 1082 120.7 7.7e-26
CCDS32099.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2328) 1082 120.8 8.2e-26
CCDS9792.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 892) 1005 113.1 6.7e-24
CCDS12518.1 ACTN4 gene_id:81|Hs108|chr19 ( 911) 997 112.3 1.2e-23
CCDS73053.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 686) 852 98.3 1.4e-19
CCDS60455.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 852 98.4 1.7e-19
CCDS1613.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 852 98.4 1.7e-19
CCDS45129.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 887) 850 98.2 1.9e-19
CCDS45130.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 914) 776 91.2 2.6e-17
CCDS76439.1 ACTN3 gene_id:89|Hs108|chr11 ( 944) 764 90.1 5.9e-17
CCDS42569.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 ( 678) 665 80.5 3.3e-14
>>CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2472 aa)
initn: 16018 init1: 16018 opt: 16018 Z-score: 8286.0 bits: 1547.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16018; 100.0% identity (100.0% similar) in 2472 aa overlap (1-2472:1-2472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREELITNWEQIRTLAAERHARLNDS
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CCDS69 ERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREELITNWEQIRTLAAERHARLNDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YRLQRFLADFRDLTSWVTEMKALINADELASDVAGAEALLDRHQEHKGEIDAHEDSFKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YRLQRFLADFRDLTSWVTEMKALINADELASDVAGAEALLDRHQEHKGEIDAHEDSFKSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DESGQALLAAGHYASDEVREKLTVLSEERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVD
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CCDS69 DESGQALLAAGHYASDEVREKLTVLSEERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYA
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CCDS69 NWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MEDVATRRDALLSRRNALHERAMRRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEA
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CCDS69 MEDVATRRDALLSRRNALHERAMRRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 YKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLW
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CCDS69 YKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLW
610 620 630 640 650 660
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pF1KB5 KKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKH
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CCDS69 KKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 ALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMVARKQKL
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CCDS69 ALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMVARKQKL
730 740 750 760 770 780
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pF1KB5 ADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRI
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CCDS69 ADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 KAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLHELNQKWEALKAKASQRRQDLEDSLQAQQYFADAN
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CCDS69 KAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLHELNQKWEALKAKASQRRQDLEDSLQAQQYFADAN
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pF1KB5 EAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIQALREQAQSCRQQV
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CCDS69 EAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIQALREQAQSCRQQV
910 920 930 940 950 960
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pF1KB5 APTDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 APTDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 VKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELG
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CCDS69 VKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB5 EKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB5 KANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPRDETDSKTASPWKSARLMVH
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CCDS69 KANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPRDETDSKTASPWKSARLMVH
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB5 TVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB5 YGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQA
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pF1KB5 WSSLGKRADQRKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 WSSLGKRADQRKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLER
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KB5 HQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQKLDILDQERADLEKAWVQRRMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQKLDILDQERADLEKAWVQRRMM
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KB5 LDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KB5 IAALQAFADQLIAAGHYAKGDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IAALQAFADQLIAAGHYAKGDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDV
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pF1KB5 DEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KB5 ACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEAL
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pF1KB5 LASEDYGKDLASVNNLLKKHQLLEADISAHEDRLKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVKDKRD
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CCDS69 LASEDYGKDLASVNNLLKKHQLLEADISAHEDRLKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVKDKRD
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB5 TINGRFQKIKSMAASRRAKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVGSEDYGRDLTGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TINGRFQKIKSMAASRRAKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVGSEDYGRDLTGVQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB5 NLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIGKEEIQQRLAQFVEHWKELKQLAA
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CCDS69 NLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIGKEEIQQRLAQFVEHWKELKQLAA
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KB5 ARGQRLEESLEYQQFVANVEEEEAWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ARGQRLEESLEYQQFVANVEEEEAWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB5 VHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHEENISSKMKGLNGKVSDLEKAAAQRKAKLDENSAFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHEENISSKMKGLNGKVSDLEKAAAQRKAKLDENSAFLQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB5 FNWKADVVESWIGEKENSLKTDDYGRDLSSVQTLLTKQETFDAGLQAFQQEGIANITALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FNWKADVVESWIGEKENSLKTDDYGRDLSSVQTLLTKQETFDAGLQAFQQEGIANITALK
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB5 DQLLAAKHVQSKAIEARHASLMKRWSQLLANSAARKKKLLEAQSHFRKVEDLFLTFAKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DQLLAAKHVQSKAIEARHASLMKRWSQLLANSAARKKKLLEAQSHFRKVEDLFLTFAKKA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB5 SAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSLEEIKALREAHDAFRSSLSSAQADFNQLAELDRQIKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSLEEIKALREAHDAFRSSLSSAQADFNQLAELDRQIKSF
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB5 RVASNPYTWFTMEALEETWRNLQKIIKERELELQKEQRRQEENDKLRQEFAQHANAFHQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RVASNPYTWFTMEALEETWRNLQKIIKERELELQKEQRRQEENDKLRQEFAQHANAFHQW
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB5 IQETRTYLLDGSCMVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IQETRTYLLDGSCMVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDN
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB5 KYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKS
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB5 GRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRET
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB5 ENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAF
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470
pF1KB5 DYVEFTRSLFVN
::::::::::::
CCDS69 DYVEFTRSLFVN
2470
>>CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2477 aa)
initn: 10272 init1: 10272 opt: 15998 Z-score: 8275.6 bits: 1545.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15998; 99.8% identity (99.8% similar) in 2477 aa overlap (1-2472:1-2477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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: ..:.: : ..:. : : .
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: :: . :: :: .: .. .: ... ... : :: :.:..:: .:
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CCDS12 DALLARHAALKEEVDQREEDYARIVAASEALLAADGAELGPGLALDEWLPHLELGWHKLL
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CCDS12 TTMELSQQKMQVAVQAAEGLLRQGNIYGEQAQEAVTRLLEKNQENQLRAQQWMQKLHDQL
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CCDS12 ELQHFLRDCHELDGWIHEKMLMARDGTREDNHKLHKRWLRHQAFMAELAQNKEWLEKIER
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CCDS12 LLHMESQLQDVDPGGDLATVNSQLKKLQSMESQVEEWYREVGELQAQTAALPLEPASK--
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CCDS12 -ELVGERQNAVGERLVRLLEPLQERRRLLLASKELHQVAHDLDDELAWVQERLPLAMQTE
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