Result of FASTA (omim) for
pF1KB5511
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5511, 727 aa
1>>>pF1KB5511 727 - 727 aa - 727 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0832+/-0.000452; mu= 20.4021+/- 0.028
mean_var=57.8977+/-12.103, 0's: 0 Z-trim(108.9): 53 B-trim: 688 in 1/50
Lambda= 0.168556
statistics sampled from 17024 (17042) to 17024 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 9.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine ( 727) 4970 1217.6 0
NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lys ( 774) 4808 1178.3 0
NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 737) 3165 778.7 0
NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine ( 738) 3081 758.3 2.5e-218
XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 1164 292.1 4.8e-78
XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 1164 292.1 4.8e-78
NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 758) 1164 292.1 5.4e-78
XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 517) 189 55.0 9.2e-07
NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glyc ( 517) 189 55.0 9.2e-07
XP_016870283 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 189 55.0 1e-06
XP_005252092 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 189 55.0 1e-06
NP_057258 (OMIM: 616626) probable inactive glycosy ( 595) 189 55.0 1e-06
XP_011517064 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 189 55.0 1e-06
>>NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine,2-o (727 aa)
initn: 4970 init1: 4970 opt: 4970 Z-score: 6523.4 bits: 1217.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4970; 100.0% identity (100.0% similar) in 727 aa overlap (1-727:1-727)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQFFNYKIQALGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQFFNYKIQALGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGPRELLKKFRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGPRELLKKFRQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAEWEGQDSDSDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAEWEGQDSDSDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARNLAYDTLPVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARNLAYDTLPVLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANAD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSDLFHHSKLDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSDLFHHSKLDPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 MAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 IHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 TFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYI
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 AVSFVDP
:::::::
NP_000 AVSFVDP
>>NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine, (774 aa)
initn: 4956 init1: 4808 opt: 4808 Z-score: 6310.1 bits: 1178.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4808; 100.0% identity (100.0% similar) in 702 aa overlap (26-727:73-774)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQFFNYKI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGRDFTVLAGARGSPSPSVSSIPRFWIPGSDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQFFNYKI
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QALGLGEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGPRELLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QALGLGEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGPRELLK
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAEWEGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAEWEGQD
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARNLAYDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARNLAYDT
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIE
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVR
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLW
410 420 430 440 450 460
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSDLFHHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSDLFHHS
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYI
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 HQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYEN
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMP
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 HHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTR
710 720 730 740 750 760
720
pF1KB5 GTRYIAVSFVDP
::::::::::::
NP_001 GTRYIAVSFVDP
770
>--
initn: 193 init1: 162 opt: 162 Z-score: 204.2 bits: 48.5 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 162; 100.0% identity (100.0% similar) in 25 aa overlap (1-25:1-25)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQFFNYKIQALGL
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPEAPCCQEGLRAGGSGSLHLGRDFTVLAGARGSPSPS
10 20 30 40 50 60
>>NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o (737 aa)
initn: 3159 init1: 2076 opt: 3165 Z-score: 4151.2 bits: 778.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3165; 59.8% identity (85.1% similar) in 734 aa overlap (1-727:6-737)
10 20 30 40
pF1KB5 MRP-LLLLALL--GW--LLLAEA-KGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQ
..: ::::::. : : :.. : .. : :.:::.::::::..::.:: .::.
NP_000 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFAS
.::: ...:: ::.: : .: ::::::::.:...:..::..:::..:.. .::.::.
NP_000 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLV
::.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....:
NP_000 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 AEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRA
.:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::
NP_000 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTV
.: :.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.:
NP_000 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNV
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVK
.::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:
NP_000 SIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLM
.:::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.
NP_000 IVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQS
::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:..
NP_000 TRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPE
. : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.::: .: :.: .::::..: ::
NP_000 RNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 DWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNR
:::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.:.:: :...:.:
NP_000 DWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSR
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 IQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPD
:.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :.. ::::.. : :::.:.:.
NP_000 ISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPE
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 EQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYH
.: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::..:::::::: :
NP_000 RQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLH
660 670 680 690 700 710
710 720
pF1KB5 EGLPTTRGTRYIAVSFVDP
::::. :::::::::.::
NP_000 EGLPVKNGTRYIAVSFIDP
720 730
>>NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine,2-o (738 aa)
initn: 3080 init1: 1061 opt: 3081 Z-score: 4040.7 bits: 758.3 E(85289): 2.5e-218
Smith-Waterman score: 3081; 58.6% identity (82.8% similar) in 734 aa overlap (3-727:8-738)
10 20 30 40
pF1KB5 MRPLLLLALLGWLLLAEAKGDAKPE-------DNLLVLTVATKETEGFRRFKRSA
: .:: :: :: :... .:. ..:::.:::: ::::. :: :::
NP_001 MTSSGPGPRFLL-LLPLLLPPAASASDRPRGRDPVNPEKLLVITVATAETEGYLRFLRSA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 QFFNYKIQALGLGEDW-NVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFA
.:::: ...:::::.: . . . ..::::::: ::: .::.::.::..:.:.:::::..:
NP_001 EFFNYTVRTLGLGEEWRGGDVARTVGGGQKVRWLKKEMEKYADREDMIIMFVDSYDVILA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SGPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKL
..: :::::: :. :...:::: . .:. : .:: :. :::::.::::::.: .. ..
NP_001 GSPTELLKKFVQSGSRLLFSAESFCWPEWGLAEQYPEVGTGKRFLNSGGFIGFATTIHQI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 VAEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVR
: .:. .:.:.::::::...::: ::.....:::. ::::::.::::::::::. ..::
NP_001 VRQWKYKDDDDDQLFYTRLYLDPGLREKLSLNLDHKSRIFQNLNGALDEVVLKFDRNRVR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 ARNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPT
::.::::::...::::::::::::::::.: :: : :: :.. :.: : :. :
NP_001 IRNVAYDTLPIVVHGNGPTKLQLNYLGNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPG-GQPP-PR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VLVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSV
:...::.::::::. :.:::: : :: .. ::.::.: :. .. . : .....:
NP_001 VFLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPPDRVTLFLHNNEVFHEPHIADSWPQLQDHFSAV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KLVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPL
:::::: .. ..::.:. :::::: : .:::.:::..::. ..::.::..:..::::.
NP_001 KLVGPEEALSPGEARDMAMDLCRQDPECEFYFSLDADAVLTNLQTLRILIEENRKVIAPM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 MTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQ
..:::.:::::::::: : :::::::::..:: .:::::::::::. :.:.:..:: ::
NP_001 LSRHGKLWSNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIRGDTLRMELP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SSDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNP
. :.: : ::::::: ..:.. .:. :.:.: .:.::. . : : ::: :::..:.::
NP_001 QRDVFSGSDTDPDMAFCKSFRDKGIFLHLSNQHEFGRLLATSRYDTEHLHPDLWQIFDNP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 EDWKEKYIHQNYTKALAGK-LVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKD
::::.:::.::..:: :. .:: :::::::::...: ::::: ::::.:::: : ..:
NP_001 VDWKEQYIHENYSRALEGEGIVEQPCPDVYWFPLLSEQMCDELVAEMEHYGQWSGGRHED
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 NRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYK
.:. ::::::::.::::.:.:.: .: ..: :..::::.:.:::.:.:. . :::::.
NP_001 SRLAGGYENVPTVDIHMKQVGYEDQWLQLLRTYVGPMTESLFPGYHTKARAVMNFVVRYR
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 PDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTH
::::::: ::::.::::.:.:::. :.::::::::::::.: : .:::::.:.:::::::
NP_001 PDEQPSLRPHHDSSTFTLNVALNHKGLDYEGGGCRFLRYDCVISSPRKGWALLHPGRLTH
660 670 680 690 700 710
710 720
pF1KB5 YHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
:::::::: ::::: ::::::
NP_001 YHEGLPTTWGTRYIMVSFVDP
720 730
>>XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla (666 aa)
initn: 2870 init1: 1164 opt: 1164 Z-score: 1522.1 bits: 292.1 E(85289): 4.8e-78
Smith-Waterman score: 2869; 58.8% identity (83.7% similar) in 668 aa overlap (81-727:1-666)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FNYKIQALGLGEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGP
.:...:..::..:::..:.. .::.::.::
XP_005 MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAE
.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....: .
XP_005 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARN
:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::.:
XP_005 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLV
:.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.: .
XP_005 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNVSI
160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLV
::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:.:
XP_005 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTR
::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.::
XP_005 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 HGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSD
::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:.. .
XP_005 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
330 340 350 360 370 380
480 490 500
pF1KB5 LFHHSKLDPDMAFCANIRQ---------------------QDVFMFLTNRHTLGHLLSLD
: ..:::::::.: : :. . :::...::: .:.:::
XP_005 YFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTA
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDEL
.: :.: .::::..: :: :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::
XP_005 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYP
::::::.:.:: :...:.::.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :..
XP_005 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 GYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSI
::::.. : :::.:.:..: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::
XP_005 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720
pF1KB5 RAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
..:::::..:::::::: :::::. :::::::::.::
XP_005 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
630 640 650 660
>>XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla (666 aa)
initn: 2870 init1: 1164 opt: 1164 Z-score: 1522.1 bits: 292.1 E(85289): 4.8e-78
Smith-Waterman score: 2869; 58.8% identity (83.7% similar) in 668 aa overlap (81-727:1-666)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FNYKIQALGLGEDWNVEKGTSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFASGP
.:...:..::..:::..:.. .::.::.::
XP_016 MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLVAE
.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....: .
XP_016 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRARN
:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::.:
XP_016 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLV
:.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.: .
XP_016 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNVSI
160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVKLV
::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:.:
XP_016 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTR
::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.::
XP_016 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 HGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSD
::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:.. .
XP_016 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
330 340 350 360 370 380
480 490 500
pF1KB5 LFHHSKLDPDMAFCANIRQ---------------------QDVFMFLTNRHTLGHLLSLD
: ..:::::::.: : :. . :::...::: .:.:::
XP_016 YFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTA
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDEL
.: :.: .::::..: :: :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::
XP_016 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 VEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYP
::::::.:.:: :...:.::.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :..
XP_016 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 GYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSI
::::.. : :::.:.:..: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::
XP_016 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720
pF1KB5 RAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
..:::::..:::::::: :::::. :::::::::.::
XP_016 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
630 640 650 660
>>NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o (758 aa)
initn: 3131 init1: 1164 opt: 1164 Z-score: 1521.2 bits: 292.1 E(85289): 5.4e-78
Smith-Waterman score: 3115; 58.1% identity (82.8% similar) in 755 aa overlap (1-727:6-758)
10 20 30 40
pF1KB5 MRP-LLLLALL--GW--LLLAEA-KGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQ
..: ::::::. : : :.. : .. : :.:::.::::::..::.:: .::.
NP_891 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFAS
.::: ...:: ::.: : .: ::::::::.:...:..::..:::..:.. .::.::.
NP_891 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLV
::.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....:
NP_891 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 AEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRA
.:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::
NP_891 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTV
.: :.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.:
NP_891 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNV
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVK
.::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:
NP_891 SIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLM
.:::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.
NP_891 IVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQS
::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:..
NP_891 TRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KB5 SDLFHHSKLDPDMAFCANIRQ---------------------QDVFMFLTNRHTLGHLLS
. : ..:::::::.: : :. . :::...::: .:.:::
NP_891 RNYFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 LDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACD
.: :.: .::::..: :: :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::
NP_891 TANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACD
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 ELVEEMEHFGQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKL
::::::::.:.:: :...:.::.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :.
NP_891 ELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKV
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 YPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNC
. ::::.. : :::.:.:..: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::
NP_891 FAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNC
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720
pF1KB5 SIRAPRKGWTLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
::..:::::..:::::::: :::::. :::::::::.::
NP_891 SIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
720 730 740 750
>>XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable inacti (517 aa)
initn: 197 init1: 105 opt: 189 Z-score: 242.4 bits: 55.0 E(85289): 9.2e-07
Smith-Waterman score: 200; 29.1% identity (57.0% similar) in 151 aa overlap (361-505:55-192)
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 AQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEP
::: ::: : . .:.: ::.
XP_011 RFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFARNWGAD---------YILFADTDNILTNN
30 40 50 60 70
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 NSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPY
..::::. :. :.::.. . .:::: ... .::: :. .: . .: : . ::.
XP_011 QTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPM
80 90 100 110 120 130
460 470 480 490 500
pF1KB5 ISNIYLIKGSALRGELQSSDLFH--HSK----LDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGH
. . .: ..::.: .. :. : . .: ..: . : . . :.: :.
XP_011 VHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGY
140 150 160 170 180 190
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 LLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEV
.
XP_011 MNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLAR
200 210 220 230 240 250
>>NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glycosyl (517 aa)
initn: 197 init1: 105 opt: 189 Z-score: 242.4 bits: 55.0 E(85289): 9.2e-07
Smith-Waterman score: 200; 29.1% identity (57.0% similar) in 151 aa overlap (361-505:55-192)
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 AQVEEFLAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEP
::: ::: : . .:.: ::.
NP_001 RFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFARNWGAD---------YILFADTDNILTNN
30 40 50 60 70
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 NSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPY
..::::. :. :.::.. . .:::: ... .::: :. .: . .: : . ::.
NP_001 QTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPM
80 90 100 110 120 130
460 470 480 490 500
pF1KB5 ISNIYLIKGSALRGELQSSDLFH--HSK----LDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGH
. . .: ..::.: .. :. : . .: ..: . : . . :.: :.
NP_001 VHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGY
140 150 160 170 180 190
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 LLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEV
.
NP_001 MNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLAR
200 210 220 230 240 250
>>XP_016870283 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable inacti (595 aa)
initn: 172 init1: 105 opt: 189 Z-score: 241.5 bits: 55.0 E(85289): 1e-06
Smith-Waterman score: 229; 25.4% identity (54.6% similar) in 260 aa overlap (279-505:24-270)
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 QLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPFVSLFFQRL
:... ::.:..... .. . .. :
XP_016 MRAARAAPLLQLLLLLGPWLEAAGVAESPLPAVVLAILARNAEHSLPHYLGAL
10 20 30 40 50
310 320 330 340 350
pF1KB5 LRLHYPQKHMRLF-IHNHEQHHKAQV-EEFLAQHGSEYQSV--------KLV----GP--
:: ::. .: :. .:. . ... .:.:: :..: .: .. ::
XP_016 ERLDYPRARMALWCATDHNVDNTTEMLQEWLAAVGDDYAAVVWRPEGEPRFYPDEEGPKH
60 70 80 90 100 110
360 370 380 390 400
pF1KB5 ----------EVRM-ANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNK
:... : . ::: ::: : . .:.: ::. ..::::. :.
XP_016 WTKERHQFLMELKQEALTFARNWGAD---------YILFADTDNILTNNQTLRLLMGQGL
120 130 140 150 160
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 NVIAPLMTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSA
:.::.. . .:::: ... .::: :. .: . .: : . ::.. . .: ..
XP_016 PVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTFL---AS
170 180 190 200 210 220
470 480 490 500 510
pF1KB5 LRGELQSSDLFH--HSK----LDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTH
::.: .. :. : . .: ..: . : . . :.: :..
XP_016 LRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGYMNVPVKSHQGL
230 240 250 260 270 280
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEH
XP_016 EDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLARRPDRRERMLAS
290 300 310 320 330 340
727 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:34:55 2016 done: Thu Nov 3 22:34:57 2016
Total Scan time: 9.250 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]