Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5508, 543 aa
1>>>pF1KB5508 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6262+/-0.000936; mu= 17.0063+/- 0.056
mean_var=75.9211+/-15.111, 0's: 0 Z-trim(106.0): 35 B-trim: 99 in 1/50
Lambda= 0.147195
statistics sampled from 8686 (8719) to 8686 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19 ( 543) 3628 780.2 0
CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 ( 534) 2608 563.6 2.1e-160
CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2 ( 535) 2608 563.6 2.1e-160
CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 ( 548) 2608 563.6 2.1e-160
CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15 ( 541) 2496 539.8 3e-153
CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16 ( 431) 727 164.1 3.1e-40
CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16 ( 473) 727 164.1 3.3e-40
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1 ( 896) 347 83.6 1.1e-15
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 601) 344 82.8 1.2e-15
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 754) 344 82.9 1.5e-15
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 864) 344 82.9 1.7e-15
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 910) 344 82.9 1.7e-15
>>CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19 (543 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 4163.9 bits: 780.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
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CCDS12 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
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CCDS12 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
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CCDS12 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
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CCDS12 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
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CCDS12 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
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CCDS12 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SAE
:::
CCDS12 SAE
>>CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 (534 aa)
initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608 Z-score: 2993.3 bits: 563.6 E(32554): 2.1e-160
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::::::::::::.:::
CCDS80 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: :::.:::::::::: .
CCDS80 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
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CCDS80 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
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CCDS80 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
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CCDS80 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
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CCDS80 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LESTEVGVQGGAFEGTHM
:::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: : ..: :.::::.::
CCDS80 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQV-VKGGAFDGTMN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGT
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CCDS80 GPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHK
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CCDS80 KLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 GSAE
>>CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2 (535 aa)
initn: 2602 init1: 2142 opt: 2608 Z-score: 2993.3 bits: 563.6 E(32554): 2.1e-160
Smith-Waterman score: 2608; 71.7% identity (89.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
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CCDS17 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
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CCDS17 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
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CCDS17 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
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CCDS17 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::.:.::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::::::.:::.:::::::::.::
CCDS17 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
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CCDS17 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
. :.:.::.::. :: ::::..:.::.::::.:: :.:::: . :.::::::: :
CCDS17 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
:: : . : . :: :: :::::..:: ::::::.:.:.:::..:..:: :: .:
CCDS17 PF---GHGYG-EGAGEGIDD-AEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSK
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
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CCDS17 LPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SAE
>>CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 (548 aa)
initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608 Z-score: 2993.2 bits: 563.6 E(32554): 2.1e-160
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:15-548)
10 20 30 40
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFH
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::
CCDS73 MEQPGTAASPVSGSMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SPALEDADFDGKPMVLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTE
::::::::::.:::::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: ::
CCDS73 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GTVPGNALVVDPDKPFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVS
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CCDS73 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 RGYDFPAVLRWFAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVET
::::: :::.::::::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::
CCDS73 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 QQLMRVYGALMWALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLP
::::::::::::.:::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.::
CCDS73 QQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 RHAALRKLNDLVKRARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEH
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CCDS73 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 HISPGDFPDCQKMQELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LEST
.:::::::. .::::::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: : .
CCDS73 QISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 EVGVQGGAFEGTHMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADG
.: :.::::.:: ::: : . : . :: :: .:::: ::: ::::::.:.:..:
CCDS73 QV-VKGGAFDGTMNGPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNG
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 KLSGSKAKTWMVGTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPAN
:..:..:: :: .::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.
CCDS73 KITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPAD
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB5 LPRRLVPPSKRRHKGSAE
:: .:::::::::.
CCDS73 LPPHLVPPSKRRHE
540
>>CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15 (541 aa)
initn: 2486 init1: 2024 opt: 2496 Z-score: 2864.7 bits: 539.8 E(32554): 3e-153
Smith-Waterman score: 2496; 68.9% identity (86.6% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-541)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MFSWLKR--GG-ARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDG
::::. : :: :. .:..:::..:. :: :.::::: ::: :::::::::::..
CCDS10 MFSWMGRQAGGRERAGGADAVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFEN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KPMVLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVD
:::.:..::::::::.::.:::::. :: :.::::::: :.:::.:.:::..::::::::
CCDS10 KPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PDKPFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRW
: ::::::. :::.:::::::.:::::::.:::.::.:::::: :::.:::::: ::.:
CCDS10 PKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALM
:::::: ::::::::::.::::::::: :.::..:::::::::::.:.::::::::::::
CCDS10 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 WALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDL
:.::::..:::::::::::::.::: ::::::: : ::::::::.::..::.::::::
CCDS10 WSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VKRARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQ
.:::::..:::::::::::::::::::::::..:: .:: :. ..: :..:: ::::. .
CCDS10 IKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KMQELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGT
::: : .::::::::::::.::.:.::.. :. :: :. ::: . ::::::.::
CCDS10 AMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDGT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 HMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMV
::: ..: :. ..::.:.: ::::.::: :::.::.:.: .::.:: .:: ::
CCDS10 TEGPF-NQGYGEG---AKEGADEE-EWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEMV
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRR
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CCDS10 TSKLPNSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRK
480 490 500 510 520 530
540
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.:.
CCDS10 SLPKAD
540
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CCDS81 VLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKTIEGIVMAADS
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CCDS81 ARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIENRKQQ-ERGYPFNDVCQWF
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CCDS81 IDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNKADNLATQMLMRVYGALFW
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.:. .... : :::..::: : ...:: :: .:..:.. . .. :. .
CCDS81 SLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLEDLNQVIENRLENKIAFIR
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pF1KB5 KRARLVRVHAYIIS-YLK--KEMPSVFGKENKKKQLILKLP---VIFAKIQLEHHISPGD
..: ::.:: ... ::. :. . :. . . :.. : :: : . ..: :
CCDS81 QHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKMTFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTILAKTNVSKFD
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.:. . ..... . ...:. :. . .:: ... .:... :.
CCDS81 LPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAITQELPGLLGSLGLGKNPGA
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410 420 430 440 450 460
pF1KB5 EVGVQGGAFEGTHMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADG
CCDS81 LNCDKTGCSETPKNRYRKH
420 430
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPAL
: . :...:.... :::. :... ... .
CCDS42 ANEEAPLRDRSHIEKTLMLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKYNELRQHEI
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60 70 80 90 100
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CCDS42 TDGEITSKPMVLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKT
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CCDS42 IEGIVMAADSARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIENRKQQ-ERG
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170 180 190 200 210 220
pF1KB5 YDFPAVLRWFAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQ
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CCDS42 YPFNDVCQWFIDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNKADNLATQM
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LMRVYGALMWALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRH
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CCDS42 LMRVYGALFWSLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLEDLNQVIEN
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CCDS42 RLENKIAFIRQHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKMTFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTI
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. ..: :.:. . ..... . ...:. :. . .:: ... .:... :.
CCDS42 LAKTNVSKFDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAITQELPGLLG
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CCDS42 SLGLGKNPGALNCDKTGCSETPKNRYRKH
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CCDS55 GLEVSLSSLNLAVPPPRFHDTSSPLLISGTSAAELPWAVKPEDKAKYDAIFDSLSPVNGF
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CCDS55 LSGDKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVPMSL
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CCDS55 PPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSTLLAHI
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CCDS59 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
90 100 110 120 130 140
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pF1KB5 SKAKTWMVGTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRR
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CCDS59 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
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:.:::::.
CCDS59 LIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTV
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CCDS58 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
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pF1KB5 SKAKTWMVGTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRR
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CCDS58 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]