Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5497, 479 aa
1>>>pF1KB5497 479 - 479 aa - 479 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0777+/-0.00137; mu= 5.4789+/- 0.080
mean_var=227.5463+/-45.956, 0's: 0 Z-trim(108.4): 956 B-trim: 34 in 1/51
Lambda= 0.085024
statistics sampled from 9144 (10176) to 9144 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 478) 3291 417.2 1.9e-116
CCDS75414.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 344) 2388 306.3 3.3e-83
CCDS75415.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 270) 1931 250.1 2.1e-66
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 1046 141.9 1.6e-33
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 1029 139.8 7.2e-33
CCDS11068.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 444) 1005 136.8 4.7e-32
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 1000 136.3 8.2e-32
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 991 135.2 1.9e-31
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 991 135.2 2e-31
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 991 135.2 2e-31
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 991 135.2 2.1e-31
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 981 133.7 3.1e-31
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 981 133.9 3.7e-31
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 981 133.9 3.9e-31
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 973 132.9 7.7e-31
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 975 133.3 8e-31
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 970 132.5 1e-30
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 971 132.8 1.1e-30
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 969 132.6 1.3e-30
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 961 131.5 2.3e-30
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 957 131.0 3.3e-30
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 957 131.1 3.6e-30
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 958 131.2 3.6e-30
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 952 130.4 5.1e-30
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 952 130.4 5.4e-30
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 953 130.6 5.6e-30
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 949 129.9 5.8e-30
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 952 130.5 6.2e-30
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 952 130.5 6.4e-30
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 948 130.0 8.2e-30
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 948 130.0 8.4e-30
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 947 129.8 8.6e-30
CCDS2718.2 ZNF35 gene_id:7584|Hs108|chr3 ( 527) 945 129.5 8.6e-30
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 950 130.5 9.7e-30
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 950 130.5 9.8e-30
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 945 129.6 1e-29
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 939 128.6 1.1e-29
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 940 128.8 1.2e-29
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 941 129.0 1.2e-29
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 941 129.0 1.2e-29
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 941 129.0 1.2e-29
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 941 129.0 1.2e-29
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 941 129.0 1.3e-29
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 943 129.4 1.3e-29
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 940 128.9 1.3e-29
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 940 128.9 1.4e-29
CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs108|chr3 ( 271) 933 127.7 1.5e-29
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 937 128.5 1.6e-29
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 938 128.7 1.6e-29
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 938 128.7 1.6e-29
>>CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 (478 aa)
initn: 2844 init1: 2391 opt: 3291 Z-score: 2204.1 bits: 417.2 E(32554): 1.9e-116
Smith-Waterman score: 3291; 99.8% identity (99.8% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATALVSAHSLAPLNLKKEGLRVVREDHYSTWEQGFKLQGNSKGLGQEPLCKQFRQLRYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MATALVSAHSLAPLNLKKEGLRVVREDHYSTWEQGFKLQGNSKGLGQEPLCKQFRQLRYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ETTGPREALSRLRELCQQWLQPETHTKEQILELLVLEQFLIILPKELQARVQEHHPESRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ETTGPREALSRLRELCQQWLQPETHTKEQILELLVLEQFLIILPKELQARVQEHHPESRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DVVVVLEDLQLDLGETGQQVDPDQPKKQKILVEEMAPLKGVQEQQVRHECEVTKPEKEKG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DVVVVLEDLQLDLGETGQQ-DPDQPKKQKILVEEMAPLKGVQEQQVRHECEVTKPEKEKG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERHQAKPKEKIEYKCSEREQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERHQAKPKEKIEYKCSEREQR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLVR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQRI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB5 KPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKLA
420 430 440 450 460 470
>>CCDS75414.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 (344 aa)
initn: 2388 init1: 2388 opt: 2388 Z-score: 1607.2 bits: 306.3 E(32554): 3.3e-83
Smith-Waterman score: 2388; 99.7% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (140-479:5-344)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 RVQEHHPESREDVVVVLEDLQLDLGETGQQVDPDQPKKQKILVEEMAPLKGVQEQQVRHE
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MATALDPDQPKKQKILVEEMAPLKGVQEQQVRHE
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 CEVTKPEKEKGEETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERHQAKPKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CEVTKPEKEKGEETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERHQAKPKEK
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 IEYKCSEREQRFIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IEYKCSEREQRFIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECG
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KAFQRSSHLVRHQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAFQRSSHLVRHQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFR
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 RSSHLNRHQRIHSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RSSHLNRHQRIHSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSD
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LIRHHRIHTGEKPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIRHHRIHTGEKPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQH
280 290 300 310 320 330
470
pF1KB5 QRYHHKDKLA
::::::::::
CCDS75 QRYHHKDKLA
340
>>CCDS75415.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 (270 aa)
initn: 1931 init1: 1931 opt: 1931 Z-score: 1305.6 bits: 250.1 E(32554): 2.1e-66
Smith-Waterman score: 1931; 100.0% identity (100.0% similar) in 270 aa overlap (210-479:1-270)
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GEETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERHQAKPKEKIEYKCSEREQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEAHNEGSNLERHQAKPKEKIEYKCSEREQ
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RFIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RFIQHLDLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLV
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RHQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RHQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQR
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 IHSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IHSQEEPCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTG
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 EKPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKPFKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKLA
220 230 240 250 260 270
>>CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 (538 aa)
initn: 2280 init1: 671 opt: 1046 Z-score: 715.2 bits: 141.9 E(32554): 1.6e-33
Smith-Waterman score: 1122; 41.3% identity (62.4% similar) in 489 aa overlap (33-457:31-514)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 TALVSAHSLAPLNLKKEGLRVVREDHYSTWEQGFKLQGNSKGLGQEPLCKQFRQLRYEET
: :: .: ::.: ..:: .:: :.
CCDS46 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEEEAGFP---SSPDLGSEGSRERFRGFRYPEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TGPREALSRLRELCQQWLQPETHTKEQILELLVLEQFLIILPKELQARVQEHHPESREDV
.:::::::::::::.:::::: :.:::::::::::::: ::: .::. :.:.:::: :.:
CCDS46 AGPREALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 VVVLEDLQLDLGETGQQVDP-DQPKKQKILVEEMA---PLKGVQEQQ-------VRHECE
::.:: :. .: : . ::. :: :..: .:: : : : .: ..::
CCDS46 VVLLEYLERQLDEPAPQVSGVDQG--QELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB5 VTKPEKEK---------G---EETRIENGKLIVVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGS--
..: ... : .: .. ..: ... .::. . : .....:
CCDS46 GSQPLQDRVLQVPVLAHGGCCREDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB5 NLERHQAKPKEKI------EYKCSEREQRFIQHLDLIEHA--STHTGKKLCESDVC----
:: : . . .. : . . :. ..: ::. : : . . . .:
CCDS46 NLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 -QSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLVRHQKIHLGEKPYQCNECGKVFSQNA
: . : ..: . . : ::::::.: .:: : .:..:: :::::.:.::::.: ..
CCDS46 EQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 GLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQRIHSQEEPCECKECGKTFSQALLLTH
.:. : :.::::::: : .::: : .:: : .::: :. :.: :: .:::::::. : .
CCDS46 ALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLE
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420
pF1KB5 HQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGEK----P------------------
:.:::. : .::. ::::: .: :.::.:::::.: :
CCDS46 HHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVE
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KB5 ----FKCNICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKL
.::: :...: :. : .: .::. ::::::. ::
CCDS46 TPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHVGKNI
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 A
CCDS46 LSQ
>>CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 (578 aa)
initn: 4052 init1: 886 opt: 1029 Z-score: 703.5 bits: 139.8 E(32554): 7.2e-33
Smith-Waterman score: 1229; 42.6% identity (63.1% similar) in 509 aa overlap (64-477:64-572)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 QGFKLQGNSKGLGQEPLCKQFRQLRYEETTGPREALSRLRELCQQWLQPETHTKEQILEL
:::::: .:: ::.:::.:. .::::::::
CCDS46 DQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILEL
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140
pF1KB5 LVLEQFLIILPKELQARVQEHHPESREDVVVVLEDL--QLD-LGET------GQQV----
::::::: :::.:::. :.::. :. :.::..:::: :.: ::. :..:
CCDS46 LVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGEEVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEE
100 110 120 130 140 150
150 160
pF1KB5 ------DPDQPKKQ------------------KILVEEMAPLK------GVQEQQ-----
:. :. : . . ..: . : ::.
CCDS46 VVHSASAPEPPNTQLQSEATQHKSPVPQESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLT
160 170 180 190 200 210
170 180 190
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200 210 220 230 240
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.. : . :...: . : ::.. . :::....: .. ..::.: . : :
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:..: :::.: . .:: . :.: .:. . .. : ..:.::::::.... :
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300 310 320 330 340 350
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. ::.:: ::::::::.:::.:::.:::. : :::.::.:: : .::: : .:::: ::
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:::. :.: :: :::::: .. : ::: :. : ..:::::.::: : ::.:.::::
CCDS46 RIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHLIGHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHT
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pF1KB5 A
CCDS46 ESISV
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:. : ..:: ... . . :.: :.:.. .. : :::.. . ...:.. .:
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.. :.. . .. : .: :: .. :. :. .. : . :
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. ::.. . .: :.: ::::.: .:::: ::..: :::::.:..:::.:.:...: .:
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: : :.:::::.. :.::::.:.:. ..:
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CCDS46 LRELCGQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVLLEYLER
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: .: . ..: ... ..:. . : .. ..: :: : . . .
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CCDS46 EKPYECEECGKVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHKIHTGEKPY
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CCDS46 ERSFTRNRSLIEHQKIHTGEKPYQCDTCGKGFTRTSYLVQHQRSHVGKKTLSQ
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CCDS74 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS12 GKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAF
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