Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5477, 391 aa
1>>>pF1KB5477 391 - 391 aa - 391 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0361+/-0.000959; mu= 0.9236+/- 0.056
mean_var=284.3959+/-72.806, 0's: 0 Z-trim(114.3): 61 B-trim: 1484 in 2/49
Lambda= 0.076052
statistics sampled from 14821 (14890) to 14821 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.789), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8100.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 ( 391) 2773 317.4 1.4e-86
CCDS81583.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 ( 405) 1454 172.7 5.3e-43
CCDS46064.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 ( 414) 1265 152.0 9.3e-37
CCDS61497.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 ( 378) 1191 143.8 2.4e-34
CCDS46065.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 ( 332) 992 121.9 8.3e-28
CCDS45133.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 ( 357) 665 86.1 5.5e-17
CCDS61495.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 ( 367) 665 86.1 5.6e-17
CCDS61496.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 ( 412) 665 86.2 6.1e-17
CCDS33008.2 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 ( 380) 529 71.2 1.8e-12
CCDS58084.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1781) 508 69.6 2.6e-11
CCDS58085.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1890) 508 69.6 2.7e-11
CCDS7345.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (2073) 508 69.7 2.8e-11
CCDS83290.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 ( 815) 489 67.1 6.3e-11
>>CCDS8100.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 2773 init1: 2773 opt: 2773 Z-score: 1667.9 bits: 317.4 E(32554): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 2773; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
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CCDS81 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB5 MSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
370 380 390
>>CCDS81583.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 (405 aa)
initn: 2758 init1: 1454 opt: 1454 Z-score: 885.6 bits: 172.7 E(32554): 5.3e-43
Smith-Waterman score: 2734; 96.3% identity (96.5% similar) in 405 aa overlap (1-391:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB5 GKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACD--------------ICGKRYKNRPGLSY
:::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::
CCDS81 GKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDNSFKQKHTSKAPQRVCGKRYKNRPGLSY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 HYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB5 DCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
370 380 390 400
>>CCDS46064.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 (414 aa)
initn: 1704 init1: 664 opt: 1265 Z-score: 773.4 bits: 152.0 E(32554): 9.3e-37
Smith-Waterman score: 1615; 59.7% identity (77.1% similar) in 402 aa overlap (1-385:28-410)
10 20 30
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCA
::.:. . ..: ::..:..:.:.:..:::::::
CCDS46 MGGLSARPTAGRTDPAGTCWGQDPGSKMATVIPGPLSL-GEDFYREAIEHCRSYNARLCA
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRL
:::.:::::::::::::.:::::::: ::::::: ::.:.:::: :::::: . :::::
CCDS46 ERSLRLPFLDSQTGVAQNNCYIWMEKTHRGPGLAPGQIYTYPARCWRKKRRLNILEDPRL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 SFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRA
: : . ::::: . . : ::::: .. ::. .. : : . .
CCDS46 RPCEYKIDCEAPLKKEGGLPE-GPVLEALLCAETGEKK------IE---LKEEETIMDCQ
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 RKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDI
....:: : ::. :: :.: :.:....:.:. :.:. ::. :.. ::::::::.:::
CCDS46 KQQLLE---FPHDLEVEDLEDDIPRRKNRAKGKAYGIGGLRKRQDTASLEDRDKPYVCDI
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250
pF1KB5 CGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQP-P----------------TPVSQRSEE
:::::::::::::::.:.::::::::.. . . : .: .:: .
CCDS46 CGKRYKNRPGLSYHYTHTHLAEEEGEENAERHALPFHRKNNHKQFYKELAWVPEAQR--K
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 QKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAA
. .::.::: ..::.::::::: :: ::: ::.:.::.:::::::::::::: : ::
CCDS46 HTAKKAPDGTVIPNGYCDFCLGGSK---KTGCPEDLISCADCGRSGHPSCLQFTVNMTAA
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 VKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLD
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CCDS46 VRTYRWQCIECKSCSLCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLSPPMAEPPEGSWSCHLCLR
350 360 370 380 390 400
380 390
pF1KB5 LLKEKASIYQNQNSS
:::::: :
CCDS46 HLKEKASAYITLT
410
>>CCDS61497.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 (378 aa)
initn: 1867 init1: 1170 opt: 1191 Z-score: 730.0 bits: 143.8 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 1802; 63.0% identity (85.1% similar) in 389 aa overlap (1-388:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
::.:..: .: ::.:.::.:.:.:..::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS61 MATVIHNPLKALGDQFYKEAIEHCRSYNSRLCAERSVRLPFLDSQTGVAQNNCYIWMEKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
::::::: ::::.:::: :::::: ::::::.: . :::... :::.:. :.. ..::
CCDS61 HRGPGLAPGQLYTYPARCWRKKRRLHPPEDPKLRLLEIKPEVELPLKKDGFTSES-TTLE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDE-DYEEDTPKR
:::: . .::. : : ...:. :. .:.:: :. ... ..: : ::: :::
CCDS61 ALLRGEGVEKK--VDAR-EEESIQEI--------QRVLENDENVEEGNEEEDLEEDIPKR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGE
... .....: ...:.. ::. ::.::::.::::::::::::::::::::.::: :::.
CCDS61 KNRTRGRARGSAGGRRRHDAASQEDHDKPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYAHTHLASEEGD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCG
. .:.. .: ..:.:... .::::: ..:::::::::: :..:::.:.:::::::.:::
CCDS61 EAQDQETRSPPNHRNENHRPQKGPDGTVIPNNYCDFCLGGSNMNKKSGRPEELVSCADCG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTP
:::::.::::: : :::::.::::::: : .:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS61 RSGHPTCLQFTLNMTEAVKTYKWQCIECKSCILCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLNP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB5 SMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
..:::::::::::: .::::::: . :
CCDS61 PVAEPPEGSWSCHLCWELLKEKASAFGCQA
350 360 370
>>CCDS46065.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 (332 aa)
initn: 1457 init1: 664 opt: 992 Z-score: 612.7 bits: 121.9 E(32554): 8.3e-28
Smith-Waterman score: 1342; 58.4% identity (74.3% similar) in 346 aa overlap (57-385:1-328)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 YNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAH
::: ::::::: ::.:.:::: :::::: .
CCDS46 MEKTHRGPGLAPGQIYTYPARCWRKKRRLN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 PPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEF
::::: : : . ::::: . . : ::::: .. ::. .. : :
CCDS46 ILEDPRLRPCEYKIDCEAPLKKEGGLPE-GPVLEALLCAETGEKK------IE---LKEE
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 PVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRD
. . ....:: : ::. :: :.: :.:....:.:. :.:. ::. :.. :::::
CCDS46 ETIMDCQKQQLLE---FPHDLEVEDLEDDIPRRKNRAKGKAYGIGGLRKRQDTASLEDRD
90 100 110 120 130
210 220 230 240
pF1KB5 KPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQP-P----------------TP
:::.::::::::::::::::::.:.::::::::.. . . : .:
CCDS46 KPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYTHTHLAEEEGEENAERHALPFHRKNNHKQFYKELAWVP
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQF
.:: .. .::.::: ..::.::::::: :: ::: ::.:.::.:::::::::::::
CCDS46 EAQR--KHTAKKAPDGTVIPNGYCDFCLGGSK---KTGCPEDLISCADCGRSGHPSCLQF
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSW
: : :::.:::::::::: :..:::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::
CCDS46 TVNMTAAVRTYRWQCIECKSCSLCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLSPPMAEPPEGSW
260 270 280 290 300 310
370 380 390
pF1KB5 SCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
:::::: :::::: :
CCDS46 SCHLCLRHLKEKASAYITLT
320 330
>>CCDS45133.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 (357 aa)
initn: 1263 init1: 648 opt: 665 Z-score: 418.4 bits: 86.1 E(32554): 5.5e-17
Smith-Waterman score: 1276; 58.6% identity (84.5% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKR
::.:..: .: ::.:.::.:.:.:..::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 MATVIHNPLKALGDQFYKEAIEHCRSYNSRLCAERSVRLPFLDSQTGVAQNNCYIWMEKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLE
::::::: ::::.:::: :::::: ::::::.: . :::... :::.:. :.. ..::
CCDS45 HRGPGLAPGQLYTYPARCWRKKRRLHPPEDPKLRLLEIKPEVELPLKKDGFTSES-TTLE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 ALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDE-DYEEDTPKR
:::: . .::. : : ...:. :. .:.:: :. ... ..: : ::: :::
CCDS45 ALLRGEGVEKK--VDAR-EEESIQEI--------QRVLENDENVEEGNEEEDLEEDIPKR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGE
... .....: ...:.. ::. ::.::::.::::::::::::::::::::.::: :::.
CCDS45 KNRTRGRARGSAGGRRRHDAASQEDHDKPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYAHTHLASEEGD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCG
. .:.. .: ..:.:... .::::: ..:::::::::: :..:::.:.:::::::.:::
CCDS45 EAQDQETRSPPNHRNENHRPQKGPDGTVIPNNYCDFCLGGSNMNKKSGRPEELVSCADCG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTP
::.:
CCDS45 RSAHLGGEGRKEKEAAAAARTTEDLFGSTSESDTSTFHGFDEDDLEEPRSCRGRRSGRGS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS61495.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 (367 aa)
initn: 1233 init1: 648 opt: 665 Z-score: 418.2 bits: 86.1 E(32554): 5.6e-17
Smith-Waterman score: 1246; 59.0% identity (84.6% similar) in 293 aa overlap (12-303:22-302)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQ
::.:.::.:.:.:..::.:::::::::::::::::::::
CCDS61 MGFTDLEEPISGCPGGPWALGLGDQFYKEAIEHCRSYNSRLCAERSVRLPFLDSQTGVAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEG
.:::::::::::::::: ::::.:::: :::::: ::::::.: . :::... :::.:
CCDS61 NNCYIWMEKRHRGPGLAPGQLYTYPARCWRKKRRLHPPEDPKLRLLEIKPEVELPLKKDG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LISQDGSSLEALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDDLDDE
. :.. ..:::::: . .::. : : ...:. :. .:.:: :. ... ..:
CCDS61 FTSES-TTLEALLRGEGVEKK--VDAR-EEESIQEI--------QRVLENDENVEEGNEE
130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB5 -DYEEDTPKRRGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYA
: ::: :::... .....: ...:.. ::. ::.::::.:::::::::::::::::::
CCDS61 EDLEEDIPKRKNRTRGRARGSAGGRRRHDAASQEDHDKPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 HSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQP
:.::: :::.. .:.. .: ..:.:... .::::: ..:::::::::: :..:::.:.:
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::::::.:::::.:
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290 300 310 320 330 340
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40 50 60 70 80 90
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220 230 240 250 260 270
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:
CCDS33 AYITLT
380
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]