Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5420, 434 aa
1>>>pF1KB5420 434 - 434 aa - 434 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4496+/-0.0011; mu= 16.1872+/- 0.066
mean_var=58.8841+/-11.621, 0's: 0 Z-trim(101.3): 15 B-trim: 2 in 1/47
Lambda= 0.167138
statistics sampled from 6439 (6447) to 6439 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS97.1 ENO1 gene_id:2023|Hs108|chr1 ( 434) 2823 689.5 1.7e-198
CCDS8570.1 ENO2 gene_id:2026|Hs108|chr12 ( 434) 2437 596.4 1.7e-170
CCDS11062.1 ENO3 gene_id:2027|Hs108|chr17 ( 434) 2416 591.4 5.8e-169
CCDS54070.1 ENO3 gene_id:2027|Hs108|chr17 ( 391) 1909 469.1 3.4e-132
>>CCDS97.1 ENO1 gene_id:2023|Hs108|chr1 (434 aa)
initn: 2823 init1: 2823 opt: 2823 Z-score: 3677.2 bits: 689.5 E(32554): 1.7e-198
Smith-Waterman score: 2823; 100.0% identity (100.0% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK
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CCDS97 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV
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CCDS97 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK
::::::::::::::
CCDS97 AKFAGRNFRNPLAK
430
>>CCDS8570.1 ENO2 gene_id:2026|Hs108|chr12 (434 aa)
initn: 2437 init1: 2437 opt: 2437 Z-score: 3174.2 bits: 596.4 E(32554): 1.7e-170
Smith-Waterman score: 2437; 84.0% identity (96.8% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK
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CCDS85 MSIEKIWAREILDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKQRYLGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
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CCDS85 GVLKAVDHINSTIAPALISSGLSVVEQEKLDNLMLELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE
:::.:. .:::::::.:::::..:::::::::::::::::::::::::::::::: .::.
CCDS85 AGAAERELPLYRHIAQLAGNSDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFRD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV
:::.::::::.::.:::.::::::::::::::::::::::.:.:::.: :: :::::.:.
CCDS85 AMRLGAEVYHTLKGVIKDKYGKDATNVGDEGGFAPNILENSEALELVKEAIDKAGYTEKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD
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CCDS85 VIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPTDPSRYITGDQLGALYQDFVRDYPVVSIEDPFDQDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA
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CCDS85 WAAWSKFTANVGIQIVGDDLTVTNPKRIERAVEEKACNCLLLKVNQIGSVTEAIQACKLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..
CCDS85 QENGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEELGDE
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK
:.:::.:::::
CCDS85 ARFAGHNFRNPSVL
430
>>CCDS11062.1 ENO3 gene_id:2027|Hs108|chr17 (434 aa)
initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3146.9 bits: 591.4 E(32554): 5.8e-169
Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK
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CCDS11 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
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CCDS11 GVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE
:::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.:
CCDS11 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV
::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: :::
CCDS11 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD
:::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.::::::::::::::
CCDS11 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA
:..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.::::::
CCDS11 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.:
CCDS11 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK
: ::::.:::: ::
CCDS11 AIFAGRKFRNPKAK
430
>>CCDS54070.1 ENO3 gene_id:2027|Hs108|chr17 (391 aa)
initn: 1909 init1: 1909 opt: 1909 Z-score: 2486.9 bits: 469.1 E(32554): 3.4e-132
Smith-Waterman score: 2119; 76.3% identity (86.4% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK
:.. :: ::::.:::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.:: ::.::
CCDS54 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK
.::::::::::::::::
CCDS54 -------------------------------------------AKFGANAILGVSLAVCK
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE
:::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.:
CCDS54 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV
::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: :::
CCDS54 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD
:::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.::::::::::::::
CCDS54 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA
:..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.::::::
CCDS54 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.:
CCDS54 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK
320 330 340 350 360 370
430
pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK
: ::::.:::: ::
CCDS54 AIFAGRKFRNPKAK
380 390
434 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]