Result of FASTA (omim) for
pF1KB5383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5383, 539 aa
1>>>pF1KB5383 539 - 539 aa - 539 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5873+/-0.000522; mu= 17.5552+/- 0.032
mean_var=74.6598+/-15.073, 0's: 0 Z-trim(108.3): 67 B-trim: 444 in 1/50
Lambda= 0.148433
statistics sampled from 16347 (16397) to 16347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 8.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subun ( 539) 3355 728.5 1.2e-209
NP_001243650 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 su ( 509) 2782 605.8 1e-172
NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein ( 541) 1177 262.1 3.1e-69
NP_001293082 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 520) 1175 261.7 4e-69
NP_001293085 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 503) 1164 259.3 2e-68
NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subun ( 545) 1039 232.6 2.4e-60
NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subun ( 543) 1005 225.3 3.8e-58
XP_011530781 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 909 204.7 5.4e-52
NP_001159757 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 499) 909 204.7 5.4e-52
XP_011530780 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 909 204.7 5.4e-52
NP_110379 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 subun ( 556) 874 197.2 1.1e-49
NP_001008800 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 su ( 507) 867 195.7 2.8e-49
NP_001293084 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 448) 857 193.6 1.1e-48
NP_001293083 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 486) 857 193.6 1.2e-48
NP_006422 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 subun ( 535) 843 190.6 1e-47
NP_006575 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 subun ( 530) 813 184.2 8.8e-46
NP_001753 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 subun ( 531) 805 182.5 2.9e-45
NP_001185771 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 su ( 488) 760 172.8 2.2e-42
NP_001159756 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 456) 715 163.1 1.6e-39
XP_016879512 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 464) 666 152.7 2.4e-36
NP_001180459 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 485) 550 127.8 7.4e-29
NP_001009186 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 su ( 486) 537 125.0 5.1e-28
NP_001008897 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 su ( 401) 532 123.9 9.1e-28
NP_001009570 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 339) 519 121.1 5.5e-27
XP_011522505 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 388) 478 112.4 2.7e-24
NP_001180458 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 493) 425 101.1 8.6e-21
XP_016879513 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 351) 354 85.8 2.4e-16
NP_002147 (OMIM: 118190,605280,612233) 60 kDa heat ( 573) 233 60.0 2.3e-08
NP_955472 (OMIM: 118190,605280,612233) 60 kDa heat ( 573) 233 60.0 2.3e-08
NP_740754 (OMIM: 209900,236700,604896,605231) McKu ( 570) 212 55.5 5.2e-07
NP_061336 (OMIM: 209900,236700,604896,605231) McKu ( 570) 212 55.5 5.2e-07
>>NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subunit d (539 aa)
initn: 3355 init1: 3355 opt: 3355 Z-score: 3884.7 bits: 728.5 E(85289): 1.2e-209
Smith-Waterman score: 3355; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
490 500 510 520 530
>>NP_001243650 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subuni (509 aa)
initn: 2779 init1: 2779 opt: 2782 Z-score: 3221.9 bits: 605.8 E(85289): 1e-172
Smith-Waterman score: 3091; 94.4% identity (94.4% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ------------------------------LVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB5 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
460 470 480 490 500
>>NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 su (541 aa)
initn: 1067 init1: 427 opt: 1177 Z-score: 1364.0 bits: 262.1 E(85289): 3.1e-69
Smith-Waterman score: 1177; 38.6% identity (70.5% similar) in 536 aa overlap (10-535:5-533)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRF-----SNISAAKAVADAIRTSLGPK
:. : :: .:.:. ... :.: ::::::...::::::.
NP_036 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGS
:.:::. : ::::.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.
NP_036 GLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNS
::. .::..:::: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.:
NP_036 LLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKV
:::.. .. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... .
NP_036 KVVNSCHRQMAEIAVNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SNSGITR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKK
:. . . :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.
NP_036 SHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFT
:: :. . : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....:
NP_036 TGANLAICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELT
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ADMLGSAELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCV
:. :: : :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.::::::
NP_036 AEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGL
:: :.. .. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.
NP_036 IRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NPISTVTELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSIL
:::.:.::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::
NP_036 NPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMIL
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 KIDDVVNTR
::::.
NP_036 KIDDIRKPGESEE
530 540
>>NP_001293082 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 (520 aa)
initn: 1069 init1: 429 opt: 1175 Z-score: 1362.0 bits: 261.7 E(85289): 4e-69
Smith-Waterman score: 1175; 39.5% identity (72.1% similar) in 509 aa overlap (32-535:11-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 PENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMI
.. :.: ::::::...::::::.:.:::.
NP_001 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCT
: ::::.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.::.
NP_001 VDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 KLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQY
.::..:::: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.::::..
NP_001 QLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT
.. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... . :. .
NP_001 HRQMAEIAVNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 R-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVL
. :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.:: :.
NP_001 KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGS
. : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....::. ::
NP_001 ICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
: :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.:::::::: :..
NP_001 AGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
.. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.:::.:.
NP_001 DNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTM
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::::::.
NP_001 TEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIR
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NTR
NP_001 KPGESEE
520
>>NP_001293085 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 (503 aa)
initn: 1058 init1: 423 opt: 1164 Z-score: 1349.4 bits: 259.3 E(85289): 2e-68
Smith-Waterman score: 1164; 39.7% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (40-535:2-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVT
::::::...::::::.:.:::. : ::::
NP_001 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIH
.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.::. .::..:::
NP_001 VTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMS
: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.::::.. .. ..
NP_001 PIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR-VEKAKI
::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... . :. . . :: :::
NP_001 VNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILR
... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.:: :. . : .
NP_001 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG---
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVN
..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....::. :: : :..:..
NP_001 --FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEIS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGG
.. . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.:::::::: :.. .. ::
NP_001 FGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHA
:: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.:::.:.::.: :..
NP_001 GAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQV
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pF1KB5 QGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
. . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::::::.
NP_001 KEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
450 460 470 480 490 500
>>NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subunit g (545 aa)
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Smith-Waterman score: 1039; 34.6% identity (69.3% similar) in 515 aa overlap (27-537:16-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
:.. ... .::.:::..:: ::: ::::.: ::
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10 20 30 40
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pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
. : : ...:::: .::...:: ::::. ..:.:..:: :.:::::::.:.:: .:.
NP_005 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
..:.. .:::.. ...:::. : : .: ::..:: . .:: ..:...:..:..:
NP_005 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWS
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pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKV-IDPATATSVDLRDIKIVKKL-GGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGI
:: ....:: : .. .:.. :.:. :: :.: ...:..... :.. .
NP_005 SLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRM
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pF1KB5 TR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNV
: ... .: :.. : : . ...: .. .. :.:. :. :: .: ..: . .:
NP_005 RRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV
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pF1KB5 LLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLG
.. .:.: :::: :.: . .: .:. ... : . : .. :.. :.. ... : .:
NP_005 VITEKGI-----SDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVG
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pF1KB5 SAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
.. :.. :. . :: : .: :. ::..::..: .. :.::...::. : : ..
NP_005 TGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDP-KACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLL
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pF1KB5 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
:. :::: :. .: ::: :....:.:.. :: :.:.:::: :: .: : . : .
NP_005 DPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLL
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pF1KB5 TELRNRHAQGE-KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
: :: .:.: . .: :.: . : . .. : . .:: :.... :.::. .:.:::.:
NP_005 TSLRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NTR
.
NP_005 SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
>>NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subunit e (543 aa)
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Smith-Waterman score: 1005; 34.4% identity (68.9% similar) in 514 aa overlap (36-539:24-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 APRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGK
::::: ...:.:.::.:::.::::.: ::.
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pF1KB5 GDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQ
: .::.:::::::: ..:.::::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ..
NP_006 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE
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pF1KB5 KGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSS
.:.:: :: ..:. : . ... . ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..
NP_006 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKA
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pF1KB5 LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT--
... : :.::: . : ..:. : : : ::...: .:: :... . : .:.
NP_006 FFAKMVVDAVMMLDD-----LLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQ
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pF1KB5 --RVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCN
. .. ::.:.. : :.. :: .: : ... .. : . . ...:...: .
NP_006 PKKYHNPKIALLNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 VLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADML
:.: . : .:.: ... .. . .::.. . : . . .. ..::.:
NP_006 VVLSKLPI-----GDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVL
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pF1KB5 GSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLV
: .. ::....: . .::: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .
NP_006 GRCQVFEETQIGGE-RYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAI
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pF1KB5 KKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPIST
:. ...::::: :.::. : .::::. : .. . :.: :.:.:: : .:::.. .
NP_006 KNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNI
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pF1KB5 VTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
...:: ::::: :... . :.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:...
NP_006 LNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETI
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 -NTR
: :
NP_006 KNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
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30 40 50 60 70 80
pF1KB5 RDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHP
:::.: ::.: .::.:::::::: ..:.::
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pF1KB5 AARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIE
::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ...:.:: :: ..:. : . ...
XP_011 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 ILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATS
. ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..... : :.::: . :
XP_011 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDD-----L
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210 220 230 240 250
pF1KB5 VDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT----RVEKAKIGLIQFCLSAPKT
..:. : : : ::...: .:: :... . : .:. . .. ::.:.. : :.
XP_011 LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 DMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFL
. :: .: : ... .. : . . ...:...: .:.: . : .:.: ...
XP_011 EKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPI-----GDVATQYF
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 NKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKIT
.. . .::.. . : . . .. ..::.:: .. ::....: . .:
XP_011 ADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGE-RYNFFT
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 GCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLT
:: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .:. ...::::: :.::. :
XP_011 GCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLR
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 EYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTAGINVRK
.::::. : .. . :.: :.:.:: : .:::.. . ...:: ::::: :... .
XP_011 DYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINN
380 390 400 410 420 430
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pF1KB5 GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV-NTR
:.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:... : :
XP_011 EDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGR
440 450 460 470 480 490
XP_011 PH
>>NP_001159757 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subuni (499 aa)
initn: 804 init1: 384 opt: 909 Z-score: 1054.4 bits: 204.7 E(85289): 5.4e-52
Smith-Waterman score: 909; 33.3% identity (67.7% similar) in 493 aa overlap (57-539:1-480)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 RDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHP
:::.: ::.: .::.:::::::: ..:.::
NP_001 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 AARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIE
::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ...:.:: :: ..:. : . ...
NP_001 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 ILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATS
. ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..... : :.::: . :
NP_001 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDD-----L
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB5 VDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT----RVEKAKIGLIQFCLSAPKT
..:. : : : ::...: .:: :... . : .:. . .. ::.:.. : :.
NP_001 LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 DMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFL
. :: .: : ... .. : . . ...:...: .:.: . : .:.: ...
NP_001 EKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPI-----GDVATQYF
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 NKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKIT
.. . .::.. . : . . .. ..::.:: .. ::....: . .:
NP_001 ADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGE-RYNFFT
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 GCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLT
:: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .:. ...::::: :.::. :
NP_001 GCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLR
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pF1KB5 EYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTAGINVRK
.::::. : .. . :.: :.:.:: : .:::.. . ...:: ::::: :... .
NP_001 DYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINN
380 390 400 410 420 430
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pF1KB5 GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV-NTR
:.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:... : :
NP_001 EDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGR
440 450 460 470 480 490
NP_001 PH
>>XP_011530780 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex prote (499 aa)
initn: 804 init1: 384 opt: 909 Z-score: 1054.4 bits: 204.7 E(85289): 5.4e-52
Smith-Waterman score: 909; 33.3% identity (67.7% similar) in 493 aa overlap (57-539:1-480)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 RDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHP
:::.: ::.: .::.:::::::: ..:.::
XP_011 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 AARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIE
::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ...:.:: :: ..:. : . ...
XP_011 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 ILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATS
. ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..... : :.::: . :
XP_011 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDD-----L
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB5 VDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT----RVEKAKIGLIQFCLSAPKT
..:. : : : ::...: .:: :... . : .:. . .. ::.:.. : :.
XP_011 LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 DMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFL
. :: .: : ... .. : . . ...:...: .:.: . : .:.: ...
XP_011 EKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPI-----GDVATQYF
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 NKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKIT
.. . .::.. . : . . .. ..::.:: .. ::....: . .:
XP_011 ADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGE-RYNFFT
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 GCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLT
:: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .:. ...::::: :.::. :
XP_011 GCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLR
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
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