Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5369, 524 aa
1>>>pF1KB5369 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9643+/-0.00104; mu= 14.1955+/- 0.062
mean_var=63.3406+/-12.729, 0's: 0 Z-trim(103.4): 20 B-trim: 398 in 1/49
Lambda= 0.161151
statistics sampled from 7404 (7411) to 7404 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS217.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 ( 524) 3489 820.2 0
CCDS53275.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 ( 469) 3135 737.9 5.9e-213
CCDS53274.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 ( 447) 2845 670.5 1.1e-192
CCDS2492.1 ALPI gene_id:248|Hs108|chr2 ( 528) 1902 451.3 1.3e-126
CCDS2491.1 ALPPL2 gene_id:251|Hs108|chr2 ( 532) 1890 448.5 9.1e-126
CCDS2490.1 ALPP gene_id:250|Hs108|chr2 ( 535) 1854 440.1 3e-123
>>CCDS217.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 (524 aa)
initn: 3489 init1: 3489 opt: 3489 Z-score: 4380.7 bits: 820.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3489; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSLVPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MISPFLVLAIGTCLTNSLVPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFLGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAH
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 YKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 YKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 PHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF
490 500 510 520
>>CCDS53275.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 (469 aa)
initn: 3135 init1: 3135 opt: 3135 Z-score: 3936.7 bits: 737.9 E(32554): 5.9e-213
Smith-Waterman score: 3135; 99.8% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (56-524:1-469)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 PKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEET
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEET
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 RLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 EVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIA
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIA
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 YQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKH
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 SHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 GFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTF
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 GGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQS
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 AVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGS
400 410 420 430 440 450
510 520
pF1KB5 LAAGPLLLALALYPLSVLF
:::::::::::::::::::
CCDS53 LAAGPLLLALALYPLSVLF
460
>>CCDS53274.1 ALPL gene_id:249|Hs108|chr1 (447 aa)
initn: 2845 init1: 2845 opt: 2845 Z-score: 3572.7 bits: 670.5 E(32554): 1.1e-192
Smith-Waterman score: 2845; 99.8% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (100-524:23-447)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MPWSFRSSTPTWLRMSSCSWEMTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVG
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSD
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSD
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDG
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSE
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERE
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 NVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAAC
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520
pF1KB5 IGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF
420 430 440
>>CCDS2492.1 ALPI gene_id:248|Hs108|chr2 (528 aa)
initn: 1298 init1: 715 opt: 1902 Z-score: 2386.6 bits: 451.3 E(32554): 1.3e-126
Smith-Waterman score: 1902; 56.1% identity (79.2% similar) in 529 aa overlap (1-524:1-521)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL
: .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .. .::::.:.::
CCDS24 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQ-KVAKNLILFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL
:::.:: ::::.:::::: . . : :: : ::.::..:::::::.. ::::::.::::::
CCDS24 GDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY
:::::: :.:.:::.. ..::::.:::: :... ::.::::::.::::::.::.:...:
CCDS24 CGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES
::...:.:::: .:: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: .
CCDS24 AHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ
: . : :::: .::. : . ... . ..::::::. .:: ..: .:.::::::: .
CCDS24 DASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQGAWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD
::..:. . :::: ::. .:...: .::.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .:
CCDS24 YEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG
:: .::.::: :::::.:::::::::.::::: ::.::::::: .. :.: .:.::::
CCDS24 DAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE
::::: .: : .:. . . .:: :.:::: :::::::::::..::.:::.:::.:
CCDS24 NGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB5 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLALALYPLSVLF
:..: ::::.:::. . : : : . :: :. .: : ..:.
CCDS24 QSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
480 490 500 510 520
>>CCDS2491.1 ALPPL2 gene_id:251|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 1728 init1: 705 opt: 1890 Z-score: 2371.4 bits: 448.5 E(32554): 9.1e-126
Smith-Waterman score: 1890; 56.0% identity (79.5% similar) in 527 aa overlap (1-520:1-518)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL
: .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .: .:::.:.::
CCDS24 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNRQAAEALGAAKKLQPAQT-AAKNLIIFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL
:::::::::::::::::: . . : :: : ::.::.:::::::... .::::..::::::
CCDS24 GDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPETFLAMDRFPYVALSKTYSVDKHVPDSGATATAYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY
::::.: :.:.:::.. ..::::.:::: :... :: ::::::.::::::.::.:..::
CCDS24 CGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES
::...:.:::: ..: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: .
CCDS24 AHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ
: . :::::: .::. : . ... ....::::::: .::: .: .:.::::::::.
CCDS24 DYSQGGTRLDGKNLVQEWLA---KHQGARYVWNRTELLQASLDP-SVTHLMGLFEPGDMK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD
::..:... :::: ::. .:. .: .::.::::.::::::::::::..: .:: :.. .:
CCDS24 YEIHRDSTLDPSLMEMTEAALLLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG
:: .::.::: ::::..:::::::::.:::: ::.::::::: . :.: .:..:::
CCDS24 DAIERAGQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPG-KARDRKAYTVLLYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE
::::: . : : .:. . . .:. :::::: :::.:::::::..::.:::.:::.:
CCDS24 NGPGYVLKDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDGETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB5 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSLAA---GPLLLALALYPLSVLF
:... ::::.:::. . : : ::. : :: .. :: ::
CCDS24 QTFIAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPRAGTTDAAHPGPSVVP-ALLPLLAGTLLLLGTATA
480 490 500 510 520 530
CCDS24 P
>>CCDS2490.1 ALPP gene_id:250|Hs108|chr2 (535 aa)
initn: 1762 init1: 700 opt: 1854 Z-score: 2326.2 bits: 440.1 E(32554): 3e-123
Smith-Waterman score: 1854; 55.0% identity (79.8% similar) in 524 aa overlap (1-520:6-521)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSLVPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVI
:. .:.:.. :. ...: .:..: .: .: :.: : .:: .: .:::.:
CCDS24 MLGPCMLLLLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKLQPAQT-AAKNLI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 MFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTAT
.:::::::::::::::::::: . . : : : ::.::.::::::::.. .::::..:::
CCDS24 IFLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPEIPLAMDRFPYVALSKTYNVDKHVPDSGATAT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AYLCGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPS
:::::::.: :.:.:::.. ..::::.:::: :... :: ::::::.::::::.::.:.
CCDS24 AYLCGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AAYAHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVE
..:::...:.:::: ..: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::. . : :
CCDS24 GTYAHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFRMGTPDPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YESDEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPG
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