Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5302
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5302, 309 aa
1>>>pF1KB5302 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3730+/-0.000755; mu= 15.1998+/- 0.046
mean_var=60.3322+/-12.082, 0's: 0 Z-trim(107.5): 29 B-trim: 26 in 1/50
Lambda= 0.165120
statistics sampled from 9584 (9611) to 9584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 ( 309) 2157 522.0 2.2e-148
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 2123 513.9 6.2e-146
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 1465 357.2 9.4e-99
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 1241 303.8 1.1e-82
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 1186 290.7 1.1e-78
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 323) 1002 246.9 1.6e-65
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 337) 1002 246.9 1.6e-65
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 330) 991 244.3 9.8e-65
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 341) 991 244.3 1e-64
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2 ( 327) 967 238.5 5.1e-63
CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 283) 930 229.7 2e-60
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 286) 895 221.4 6.6e-58
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 783 194.8 1.2e-49
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 697 174.3 1.6e-43
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 697 174.3 1.7e-43
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 697 174.3 1.8e-43
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 677 169.5 4.8e-42
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 677 169.5 4.9e-42
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 677 169.5 4.9e-42
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 661 165.7 6.6e-41
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 661 165.7 6.7e-41
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 661 165.7 6.8e-41
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 ( 753) 367 95.7 1.1e-19
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 591) 322 85.0 1.5e-16
>>CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 (309 aa)
initn: 2157 init1: 2157 opt: 2157 Z-score: 2777.3 bits: 522.0 E(32554): 2.2e-148
Smith-Waterman score: 2157; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TRRTPDYFL
:::::::::
CCDS41 TRRTPDYFL
>>CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 (309 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 2733.5 bits: 513.9 E(32554): 6.2e-146
Smith-Waterman score: 2123; 97.4% identity (99.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::.:.::::::::.:::::::::.:.::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS60 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TRRTPDYFL
:::::::::
CCDS60 TRRTPDYFL
>>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 (307 aa)
initn: 1464 init1: 1442 opt: 1465 Z-score: 1886.4 bits: 357.2 E(32554): 9.4e-99
Smith-Waterman score: 1465; 66.7% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (9-309:6-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
.::. :::: .:. ..::.::.:: ::.:::..:::::.: :::::::.::
CCDS10 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
::.:: ::::.:: :.::::::::.::::.::::: ::.:::::: .:::..::::::
CCDS10 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
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CCDS10 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:..:: :::::.:::::::::::.: :::.::::::: ::.:. :: :: . .. ::
CCDS10 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB5 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPR--RGEP
::::::::.: ...:.:..::::::::::: :::.:::. :. .:. :. ::. :: :
CCDS10 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 HVTRRTPDYFL
. . ::::
CCDS10 S-KKPVADYFL
300
>>CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 (305 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1241 Z-score: 1598.1 bits: 303.8 E(32554): 1.1e-82
Smith-Waterman score: 1241; 58.4% identity (79.9% similar) in 303 aa overlap (9-309:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
.::...: :: : :...: ::. . ..: .::::: : :::::::.::
CCDS68 MAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
::.:: :::: ::. :::::.::::.:::::::.:: : :.:::... .:::.:::::::
CCDS68 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::: ::::::.:.: : .::.: ..::.: ::.:.::::::.: :::.:
CCDS68 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:...: ::.::.: .:::.::::.: :.:::::::. :: ... : : :.: :. ::
CCDS68 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB5 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDD--TLKYSFLQFDPAPRRGEP
:::: :::.. :...::..::::::::::: :.:: . : : . .... : .: :
CCDS68 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 HVTRRTPDYFL
: : :::
CCDS68 --PRTTTPYFL
300
>>CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 (342 aa)
initn: 1225 init1: 1185 opt: 1186 Z-score: 1526.5 bits: 290.7 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 1186; 60.1% identity (80.8% similar) in 281 aa overlap (31-309:64-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::. . ..: .::::: : :::::::.::
CCDS48 PSGCGAPAGRPFLSPGPPPVFHFLRFLKERLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
::.:: :::: ::. :::::.::::.:::::::.:: : :.:::... .:::.:::::::
CCDS48 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::: ::::::.:.: : .::.: ..::.: ::.:.::::::.: :::.:
CCDS48 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:...: ::.::.: .:::.::::.: :.:::::::. :: ... : : :.: :. ::
CCDS48 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KB5 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDD--TLKYSFLQFDPAPRRGEP
:::: :::.. :...::..::::::::::: :.:: . : : . .... : .: :
CCDS48 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP
280 290 300 310 320 330
300
pF1KB5 HVTRRTPDYFL
: : :::
CCDS48 --PRTTTPYFL
340
>>CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 (323 aa)
initn: 652 init1: 652 opt: 1002 Z-score: 1290.0 bits: 246.9 E(32554): 1.6e-65
Smith-Waterman score: 1002; 48.9% identity (77.7% similar) in 282 aa overlap (22-302:29-308)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVT
::.:.....:: :..::. .. . :.. :.
CCDS91 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITI
.:::.:::..::..::. :: :..::::.::::::: :.::. ::.: :..: : . .
CCDS91 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPS
:::::: .:...::::::: :.: : ..:: ::: :. ::..:.:: .::: ::::::.
CCDS91 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPD-DRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHAN
......:: . : .:: .: .::::::::: : ::: . ::...::: .. : : .
CCDS91 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPA
: :. ::::.: .::.. :..::.::::::: . : .:.: .:.:: :: . ::
CCDS91 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 PRRGEPHVTRRTPDYFL
.. .:..::
CCDS91 EKK-KPNATRPVTPPRGMITKQAKK
300 310 320
>>CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 (337 aa)
initn: 652 init1: 652 opt: 1002 Z-score: 1289.7 bits: 246.9 E(32554): 1.6e-65
Smith-Waterman score: 1002; 48.9% identity (77.7% similar) in 282 aa overlap (22-302:29-308)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVT
::.:.....:: :..::. .. . :.. :.
CCDS58 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITI
.:::.:::..::..::. :: :..::::.::::::: :.::. ::.: :..: : . .
CCDS58 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPS
:::::: .:...::::::: :.: : ..:: ::: :. ::..:.:: .::: ::::::.
CCDS58 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPD-DRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHAN
......:: . : .:: .: .::::::::: : ::: . ::...::: .. : : .
CCDS58 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPA
: :. ::::.: .::.. :..::.::::::: . : .:.: .:.:: :: . ::
CCDS58 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 PRRGEPHVTRRTPDYFL
.. .:..::
CCDS58 EKK-KPNATRPVTPPRVASGLNPSIQKASNYRNNTVLYE
300 310 320 330
>>CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 920 init1: 652 opt: 991 Z-score: 1275.7 bits: 244.3 E(32554): 9.8e-65
Smith-Waterman score: 991; 49.3% identity (77.4% similar) in 274 aa overlap (22-294:29-301)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]