FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5232, 502 aa
1>>>pF1KB5232 502 - 502 aa - 502 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5609+/-0.000403; mu= 16.3960+/- 0.025
mean_var=66.4906+/-13.514, 0's: 0 Z-trim(112.1): 177 B-trim: 623 in 1/51
Lambda= 0.157288
statistics sampled from 20678 (20859) to 20678 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 8.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 3377 775.5 0
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1392 325.1 2.9e-88
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1348 315.1 2.9e-85
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1348 315.1 3.3e-85
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 1336 312.4 1.9e-84
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 1324 309.7 1.3e-83
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1313 307.2 7.2e-83
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1304 305.1 2.9e-82
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 1295 303.1 1.2e-81
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 1279 299.5 1.5e-80
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 1276 298.8 2.2e-80
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XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1275 298.6 2.9e-80
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 1266 296.5 1.1e-79
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 1266 296.5 1.1e-79
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 1261 295.4 2.5e-79
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 1241 290.8 5.9e-78
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 1230 288.3 3.3e-77
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 1225 287.2 7.3e-77
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 1225 287.2 7.3e-77
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1212 284.3 5.7e-76
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1212 284.3 5.7e-76
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1212 284.3 6.5e-76
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1188 278.8 2.5e-74
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 1180 277.0 9.5e-74
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1173 275.4 2.4e-73
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1168 274.2 5e-73
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1168 274.2 5e-73
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1144 268.8 2.5e-71
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 1141 268.1 3.2e-71
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1122 263.8 7.1e-70
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 1122 263.8 7.3e-70
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 1103 259.5 1.3e-68
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1100 258.9 2.9e-68
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1096 257.9 4.6e-68
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 1077 253.7 1.1e-66
XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1017 240.0 1e-62
XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1007 237.7 4.6e-62
XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1007 237.7 4.9e-62
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 955 225.9 1.9e-58
XP_011528272 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 451) 917 217.3 7.4e-56
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 820 195.2 2.2e-49
XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 800 190.8 7.4e-48
XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 747 178.7 2.8e-44
>>NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo sap (502 aa)
initn: 3377 init1: 3377 opt: 3377 Z-score: 4139.9 bits: 775.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3377; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNYPPGPWRLPFLGNFFLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNYPPGPWRLPFLGNFFLVD
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 FEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMREHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMREHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPFDP
130 140 150 160 170 180
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pF1KB5 HFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMKFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMKFL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSFHEEN
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pF1KB5 LICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARESMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARESMP
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pF1KB5 YTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWATPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWATPDT
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pF1KB5 FNPDHFLENGQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRPPNNEKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FNPDHFLENGQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRPPNNEKLS
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490 500
pF1KB5 LKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
::::::::::::::::::::::
NP_000 LKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
490 500
>>NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydroxyla (501 aa)
initn: 1120 init1: 872 opt: 1392 Z-score: 1705.6 bits: 325.1 E(85289): 2.9e-88
Smith-Waterman score: 1392; 43.5% identity (74.6% similar) in 496 aa overlap (12-498:4-498)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAA----DFLKRRRPKNYPPGPWRLPFLGNF
:: . . . : :.. .:: : ..::.::: ..:::: :::.::.
NP_078 MWKLWRAEEGAAALGGALFLLLFALGVRQLLKQRRPMGFPPGPPGLPFIGNI
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pF1KB5 FLV--DFEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVT
. . . : :. .. . ::..:::.:: ::.:...: ..:: :.:... :..::
NP_078 YSLAASSELPHVYMRKQSQVYGEIFSLDLGGISTVVLNGYDVVKECLVHQSEIFADRPCL
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pF1KB5 PMREHIFKKNGLIMSS-GQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEE
:. .. : .::. : :..: ..::......: :: :.::.: .: ::.. ...::.
NP_078 PLFMKMTKMGGLLNSRYGRGWVDHRRLAVNSFRYFGYGQKSFESKILEETKFFNDAIETY
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pF1KB5 NGQPFDPHFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVF
.:.::: . :.:::::: : ::::: :.:. ::....:..: . : :: . :::.:
NP_078 KGRPFDFKQLITNAVSNITNLIIFGERFTYEDTDFQHMIELFSENVELAASASVFLYNAF
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pF1KB5 PWIMKFLP-GPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNP
::: .:: : :: :: : . :.:..:.: . .: . :.:::: ::.. ..:
NP_078 PWI-GILPFGKHQQLFRNAAVVYDFLSRLIEKASVNRKPQLPQHFVDAYLDEMDQGKNDP
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 TSSFHEENLICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPS
.:.: .:::: :. .:..::::::...::::.:.:::::.:: .:: ::: ..: . .::
NP_078 SSTFSKENLIFSVGELIIAGTETTTNVLRWAILFMALYPNIQGQVQKEIDLIMGPNGKPS
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pF1KB5 TAARESMPYTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDP
. .::::.::.::: :. ::.::.. . .. :... :: .:::: ..::: ..: :
NP_078 WDDKCKMPYTEAVLHEVLRFCNIVPLGIFHATSEDAVVRGYSIPKGTTVITNLYSVHFDE
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pF1KB5 TEWATPDTFNPDHFLEN-GQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTF
: :..:.:..::.. : : :.::..:::.:.: ::::.::: :.:.:::.:.:.: .
NP_078 KYWRDPEVFHPERFLDSSGYFAKKEALVPFSLGRRHCLGEHLARMEMFLFFTALLQRFHL
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pF1KB5 RPPNNEKLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
. :.. .:: :.:.:..: . .::
NP_078 HFPHELVPDLKPRLGMTLQPQPYLICAERR
480 490 500
>>NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precursor (491 aa)
initn: 1319 init1: 1143 opt: 1348 Z-score: 1651.8 bits: 315.1 E(85289): 2.9e-85
Smith-Waterman score: 1348; 41.2% identity (72.8% similar) in 485 aa overlap (21-501:11-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNYPPGPWRLPFLGNFFLVD
:::. : .::. :. : . :::: : .:::..:.
NP_000 MDSISTAILLLLLALVCLLLT---LSSRDKGKLPPGPRPLSILGNLLLLC
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pF1KB5 FEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMREHI
.. . . :.::......:: .:...: .::::. . ..:..: : ..
NP_000 SQDMLTSLTKLSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSGRGDYPAFFNF
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pF1KB5 FKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPFDP
: ::. .:::. :: :.:.. :::::.::.:.:::: ::.. : ... .:.::::
NP_000 TKGNGIAFSSGDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAELRKTEGEPFDP
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pF1KB5 HFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMKFL
: .. .:::::::. :: ::.:.: . ...:... . .: .::..:: .. ..
NP_000 TFVLSRSVSNIICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELYDIFPSLLDWV
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pF1KB5 PGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSFHEEN
::::: .:.:.: :. ...: . :. . .: ::::. .: .:... .: : :: ..
NP_000 PGPHQRIFQNFKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKEDPLSHFHMDT
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 LICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARESMP
:. .: .:.:.::.:.::::. :.: . ::..: .:: ::: :.:... :. : .::
NP_000 LLMTTHNLLFGGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARLPALKDRAAMP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWATPDT
::.::::::::...:::.:.:..:: ::.. :. .:::: ..: :...: ::... ::.
NP_000 YTDAVIHEVQRFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHYDPSQFLTPQE
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pF1KB5 FNPDHFLENGQ-FKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRP---PNN
:::.:::. .: ::: :::::: :.: ::::.::: :::...:...:.:...: :..
NP_000 FNPEHFLDANQSFKKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFLYLTAILQSFSLQPLGAPED
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pF1KB5 EKLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
:. . :. : .:: :.
NP_000 IDLT-PLSSGLGNLPRPFQLCLRPR
470 480 490
>>XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome P450 (566 aa)
initn: 1321 init1: 1145 opt: 1348 Z-score: 1650.8 bits: 315.1 E(85289): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 1348; 41.2% identity (72.8% similar) in 485 aa overlap (21-501:86-566)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNYPPGPWRL
:::. : .::. :. : . :::: :
XP_016 GGISDVLSHFALHTPAAAFTMDSISTAILLLLLALVCLLLT---LSSRDKGKLPPGPRPL
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60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PFLGNFFLVDFEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGN
.:::..:. .. . . :.::......:: .:...: .::::. . ..:..
XP_016 SILGNLLLLCSQDMLTSLTKLSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSG
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RPVTPMREHIFKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAI
: : .. : ::. .:::. :: :.:.. :::::.::.:.:::: ::.. : .
XP_016 RGDYPAFFNFTKGNGIAFSSGDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAEL
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KEENGQPFDPHFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLY
.. .:.:::: : .. .:::::::. :: ::.:.: . ...:... . .: .::
XP_016 RKTEGEPFDPTFVLSRSVSNIICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELY
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NVFPWIMKFLPGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTG
..:: .. ..::::: .:.:.: :. ...: . :. . .: ::::. .: .:...
XP_016 DIFPSLLDWVPGPHQRIFQNFKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKE
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300 310 320 330 340 350
pF1KB5 NPTSSFHEENLICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQ
.: : :: ..:. .: .:.:.::.:.::::. :.: . ::..: .:: ::: :.:...
XP_016 DPLSHFHMDTLLMTTHNLLFGGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARL
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360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PSTAARESMPYTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHR
:. : .::::.::::::::...:::.:.:..:: ::.. :. .:::: ..: :...:
XP_016 PALKDRAAMPYTDAVIHEVQRFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHY
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420 430 440 450 460
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::... ::. :::.:::. .: ::: :::::: :.: ::::.::: :::...:...:.:
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470 480 490 500
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...: :.. :. . :. : .:: :.
XP_016 SLQPLGAPEDIDLT-PLSSGLGNLPRPFQLCLRPR
540 550 560
>>NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Homo sa (494 aa)
initn: 1360 init1: 1111 opt: 1336 Z-score: 1637.0 bits: 312.4 E(85289): 1.9e-84
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10 20 30 40 50 60
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::: ....: . . .:. . :::: :::.::.. ..
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:: . .. . ..:: .:...:: .:.. : .::::. . ..:..: . .
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:: :. .:.:. :. :::....::.::.::...:::::::: : .:.. .: .::
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: .. .:::.: ::.::.::.:.:. : .::... . :..: :::..: .:: :
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:::.: :.. . :. :... ...... .: :::::..: .:... ::.. :. .:
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::.:::::.::.:...:... ..:. :: . . ::::: .. : .. ::: ...:
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:::.:::.. ::::: .::.::::::: :.:: ::: :::.:::..::.: :. :.. :
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pF1KB5 --LSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
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480 490
>>NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cytochro (494 aa)
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Smith-Waterman score: 1324; 40.4% identity (74.2% similar) in 485 aa overlap (21-501:11-494)
10 20 30 40 50 60
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::. ....: . . .:. . :::: :::.::.. ..
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:: . .. . ..:: .:...:: .:.. : ..:::. . ..:..: . .
NP_000 TEQMYNSLMKISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWV
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pF1KB5 FKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPFDP
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NP_000 FKGYGVVFSNGERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDP
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pF1KB5 HFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMKFL
: .. .:::.: ::.::.::.:.:. : .::... . . ...: :::..: .:: :
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pF1KB5 PGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSFHEEN
:::.: :. . :. :... ...... .: :::::..: .:... ::.. :. .:
NP_000 PGPQQQAFQLLQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKN
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pF1KB5 LICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARESMP
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NP_000 LVMTTLNLFIGGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMP
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pF1KB5 YTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWATPDT
: .:::::.::.:..::... :.: :: . . ::::: . : .. :::. ...:.
NP_000 YMEAVIHEIQRFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQD
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NP_000 FNPQHFLNEKGQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKD
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pF1KB5 EKLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
.: : ..:.. : .. . .:.
NP_000 IDVSPK-HVGFATIPRNYTMSFLPR
480 490
>>NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D6 is (497 aa)
initn: 1233 init1: 790 opt: 1313 Z-score: 1608.8 bits: 307.2 E(85289): 7.2e-83
Smith-Waterman score: 1313; 43.1% identity (72.5% similar) in 483 aa overlap (28-501:16-497)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRR--PKNYPPGPWRLPFLGNFFL
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:::... . . ...:..:::.:. .:...:: ..:::. .. ..:: .:. .
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pF1KB5 HI-F--KKNGLIMSS-GQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEEN
. : ...:.... : ::.:::::....:::.::::::::. . ::: : :. ...
NP_000 ILGFGPRSQGVFLARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKSLEQWVTEEAACLCAAFANHS
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:.:: :. ...::::.: :.: :.::::.: : .:: : .: :.. .. :. :
NP_000 GRPFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVP
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pF1KB5 WIMKFLPGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAET-RDFIDAYLKEMSKHTGNPT
.. .:. .. : . ..... .:: :.::. ::. .:.: :: : :::
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:::..::: . ::: :: :::::: :.:: : :.:..:..:: ::: :::: ..:
NP_000 SSFNDENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEM
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pF1KB5 AARESMPYTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPT
. . ::::.::::::::.:.:.::.: . .. : . :...:::: ..:::... .: .
NP_000 GDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEA
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pF1KB5 EWATPDTFNPDHFLE-NGQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFR
: : :.:.:::. .:.: : :::.::: :.:::::: ::: :::.:::::.:.:.:
NP_000 VWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFS
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pF1KB5 PPNNE-KLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
:... . : . ... .:: ..:::::.
NP_000 VPTGQPRPSHHGVFAFLVSPSPYELCAVPR
470 480 490
>>NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B6 pr (491 aa)
initn: 1288 init1: 1093 opt: 1304 Z-score: 1597.8 bits: 305.1 E(85289): 2.9e-82
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNY---PPGPWRLPFLGNFF
:.:. .. :: .: .:.:... :::: ::.:::..
NP_000 MELSVLLFLALLTGLLL--LLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLL
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.: ... :. : : .:::..:...:: .:.. :. :.:::. . :..: :
NP_000 QMD-RRGLLKSFLRFREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGKIAM
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pF1KB5 REHIFKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQ
. .:. :.:...:. :: :::..:..:.::.::.:.::::::::: : : ... .:
NP_000 VDPFFRGYGVIFANGNRWKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLIEELRKSKGA
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 PFDPHFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWI
.:: : ... ..::::::.::.::.:::. : ..:.:. .. : .: ::...: .
NP_000 LMDPTFLFQSITANIICSIVFGKRFHYQDQEFLKMLNLFYQTFSLISSVFGQLFELFSGF
170 180 190 200 210 220
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pF1KB5 MKFLPGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSF
.:..:: :. ...: .... ...: ..:::. .:. .:.::.:: .: :. .: : :
NP_000 LKYFPGAHRQVYKNLQEINAYIGHSVEKHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEF
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pF1KB5 HEENLICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAAR
..:: .::.::::::::::::::...: : ::.. :.: ::..::: . : :
NP_000 SHQNLNLNTLSLFFAGTETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDR
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pF1KB5 ESMPYTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNL-TALHRDPTEW
.::::.:::.:.::.....:..::. :: :.. :: .:: : .. : :::: :: .
NP_000 AKMPYTEAVIYEIQRFSDLLPMGVPHIVTQHTSFRGYIIPKDTEVFLILSTALH-DPHYF
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pF1KB5 ATPDTFNPDHFLE-NGQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRPP
::.:::::::. :: .:: :::.:::.::: :::: .::.:::.:::...:.:.. :
NP_000 EKPDAFNPDHFLDANGALKKTEAFIPFSLGKRICLGEGIARAELFLFFTTILQNFSMASP
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pF1KB5 -NNEKLSLKFRM-GITISPVSHRLCAVPQV
: ..: . :. : .... .:.
NP_000 VAPEDIDLTPQECGVGKIPPTYQIRFLPR
470 480 490
>>NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isoform 1 (494 aa)
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Smith-Waterman score: 1295; 40.6% identity (73.0% similar) in 485 aa overlap (21-501:11-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRRPKNYPPGPWRLPFLGNFFLVD
:: ....: . . .:. . :::: :::.::.. ..
NP_000 MLASGLLLVALLACLTVMVLMSVWQQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLN
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pF1KB5 FEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMREHI
:. .. : . :: .:...:: .:.. : ..:::. . ..:..: . .
NP_000 TEHICDSIMKFSECYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWV
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pF1KB5 FKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPFDP
:: :. .:.:. :. ::....::.::.::...:::::::. : :::. .: .::
NP_000 FKGYGVAFSNGERAKQLLRFAIATLRDFGVGKRGIEERIQEESGFLIEAIRSTHGANIDP
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 HFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMKFL
: .. .:::.: ::.::.::.:.:. : .::... . . ...: :::..: .:: :
NP_000 TFFLSRTVSNVISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLSMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 PGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAETRDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSFHEEN
:::.: :. . :. :... ...... .: .::::..: .:... ::.. :. .:
NP_000 PGPQQQAFKLLQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPQDFIDSFLIHMQEEEKNPNTEFYLKN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARESMP
:. :::.::.:::::.:::::...: . .::.. ::. :::::::...::. : .::
NP_000 LMMSTLNLFIAGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRTKMP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWATPDT
: .:::::.::.:..::... :.: :: . . ::::: .. : .. :::. ...:.
NP_000 YMEAVIHEIQRFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPSFFSNPQD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB5 FNPDHFLEN-GQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRP---PNN
:::.:::.. ::::: .::.::::::: :.:: ::: :::.:::..::.: .. :..
NP_000 FNPQHFLDDKGQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKD
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB5 EKLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
.: : . :: : .. . .:.
NP_000 IDVSPKHVVFATI-PRNYTMSFLPR
480 490
>>NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isoform a (490 aa)
initn: 1239 init1: 1058 opt: 1279 Z-score: 1567.2 bits: 299.5 E(85289): 1.5e-80
Smith-Waterman score: 1279; 40.1% identity (69.7% similar) in 489 aa overlap (16-500:1-489)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRR-RPKNYPPGPWRLPFLGNFFLV
..: ..:. ..:.: .. .. : .. :::: ::..::.. .
NP_000 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQI
10 20 30 40
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pF1KB5 DFEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMREH
: .. : : :: .:.. .: :.. : .::::: ..:..: .:. ..
NP_000 DVKDICKSFTNFSKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQR
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