Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5208
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5208, 369 aa
1>>>pF1KB5208 369 - 369 aa - 369 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8591+/-0.00116; mu= 12.8346+/- 0.068
mean_var=115.1368+/-35.201, 0's: 0 Z-trim(103.0): 371 B-trim: 908 in 2/42
Lambda= 0.119527
statistics sampled from 6587 (7187) to 6587 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 2430 430.9 8.5e-121
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 1289 234.2 1.4e-61
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 1192 217.5 1.7e-56
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 1143 209.0 5.7e-54
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 1110 203.3 2.9e-52
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 856 159.5 4.6e-39
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 856 159.6 5.3e-39
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 848 158.2 1.2e-38
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 847 158.0 1.3e-38
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 847 158.0 1.4e-38
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 846 157.8 1.5e-38
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 846 157.8 1.5e-38
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 846 157.8 1.5e-38
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 846 157.8 1.5e-38
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 846 157.8 1.6e-38
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 832 155.3 7.1e-38
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 829 154.8 1.1e-37
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 806 150.9 1.7e-36
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 795 149.0 6.3e-36
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 772 145.0 9.1e-35
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 764 143.6 2.3e-34
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 743 139.9 2.7e-33
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 702 132.8 3.6e-31
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 674 128.2 1.3e-29
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 619 118.6 8.3e-27
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 591 113.8 2.5e-25
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 588 113.2 3.3e-25
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 586 112.9 4.5e-25
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 566 109.5 4.8e-24
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 548 106.4 4.1e-23
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 548 106.4 4.3e-23
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 548 106.4 4.4e-23
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 540 105.0 1.1e-22
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 520 101.6 1.2e-21
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 515 100.7 2.1e-21
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 515 100.7 2.2e-21
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 511 100.0 3.6e-21
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 507 99.3 5.5e-21
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 503 98.6 8.9e-21
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 502 98.4 9.8e-21
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 499 97.9 1.4e-20
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 497 97.6 1.9e-20
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 496 97.4 2e-20
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 494 97.1 2.6e-20
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 492 96.7 3.4e-20
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 490 96.4 4.3e-20
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 490 96.4 4.4e-20
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 490 96.4 4.4e-20
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 489 96.2 4.7e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 489 96.2 4.7e-20
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 2430 init1: 2430 opt: 2430 Z-score: 2282.2 bits: 430.9 E(32554): 8.5e-121
Smith-Waterman score: 2430; 100.0% identity (100.0% similar) in 369 aa overlap (1-369:1-369)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTL
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LNGDLQTSI
:::::::::
CCDS11 LNGDLQTSI
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 1278 init1: 654 opt: 1289 Z-score: 1218.9 bits: 234.2 E(32554): 1.4e-61
Smith-Waterman score: 1289; 55.7% identity (79.8% similar) in 336 aa overlap (36-368:32-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 EPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLT-FIYFVVCIIGLCGNTLV
: . . :::. .:..:: :: :::::
CCDS10 EPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVLVPVLYLLVCAAGLGGNTLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGI
:::.::.:::::.:::::::::.:: :.:::::::: : : :::: ..::.:::.::.
CCDS10 IYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVLCRLVMTLDGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLR
:::::.:::::::.:::::::::..::.:::::.::. . :.: .:: . ::....: .
CCDS10 NQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLCMSLPLLVFADV-
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGS
: : ..:. .:: : : . ::::: .:::..:: .::::::.:..::...:.:::
CCDS10 --QEG-GTCNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKVRAAGVRVGC
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYAN
.:. ::.:::::: .:: :: :::::. :. ....:. :: :.. :::.:.:::
CCDS10 VRRR-SERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYFFVVILSYAN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNE--TTETQRTLLN
:::::.::.::::::..:::.:::: : ::. :.. .. . :. : .. : ..:. :
CCDS10 SCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQQQEATPPAHRAAAN
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GDLQTSI
: .:::
CCDS10 GLMQTSKL
360
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 914 init1: 914 opt: 1192 Z-score: 1127.7 bits: 217.5 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 1192; 53.2% identity (78.8% similar) in 325 aa overlap (6-327:14-328)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFV
:: :.: .: : : . . ::.. : : .:.... ..:.:
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAW---PPDATLGNVSAGPS----PAGLAVSGVLIPLVYLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VCIIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGK
::..:: ::.:::::.::.. ..::.::::::.::::::::::::: : :: .::::.
CCDS13 VCVVGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLL
.::.::.:::::::::::::::::.::::::::: .::.:: .:. .. ::: .: .
CCDS13 LMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFII
:.::.....:. : :.: ..:: ..:: .:::::: :::. :: .::::::.:.
CCDS13 VVLPVVVFSGV---PRGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 IKVKSSGIRV---GSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPA
.::.:.: :: . ..:..::..::::: :::.:..::.:::..:. .: . ::
CCDS13 VKVRSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSR
. :.. .::.: :::::::::::.::: ::..:. ::
CCDS13 FFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB5 LNETTETQRTLLNGDLQTSI
CCDS13 EDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 1158 init1: 986 opt: 1143 Z-score: 1082.4 bits: 209.0 E(32554): 5.7e-54
Smith-Waterman score: 1143; 55.6% identity (83.3% similar) in 288 aa overlap (42-329:57-340)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 HTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRY
: ...::: :::..:::::..::::::::
CCDS96 SRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRY
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 AKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIF
::::: ::::::::::::::.::..:::. .. : ::::: .::.:..::..:.::::.
CCDS96 AKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIY
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 CLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRS
::::.:.:::.:::::::.:..::: .::.....:: .::::::::.... .:. :
CCDS96 CLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTV
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 SCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSE
.:.. : . : .::..:::..:::.:. :::::..:: :.. ....: ..::.::
CCDS96 ACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSE
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 KKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPIL
.:.: :: .:: ::..::.:::. :. :.. : .... :.: ::::::::::
CCDS96 RKITLMVMMVVMVFVICWMPFYV--VQLVNVFAEQDDATVSQLS--VILGYANSCANPIL
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KB5 YAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI
:.:::::::.::: .:::
CCDS96 YGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDNAAEEPVDYYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNG
330 340 350 360 370 380
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 1092 init1: 644 opt: 1110 Z-score: 1051.7 bits: 203.3 E(32554): 2.9e-52
Smith-Waterman score: 1110; 55.3% identity (84.4% similar) in 282 aa overlap (49-329:53-328)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 FDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTIT
:: .::..:: ::.:::.:::::::::: :
CCDS42 ANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTAT
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 NIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSI
:::.::::.:::::::..::.: ..:: :::::...::.:..:::.:.:::.:::::.:.
CCDS42 NIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 DRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRS-SCTINW
:::.:::::...: .::: .::.:...:: .:::: ::: :.: : . :.. .:...:
CCDS42 DRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQW
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 PGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRM
: :: . :..:::.::::.:. : ::::.:. :... ..:.: ..:..::::.::.
CCDS42 PHP--AWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRL
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSD
: .::.::..::.:::. :. ... .. : . ... :.:::::::::::.::::
CCDS42 VLMVVVVFVLCWMPFYV--VQLLNLFVTSLDATVNHVSLI--LSYANSCANPILYGFLSD
270 280 290 300 310
320 330 340 350 360
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::.. :: ::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]