Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5199
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5199, 452 aa
1>>>pF1KB5199 452 - 452 aa - 452 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0112+/-0.0011; mu= 18.7041+/- 0.066
mean_var=60.0376+/-12.207, 0's: 0 Z-trim(101.7): 67 B-trim: 29 in 1/47
Lambda= 0.165525
statistics sampled from 6552 (6621) to 6552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 2965 717.0 9.4e-207
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1093 270.0 3.6e-72
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 1093 270.0 3.9e-72
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 1090 269.3 6e-72
CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 1088 268.8 8.4e-72
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1077 266.2 5.2e-71
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 1060 262.1 8.1e-70
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 1049 259.5 5.2e-69
CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 1048 259.2 5.4e-69
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 1049 259.5 5.4e-69
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 1032 255.4 8.7e-68
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 1015 251.4 1.5e-66
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 968 240.2 3.5e-63
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 967 239.9 4e-63
CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 965 239.4 5.7e-63
CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 936 232.6 9e-61
CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 933 231.8 1e-60
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 927 230.4 3e-60
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 926 230.1 3.6e-60
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 926 230.1 3.6e-60
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 924 229.6 5.1e-60
CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 918 228.2 1.3e-59
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 911 226.5 4e-59
CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 910 226.3 4.4e-59
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 885 220.3 3.2e-57
CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 861 214.6 2e-55
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 854 212.9 5.4e-55
CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 850 211.9 7.1e-55
CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 851 212.2 8.8e-55
CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 849 211.8 1.3e-54
CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 832 207.7 2.1e-53
CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 830 207.1 2.4e-53
CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 812 202.9 6.1e-52
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 809 202.2 9.2e-52
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 804 201.0 2.1e-51
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 804 201.0 2.3e-51
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 728 182.9 6.6e-46
CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 587 149.1 6e-36
CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 477 122.8 4.2e-28
CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 411 107.2 4.2e-23
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 307 82.3 1.2e-15
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 304 81.6 1.9e-15
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 304 81.6 1.9e-15
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 285 77.0 4.2e-14
CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 272 73.9 3.7e-13
CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 471) 272 74.0 3.8e-13
CCDS8364.1 HTR3B gene_id:9177|Hs108|chr11 ( 441) 271 73.7 4.2e-13
CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 441) 270 73.5 5e-13
CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 270 73.5 5.1e-13
CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs108|chr8 ( 458) 264 72.0 1.4e-12
>>CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 (452 aa)
initn: 2965 init1: 2965 opt: 2965 Z-score: 3825.3 bits: 717.0 E(32554): 9.4e-207
Smith-Waterman score: 2965; 100.0% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (1-452:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDAPARLLAPLLLLCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYARNFRPGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MDAPARLLAPLLLLCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYARNFRPGIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFVDKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFVDKLW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQECML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQECML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 FHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRPRAEMDVRNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRPRAEMDVRNAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VLFSLSAAGVTQELAISRRQRRVPGNLMGSYRSVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VLFSLSAAGVTQELAISRRQRRVPGNLMGSYRSVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB5 PIDADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYWAAYAM
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PIDADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYWAAYAM
430 440 450
>>CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (473 aa)
initn: 1137 init1: 657 opt: 1093 Z-score: 1409.1 bits: 270.0 E(32554): 3.6e-72
Smith-Waterman score: 1171; 40.8% identity (70.8% similar) in 476 aa overlap (7-450:8-471)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAPARLLAPLLLLCAQQLRGT--RAMNDIGDYVGSNLEISWLPN-LDGLIAGYARNFR
:: :. : . ::. :..:: :. .:.. . .: :. :: .:
CCDS10 MCSGLLELLLPIWLSWTLGTRGSEPRSVNDPGN-------MSFVKETVDKLLKGYDIRLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PGIGGPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFV
: .::::: :.. ...:::: .::.::.::.:....: :::.::.:. .: ::.: .
CCDS10 PDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DKLWLPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQ
:.::.:::...: :... : :::.:..:::.:::..::..:::.:.:: ::: .::.:::
CCDS10 DQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPR
.: :..:::::...:: .:: ... . :.....: ::.:. .:.... . : ..: .::
CCDS10 NCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVF-ATGAYPR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LSLHFHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVS
::: :.:.:: : .:.:.::::.:.. .:::::::. : :::.:::::::::::. .
CCDS10 LSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 ARSSLPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAHF----NADYRKKQ----KAKVKVS
: .::. .::.:.:. :.:::: ::.::::... . :.:. ::.: .
CCDS10 LRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKND
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KB5 RPRAE---MDVRNAIVLFSL----------SAAGVTQELAIS-------RRQRRVPGNLM
: ..: .:... :.: :: .. : :.. ::: :.. .: .
CCDS10 RSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE--
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 GSYRSVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLRPI-DADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYW
: : .: .. :: : ..: .. .. . :...:: ..: ::: .:. :..::
CCDS10 GHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQ--LKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYW
420 430 440 450 460
450
pF1KB5 AAYAM
:
CCDS10 LYYVN
470
>>CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (512 aa)
initn: 1169 init1: 674 opt: 1093 Z-score: 1408.5 bits: 270.0 E(32554): 3.9e-72
Smith-Waterman score: 1129; 41.6% identity (70.2% similar) in 447 aa overlap (10-436:16-447)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAPARLLAPLLL--LCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYA
::.. .:::.. :. . . : : :. ::
CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETV------------DRLLKGYD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RNFRPGIGGPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLD
.:: .::::: :.. ...:::: .::.::.::.:....:.:::.::::: .: ::
CCDS43 IRLRPDFGGPPVAVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SRFVDKLWLPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYP
.: .:.::.:::...: :... : :::.:..:::.:::..::..:::.:.:: ::: .::
CCDS43 NRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MDEQECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAG
.:::.: :..:::::...:: .:: ... . :. :..: ::.:..:.. :. . : :.:
CCDS43 LDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVF-STG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QFPRLSLHFHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTT
..::::: :.:.:: : .:.:.::::.:.. .:::::::. : :::.:::::::::::
CCDS43 SYPRLSLSFKLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB5 LMVSARSSLPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAH---FNADYRKKQKAKVKVSR
. . : .::. .::.:.:. :.:::: ::.:::... :. ....:: :..
CCDS43 INTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAAS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB5 PRAE---MDVRNAIVLFSLSAAGV--------TQELAISRRQRRVPGNL--MGSYRSVGV
: .:: : : ... :. : .:. .:: .: : .... .
CCDS43 ANNEKMRLDV-NKIFYKDIKQNGTQYRSLWDPTGNLSPTRRTTNYDFSLYTMDPHENILL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 ETGETKKEGAARSG--GQGGIRARLRPIDADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYWAAYAM
: : :.: :. . : : :. . ::..:. : .: .:
CCDS43 STLEIKNEMATSEAVMGLGDPRSTMLAYDASSIQ-YRKAGLPRHSFGRNALERHVAQKKS
410 420 430 440 450 460
CCDS43 RLRRRASQLKITIPDLTDVNAIDRWSRIFFPVVFSFFNIVYWLYYVN
470 480 490 500 510
>>CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (474 aa)
initn: 1135 init1: 691 opt: 1090 Z-score: 1405.2 bits: 269.3 E(32554): 6e-72
Smith-Waterman score: 1155; 40.4% identity (68.3% similar) in 473 aa overlap (10-450:16-472)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAPARLLAPLLL--LCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYA
::.. .:::.. :. . . : : :. ::
CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETV------------DRLLKGYD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RNFRPGIGGPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLD
.:: .::::: :.. ...:::: .::.::.::.:....:.:::.::::: .: ::
CCDS43 IRLRPDFGGPPVAVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SRFVDKLWLPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYP
.: .:.::.:::...: :... : :::.:..:::.:::..::..:::.:.:: ::: .::
CCDS43 NRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MDEQECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAG
.:::.: :..:::::...:: .:: ... . :. :..: ::.:..:.. :. . : :.:
CCDS43 LDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVF-STG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QFPRLSLHFHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTT
..::::: :.:.:: : .:.:.::::.:.. .:::::::. : :::.:::::::::::
CCDS43 SYPRLSLSFKLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB5 LMVSARSSLPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAH---FNADYRKKQKAKVKVSR
. . : .::. .::.:.:. :.:::: ::.:::... :. ....:: :..
CCDS43 INTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAAS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB5 PRAE--------MDVRNAIVLFSLSAAGVTQELAISRRQRRV--PGNLMGSY-------R
: :: .. :.: .: . .:.: :. . : . : .: :
CCDS43 ANNEKMRLDVNKMDPHENILLSTLE---IKNEMATSEAVMGLGDPRSTMLAYDASSIQYR
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KB5 SVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLR--------P--IDADTIDIYARAVFPAAFAAV
..:. ... : .: : : : : :...:: ..: ::..:.
CCDS43 KAGLPRHSFGRNALERHVAQKKSRLRRRASQLKITIPDLTDVNAIDRWSRIFFPVVFSFF
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450
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:..:: :
CCDS43 NIVYWLYYVN
470
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.: :. :: .:: .:::::.:.. ..::
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: :::.:..:::.:::..::..:::.:.:: ::: .::.:::.: :..:::::...::
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.: . .: . :. : : : :: :.... . ...:. .:. . :. .
CCDS34 STLE---IRNETSGSEVLTSVSDPKATMYSYDSASIQYRKPLSSREAYGRALDRHGVPSK
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.:.: : :...:: ..: :: .:. ::.:: :
CCDS34 GRIRRRASQLKVKIPDLTDVNSIDKWSRMFFPITFSLFNVVYWLYYVH
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CCDS10 AKAKNDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQS
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CCDS10 MPRE--GHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQ--LKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSL
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:..:: :
CCDS10 FNLVYWLYYVN
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CCDS43 PDTYIVESKKSFLHEVTVGNRLIRLFSNGTVLYALRITTTVACNMDLSKYPMDTQTCKLQ
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CCDS43 ELRRNVLYFILETYVPSTFLVVLSWVSFWISLDSVPARTCIGVTTVLSMTTLMIGSRTSL
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CCDS43 PNTNCFIKAIDVYLGICFSFVFGALLEYAVAHYSSLQQMAAKDR-GTTKEVEEVSITN-I
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CCDS43 INSSIS----SFKRKISFASIEISSDNV-DYSDLTMKTSD-KFKFVFREK-MGRIVDYFT
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CCDS43 IQNPSNVDHYSKLLFPLIFMLANVFYWAYYMYF
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450
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CCDS59 LFNLIYWSIFS
460
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CCDS59 MRPGFGGPAIPVGVDVQVESLDSISEVDMDF
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CCDS59 TMTLYLRHYWKDERLSFPSTNNLSMTFDGRLVKKIWVPDMFFVHSKRSFIHDTTTDNVML
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CCDS59 TDERISLSQFLIQEFHTTTKLAFYSSTGWYNRLYINFTLRRHIFFFLLQTYFPATLMVML
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CCDS59 SWVSFWIDRRAVPARVPLGITTVLTMSTIITGVNASMPRVSYIKAVDIYLWVSFVFVFLS
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CCDS59 MPENGEKPDRMM-VQLTLASERSSPQRKSQRSSYVSMR-IDTHAIDKYSRIIFPAAYILF
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CCDS59 NLIYWSIFS
390
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CCDS50 DFTMTLYLRHYWKDERLSFPSTNNLSMTFDGRLVKKIWVPDMFFVHSKRSFIHDTTTDNV
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CCDS50 MLRVQPDGKVLYSLRVTVTAMCNMDFSRFPLDTQTCSLEIESYAYTEDDLMLYWKKGNDS
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CCDS50 MLSWVSFWIDRRAVPARVPLGITTVLTMSTIITGVNASMPRVSYIKAVDIYLWVSFVFVF
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CCDS50 LSVLEYAAVNYLTTVQERKEQKLREKLPCTSGLPPPRTAML------DGNYSDGEVNDLD
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CCDS50 LFNLIYWSIFS
470
452 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 16:18:43 2016 done: Thu Nov 3 16:18:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]