FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5147, 354 aa
  1>>>pF1KB5147 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4154+/-0.00084; mu= 15.3354+/- 0.050
 mean_var=62.9272+/-12.741, 0's: 0 Z-trim(106.2): 17  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.161680
 statistics sampled from 8851 (8857) to 8851 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  2.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9785.1 ARG2 gene_id:384|Hs108|chr14            ( 354) 2340 554.5  5e-158
CCDS5145.1 ARG1 gene_id:383|Hs108|chr6             ( 322) 1336 320.3 1.4e-87
CCDS59038.1 ARG1 gene_id:383|Hs108|chr6            ( 330) 1317 315.8 3.2e-86


>>CCDS9785.1 ARG2 gene_id:384|Hs108|chr14                 (354 aa)
 initn: 2340 init1: 2340 opt: 2340  Z-score: 2950.6  bits: 554.5 E(32554): 5e-158
Smith-Waterman score: 2340; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSLRGSLSRLLQTRVHSILKKSVHSVAVIGAPFSQGQKRKGVEHGPAAIREAGLMKRLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MSLRGSLSRLLQTRVHSILKKSVHSVAVIGAPFSQGQKRKGVEHGPAAIREAGLMKRLSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LGCHLKDFGDLSFTPVPKDDLYNNLIVNPRSVGLANQELAEVVSRAVSDGYSCVTLGGDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LGCHLKDFGDLSFTPVPKDDLYNNLIVNPRSVGLANQELAEVVSRAVSDGYSCVTLGGDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SLAIGTISGHARHCPDLCVVWVDAHADINTPLTTSSGNLHGQPVSFLLRELQDKVPQLPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SLAIGTISGHARHCPDLCVVWVDAHADINTPLTTSSGNLHGQPVSFLLRELQDKVPQLPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FSWIKPCISSASIVYIGLRDVDPPEHFILKNYDIQYFSMRDIDRLGIQKVMERTFDLLIG
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CCDS97 FSWIKPCISSASIVYIGLRDVDPPEHFILKNYDIQYFSMRDIDRLGIQKVMERTFDLLIG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KRQRPIHLSFDIDAFDPTLAPATGTPVVGGLTYREGMYIAEEIHNTGLLSALDLVEVNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KRQRPIHLSFDIDAFDPTLAPATGTPVVGGLTYREGMYIAEEIHNTGLLSALDLVEVNPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KB5 LATSEEEAKTTANLAVDVIASSFGQTREGGHIVYDQLPTPSSPDESENQARVRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LATSEEEAKTTANLAVDVIASSFGQTREGGHIVYDQLPTPSSPDESENQARVRI
              310       320       330       340       350    

>>CCDS5145.1 ARG1 gene_id:383|Hs108|chr6                  (322 aa)
 initn: 1353 init1: 1110 opt: 1336  Z-score: 1685.6  bits: 320.3 E(32554): 1.4e-87
Smith-Waterman score: 1336; 60.1% identity (85.4% similar) in 316 aa overlap (25-340:7-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSLRGSLSRLLQTRVHSILKKSVHSVAVIGAPFSQGQKRKGVEHGPAAIREAGLMKRLSS
                               ....::::::.:: : :::.::...:.:::...:. 
CCDS51                   MSAKSRTIGIIGAPFSKGQPRGGVEEGPTVLRKAGLLEKLKE
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LGCHLKDFGDLSFTPVPKDDLYNNLIVNPRSVGLANQELAEVVSRAVSDGYSCVTLGGDH
         : .::.::: :. .:.:. .. .. :::::: :...::  :... ..:   ..:::::
CCDS51 QECDVKDYGDLPFADIPNDSPFQ-IVKNPRSVGKASEQLAGKVAEVKKNGRISLVLGGDH
             50        60         70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SLAIGTISGHARHCPDLCVVWVDAHADINTPLTTSSGNLHGQPVSFLLRELQDKVPQLPG
       :::::.::::::  ::: :.:::::.::::::::.:::::::::::::.::. :.:..::
CCDS51 SLAIGSISGHARVHPDLGVIWVDAHTDINTPLTTTSGNLHGQPVSFLLKELKGKIPDVPG
             110       120       130       140       150       160 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FSWIKPCISSASIVYIGLRDVDPPEHFILKNYDIQYFSMRDIDRLGIQKVMERTFDLLIG
       :::. ::::. .::::::::::: ::.:::.  :.:::: ..::::: ::::.:.. :.:
CCDS51 FSWVTPCISAKDIVYIGLRDVDPGEHYILKTLGIKYFSMTEVDRLGIGKVMEETLSYLLG
             170       180       190       200       210       220 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KRQRPIHLSFDIDAFDPTLAPATGTPVVGGLTYREGMYIAEEIHNTGLLSALDLVEVNPQ
       ...::::::::.:..::...::::::::::::::::.::.:::..:::::.::..::::.
CCDS51 RKKRPIHLSFDVDGLDPSFTPATGTPVVGGLTYREGLYITEEIYKTGLLSGLDIMEVNPS
             230       240       250       260       270       280 

              310       320       330       340       350    
pF1KB5 LATSEEEAKTTANLAVDVIASSFGQTREGGHIVYDQLPTPSSPDESENQARVRI
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CCDS51 LGKTPEEVTRTVNTAVAITLACFGLAREGNHKPIDYLNPPK             
             290       300       310       320               

>>CCDS59038.1 ARG1 gene_id:383|Hs108|chr6                 (330 aa)
 initn: 1322 init1: 1110 opt: 1317  Z-score: 1661.5  bits: 315.8 E(32554): 3.2e-86
Smith-Waterman score: 1317; 59.0% identity (83.6% similar) in 324 aa overlap (25-340:7-329)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSLRGSLSRLLQTRVHSILKKSVHSVAVIGAPFSQGQKRKGVEHGPAAIREAGLMKRLSS
                               ....::::::.:: : :::.::...:.:::...:. 
CCDS59                   MSAKSRTIGIIGAPFSKGQPRGGVEEGPTVLRKAGLLEKLKE
                                 10        20        30        40  

                       70        80        90       100       110  
pF1KB5 --------LGCHLKDFGDLSFTPVPKDDLYNNLIVNPRSVGLANQELAEVVSRAVSDGYS
               : : .::.::: :. .:.:. .. .. :::::: :...::  :... ..:  
CCDS59 QVTQNFLILECDVKDYGDLPFADIPNDSPFQ-IVKNPRSVGKASEQLAGKVAEVKKNGRI
             50        60        70         80        90       100 

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB5 CVTLGGDHSLAIGTISGHARHCPDLCVVWVDAHADINTPLTTSSGNLHGQPVSFLLRELQ
        ..::::::::::.::::::  ::: :.:::::.::::::::.:::::::::::::.::.
CCDS59 SLVLGGDHSLAIGSISGHARVHPDLGVIWVDAHTDINTPLTTTSGNLHGQPVSFLLKELK
             110       120       130       140       150       160 

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB5 DKVPQLPGFSWIKPCISSASIVYIGLRDVDPPEHFILKNYDIQYFSMRDIDRLGIQKVME
        :.:..:::::. ::::. .::::::::::: ::.:::.  :.:::: ..::::: ::::
CCDS59 GKIPDVPGFSWVTPCISAKDIVYIGLRDVDPGEHYILKTLGIKYFSMTEVDRLGIGKVME
             170       180       190       200       210       220 

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB5 RTFDLLIGKRQRPIHLSFDIDAFDPTLAPATGTPVVGGLTYREGMYIAEEIHNTGLLSAL
       .:.. :.:...::::::::.:..::...::::::::::::::::.::.:::..:::::.:
CCDS59 ETLSYLLGRKKRPIHLSFDVDGLDPSFTPATGTPVVGGLTYREGLYITEEIYKTGLLSGL
             230       240       250       260       270       280 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB5 DLVEVNPQLATSEEEAKTTANLAVDVIASSFGQTREGGHIVYDQLPTPSSPDESENQARV
       :..::::.:. . ::.  :.: :: .  . :: .:::.:   : :  :            
CCDS59 DIMEVNPSLGKTPEEVTRTVNTAVAITLACFGLAREGNHKPIDYLNPPK           
             290       300       310       320       330           

         
pF1KB5 RI




354 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 21:45:41 2016 done: Sat Nov  5 21:45:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]