FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5144, 730 aa
1>>>pF1KB5144 730 - 730 aa - 730 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6694+/-0.00112; mu= 17.9618+/- 0.067
mean_var=67.6324+/-13.650, 0's: 0 Z-trim(102.5): 34 B-trim: 11 in 1/46
Lambda= 0.155954
statistics sampled from 6926 (6959) to 6926 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 3376 769.2 0
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 1735 399.8 3e-111
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 1593 368.0 2.3e-101
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 1549 358.1 2.7e-98
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 1498 346.6 6.7e-95
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 1481 342.8 9.4e-94
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 912 214.8 3.1e-55
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 828 195.9 1.4e-49
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CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 519 126.4 1.4e-28
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 508 123.7 2.7e-28
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 512 124.8 4.1e-28
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 512 124.8 4.2e-28
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 512 124.8 4.5e-28
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 511 124.6 4.7e-28
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 508 123.9 7.4e-28
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 508 123.9 8.5e-28
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 501 122.4 2.8e-27
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 494 120.8 6.7e-27
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 490 119.9 1.3e-26
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 482 118.0 4.2e-26
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 480 117.6 5.7e-26
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 479 117.3 5.8e-26
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 466 114.3 2e-25
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 466 114.5 5.3e-25
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 432 106.8 1e-22
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 410 101.8 2.7e-21
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 410 101.9 3.2e-21
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 410 101.9 3.3e-21
>>CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 (730 aa)
initn: 4873 init1: 4873 opt: 4873 Z-score: 5920.2 bits: 1106.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4873; 100.0% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPKNSKVVKRELDDDVTESVKDLLSNEDAADDAFKTSELIVDGQEEKDTDVEEGSEVEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MPKNSKVVKRELDDDVTESVKDLLSNEDAADDAFKTSELIVDGQEEKDTDVEEGSEVEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LAMIKGIQSSGKIIYFSSLFPYVVLICFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LAMIKGIQSSGKIIYFSSLFPYVVLICFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVWR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NVINEKCITQNSETIMKFLKMGNISQDIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NVINEKCITQNSETIMKFLKMGNISQDIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEFPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LHLNSCKIEEELNKAVQGTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LHLNSCKIEEELNKAVQGTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGTIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GIVTPIVDTFKVRKEILTVICCLLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GIVTPIVDTFKVRKEILTVICCLLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVILE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 NIAVCFVYGIDKFMEDLKDMLGFAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPPGYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NIAVCFVYGIDKFMEDLKDMLGFAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPPGYN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 AWIEDKASEEFLSYPTWGLVVCVSLVVFAILPVPVVFIVRRFNLIDDSSGNLASVTYKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AWIEDKASEEFLSYPTWGLVVCVSLVVFAILPVPVVFIVRRFNLIDDSSGNLASVTYKRG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RVLKEPVNLEGDDTSLIHGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTAPNGRYGIGYLMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RVLKEPVNLEGDDTSLIHGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTAPNGRYGIGYLMAD
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 IMPDMPESDL
::::::::::
CCDS90 IMPDMPESDL
730
>>CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 (623 aa)
initn: 4167 init1: 4167 opt: 4167 Z-score: 5062.8 bits: 947.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4167; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (108-730:1-623)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 SVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELSVGQRIRRGSIGVWNYIS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVIGIPLFFLELSVGQRIRRGSIGVWNYIS
10 20 30
140 150 160 170 180 190
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWDQCPLVKNASHTFVEPEC
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 EQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVCLAMIKGIQSSGKIIYFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVCLAMIKGIQSSGKIIYFS
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 SLFPYVVLICFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVWREAATQVFFALGLGFGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLFPYVVLICFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVWREAATQVFFALGLGFGGV
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 IAFSSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANVINEKCITQNSETIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IAFSSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANVINEKCITQNSETIMK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 FLKMGNISQDIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEFPALHLNSCKIEEELNKAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FLKMGNISQDIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEFPALHLNSCKIEEELNKAVQ
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 GTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGTIEGIVTPIVDTFKVRKEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGTIEGIVTPIVDTFKVRKEIL
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 TVICCLLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVILENIAVCFVYGIDKFMEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TVICCLLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVILENIAVCFVYGIDKFMEDL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 KDMLGFAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPPGYNAWIEDKASEEFLSYPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDMLGFAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPPGYNAWIEDKASEEFLSYPTW
460 470 480 490 500 510
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLVVCVSLVVFAILPVPVVFIVRRFNLIDDSSGNLASVTYKRGRVLKEPVNLEGDDTSLI
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680 690 700 710 720 730
pF1KB5 HGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTAPNGRYGIGYLMADIMPDMPESDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTAPNGRYGIGYLMADIMPDMPESDL
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>>CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 (727 aa)
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Smith-Waterman score: 3376; 66.3% identity (87.8% similar) in 735 aa overlap (1-730:1-727)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPKNSKVVKRELDDD-VTESVKDLLSNEDAADDAFKTSELIVDGQEE-KDTDVEEGSEVE
:::::::..:: ... ::::: :::. :. .: .: : : : :. :. ::: ..:
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10 20 30 40 50
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pF1KB5 DERPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLE
: ::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::.:::.::..:::::::::
CCDS30 D-RPAWNSKLQYILAQIGFSVGLGNIWRFPYLCQKNGGGAYLVPYLVLLIIIGIPLFFLE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LSVGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLP
:.:::::::::::::.:: :.::::::.::.:: ::.::::::::::.::: .::: :::
CCDS30 LAVGQRIRRGSIGVWHYICPRLGGIGFSSCIVCLFVGLYYNVIIGWSIFYFFKSFQYPLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WDQCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVM
:..::.:.:.: . :: :::.::::::.::::::.::.:::::::::::::.:::.:: .
CCDS30 WSECPVVRNGSVAVVEAECEKSSATTYFWYREALDISDSISESGGLNWKMTLCLLVAWSI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VCLAMIKGIQSSGKIIYFSSLFPYVVLICFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKV
: .:..::::::::..::::::::::: :::.:..:: :..::: :::::::. ::.:.:
CCDS30 VGMAVVKGIQSSGKVMYFSSLFPYVVLACFLVRGLLLRGAVDGILHMFTPKLDKMLDPQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 WREAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGF
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS30 WREAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKQDNNCHFDAALVSFINFFTSVLATLVVFAVLGF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KANVINEKCITQNSETIMKFLKMGNISQDIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEF
:::..::::...:.: :. .:. . .:.:.:: :.:.: .:..:: .:..:. :::..:
CCDS30 KANIMNEKCVVENAEKILGYLNTNVLSRDLIPPHVNFSHLTTKDYMEMYNVIMTVKEDQF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PALHLNSCKIEEELNKAVQGTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGT
:: :. : .:.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS30 SALGLDPCLLEDELDKSVQGTGLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLINLGLGSMIGT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IEGIVTPIVDTFKVRKEILTVICCLLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVI
. ::.:::.::::: ::..:: ::..:: .::.:::::::::::::::::::::: ..::
CCDS30 MAGITTPIIDTFKVPKEMFTVGCCVFAFLVGLLFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLTLIVI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LENIAVCFVYGIDKFMEDLKDMLGFAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPPG
:::::: ..:: :::..: .:::: : :.:.::::..::: . : ::....:..:::
CCDS30 LENIAVAWIYGTKKFMQELTEMLGFRPYRFYFYMWKFVSPLCMAVLTTASIIQLGVTPPG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 YNAWIEDKASEEFLSYPTWGLVVCVSLVVFAILPVPVVFIVRRFNLIDDSSGNLASVTYK
:.:::...:.:..: .:.:.... ..:.: : ::.::::..:.:.:..:.:..: ::.::
CCDS30 YSAWIKEEAAERYLYFPNWAMALLITLIVVATLPIPVVFVLRHFHLLSDGSNTL-SVSYK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 RGRVLKEPVNLE-GDDTSLIHGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTA--PNGRYGIG
.::..:. ::: .:.: .: .:.::: ::: . : ... :.:. :::::: :
CCDS30 KGRMMKDISNLEENDETRFILSKVPSEAPSPMPTHRSYLGPGSTSPLETSGNPNGRYGSG
660 670 680 690 700 710
720 730
pF1KB5 YLMADIMPDMPESDL
::.:. :::.:
CCDS30 YLLAS----TPESEL
720
>>CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 (289 aa)
initn: 1716 init1: 1716 opt: 1735 Z-score: 2110.8 bits: 399.8 E(32554): 3e-111
Smith-Waterman score: 1735; 92.9% identity (96.8% similar) in 280 aa overlap (1-279:1-276)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPKNSKVVKRELDDDVTESVKDLLSNEDAADDAFKTSELIVDGQEEKDTDVEEGSEVEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MPKNSKVVKRELDDDVTESVKDLLSNEDAADDAFKTSELIVDGQEEKDTDVEEGSEVEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWRFPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFASCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYYWYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVC
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 LAMIKGIQSSGKIIYFSSLFPYVVLICFLIRAFL-LNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVW
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CCDS90 LAMIKGIQSSGKV---SMLEPFLILL-ITISGFIPLSNSVTDFCGQITHNTSF
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CCDS38 TDLHMPGAPVWAMLFFGMLFTLGLSTMFGTVEAVITPLLDVGVLPRWVPKEALTGLVCLV
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CCDS38 PSPYWRLTWRVVSPL-LLTIFVAYIILLFWKPLRYKAWNPKYELFPSRQEKLYPGWARAA
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CCDS38 CVLLSLLPVLWVPVAALAQLLTRRRRTWRDRDARPDTDMRPDTDTRPDTDMRPDTDMR
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CCDS26 DLPDRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFL
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CCDS26 LECSLGQYTSIGGLGVWK-LAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTT
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CCDS26 LPWKQCDNPWNTDRCFSNYSMVNTTNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITL
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CCDS26 AIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRK
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