Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5140
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5140, 393 aa
1>>>pF1KB5140 393 - 393 aa - 393 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1781+/-0.000799; mu= 17.0330+/- 0.048
mean_var=62.9803+/-12.497, 0's: 0 Z-trim(107.3): 29 B-trim: 71 in 1/48
Lambda= 0.161611
statistics sampled from 9483 (9509) to 9483 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 2626 620.9 6.1e-178
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1845 438.9 4.2e-123
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1724 410.6 1.3e-114
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 1478 353.3 2.8e-97
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1323 317.1 1.9e-86
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1306 313.2 2.9e-85
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1283 307.8 1.2e-83
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1201 288.7 6.9e-78
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 1197 287.7 1.2e-77
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1142 274.9 9.3e-74
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1037 250.4 2e-66
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1037 250.4 2e-66
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 1024 247.4 1.9e-65
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 977 236.5 3.5e-62
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 977 236.5 3.7e-62
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 973 235.5 5.1e-62
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 921 223.4 2.7e-58
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 897 217.7 8.9e-57
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 806 196.6 3.2e-50
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 645 159.0 6.2e-39
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 2626 init1: 2626 opt: 2626 Z-score: 3308.1 bits: 620.9 E(32554): 6.1e-178
Smith-Waterman score: 2626; 99.7% identity (100.0% similar) in 393 aa overlap (1-393:1-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTDLFTTLVDLQWRLS
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CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTDLFTTLVDLQWRLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGFVAAFLFSIETETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGFVAAFLFSIETETT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKRAATLVFSSHAVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKRAATLVFSSHAVVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTDLSVGFDTGDDRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTDLSVGFDTGDDRLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYLVDEVLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYLVDEVLW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDAHLYWSIPSRLDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDAHLYWSIPSRLDEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB5 VEEEGVGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
:::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
370 380 390
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 1847 init1: 1820 opt: 1845 Z-score: 2323.5 bits: 438.9 E(32554): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 1845; 71.8% identity (89.6% similar) in 376 aa overlap (18-393:50-423)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTD
.: ::::.:::.:::..::::::::::::
CCDS42 DVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYLTD
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 LFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGF
.:::::::.::..::.::..:..:::::: ::::::: :::..:.:: .:::::.:::::
CCDS42 IFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKR
:.:::::::::::::::.:::::.:::::.:::.:..:::.::::::::::::::::.::
CCDS42 VSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKR
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 AATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTD
: :::::.:::.:.:::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:: :::::::.:::
CCDS42 AETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTD
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTC
..::. ::::::::::::.:::::. ::::: :. : ....:::::::::::::::::
CCDS42 INVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTC
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDA
::::::...:.:::.::: ::::::::::::: :::::.:. ::: ::.:::: :.: .
CCDS42 QARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAEL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KB5 HLYWSIPSRLDEKVEEEGVGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
: ::. :.:....: : : . : . :.:: . :.::::
CCDS42 PLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLE--EQTERNGDVANLENESKV
380 390 400 410 420
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1719 init1: 1719 opt: 1724 Z-score: 2171.1 bits: 410.6 E(32554): 1.3e-114
Smith-Waterman score: 1725; 70.0% identity (86.6% similar) in 367 aa overlap (18-372:47-411)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTD
.. ::::.::.:.:::..:::.::::::.:
CCDS84 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSD
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 LFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGF
::::::::.::..:: :...:..:::::: ::::::: ::::.:. : : :::.::.::
CCDS84 LFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKR
:.::::::::::::::: ::::..:::::.:::.::::::.::::::::::::::::.::
CCDS84 VSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKR
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 AATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTD
: ::.::..::.:.:: .:::::::::::.:::::::::::::.:::: :::::::.:::
CCDS84 AETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTD
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTC
..::::::::::::::::.:::::. ::::: :. :....::.:::::::::::::::
CCDS84 INVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTC
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDA
::::::. ::::::::: ::::: ::::::: .::.:.:. :::: :.:::: . ..
CCDS84 QARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM--KREG
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KB5 HLYWSIPSR----------LDEKVE--EEGVGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
.: .:: :: ..: :: .: ::
CCDS84 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
380 390 400 410
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 1509 init1: 1369 opt: 1478 Z-score: 1860.0 bits: 353.3 E(32554): 2.8e-97
Smith-Waterman score: 1478; 63.3% identity (87.7% similar) in 332 aa overlap (10-340:33-363)
10 20 30
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNV-
: :. :... :::.:.:.::::::.::.
CCDS22 ALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKK-RQRFVDKNGRCNVQHGNLG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RETYRYLTDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWT
:: :::.:::::::::.:: .:..:.:.:...:::....::.::: ::::.. . .:
CCDS22 SETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNYT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PCVNNLNGFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMF
::: :. .: .:::: ::::.:::::.: :::.:::::.:.:.:.::::.:.::..::::
CCDS22 PCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCMF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 VKISQPNKRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEG
.:.:::.::: ::.:: :::.:.:::.: ::::::.::.::.: :.:: ::..:::: ::
CCDS22 IKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPEG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EFIPLHQTDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEG
::.:: : .:.:::.:: :.:::::::.: : ::: :::.. :.:... ..:::::::::
CCDS22 EFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILEG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MVEATGMTCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSAREL
.::.::::::::.:: ::::::::: :..::.::..:::..:: ::::::: :..:
CCDS22 IVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPYSVKEQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 AEAAARLDAHLYWSIPSRLDEKVEEEGVGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
:
CCDS22 EEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMSS
370 380 390 400 410 420
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1319 init1: 1201 opt: 1323 Z-score: 1665.6 bits: 317.1 E(32554): 1.9e-86
Smith-Waterman score: 1323; 55.3% identity (80.0% similar) in 360 aa overlap (17-369:39-398)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRE-TYRYL
::: :.:.:.:.:.::.. .:. : . :::
CCDS11 PYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRYL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 TDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLN
.:.::: ::..:: ::.: ::. .::.:: :.:.:: ..:::: : . :::: ...
CCDS11 ADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEGRGRTPCVMQVH
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPN
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CCDS11 GFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 KRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQ
::: ::.:: .:::.::::.::::.:::.::.:::::: .::.::. : : :::.::: :
CCDS11 KRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGM
:..:::: : ::.:::::..: :::: :::.. ::. :: ::::::::::::::::.:
CCDS11 IDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVP-TPSCSARELAEAAAR
: :::::::..:.:::::: :: : . :..::. ::.:.::: :: :::..:.:
CCDS11 TTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB5 LDAHLYWSIPSRL-----DEKVEEEGVGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
: . . ..: ::. : .: .:
CCDS11 LPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPYR
370 380 390 400 410 420
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1295 init1: 1187 opt: 1306 Z-score: 1644.2 bits: 313.2 E(32554): 2.9e-85
Smith-Waterman score: 1306; 55.0% identity (79.7% similar) in 360 aa overlap (17-369:39-398)
10 20 30 40
pF1KB5 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRE-TYRYL
::: :.:.:.:.:.::. .:. : . :::
CCDS74 PYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 TDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLN
.:.::: ::..:: ::.: ::. .::.::.:.:.:: ..:::: : . :::: ...
CCDS74 ADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGHGRTPCVMQVH
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPN
::.:::::::::.:::::: : .:..: .. ... :.:.: ....::.: ...:...:.
CCDS74 GFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 KRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQ
::: ::.:: .:::.::::.::::.:::.::.:::::: .::.::. : : :::.::: :
CCDS74 KRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGM
:..:::: : ::.:::::..: :::: :::.. ::. :: ::::::::::::::::.:
CCDS74 IDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVP-TPSCSARELAEAAAR
: :::::::..:.:::::: :: : . :..::. ::.:.::: :: :::..:.:
CCDS74 TTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
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CCDS12 PRVLTPTLALTLPP
430
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CCDS86 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]