Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5136
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5136, 266 aa
1>>>pF1KB5136 266 - 266 aa - 266 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2016+/-0.000879; mu= 15.4443+/- 0.053
mean_var=66.1091+/-13.364, 0's: 0 Z-trim(106.8): 27 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.157741
statistics sampled from 9154 (9181) to 9154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9011.1 GLIPR1 gene_id:11010|Hs108|chr12 ( 266) 1875 435.3 2e-122
CCDS58258.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 ( 344) 705 169.2 3.6e-42
CCDS9009.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 ( 233) 692 166.1 2e-41
CCDS76578.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 ( 242) 689 165.4 3.4e-41
CCDS9010.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 ( 253) 603 145.9 2.7e-35
CCDS10949.1 CRISPLD2 gene_id:83716|Hs108|chr16 ( 497) 454 112.1 7.6e-25
CCDS6219.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 ( 500) 453 111.9 8.9e-25
CCDS34440.1 PI16 gene_id:221476|Hs108|chr6 ( 463) 444 109.8 3.5e-24
CCDS4928.1 CRISP2 gene_id:7180|Hs108|chr6 ( 243) 415 103.1 2e-22
CCDS6218.1 PI15 gene_id:51050|Hs108|chr8 ( 258) 412 102.4 3.3e-22
CCDS4929.2 CRISP3 gene_id:10321|Hs108|chr6 ( 258) 396 98.8 4.2e-21
CCDS55019.1 CRISP3 gene_id:10321|Hs108|chr6 ( 268) 396 98.8 4.3e-21
CCDS4931.1 CRISP1 gene_id:167|Hs108|chr6 ( 249) 372 93.3 1.8e-19
CCDS13329.1 R3HDML gene_id:140902|Hs108|chr20 ( 253) 372 93.3 1.8e-19
CCDS32484.1 CLEC18B gene_id:497190|Hs108|chr16 ( 455) 316 80.7 2e-15
CCDS10886.1 CLEC18A gene_id:348174|Hs108|chr16 ( 446) 305 78.2 1.1e-14
CCDS32473.1 CLEC18C gene_id:283971|Hs108|chr16 ( 446) 304 78.0 1.3e-14
CCDS4932.1 CRISP1 gene_id:167|Hs108|chr6 ( 178) 270 70.0 1.3e-12
>>CCDS9011.1 GLIPR1 gene_id:11010|Hs108|chr12 (266 aa)
initn: 1875 init1: 1875 opt: 1875 Z-score: 2311.2 bits: 435.3 E(32554): 2e-122
Smith-Waterman score: 1875; 100.0% identity (100.0% similar) in 266 aa overlap (1-266:1-266)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTW
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CCDS90 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGFDALSNGAHFICNYGPGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 IQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGFDALSNGAHFICNYGPGGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YPTWPYKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIV
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CCDS90 YPTWPYKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIV
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB5 NSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
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CCDS90 NSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
250 260
>>CCDS58258.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 (344 aa)
initn: 689 init1: 439 opt: 705 Z-score: 870.6 bits: 169.2 E(32554): 3.6e-42
Smith-Waterman score: 705; 40.5% identity (68.0% similar) in 259 aa overlap (10-264:32-283)
10 20 30
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVR
:.. . : : .: .::: :. :::.. :
CCDS58 EAARPFAREWRAQSLPLAVGGVLKLRLCELWLLLLGS--SLNARFLPDEEDVDFINEYVN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGEN
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CCDS58 LHNELRGDVIPRGSNLRFMTWDVALSRTARAWGKKCLFTHNIYLQDVQMVHPKFYGIGEN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 IWTGSVPIFSVSSAITNWYDEIQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKV
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CCDS58 MWVGPENEFTASIAIRSWHAEKKMYNFENGSCSGDCSNYIQLVWDHSYKVGCAVTPCSKI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SGFDALSNGAHFICNYGPGGNYPTWPYKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYS
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CCDS58 GH---IIHAAIFICNYAPGGTLTRRPYEPGIFCTRCGRRDKCTDFLCSNADRDQAT-YYR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB5 VVYPGWPIYPR----NRYTSLFLIVNSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
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CCDS58 FWYPKWEM-PRPVVCDPLCTFILLLRILCFILCVITVLIVQSQFPNILLEQQMIFTPEES
240 250 260 270 280 290
CCDS58 EAGNEEEEKEEEKKEKEEMEMEIMEMEEEKEEREEEEEETQKEKMEEEEK
300 310 320 330 340
>>CCDS9009.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 (233 aa)
initn: 690 init1: 536 opt: 692 Z-score: 857.1 bits: 166.1 E(32554): 2e-41
Smith-Waterman score: 692; 46.0% identity (72.5% similar) in 200 aa overlap (10-208:11-205)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMT
:.... . :.. .:.: . :: .:.. ::..:..:.: :.:: ::
CCDS90 MALKNKFSCLWILGLCL-VATTSSKIPSITDPHFIDNCIEAHNEWRGKVNPPAADMKYMI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 WDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYD
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CCDS90 WDKGLAKMAKAWANQCKFEHNDCLDKSYKCYAAFEYVGENIWLGGIKSFTPRHAITAWYN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EIQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGFDALSNGAHFICNYGPGG
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CCDS90 ETQFYDFDSLSCSRVCGHYTQLVWANSFYVGCAVAMCPNLGG----ASTAIFVCNYGPAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NYPTWP-YKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFL
:. . : : :: .:: : ...::. ::: :
CCDS90 NFANMPPYVRGESCSLCSKEEKCVKNLCKNPFLKPTGRAPQQTAFNPFSLGFLLLRIF
180 190 200 210 220 230
>>CCDS76578.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 (242 aa)
initn: 686 init1: 536 opt: 689 Z-score: 853.2 bits: 165.4 E(32554): 3.4e-41
Smith-Waterman score: 689; 45.5% identity (72.3% similar) in 202 aa overlap (10-210:11-207)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMT
:.... . :.. .:.: . :: .:.. ::..:..:.: :.:: ::
CCDS76 MALKNKFSCLWILGLCL-VATTSSKIPSITDPHFIDNCIEAHNEWRGKVNPPAADMKYMI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 WDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYD
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CCDS76 WDKGLAKMAKAWANQCKFEHNDCLDKSYKCYAAFEYVGENIWLGGIKSFTPRHAITAWYN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EIQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGFDALSNGAHFICNYGPGG
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CCDS76 ETQFYDFDSLSCSRVCGHYTQLVWANSFYVGCAVAMCPNLGG----ASTAIFVCNYGPAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NYPTWP-YKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFL
:. . : : :: .:: : ...::. ::: . :
CCDS76 NFANMPPYVRGESCSLCSKEEKCVKNLCRTPQLIIPNQNPFLKPTGRAPQQTAFNPFSLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB5 IVNSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
CCDS76 FLLLRIF
240
>>CCDS9010.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 (253 aa)
initn: 579 init1: 439 opt: 603 Z-score: 747.1 bits: 145.9 E(32554): 2.7e-35
Smith-Waterman score: 603; 40.5% identity (70.0% similar) in 210 aa overlap (10-219:32-236)
10 20 30
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVR
:.. . : : .: .::: :. :::.. :
CCDS90 EAARPFAREWRAQSLPLAVGGVLKLRLCELWLLLLGS--SLNARFLPDEEDVDFINEYVN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGEN
.::..:..: : .:.. .:::: ::.. :.::...: :.:: :. . .::.: ..:::
CCDS90 LHNELRGDVIPRGSNLRFMTWDVALSRTARAWGKKCLFTHNIYLQDVQMVHPKFYGIGEN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 IWTGSVPIFSVSSAITNWYDEIQDYDFKTRICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKV
.:.: :..: :: .:. : . :.:.. :. :..: :.:: :::::::: : :.
CCDS90 MWVGPENEFTASIAIRSWHAEKKMYNFENGSCSGDCSNYIQLVWDHSYKVGCAVTPCSKI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SGFDALSNGAHFICNYGPGGNYPTWPYKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYS
. . ..: :::::.:::. ::. : :. : ::: : :: . .. ..:....
CCDS90 GH---IIHAAIFICNYAPGGTLTRRPYEPGIFCTRCGRRDKCTDFLCSKIKKINMKKMHN
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB5 VVYPGWPIYPRNRYTSLFLIVNSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
CCDS90 GLDKKNKRLNTSFLWSC
240 250
>>CCDS10949.1 CRISPLD2 gene_id:83716|Hs108|chr16 (497 aa)
initn: 406 init1: 163 opt: 454 Z-score: 559.5 bits: 112.1 E(32554): 7.6e-25
Smith-Waterman score: 454; 36.3% identity (60.1% similar) in 223 aa overlap (5-206:25-234)
10 20 30
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTAN---ILPDIENEDFIKDC
: ... . ..:.:.:. . . : :: ..
CCDS10 MSCVLGGVIPLGLLFLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPRED-KEEI
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 VRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLG
. .:::.:..:.: ::.: ::::: : . : ::::.: . :. : .: ..:.:
CCDS10 LMLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHG-----PTSL---LVSIG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB5 ENI---W-TGSVPIFSVSSAITNWYDEIQDYDFK----------TRICKKVCGHYTQVVW
.:. : : : :.: ::::..:: . : .: ::::.::
CCDS10 QNLGAHWGRYRSPGFHVQS----WYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVW
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KB5 ADSYKVGCAVQFCPKVSGF-DALSNGAHFICNYGPGGNY-PTWPYKRGATCSACPNN--D
: . :.::::. : :.. . .. :...:.:::.: ::. ::: : :: :: .
CCDS10 ATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGG
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIVNSVILILSVIITILVQHKY
.: .:::
CCDS10 SCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVETAPIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQV
230 240 250 260 270 280
>>CCDS6219.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 (500 aa)
initn: 428 init1: 161 opt: 453 Z-score: 558.3 bits: 111.9 E(32554): 8.9e-25
Smith-Waterman score: 453; 38.2% identity (61.3% similar) in 212 aa overlap (28-218:57-249)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLY
: ..: ... . .:::.::.: ::::.: :
CCDS62 PNATLLEKLLEKYMDEDGEWWIAKQRGKRAITDND-MQSILDLHNKLRSQVYPTASNMEY
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 MTWDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENI---WTGSV--PIFSVSS
:::: : . :..:: .: . :. : .: : :.:.:. : : : : :.:
CCDS62 MTWDVELERSAESWAESCLWEHG-----PASLLP---SIGQNLGAHW-GRYRPPTFHVQS
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KB5 AITNWYDEIQDYDFKT----------RICKKVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGF
::::..:... : :: :::::::: : ..:::...: ... .
CCDS62 ----WYDEVKDFSYPYEHECNPYCPFRCSGPVCTHYTQVVWATSNRIGCAINLCHNMNIW
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KB5 DAL-SNGAHFICNYGPGGNYPTW---PYKRGATCSACPNN--DKCLDNLCVNRQRDQVKR
. ......:::.: ::. : :::.: ::::: . : .::: .. : :
CCDS62 GQIWPKAVYLVCNYSPKGNW--WGHAPYKHGRPCSACPPSFGGGCRENLCYKEGSD---R
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB5 YYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIVNSVILILSVIITILVQHKYPNLVLLD
::
CCDS62 YYPPREEETNEIERQQSQVHDTHVRTRSDDSSRNEVISAQQMSQIVSCEVRLRDQCKGTT
250 260 270 280 290 300
>>CCDS34440.1 PI16 gene_id:221476|Hs108|chr6 (463 aa)
initn: 385 init1: 226 opt: 444 Z-score: 547.7 bits: 109.8 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 444; 39.0% identity (67.4% similar) in 172 aa overlap (38-206:37-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 IAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPALAQI
:..:: .:..:.:::::::.: :: :: .
CCDS34 FLMLLLPLLLLLVATTGPVGALTDEEKRLMVELHNLYRAQVSPTASDMLHMRWDEELAAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYDEIQDYDFK
:::.: .: ..:: : . :::... . ..: :. .:. : . :...
CCDS34 AKAYARQCVWGHN---KERGRR-------GENLFAITDEGMDVPLAMEEWHHEREHYNLS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TRICK--KVCGHYTQVVWADSYKVGCAVQFCPKVSGFDALSNGAHFICNYGPGGNYP-TW
. :. ..:::::::::: . ..::. .:: :..: . .: ..::: : ::
CCDS34 AATCSPGQMCGHYTQVVWAKTERIGCGSHFCEKLQGVEE-TNIELLVCNYEPPGNVKGKR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PYKRGATCSACPNNDKCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIVNSVI
::..:. :: ::.. .: ..::
CCDS34 PYQEGTPCSQCPSGYHCKNSLCEPIGSPEDAQDLPYLVTEAPSFRATEASDSRKMGTPSS
180 190 200 210 220 230
>>CCDS4928.1 CRISP2 gene_id:7180|Hs108|chr6 (243 aa)
initn: 333 init1: 129 opt: 415 Z-score: 516.1 bits: 103.1 E(32554): 2e-22
Smith-Waterman score: 415; 37.5% identity (63.6% similar) in 184 aa overlap (35-213:38-208)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 LATIAWMVSFVSNYSHTANILPDIENEDFIKDCVRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPAL
.. : ::..:. :.: ::.:: : :. .
CCDS49 FLVTVLLPSLPAEGKDPAFTALLTTQLQVQREIVNKHNELRKAVSPPASNMLKMEWSREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVPIFSVSSAITNWYDEIQD-
. :. ::..: ..:. : . . : :::.. .: : : :::: .::::: :
CCDS49 TTNAQRWANKCTLQHS---DPEDR--KTSTRCGENLYMSSDPT-SWSSAIQSWYDEILDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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