Result of FASTA (omim) for
pF1KB5128
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5128, 795 aa
1>>>pF1KB5128 795 - 795 aa - 795 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9096+/-0.00042; mu= 17.0202+/- 0.026
mean_var=85.1967+/-17.382, 0's: 0 Z-trim(111.6): 401 B-trim: 11 in 2/53
Lambda= 0.138951
statistics sampled from 19756 (20196) to 19756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 12.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061761 (OMIM: 606330) protocadherin beta-4 prec ( 795) 5168 1046.9 0
NP_056484 (OMIM: 606331) protocadherin beta-5 prec ( 795) 4035 819.7 0
NP_061762 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 isof ( 794) 3998 812.3 0
NP_061760 (OMIM: 606329) protocadherin beta-3 prec ( 796) 3976 807.9 0
NP_061758 (OMIM: 606341) protocadherin beta-15 pre ( 787) 3965 805.7 0
NP_061757 (OMIM: 606340) protocadherin beta-14 pre ( 798) 3931 798.9 0
NP_061759 (OMIM: 606328) protocadherin beta-2 prec ( 798) 3885 789.7 0
NP_066008 (OMIM: 606345) protocadherin beta-16 pre ( 776) 3871 786.8 0
NP_061755 (OMIM: 606338) protocadherin beta-12 pre ( 795) 3866 785.9 0
NP_061754 (OMIM: 606337) protocadherin beta-11 pre ( 797) 3840 780.6 0
NP_061763 (OMIM: 606333) protocadherin beta-7 prec ( 793) 3839 780.4 0
NP_061993 (OMIM: 606334) protocadherin beta-8 prec ( 801) 3825 777.6 0
NP_061992 (OMIM: 606335) protocadherin beta-9 prec ( 797) 3783 769.2 0
NP_061753 (OMIM: 606336) protocadherin beta-10 pre ( 800) 3772 767.0 0
NP_061756 (OMIM: 606339) protocadherin beta-13 pre ( 798) 3770 766.6 0
NP_001290074 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 i ( 658) 3465 705.4 2e-202
NP_037472 (OMIM: 606327) protocadherin beta-1 prec ( 818) 2596 531.3 6.5e-150
NP_115272 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 808) 2131 438.1 7.4e-122
NP_061750 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 929) 2131 438.1 8.4e-122
NP_114475 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 818) 2120 435.8 3.5e-121
NP_061742 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 932) 2120 435.9 3.9e-121
NP_114398 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 823) 2119 435.7 4e-121
NP_061738 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 932) 2119 435.7 4.4e-121
NP_115267 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 811) 2117 435.2 5.2e-121
NP_061746 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 931) 2117 435.3 5.9e-121
NP_114476 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 817) 2106 433.0 2.4e-120
NP_061743 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 932) 2106 433.1 2.7e-120
NP_114382 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 823) 2102 432.2 4.3e-120
NP_061735 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 931) 2102 432.3 4.7e-120
NP_114443 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 813) 2100 431.8 5.6e-120
NP_061741 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 931) 2100 431.9 6.2e-120
NP_115271 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 820) 2098 431.4 7.4e-120
NP_061749 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 930) 2098 431.5 8.2e-120
NP_114442 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 851) 2095 430.8 1.2e-119
NP_061740 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 962) 2095 430.9 1.3e-119
NP_115270 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 818) 2091 430.0 2e-119
NP_061748 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 923) 2091 430.1 2.2e-119
NP_114478 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 828) 2089 429.6 2.6e-119
NP_061744 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 932) 2089 429.7 2.9e-119
NP_115269 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 803) 2074 426.6 2e-118
NP_003727 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 923) 2074 426.7 2.3e-118
NP_114479 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 850) 2073 426.4 2.5e-118
NP_061736 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 936) 2073 426.5 2.7e-118
NP_114400 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 829) 2072 426.2 2.8e-118
NP_114480 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 837) 2072 426.2 2.8e-118
NP_061739 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 932) 2072 426.3 3e-118
NP_061737 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 935) 2072 426.3 3.1e-118
NP_115265 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 820) 2071 426.0 3.1e-118
NP_003726 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 932) 2071 426.1 3.5e-118
NP_115268 (OMIM: 606301) protocadherin gamma-B3 is ( 814) 2045 420.8 1.2e-116
>>NP_061761 (OMIM: 606330) protocadherin beta-4 precurso (795 aa)
initn: 5168 init1: 5168 opt: 5168 Z-score: 5599.0 bits: 1046.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5168; 100.0% identity (100.0% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNITI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 LSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 VGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTGR
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB5 EVKENPKFRNSLVFS
:::::::::::::::
NP_061 EVKENPKFRNSLVFS
790
>>NP_056484 (OMIM: 606331) protocadherin beta-5 precurso (795 aa)
initn: 4035 init1: 2871 opt: 4035 Z-score: 4371.6 bits: 819.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4035; 77.8% identity (90.9% similar) in 789 aa overlap (4-792:5-792)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA
:.. .:::. . ....: .. : .:::. :::::: ::.::::::::.::::
NP_056 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE
.:.::. .:. :::: .::.::: :::::: .:: :::.::::..:: :::::: .
NP_056 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI
: . :::::.: :::.:.:::: :..::::.::: ::.:.:.::: .:.::::::::::.
NP_056 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP
:.:...:.:::.:: :: :::::.::.::::.:::::.::::::. .::...: :::::
NP_056 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGE
::... : ::: :::::.: .: : :::.::: .:::.:.:::. ::. : : :.: :.:
NP_056 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQG-DEVTQPFVIDEKTAE
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENA
: ::. :::: :.::: :::::::::: ::.::::::::: ::: .:.:.: ::::
NP_056 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
:::::..: . : :::.::.::::: ..:::.:::::::::::::.: ::::..::::::
NP_056 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:.:::.:::::::..:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA
::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_056 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::.:::: : .:
NP_056 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KB5 REVKENPKFRNSLVFS
.:. .. ::::.
NP_056 EEIGKTAAFRNSFGLN
780 790
>>NP_061762 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 isoform (794 aa)
initn: 2814 init1: 2814 opt: 3998 Z-score: 4331.5 bits: 812.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3998; 77.8% identity (90.4% similar) in 785 aa overlap (11-795:11-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELAS
::: :::... ..: : :.::::::::::.:::.:.::::: .:::::
NP_061 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGEL
:.:::. ..:.::.: :: :::: :::::::::: ::::: :::.:: :.::::. :
NP_061 RGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQASL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHIL
..:::::.: :: ::.:::: : ..:: .::: .:.:::.::::::.:::: : :::.:
NP_061 RVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAPE
:::.:::.:.:.:: ::::::::::.. :::.:::::::::::: ..: ..:::::.::
NP_061 TRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGEI
:.. : .:: ::.:: : .. : :::.:::.::.:::.:::. :...: : :: .::::
NP_061 FAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAITGEI
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENAP
:.: ::::.:.:: :..::::::::::: ..:..:.::::: ::: .: . : :::: :
NP_061 RLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENLP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
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: .:..: . : :::.: ..:::: .::::.:.:...:::::::: ::::. :::::::
NP_061 EITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNITI
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.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
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::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
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:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:..:.: :::. ::
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::.:.:.:.: .::..::..::::::: ::::::::::: :::.::::..:. :.::
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NP_061 HVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
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NP_061 AERVSEANPSFRKSFEFS
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NP_061 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE
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NP_061 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
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:..::::::::::.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVFLFVAVRLCRRSRAA
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NP_061 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
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pF1KB5 REVKENPKFRNSLVFS
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NP_061 RKSEFLE
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NP_061 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
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pF1KB5 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI
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NP_061 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
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. :.. :::: :.:: ..:.:::::::::: :....:.:.::::::. :::.:. :::::
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pF1KB5 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
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NP_061 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
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pF1KB5 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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NP_061 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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NP_061 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA
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NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB5 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB5 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG
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NP_061 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
730 740 750 760 770 780
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pF1KB5 REVKENPKFRNSLVFS
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NP_061 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
790
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NP_061 MEAGEGKERVPKQRQVLIFFVLLGIAQASCQPRHYSVAEETESGSFVANLLKDLGLEIGE
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pF1KB5 LASRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQ
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NP_061 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
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NP_061 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
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pF1KB5 HILTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDN
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NP_061 HLNLQDSLDGIILPQLVLNRALDREEQPEIRLTLTALDGGSPPRSGTALVRIEVVDINDN
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pF1KB5 APEFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVT
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NP_061 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
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: .:....: . : :::.::.:.::: :.:::.:::...:::::: ::::: .:::
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NP_061 HVLLVDGFSQPYLLLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
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NP_061 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
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NP_061 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
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pF1KB5 REVKENPKFRNSLVFS
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NP_061 SEVEENPPFQNNLGF
790
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pF1KB5 MKKLG-RIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA
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NP_061 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
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pF1KB5 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE
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NP_061 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
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NP_061 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
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pF1KB5 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP
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NP_061 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
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NP_061 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
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NP_061 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
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pF1KB5 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
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NP_061 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT
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pF1KB5 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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NP_061 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB5 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA
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NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB5 REVKENPKFRNSLVFS
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NP_061 KNSEENSTFRNSFGFNF
790
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]