FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5107, 735 aa
1>>>pF1KB5107 735 - 735 aa - 735 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4571+/-0.000634; mu= 11.0864+/- 0.038
mean_var=563.1413+/-125.370, 0's: 0 Z-trim(114.2): 2224 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.054046
statistics sampled from 21192 (23973) to 21192 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 12.450
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002944 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kina ( 735) 4900 399.1 3.4e-110
NP_001006666 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 k ( 744) 4679 381.8 5.3e-105
NP_001317370 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 k ( 719) 4664 380.6 1.2e-104
NP_004577 (OMIM: 300075,300844,303600) ribosomal p ( 740) 3967 326.3 2.7e-88
XP_005274630 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 739) 3948 324.8 7.6e-88
XP_016885203 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
XP_016885205 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
XP_016885202 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
XP_016885206 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
XP_016885204 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
XP_011543865 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87
NP_001006933 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 741) 3903 321.3 8.6e-87
XP_016885207 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3890 320.3 1.7e-86
XP_006724570 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3887 320.1 2e-86
XP_016885208 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3887 320.1 2e-86
XP_011543860 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86
XP_011543862 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86
XP_011543859 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86
XP_011543861 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86
XP_011543863 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86
XP_011543858 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 745) 3872 318.9 4.6e-86
XP_011543857 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 746) 3872 318.9 4.6e-86
XP_005274634 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 710) 3871 318.8 4.8e-86
XP_011543864 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 717) 3868 318.6 5.6e-86
NP_066958 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 kina ( 733) 3860 318.0 8.8e-86
NP_001305865 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 758) 3857 317.8 1e-85
XP_006715612 (OMIM: 601685) PREDICTED: ribosomal p ( 761) 3857 317.8 1e-85
XP_011529219 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 745) 3603 298.0 9.5e-80
NP_001317441 (OMIM: 300303) ribosomal protein S6 k ( 745) 3603 298.0 9.5e-80
NP_055311 (OMIM: 300303) ribosomal protein S6 kina ( 745) 3603 298.0 9.5e-80
XP_016884913 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80
XP_016884914 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80
XP_016884912 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80
NP_001305867 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 644) 3576 295.7 3.9e-79
NP_001305866 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 635) 3466 287.1 1.5e-76
XP_011529221 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 642) 3300 274.2 1.2e-72
XP_011529222 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 624) 3197 266.1 3e-70
XP_016884915 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 506) 2482 210.2 1.7e-53
NP_001258972 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 451) 1257 114.6 9e-25
NP_001258989 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 502) 1257 114.7 9.4e-25
NP_003152 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 kina ( 525) 1257 114.7 9.6e-25
NP_001258973 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 472) 1255 114.5 1e-24
NP_003943 (OMIM: 608939) ribosomal protein S6 kina ( 482) 1235 112.9 3e-24
XP_011523403 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 489) 1153 106.6 2.6e-22
XP_016880418 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 436) 1151 106.3 2.7e-22
XP_011523404 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 391) 1150 106.1 2.8e-22
NP_872198 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 kina ( 549) 1145 106.0 4.1e-22
NP_001309158 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 k ( 795) 1145 106.4 4.8e-22
NP_004746 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 kina ( 802) 1145 106.4 4.8e-22
NP_001287731 (OMIM: 603606) ribosomal protein S6 k ( 765) 1093 102.3 7.9e-21
>>NP_002944 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kinase a (735 aa)
initn: 4900 init1: 4900 opt: 4900 Z-score: 2099.3 bits: 399.1 E(85289): 3.4e-110
Smith-Waterman score: 4900; 100.0% identity (100.0% similar) in 735 aa overlap (1-735:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MPLAQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 HQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIESS
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 ILAQRRVRKLPSTTL
:::::::::::::::
NP_002 ILAQRRVRKLPSTTL
730
>>NP_001006666 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kinas (744 aa)
initn: 4662 init1: 4662 opt: 4679 Z-score: 2006.2 bits: 381.8 E(85289): 5.3e-105
Smith-Waterman score: 4679; 96.9% identity (97.8% similar) in 732 aa overlap (10-735:13-744)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMELVPLD--PENGQTS----GEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVK
: :. .: :. .::: : .: : ..:::::::::::::::
NP_001 MEQDPKPPRLRLWALIPWLPRKQRPRISQTSLPVPGPGSGPQRDSDEGVLKEISITHHVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 AGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LVFSDGYVVKETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVFSDGYVVKETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPN
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480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 VHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGY
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 DEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 VSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPT
670 680 690 700 710 720
720 730
pF1KB5 PQLKPIESSILAQRRVRKLPSTTL
::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQLKPIESSILAQRRVRKLPSTTL
730 740
>>NP_001317370 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kinas (719 aa)
initn: 4664 init1: 4664 opt: 4664 Z-score: 1999.9 bits: 380.6 E(85289): 1.2e-104
Smith-Waterman score: 4664; 99.9% identity (99.9% similar) in 702 aa overlap (34-735:18-719)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 AQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFE
: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQTPADFPRVERDLVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPAN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKET
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIESSILA
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730
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::::::::::::
NP_001 QRRVRKLPSTTL
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:::..:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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::::::::::.::.:::::.:::::::::::::::::::: :: :: :::::::.:::::
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:::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::: ::.:::... :.::: ::..:: .:::::::::::::: .. .:
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720 730
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:.:. : ::::: ..:. ::.:
NP_004 VLEPVGRSTLAQRRGIKKITSTAL
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pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMEL-VPLDP-ENGQT-----SGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAG
:::::: .:: : . : : :::: ::: ..:. .: .:::.:::::: :
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pF1KB5 DILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELAL
:::..:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DILVEVNHPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELAL
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pF1KB5 GLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEV
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
XP_005 ALDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKESIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEV
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pF1KB5 VNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLL
:::.::..::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: ::::::
XP_005 VNRRGHTQSADWWSFGVLMFEMLTGTLPFQGKDRKETMTMILKAKLGMPQFLSPEAQSLL
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pF1KB5 RALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDT
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XP_005 RMLFKRNPANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDP
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pF1KB5 EFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLV
:::..::::::::::::.:::::::::::: . :: . . .::.:: :: ...
XP_005 EFTAKTPKDSPGIPPSANAHQLFRGFSFVA--ITSDDESQAMQTVGVHSIVQ-LHRNSIQ
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:.::: ::: ::::::: ::::.:::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::
XP_005 FTDGYEVKEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNII
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::::::::::.::.:::::.:::::::::::::::::::: :: :: :::::::.:::::
XP_005 TLKDVYDDGKYVYVVTELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVH
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:::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RDLKPSNILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDA
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XP_005 ACDIWSLGVLLYTMLTGYTPFANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVS
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::::::::::::: ::.:::... :.::: ::..:: .:::::::::::::: .. .:
XP_005 KMLHVDPHQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ-SP
660 670 680 690 700 710
720 730
pF1KB5 QLKPIESSILAQRR-VRKLPSTTL
:.:. : ::::: ..:. ::.:
XP_005 VLEPVGRSTLAQRRGIKKITSTAL
720 730
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pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPS
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.::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: ::::::: :::::
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pF1KB5 PANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTP
::::::.::::.:::::: :.:::::::::::::.::::::...:.:::::: :::..::
XP_016 PANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDPEFTAKTP
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pF1KB5 KDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVV
::::::::::.:::::::::::: . :: . . .::.::::: ... :.::: :
XP_016 KDSPGIPPSANAHQLFRGFSFVA--ITSDDESQAMQTVGVHSIVQQLHRNSIQFTDGYEV
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:: ::::::: ::::.:::::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_016 KEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
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pF1KB5 DGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSN
:::.::.:::::.:::::::::::::::::::: :: :: :::::::.::::::::::::
XP_016 DGKYVYVVTELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSN
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pF1KB5 ILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSL
::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::
XP_016 ILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDAACDIWSL
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pF1KB5 GILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDP
:.::::::.:::::::::.:::::::.:::::::.:::: ::.::.::::::::::::::
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pF1KB5 HQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDL-QLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIES
:::::: ::.:::... :.::: ::..:: .:::::::::::::: .. .: :.:.
XP_016 HQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ-SPVLEPVGR
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pF1KB5 SILAQRR-VRKLPSTTL
: ::::: ..:. ::.:
XP_016 STLAQRRGIKKITSTAL
700 710
>>XP_016885205 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTED: r (712 aa)
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Smith-Waterman score: 3906; 82.1% identity (93.0% similar) in 711 aa overlap (27-735:6-712)
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pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPS
::: ..:. .: .:::.:::::: : ::::::
XP_016 MDEPMGEEE-INPQTEEVSIKEIAITHHVKEGHEKADPS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVN
.::::::::::::::::::.:.. :. .:::::::::::::::::::::::::::..::
XP_016 QFELLKVLGQGSFGKVFLVKKISGSDARQLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILVEVN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 HPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHS
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 HPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALALDHLHS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::.
XP_016 LGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKESIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRRGHT
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pF1KB5 HSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRN
.::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: ::::::: :::::
XP_016 QSADWWSFGVLMFEMLTGTLPFQGKDRKETMTMILKAKLGMPQFLSPEAQSLLRMLFKRN
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 PANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTP
::::::.::::.:::::: :.:::::::::::::.::::::...:.:::::: :::..::
XP_016 PANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDPEFTAKTP
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 KDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVV
::::::::::.:::::::::::: . :: . . .::.::::: ... :.::: :
XP_016 KDSPGIPPSANAHQLFRGFSFVA--ITSDDESQAMQTVGVHSIVQQLHRNSIQFTDGYEV
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
:: ::::::: ::::.:::::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_016 KEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 DGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSN
:::.::.:::::.:::::::::::::::::::: :: :: :::::::.::::::::::::
XP_016 DGKYVYVVTELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSN
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 ILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSL
::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::
XP_016 ILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDAACDIWSL
520 530 540 550 560 570
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XP_016 HQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ-SPVLEPVGR
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720 730
pF1KB5 SILAQRR-VRKLPSTTL
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XP_016 STLAQRRGIKKITSTAL
700 710
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pF1KB5 SILAQRR-VRKLPSTTL
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XP_016 STLAQRRGIKKITSTAL
700 710
>>XP_016885204 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTED: r (712 aa)
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XP_016 MDEPMGEEE-INPQTEEVSIKEIAITHHVKEGHEKADPS
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pF1KB5 HFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVN
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XP_016 QFELLKVLGQGSFGKVFLVKKISGSDARQLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILVEVN
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pF1KB5 HPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHS
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XP_016 HPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALALDHLHS
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pF1KB5 PANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTP
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XP_016 PANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDPEFTAKTP
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pF1KB5 KDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVV
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pF1KB5 DGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSN
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pF1KB5 ILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSL
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pF1KB5 GILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDP
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XP_016 GVLLYTMLTGYTPFANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVSKMLHVDP
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710
pF1KB5 HQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDL-QLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIES
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XP_016 HQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ-SPVLEPVGR
640 650 660 670 680 690
720 730
pF1KB5 SILAQRR-VRKLPSTTL
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700 710
735 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:17:35 2016 done: Thu Nov 3 22:17:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]