Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5103
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5103, 700 aa
1>>>pF1KB5103 700 - 700 aa - 700 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7907+/-0.00106; mu= 18.1403+/- 0.063
mean_var=127.6791+/-23.743, 0's: 0 Z-trim(107.5): 115 B-trim: 13 in 2/48
Lambda= 0.113505
statistics sampled from 9512 (9635) to 9512 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3762.1 HHIP gene_id:64399|Hs108|chr4 ( 700) 4896 814.0 0
CCDS1530.2 HHIPL2 gene_id:79802|Hs108|chr1 ( 724) 734 132.5 2.1e-30
CCDS9953.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 ( 608) 656 119.7 1.3e-26
CCDS45162.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 ( 782) 656 119.8 1.6e-26
>>CCDS3762.1 HHIP gene_id:64399|Hs108|chr4 (700 aa)
initn: 4896 init1: 4896 opt: 4896 Z-score: 4342.8 bits: 814.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4896; 100.0% identity (100.0% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLKMLSFKLLLLAVALGFFEGDAKFGERNEGSGARRRRCLNGNPPKRLKRRDRRMMSQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MLKMLSFKLLLLAVALGFFEGDAKFGERNEGSGARRRRCLNGNPPKRLKRRDRRMMSQLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLSGGEMLCGGFYPRLSCCLRSDSPGLGRLENKIFSVTNNTECGKLLEEIKCALCSPHSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LLSGGEMLCGGFYPRLSCCLRSDSPGLGRLENKIFSVTNNTECGKLLEEIKCALCSPHSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SLFHSPEREVLERDLVLPLLCKDYCKEFFYTCRGHIPGFLQTTADEFCFYYARKDGGLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLFHSPEREVLERDLVLPLLCKDYCKEFFYTCRGHIPGFLQTTADEFCFYYARKDGGLCF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PDFPRKQVRGPASNYLDQMEEYDKVEEISRKHKHNCFCIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PDFPRKQVRGPASNYLDQMEEYDKVEEISRKHKHNCFCIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RLFILEKEGYVKILTPEGEIFKEPYLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RLFILEKEGYVKILTPEGEIFKEPYLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VSYTTNQERWAIGPHDHILRVVEYTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VSYTTNQERWAIGPHDHILRVVEYTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PDGFLYIILGDGMITLDDMEEMDGLSDFTGSVLRLDVDTDMCNVPYSIPRSNPHFNSTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PDGFLYIILGDGMITLDDMEEMDGLSDFTGSVLRLDVDTDMCNVPYSIPRSNPHFNSTNQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PPEVFAHGLHDPGRCAVDRHPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYESEPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PPEVFAHGLHDPGRCAVDRHPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYESEPSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LEFKPFSNGPLVGGFVYRGCQSERLYGSYVFGDRNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLCLGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LEFKPFSNGPLVGGFVYRGCQSERLYGSYVFGDRNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLCLGTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GSCRGYFSGHILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMPEECRATVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GSCRGYFSGHILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMPEECRATVQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 AQTLTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVCVRPNKCLCKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AQTLTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVCVRPNKCLCKKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB5 YLGPQCEQVDRNIRRVTRAGILDQIIDMTSYLLDLTSYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YLGPQCEQVDRNIRRVTRAGILDQIIDMTSYLLDLTSYIV
670 680 690 700
>>CCDS1530.2 HHIPL2 gene_id:79802|Hs108|chr1 (724 aa)
initn: 1029 init1: 281 opt: 734 Z-score: 659.3 bits: 132.5 E(32554): 2.1e-30
Smith-Waterman score: 1007; 32.6% identity (60.5% similar) in 582 aa overlap (68-603:60-618)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RCLNGNPPKRLKRRDRRMMSQLELLSGGEMLCGGFYPRLSCC-LRSDSPGLGRLEN--KI
.:. : ..:: ..: .: . .
CCDS15 IFLLGQVGLLQGHPQCLDYGPPFQPPLHLEFCSD-YESFGCCDQHKDRRIAARYWDIMEY
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 FSVTNNTECGKLLEEIKCALCSPHSQSLFHSPEREVLERDLVLPLLCKDYCKEFFYTCRG
:.. . :: ...: : :::.. :. . . .. :. :: ::.:::. : .:..
CCDS15 FDLKRHELCGDYIKDILCQECSPYAAHLYDAENTQTPLRN--LPGLCSDYCSAFHSNCHS
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200
pF1KB5 HIPGF-----LQTT----ADEFCFYYARKDGGLCFPDFPRKQVRGPASNYLDQMEEYDKV
: . :: . . .:: : :::. : ..::..
CCDS15 AISLLTNDRGLQESHGRDGTRFCHLLDLPDKDYCFPNVLR-------NDYLNRHLG----
150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 EEISRKHKHNCF--CIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQRLFILEKEGYVKILTPEGEIFKE
. . ..:. :..::..:::.::. .:.:::..:.:. :. : : . :.: ...
CCDS15 --MVAQDPQGCLQLCLSEVANGLRNPVSMVHAGDGTHRFFVAEQVGVVWVYLPDGSRLEQ
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PYLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLYVSYTTNQERWAIGPHDHILRVVE
:.::....: . :::::.:.:::::....: :.:. :. ... . . .:. :
CCDS15 PFLDLKNIVLTTPWIGDERGFLGLAFHPKFRHNRKFYIYYSCLDKKKV-----EKIRISE
260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 YTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFGPDGFLYIILGDGMITLDDME---
. ::: .:...::.. ::.::. : .: ::::::: ::..::. ::: . : .
CCDS15 MKVSRADPNKADLKSERVILEIEEPASNHNGGQLLFGLDGYMYIFTGDGGQAGDPFGLFG
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430
pF1KB5 EMDGLSDFTGSVLRLDVDTDMCNVP-YSIPRSNPHFNSTNQPPEVFAHGLHDPGRCAVDR
. .. :.. :.:::.::. . : .: .:: . . : ..:.:... ::::::
CCDS15 NAQNKSSLLGKVLRIDVNRAGSHGKRYRVPSDNPFVSEPGAHPAIYAYGIRNMWRCAVDR
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480
pF1KB5 -HPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYE---------------SEPSLLEF
: . :.:.: :.:: .. :.:: .: . :: .
CCDS15 GDPITRQGRGRIFCGDV-GQNRFE-EVDLILKGGNYGWRAKEGFACYDKKLCHNASLDDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 KP-FSNGPLVG-----GFVYRGCQSERLYGSYVFGD-RNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLC
: .. : :: :.:::::.: : : :.::: .: ...::.. .:.:... ::
CCDS15 LPIYAYGHAVGKSVTGGYVYRGCESPNLNGLYIFGDFMSGRLMALQEDRKNKKWKKQDLC
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LGTSGSCR--GYFSGH---ILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMP
::.. :: : .: : :..:.::: ::.:.:..: . . :..::.:::.: :
CCDS15 LGSTTSCAFPGLISTHSKFIISFAEDEAGELYFLATSYPSAYAPRGSIYKFVDPSRRAPP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 EECRATVQPAQTLTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVCVR
.:. :..:
CCDS15 GKCKYKPVPVRTKSKRIPFRPLAKTVLDLLKEQSEKAARKSSSATLASGPAQGLSEKGSS
610 620 630 640 650 660
>>CCDS9953.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 (608 aa)
initn: 860 init1: 268 opt: 656 Z-score: 591.1 bits: 119.7 E(32554): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 920; 31.2% identity (58.4% similar) in 592 aa overlap (68-611:38-597)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RCLNGNPPKRLKRRDRRMMSQLELLSGGEMLCGGFYPRLSCCLRSDSPGLGRLENKIFSV
::. : ..:: .. . : : . :
CCDS99 ALLALWVLGAAAHPQCLDFRPPFRPTQPLRLCAQ-YSDFGCCDEGRDAELTRRFWALASR
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TNNTE---CGKLLEEIKCALCSPHSQSLFHSPEREVLERDLVLPLLCKDYCKEFFYTCRG
.. .: :. ... : :::.. :. . . . : ..: ::.::: .... :::
CCDS99 VDAAEWAACAGYARDLLCQECSPYAAHLYDAEDPFTPLR--TVPGLCQDYCLDMWHKCRG
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200
pF1KB5 ---HIPGFLQTTADE-----FCFYYARKDGGLCFPDFPRKQVRGPASNYLDQMEEYDKVE
:. . : : :: : . : ::: . : .. : .. :
CCDS99 LFRHLSTDQELWALEGNLARFCRYLSLDDTDYCFPYL---LVNKNLNSNLGHVVADAK--
130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 EISRKHKHNCF--CIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQRLFILEKEGYVKILTPEGEIFKEP
.:. :..::..:::.::. .:. ::..:.:. :. : : :. . .:
CCDS99 --------GCLQLCLEEVANGLRNPVAMVHARDGTHRFFVAEQVGLVWAYLPDRSRLGKP
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 YLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLYVSYTTN--QERWAIGPHDHILRVV
.:.: ..: .. :::::.:..::::....: .::: :... . .: .:.
CCDS99 FLNISRVVLTSPWEGDERGFLGIAFHPSFQHNRRLYVYYSVGIRSSEW--------IRIS
240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 EYTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFGPDGFLYIILGDGMITLDDMEEM
:. ::. . . :: . :..::: : .: ::::::: ::.:::. ::: .. : . .
CCDS99 EFRVSEDDENAVDHSSERIILEVKEPASNHNGGQLLFGDDGYLYIFTGDGGMAGDPFGTF
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430
pF1KB5 DGL---SDFTGSVLRLDVDTDMCNVPYSIPRSNPHFNSTNQPPEVFAHGLHDPGRCAVDR
. : . :.:::.::: ..::.:: .:: .. :::.: :... ::. ::
CCDS99 GNAQNKSALLGKVLRIDVDRKERGLPYGIPPDNPFVGDPAAQPEVYALGVRNMWRCSFDR
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480
pF1KB5 -HPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYE---------------SEPSLLEF
:.. . ..:.: :.:. .. . .: .: .. :: ..
CCDS99 GDPSSGTGRGRLFCGDV-GQNKFE-EVDVVERGGNYGWRAREGFECYDRSLCANTSLNDL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB5 KPFSNGP------LVGGFVYRGCQSERLYGSYVFGD-RNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLC
:. : ..::.:::::. : : :.::: .: ...::..: : ::: . .:
CCDS99 LPIFAYPHTVGKSVTGGYVYRGCEYPNLNGLYIFGDFMSGRLMSLQENPGTGQWQYSEIC
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LGTSGSCR--GYFSGH---ILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMP
.: . .:. : .... :..::::: ::.:..:... . . : .:::.: .
CCDS99 MGHGQTCEFPGLINNYYPYIISFGEDEAGELYFMSTGEPSATAPRGVVYKIIDASS----
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KB5 EECRA-TVQPAQT-LTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVC
:.: ...:. . : :: :
CCDS99 --CKARSAMPGYVPAPSVCSSLTSQPFILQWWK
580 590 600
>>CCDS45162.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 (782 aa)
initn: 867 init1: 268 opt: 656 Z-score: 589.9 bits: 119.8 E(32554): 1.6e-26
Smith-Waterman score: 954; 31.8% identity (59.0% similar) in 581 aa overlap (68-602:38-590)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RCLNGNPPKRLKRRDRRMMSQLELLSGGEMLCGGFYPRLSCCLRSDSPGLGRLENKIFSV
::. : ..:: .. . : : . :
CCDS45 ALLALWVLGAAAHPQCLDFRPPFRPTQPLRLCAQ-YSDFGCCDEGRDAELTRRFWALASR
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TNNTE---CGKLLEEIKCALCSPHSQSLFHSPEREVLERDLVLPLLCKDYCKEFFYTCRG
.. .: :. ... : :::.. :. . . . : ..: ::.::: .... :::
CCDS45 VDAAEWAACAGYARDLLCQECSPYAAHLYDAEDPFTPLR--TVPGLCQDYCLDMWHKCRG
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200
pF1KB5 ---HIPGFLQTTADE-----FCFYYARKDGGLCFPDFPRKQVRGPASNYLDQMEEYDKVE
:. . : : :: : . : ::: . : .. : .. :
CCDS45 LFRHLSTDQELWALEGNLARFCRYLSLDDTDYCFPYL---LVNKNLNSNLGHVVADAK--
130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 EISRKHKHNCF--CIQEVVSGLRQPVGALHSGDGSQRLFILEKEGYVKILTPEGEIFKEP
.:. :..::..:::.::. .:. ::..:.:. :. : : :. . .:
CCDS45 --------GCLQLCLEEVANGLRNPVAMVHARDGTHRFFVAEQVGLVWAYLPDRSRLGKP
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 YLDIHKLVQSGIKGGDERGLLSLAFHPNYKKNGKLYVSYTTN--QERWAIGPHDHILRVV
.:.: ..: .. :::::.:..::::....: .::: :... . .: .:.
CCDS45 FLNISRVVLTSPWEGDERGFLGIAFHPSFQHNRRLYVYYSVGIRSSEW--------IRIS
240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 EYTVSRKNPHQVDLRTARVFLEVAELHRKHLGGQLLFGPDGFLYIILGDGMITLDDMEEM
:. ::. . . :: . :..::: : .: ::::::: ::.:::. ::: .. : . .
CCDS45 EFRVSEDDENAVDHSSERIILEVKEPASNHNGGQLLFGDDGYLYIFTGDGGMAGDPFGTF
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430
pF1KB5 DGL---SDFTGSVLRLDVDTDMCNVPYSIPRSNPHFNSTNQPPEVFAHGLHDPGRCAVDR
. : . :.:::.::: ..::.:: .:: .. :::.: :... ::. ::
CCDS45 GNAQNKSALLGKVLRIDVDRKERGLPYGIPPDNPFVGDPAAQPEVYALGVRNMWRCSFDR
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480
pF1KB5 -HPTDININLTILCSDSNGKNRSSARILQIIKGKDYE---------------SEPSLLEF
:.. . ..:.: :.:. .. . .: .: .. :: ..
CCDS45 GDPSSGTGRGRLFCGDV-GQNKFE-EVDVVERGGNYGWRAREGFECYDRSLCANTSLNDL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB5 KPFSNGP------LVGGFVYRGCQSERLYGSYVFGD-RNGNFLTLQQSPVTKQWQEKPLC
:. : ..::.:::::. : : :.::: .: ...::..: : ::: . .:
CCDS45 LPIFAYPHTVGKSVTGGYVYRGCEYPNLNGLYIFGDFMSGRLMSLQENPGTGQWQYSEIC
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LGTSGSCR--GYFSGH---ILGFGEDELGEVYILSSSKSMTQTHNGKLYKIVDPKRPLMP
.: . .:. : .... :..::::: ::.:..:... . . : .:::.: .: :
CCDS45 MGHGQTCEFPGLINNYYPYIISFGEDEAGELYFMSTGEPSATAPRGVVYKIIDASRRAPP
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 EECRATVQPAQTLTSECSRLCRNGYCTPTGKCCCSPGWEGDFCRTAKCEPACRHGGVCVR
.:. .::::
CCDS45 GKCQ--IQPAQVKIRSRLIPFVPKEKFIPKTRSTPRPTARAPTRAPRRGRPTAAPPAPTP
590 600 610 620 630
700 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:16:57 2016 done: Thu Nov 3 22:16:57 2016
Total Scan time: 3.410 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]