Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5091, 604 aa
1>>>pF1KB5091 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7688+/-0.00101; mu= 16.6660+/- 0.060
mean_var=84.2504+/-16.372, 0's: 0 Z-trim(105.6): 71 B-trim: 25 in 2/48
Lambda= 0.139730
statistics sampled from 8442 (8509) to 8442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1371.1 PTGS2 gene_id:5743|Hs108|chr1 ( 604) 4137 844.4 0
CCDS6842.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 ( 599) 2660 546.7 3.2e-155
CCDS59521.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 ( 490) 2341 482.3 6.3e-136
CCDS75895.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 ( 551) 2079 429.5 5.5e-120
CCDS59520.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 ( 537) 1819 377.1 3.2e-104
CCDS6843.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 ( 562) 1819 377.1 3.3e-104
>>CCDS1371.1 PTGS2 gene_id:5743|Hs108|chr1 (604 aa)
initn: 4137 init1: 4137 opt: 4137 Z-score: 4509.2 bits: 844.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4137; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLARALLLCAVLALSHTANPCCSHPCQNRGVCMSVGFDQYKCDCTRTGFYGENCSTPEFL
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CCDS13 MLARALLLCAVLALSHTANPCCSHPCQNRGVCMSVGFDQYKCDCTRTGFYGENCSTPEFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TRIKLFLKPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSHLIDSPPTYNADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TRIKLFLKPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSHLIDSPPTYNADY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLLLRRKFIPDPQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLLLRRKFIPDPQGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQRKLRLFKDGKMKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQRKLRLFKDGKMKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 QIIDGEMYPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYATIWLREHNRVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QIIDGEMYPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYATIWLREHNRVCD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLKQEHPEWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFDPELLFNKQFQYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLKQEHPEWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFDPELLFNKQFQYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQFVESFTRQIAGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQFVESFTRQIAGRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AGGRNVPPAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELTGEKEMSAELEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGGRNVPPAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELTGEKEMSAELEAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YGDIDAVELYPALLVEKPRPDAIFGETMVEVGAPFSLKGLMGNVICSPAYWKPSTFGGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YGDIDAVELYPALLVEKPRPDAIFGETMVEVGAPFSLKGLMGNVICSPAYWKPSTFGGEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GFQIINTASIQSLICNNVKGCPFTSFSVPDPELIKTVTINASSSRSGLDDINPTVLLKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GFQIINTASIQSLICNNVKGCPFTSFSVPDPELIKTVTINASSSRSGLDDINPTVLLKER
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 STEL
::::
CCDS13 STEL
>>CCDS6842.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 (599 aa)
initn: 2362 init1: 2362 opt: 2660 Z-score: 2900.1 bits: 546.7 E(32554): 3.2e-155
Smith-Waterman score: 2660; 64.7% identity (87.5% similar) in 552 aa overlap (19-570:33-583)
10 20 30 40
pF1KB5 MLARALLLCAVLALSHTANPCCSHPCQNRGVCMSVGFDQYKCDCTRTG
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CCDS68 RSLLLWFLLFLLLLPPLPVLLADPGAPTPVNPCCYYPCQHQGICVRFGLDRYQCDCTRTG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FYGENCSTPEFLTRIKLFLKPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSH
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CCDS68 YSGPNCTIPGLWTWLRNSLRPSPSFTHFLLTHGRWFWEFVNAT-FIREMLMRLVLTVRSN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LIDSPPTYNADYGYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLL
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CCDS68 LIPSPPTYNSAHDYISWESFSNVSYYTRILPSVPKDCPTPMGTKGKKQLPDAQLLARRFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LRRKFIPDPQGSNMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQR
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CCDS68 LRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 KLRLFKDGKMKYQIIDGEMYPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYA
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CCDS68 QLRLFKDGKLKYQVLDGEMYPPSVEEAPVLMHYPRGIPPQSQMAVGQEVFGLLPGLMLYA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TIWLREHNRVCDVLKQEHPEWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFD
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CCDS68 TLWLREHNRVCDLLKAEHPTWGDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PELLFNKQFQYQNRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQF
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CCDS68 PELLFGVQFQYRNRIAMEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLVDYGVEAL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VESFTRQIAGRVAGGRNVPPAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELT
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CCDS68 VDAFSRQIAGRIGGGRNMDHHILHVAVDVIRESREMRLQPFNEYRKRFGMKPYTSFQELV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 GEKEMSAELEALYGDIDAVELYPALLVEKPRPDAIFGETMVEVGAPFSLKGLMGNVICSP
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CCDS68 GEKEMAAELEELYGDIDALEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNPICSP
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AYWKPSTFGGEVGFQIINTASIQSLICNNVKGCPFTSFSVPDPELIKTVTINASSSRSGL
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CCDS68 EYWKPSTFGGEVGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDASQDDGPAVERPSTEL
550 560 570 580 590
590 600
pF1KB5 DDINPTVLLKERSTEL
>>CCDS59521.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 (490 aa)
initn: 2341 init1: 2341 opt: 2341 Z-score: 2553.8 bits: 482.3 E(32554): 6.3e-136
Smith-Waterman score: 2341; 67.7% identity (89.4% similar) in 473 aa overlap (98-570:2-474)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSHLIDSPPTYNADYGYKSWEA
.: ::: ::.:: ::::::. . : :::.
CCDS59 MLMRLVLTVRSNLIPSPPTYNSAHDYISWES
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLLLRRKFIPDPQGSNMMFAFF
:::.::::: :: :: :::::.:.::::::::.. .....::::::::::::.:.:::::
CCDS59 FSNVSYYTRILPSVPKDCPTPMGTKGKKQLPDAQLLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFF
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQRKLRLFKDGKMKYQIIDGEM
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CCDS59 AQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGEM
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYATIWLREHNRVCDVLKQEHP
:::.:... . : :: .: . ..:::::::::.::::.:::.::::::::::.:: :::
CCDS59 YPPSVEEAPVLMHYPRGIPPQSQMAVGQEVFGLLPGLMLYATLWLREHNRVCDLLKAEHP
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFDPELLFNKQFQYQNRIAAEF
:::::::::.::::::::::::::.:::.:::: ..:::::::::. ::::.:::: ::
CCDS59 TWGDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYRNRIAMEF
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQFVESFTRQIAGRVAGGRNVP
: :::::::.::.:.. .:.:.:.::..:.:.:...:. .:..:.::::::..::::.
CCDS59 NHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLVDYGVEALVDAFSRQIAGRIGGGRNMD
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELTGEKEMSAELEALYGDIDAV
. .:. : .::.:. : :::::::: .::: ::.::.:::::.:::: :::::::.
CCDS59 HHILHVAVDVIRESREMRLQPFNEYRKRFGMKPYTSFQELVGEKEMAAELEELYGDIDAL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ELYPALLVEKPRPDAIFGETMVEVGAPFSLKGLMGNVICSPAYWKPSTFGGEVGFQIINT
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CCDS59 EFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNPICSPEYWKPSTFGGEVGFNIVKT
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ASIQSLICNNVKGCPFTSFSVPDPELIKTVTINASSSRSGLDDINPTVLLKERSTEL
:....:.: :.: ::..:: :::
CCDS59 ATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDASQDDGPAVERPSTEL
460 470 480 490
>>CCDS75895.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 (551 aa)
initn: 2382 init1: 2079 opt: 2079 Z-score: 2267.6 bits: 429.5 E(32554): 5.5e-120
Smith-Waterman score: 2313; 58.7% identity (80.3% similar) in 552 aa overlap (19-570:33-535)
10 20 30 40
pF1KB5 MLARALLLCAVLALSHTANPCCSHPCQNRGVCMSVGFDQYKCDCTRTG
:::: .:::..:.:. :.:.:.:::::::
CCDS75 RSLLLWFLLFLLLLPPLPVLLADPGAPTPVNPCCYYPCQHQGICVRFGLDRYQCDCTRTG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FYGENCSTPEFLTRIKLFLKPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSH
. : ::. : . : .. :.:.:. .:..::: . ::. :: :.:. .: :::
CCDS75 YSGPNCTIPGLWTWLRNSLRPSPSFTHFLLTHGRWFWEFVNAT-FIREMLMRLVLT----
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LIDSPPTYNADYGYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLL
:::::::.. .....:
CCDS75 --------------------------------------------GKKQLPDAQLLARRFL
120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LRRKFIPDPQGSNMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQR
:::::::::::.:.::::::::::::::::. : ::.::..:::::::.::::..: ::
CCDS75 LRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQY
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 KLRLFKDGKMKYQIIDGEMYPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYA
.::::::::.:::..:::::::.:... . : :: .: . ..:::::::::.::::.::
CCDS75 QLRLFKDGKLKYQVLDGEMYPPSVEEAPVLMHYPRGIPPQSQMAVGQEVFGLLPGLMLYA
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TIWLREHNRVCDVLKQEHPEWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFD
:.::::::::::.:: ::: :::::::::.::::::::::::::.:::.:::: ..::::
CCDS75 TLWLREHNRVCDLLKAEHPTWGDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFD
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PELLFNKQFQYQNRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQF
:::::. ::::.:::: ::: :::::::.::.:.. .:.:.:.::..:.:.:...:. .
CCDS75 PELLFGVQFQYRNRIAMEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLVDYGVEAL
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VESFTRQIAGRVAGGRNVPPAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELT
:..:.::::::..::::. . .:. : .::.:. : :::::::: .::: ::.::.
CCDS75 VDAFSRQIAGRIGGGRNMDHHILHVAVDVIRESREMRLQPFNEYRKRFGMKPYTSFQELV
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 GEKEMSAELEALYGDIDAVELYPALLVEKPRPDAIFGETMVEVGAPFSLKGLMGNVICSP
:::::.:::: :::::::.:.::.::.:: .:..::::.:.:.:::::::::.:: ::::
CCDS75 GEKEMAAELEELYGDIDALEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNPICSP
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AYWKPSTFGGEVGFQIINTASIQSLICNNVKGCPFTSFSVPDPELIKTVTINASSSRSGL
:::::::::::::.:..::....:.: :.: ::..:: :::
CCDS75 EYWKPSTFGGEVGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDASQDDGPAVERPSTEL
500 510 520 530 540 550
590 600
pF1KB5 DDINPTVLLKERSTEL
>>CCDS59520.1 PTGS1 gene_id:5742|Hs108|chr9 (537 aa)
initn: 1796 init1: 1493 opt: 1819 Z-score: 1984.5 bits: 377.1 E(32554): 3.2e-104
Smith-Waterman score: 2435; 61.8% identity (81.3% similar) in 552 aa overlap (19-570:8-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLARALLLCAVLALSHTANPCCSHPCQNRGVCMSVGFDQYKCDCTRTGFYGENCSTPEFL
:::: .:::..:.:. :.:.:.:::::::. : ::. : .
CCDS59 MRKPRLMNPCCYYPCQHQGICVRFGLDRYQCDCTRTGYSGPNCTIPGLW
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TRIKLFLKPTPNTVHYILTHFKGFWNVVNNIPFLRNAIMSYVLTSRSHLIDSPPTYNADY
: .. :.:.:. .:..::: . ::. :: :.:. .: ::: ::.:: ::::::. .
CCDS59 TWLRNSLRPSPSFTHFLLTHGRWFWEFVNAT-FIREMLMRLVLTVRSNLIPSPPTYNSAH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPDDCPTPLGVKGKKQLPDSNEIVEKLLLRRKFIPDPQGS
: :::.:::.::::: :: :: :::::.:.::::::::.. .....::::::::::::.
CCDS59 DYISWESFSNVSYYTRILPSVPKDCPTPMGTKGKKQLPDAQLLARRFLLRRKFIPDPQGT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTNGLGHGVDLNHIYGETLARQRKLRLFKDGKMKY
:.::::::::::::::::. : ::.::..:::::::.::::..: :: .::::::::.::
CCDS59 NLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 QIIDGEMYPPTVKDTQAEMIYPPQVPEHLRFAVGQEVFGLVPGLMMYATIWLREHNRVCD
:..:::::::.:... . : :: .: . ..:::::::::.::::.:::.::::::::::
CCDS59 QVLDGEMYPPSVEEAPVLMHYPRGIPPQSQMAVGQEVFGLLPGLMLYATLWLREHNRVCD
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLKQEHPEWGDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYHFKLKFDPELLFNKQFQYQ
.:: ::: :::::::::.::::::::::::::.:::.:::: ..:::::::::. ::::.
CCDS59 LLKAEHPTWGDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYR
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIHDQKYNYQQFIYNNSILLEHGITQFVESFTRQIAGRV
:::: ::: :::::::.::.:.:
CCDS59 NRIAMEFNHLYHWHPLMPDSFKI-------------------------------------
350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AGGRNVPPAVQKVSQASIDQSRQMKYQSFNEYRKRFMLKPYESFEELTGEKEMSAELEAL
.::::. . .:. : .::.:. : :::::::: .::: ::.::.:::::.:::: :
CCDS59 GGGRNMDHHILHVAVDVIRESREMRLQPFNEYRKRFGMKPYTSFQELVGEKEMAAELEEL
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