Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5078
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5078, 857 aa
1>>>pF1KB5078 857 - 857 aa - 857 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8734+/-0.00105; mu= 17.2810+/- 0.062
mean_var=64.3421+/-12.698, 0's: 0 Z-trim(103.6): 20 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.159892
statistics sampled from 7485 (7498) to 7485 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 857) 5836 1355.5 0
CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 782) 5320 1236.5 0
CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 ( 859) 4926 1145.6 0
CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 860) 4508 1049.2 0
CCDS55279.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 ( 825) 4058 945.4 0
CCDS400.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 626) 3903 909.6 0
CCDS397.1 AGO4 gene_id:192670|Hs108|chr1 ( 861) 3664 854.5 0
CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 ( 861) 433 109.2 3.3e-23
CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 ( 973) 419 106.0 3.4e-22
CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22 ( 882) 397 100.9 1.1e-20
CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11 ( 852) 374 95.6 4e-19
CCDS83261.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 ( 937) 351 90.3 1.7e-17
>>CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 (857 aa)
initn: 5836 init1: 5836 opt: 5836 Z-score: 7266.0 bits: 1355.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5836; 100.0% identity (100.0% similar) in 857 aa overlap (1-857:1-857)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPILQYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPILQYGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKDAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 MPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 ATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 AGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 AGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADKNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADKNE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 RIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQIL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 TYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQAL
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB5 AKAVQVHQDTLRTMYFA
:::::::::::::::::
CCDS39 AKAVQVHQDTLRTMYFA
850
>>CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 (782 aa)
initn: 5320 init1: 5320 opt: 5320 Z-score: 6623.4 bits: 1236.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5320; 100.0% identity (100.0% similar) in 782 aa overlap (76-857:1-782)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 DIPKIDVYHYEVDIKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALP
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 IGNERVDFEVTIPGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IGNERVDFEVTIPGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 HLASMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HLASMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 QPVIEFMCEVLDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QPVIEFMCEVLDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRR
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PASHQTFPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PASHQTFPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 AGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VTGRVLPAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VTGRVLPAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 KNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTP
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 VYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVF
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 QQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVR
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVV
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 QKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYV
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 LWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEG
700 710 720 730 740 750
830 840 850
pF1KB5 SHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
760 770 780
>>CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 (859 aa)
initn: 4904 init1: 4904 opt: 4926 Z-score: 6131.5 bits: 1145.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4926; 83.0% identity (93.9% similar) in 857 aa overlap (3-857:5-859)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEAGPSGAAAGAYLPPLQ-QVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEV
:::. : : ::.: .:. : :: .:: :. ::: ::.::.::::::.::::.
CCDS63 MYSGAGPA-LAPPAPPPPIQGYAFKPPPRPDFGTSGRTIKLQANFFEMDIPKIDIYHYEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 DIKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTI
::::.:::::::::.::.:::::: :::::::::.::.::.::. :::: ..:..:::.
CCDS63 DIKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIP-VPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVG
:::::::::::::::.. :: . ::.:: ::..: ::.:..:::::.:::: ::::::::
CCDS63 PGEGKDRIFKVSIKWVSCVSLQALHDAL-SGRLPSVPFETIQALDVVMRHLPSMRYTPVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVL
::::. :: .::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS63 RSFFTASEGCSNPLGGGREVWFGFHQSVRPSLWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQL
:...:.:: :::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DFKSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTD
:::::::::::::::....: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ESGQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPIL
:::::::.::::::::::::::.::..::.: :::..:::: :::.::.:::::: : .
CCDS63 NQTSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASFNTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 QYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKIS
:::::.::::: :::::::.:::..:::::::::::::::.:: : ::.::.::::::
CCDS63 LYGGRNKAIATPVQGVWDMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKIS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDT
.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..:::::::::::::::::::
CCDS63 RDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADV
.:::::::::.::: .:.:::::::::::::::::.::::.:. : :::::::::::::
CCDS63 VLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 THPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTR
:::::::::::::.::::::::::.:::::::::. :::::.::. ::::::::::::::
CCDS63 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 FKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCA
::::::::::::: :::. :.::.::::::.::::::::::::::.:::::::::::::.
CCDS63 FKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADE
:::::.::::::::::::::.:::: :::::::::::::::::::::.::::::::..::
CCDS63 DKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 LQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRD
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::: ::::::::
CCDS63 LQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRD
780 790 800 810 820 830
840 850
pF1KB5 PQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
::::::::::::::::::::
CCDS63 HQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
840 850
>>CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 (860 aa)
initn: 4900 init1: 4386 opt: 4508 Z-score: 5610.4 bits: 1049.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5009; 84.1% identity (94.6% similar) in 866 aa overlap (1-857:1-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIK
:: : .: : :: : ....::::: ::.::::::::: :.:.::::::: ::::::
CCDS39 MEIGSAGPA-GA-----QPLLMVPRRPGYGTMGKPIKLLANCFQVEIPKIDVYLYEVDIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGE
:::::::::::::. :::::: :::::.::::::...::.. ::... ::..::.:::
CCDS39 PDKCPRRVNREVVDSMVQHFKVTIFGDRRPVYDGKRSLYTANPLPVATTGVDLDVTLPGE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 G-KDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLE--------SVQALDVAMRHLASMR
: ::: ::::::... :::..:::.:.. .: ::: :.:.::..::: ::.
CCDS39 GGKDRPFKVSIKFVSRVSWHLLHEVLTGRTLPEPLELDKPISTNPVHAVDVVLRHLPSMK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEF
:::::::::: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS39 YTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 MCEVLDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQT
:::::::.::::::.:::::.::.:::::::::::::::: :.:::::::::::::::::
CCDS39 MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCI
::::::.::::: ::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVL
:::::::::::::::::::::::::::::...:.:. ::..::: .::.:.:..::::::
CCDS39 KKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQ
:::.::::::::..:::..::::::::::..:.:::.::::::: :.:::::.::.::::
CCDS39 PAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIF
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::
CCDS39 RVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 LGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQF
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::. :::::::::
CCDS39 LGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQF
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 YKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHT
:::::::::::::::::: :::. :.:.:::::::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS39 YKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 RLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNR
::::::..::.:.::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::.::::::
CCDS39 RLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNC
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780 790 800 810 820 830
pF1KB5 FTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQ
:::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::
CCDS39 FTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQ
780 790 800 810 820 830
840 850
pF1KB5 SNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
::::::::::::::.:::::::::::
CCDS39 SNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
840 850 860
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:::. : : ::.: .:. : :: .:: :. ::: ::.::.::::::.::::.
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10 20 30 40 50
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pF1KB5 DIKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTI
::::.:::::::::.::.:::::: :::::::::.::.::.::. :::: ..:..:::.
CCDS55 DIKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 PGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIP-VPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVG
:::::::::::::::.. :: . ::.:: ::..: ::.:..:::::.:::: ::::::::
CCDS55 PGEGKDRIFKVSIKWVSCVSLQALHDAL-SGRLPSVPFETIQALDVVMRHLPSMRYTPVG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 RSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVL
::::. :: .::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 RSFFTASEGCSNPLGGGREVWFGFHQSVRPSLWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQL
:...:.:: :::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DFKSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTD
:::::::::::::::....: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESGQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTD
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 NQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPIL
:::::::.::::::::::::::.::..::.: :::..:::: :::.::.:::::: : .
CCDS55 NQTSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASFNTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSI
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 QYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKIS
:::::.::::: :::::::.:::..:::::::::::::::.:: : ::.::.::::::
CCDS55 LYGGRNKAIATPVQGVWDMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKIS
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pF1KB5 KDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDT
.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..:::::::::::::::::::
CCDS55 RDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADV
.:::::::::.::: .:.:::::::::::::::::.::::.:. : :::::::::::::
CCDS55 VLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADV
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pF1KB5 THPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTR
:::::::::::::.::::::::::.:::::::::. :::::.::. ::::::::::::::
CCDS55 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTR
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pF1KB5 FKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCA
::::::::::::: :::. :.::.::::::.::::::::::::::.:::::::::::::.
CCDS55 FKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCT
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pF1KB5 DKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADE
::::: ::::::::.::::::::..::
CCDS55 DKNER----------------------------------GTSRPSHYHVLWDDNRFSSDE
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pF1KB5 LQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRD
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::: ::::::::
CCDS55 LQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRD
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840 850
pF1KB5 PQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
::::::::::::::::::::
CCDS55 HQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::.::::: ::::::..::.::::::
CCDS40 GLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYP
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS40 HLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLV
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..:.:. ::..::: .::.:.:..:::::::::.::::::::..:::..::::::::::.
CCDS40 RSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFH
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.:.:::.::::::: :.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEP
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pF1KB5 MFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS40 MFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNL
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pF1KB5 CLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPS
:::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS40 CLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPS
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pF1KB5 RYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYE
::::::::::::::::.::. ::::::::::::::::::::::::::: :::. :.:.::
CCDS40 RYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYE
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pF1KB5 LLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHP
:::::.:::.::::::::::::::::::::::::::..::.:.::::::::::::.::::
CCDS40 LLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHP
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pF1KB5 FEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPA
.:::::::::::::::::::::.:::::: :::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS40 YEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPA
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pF1KB5 YYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
:::.:::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS40 YYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
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>>CCDS397.1 AGO4 gene_id:192670|Hs108|chr1 (861 aa)
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Smith-Waterman score: 4925; 83.5% identity (93.6% similar) in 855 aa overlap (15-857:8-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIK
:: ..:: :::::.:::::::.::::.:.:.:::::::::.::::
CCDS39 MEALGPGPP-ASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVDIK
10 20 30 40 50
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pF1KB5 PDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGE
:.: :::::::::. ::.::: ::::::.: ::::.:.::. :::: .:::.:::.:::
CCDS39 PEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLPGE
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 GKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFF
:::. ::::..:...:: ..: :::.. :: .::::::: ::: ::::::::::::
CCDS39 GKDQTFKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRSFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRN
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::.:
CCDS39 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDIQN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQ
:.:: :::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS39 INEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 TVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
..::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 AMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 TMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASY--NLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPILQY
::::::::::::::::::::.:. :. . :::..:::: :...:::.::::::::.:::
CCDS39 TMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQY
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 GGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKD
::::...:::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..::.:::::::::::
CCDS39 GGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 AGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLL
:::::::::::::::::::::::::.::: :: :::::.:::::::::::::::::::::
CCDS39 AGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTH
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: .:::::::::::::::
CCDS39 GMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTH
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 PPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEI----------IEDLSYMVRELL
:::::::::::.:::::::.:::::::::::: :::: :.::. ::::::
CCDS39 PPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 IQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKR
:::::::::::::::.:: :: :::. :. ::.::: :::.::.::.:::::::::::
CCDS39 IQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKR
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 HHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWD
::::::::::.::.:::::.:::::::..:::: ::::::::::::::::::::: ::::
CCDS39 HHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 DNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHI
:: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.
CCDS39 DNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHV
780 790 800 810 820 830
830 840 850
pF1KB5 SGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
:::::::::::::::::.:.:: .:::::
CCDS39 SGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
840 850 860
>>CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 (861 aa)
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Smith-Waterman score: 689; 24.5% identity (55.0% similar) in 804 aa overlap (30-809:106-840)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDI-PKIDVYHYEVD
:. : ..: .:.:.. :. .:.:..:
CCDS92 LAERGGRRRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTNHFRLTSRPQWALYQYHID
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 IKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIG-NERVDFEVTI
.: ::. . . :: ...: . ..:: :. :: ...: .
CCDS92 YNPLMEARRLRSAL---LFQH--EDLIG-KCHAFDG-----TILFLPKRLQQKVTEVFSK
140 150 160 170 180
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLAS-MRYTPVG
.:.: ...: .:.. :. .: .. .:.: . : .:
CCDS92 TRNGED--VRITI-------------TLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIG
190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RSFFSPPEGYYHPLGGGREV-WFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEV
:....: . : . : : : :: :. ..:: ::: .. ... :..::
CCDS92 RNYYNPNDPIDIP--SHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVL-RSETVLDFMF--
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQ
:. .: . ...: .::. :: : . . .. ::: .. ..::
CCDS92 ----NFYHQTEEHKFQEQV--SKELIGLVVLTKY---NNKTYRVDDIDWDQNPKSTF---
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