Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5068, 547 aa
1>>>pF1KB5068 547 - 547 aa - 547 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1241+/-0.000897; mu= 14.8546+/- 0.054
mean_var=79.5278+/-15.916, 0's: 0 Z-trim(107.6): 58 B-trim: 189 in 1/49
Lambda= 0.143818
statistics sampled from 9633 (9691) to 9633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 3588 754.1 9.3e-218
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 1887 401.2 1.5e-111
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 581 130.3 8.5e-30
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 467 106.6 9.6e-23
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 452 103.6 1.1e-21
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 444 101.9 3.4e-21
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 444 101.9 3.4e-21
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 436 100.2 1.1e-20
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 409 94.6 3.7e-19
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 402 93.2 1.3e-18
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 391 90.8 4.7e-18
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 390 90.6 5.5e-18
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 391 90.8 5.5e-18
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 391 90.8 5.6e-18
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 391 90.9 5.8e-18
CCDS6951.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 851) 390 90.7 7.7e-18
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 369 86.2 7.5e-17
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 364 85.2 1.9e-16
CCDS9918.1 DDX24 gene_id:57062|Hs108|chr14 ( 859) 350 82.4 2.4e-15
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 342 80.7 5.9e-15
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 335 79.1 1.1e-14
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 334 79.0 1.5e-14
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 329 77.9 2.7e-14
CCDS10858.1 DDX28 gene_id:55794|Hs108|chr16 ( 540) 310 74.0 5.1e-13
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 298 71.5 2.2e-12
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 290 69.8 8.2e-12
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 278 67.3 3.4e-11
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 278 67.3 4e-11
>>CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 (547 aa)
initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588 Z-score: 4022.9 bits: 754.1 E(32554): 9.3e-218
Smith-Waterman score: 3588; 100.0% identity (100.0% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-547)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQSMIQQLATYCARDVRVANVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQSMIQQLATYCARDVRVANVSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSRCHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSRCHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRGPKGDKASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRGPKGDKASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPTEQFHLGKIEELLSGENRGPILLPYQFRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPTEQFHLGKIEELLSGENRGPILLPYQFRM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEIKEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEIKEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 HPAVVKPHLGHVPDYLVPPALRGLVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKSQNPLRSFKHKGKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HPAVVKPHLGHVPDYLVPPALRGLVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKSQNPLRSFKHKGKKF
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 RPTAKPS
:::::::
CCDS54 RPTAKPS
>>CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 (507 aa)
initn: 1887 init1: 1887 opt: 1887 Z-score: 2116.0 bits: 401.2 E(32554): 1.5e-111
Smith-Waterman score: 3214; 92.7% identity (92.7% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQSMIQQLATYCARDVRVANVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQSMIQQLATYCARDVRVANVSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSRCHI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSR---
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRGPKGDKASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNF
:::::::::::::::::::::::
CCDS59 -------------------------------------ASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNF
300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPTEQFHLGKIEELLSGENRGPILLPYQFRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPTEQFHLGKIEELLSGENRGPILLPYQFRM
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEIKEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEIKEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 HPAVVKPHLGHVPDYLVPPALRGLVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKSQNPLRSFKHKGKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HPAVVKPHLGHVPDYLVPPALRGLVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKSQNPLRSFKHKGKKF
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RPTAKPS
:::::::
CCDS59 RPTAKPS
>>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa)
initn: 553 init1: 293 opt: 581 Z-score: 648.4 bits: 130.3 E(32554): 8.5e-30
Smith-Waterman score: 660; 28.7% identity (60.5% similar) in 564 aa overlap (5-539:216-742)
10 20 30
pF1KB5 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQ
: :.:. :.:. ::.:.: .:...:: ::
CCDS13 ADTLKVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQ
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 EKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKEL
. ::..: :::. : : ::.:::::.:.:.:. :... .:: .: ::::::.::
CCDS13 KACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPV----TRVLVLVPTREL
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ARQAQSMIQQLATYCARDVRVANVSAAEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQ-DS
. :..:. .::: .: .. . . .. : ::.:.: ::....::.:...::.. :
CCDS13 GIQVHSVTRQLAQFC--NITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPS
310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LKLRDSLELLVVDEADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILH
..: .:.:.:..:::: ... :::..: .. . :..:.:::....:. : . :.
CCDS13 FHL-SSIEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLK
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 NPVTLKLQESQLPGPDQLQQF-QVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSY
::: . .. . .: :.: .. . : :. .. ::: .. . .::..: ....
CCDS13 NPVRIFVNSNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFT-DHVMLFTQTKKQAH
420 430 440 450 460 470
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 RLRLFLEQFSIPTCVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRG
:....: ... . :.:.: .: . . .:.. : ..:::.
CCDS13 RMHILLGLMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDV---------------
480 490 500 510 520
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 PKGDKASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARANNPGIVLTFVLPT
.:::.:.. :..:.:: .: : . :.::.::::::. : ...:
CCDS13 ------------AARGLDIEGVKTVINFTMPNTIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGED
530 540 550 560 570
400 410 420 430 440
pF1KB5 EQFHLGKIEELLSGENRGPIL-----LPYQFRMEEIEGFRYRC------RDAMRSVTKQA
:. : .: . .. .. :: : .. ..:..: : . :.. :
CCDS13 ERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDKIEKMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQI
580 590 600 610 620 630
450 460 470 480 490
pF1KB5 IREARLKEIKEELLHSEKLKTYFEDNPRDLQ------LLRHDLPLHPAVVKPHLGHVPDY
:: : .: . .: ...:. . . . : . :: :. : . . :
CCDS13 NTAKRLLEKGKEAVVQEPERSWFQTKEERKKEKIAKALQEFDLALRGK--KKRKKFMKDA
640 650 660 670 680
500 510 520 530 540
pF1KB5 LVPPALRG-------LVRPHKKRKKLSSSCRKAKRAKS---QNPLRSFKHKGKKFRPTAK
. . ... . ..:.. :.::::.. ..:.:. .: :.
CCDS13 KKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRNRRAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKSVF
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 PS
CCDS13 DEELTNTSKKALKQYRAGPSFEERKQLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK
750 760 770 780 790
>>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 (670 aa)
initn: 481 init1: 188 opt: 467 Z-score: 521.8 bits: 106.6 E(32554): 9.6e-23
Smith-Waterman score: 549; 28.5% identity (59.7% similar) in 529 aa overlap (19-539:191-661)
10 20 30 40
pF1KB5 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAI-PLALEGKDL
:.:. ..:.. : ::.:.: :: :::.::
CCDS21 SEVPSLPLGLTGAFEDTSFASLCNLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQHKSIRPL-LEGRDL
170 180 190 200 210
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 LARARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQAQSMIQQLAT
:: :.:::::: :. :: ..:... . : .: :.: ::.::: :. .....: :
CCDS21 LAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLRFM-PRNGTGV--LILSPTRELAMQTFGVLKELMT
220 230 240 250 260 270
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 YCARDVRVANVSAAEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRDSLELLVVDE
. .. . .. ... .:. : . ...:.::.:.:.:.:. . .:. ::.::
CCDS21 HHVHTYGLIMGGSNRSAEAQK--LGNGINIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQCLVIDE
280 290 300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELILHN-PVTLKLQESQLP
:: ... :::::::... :: :..:.::: .. :. : .. :.. :. . .....
CCDS21 ADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTMLFSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGVDDDKAN
340 350 360 370 380 390
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GP-DQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPT
. : :.: ::: .:. .::::...:: . . ..: . . .:. .: :. ...:.
CCDS21 ATVDGLEQGYVVCPSEK-RFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFSSCMSVKYHYEL-LNYIDLPV
400 410 420 430 440 450
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 CVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGKRRGRGPKGDKASDPEAGV
...:. .: . :: .. .. ::. .
CCDS21 LAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCTDV---------------------------A
460 470 480
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARA-NNPGIVLTFVLPTEQFHLGKIEELL
:::.:. .:. ....: : :. ::::.:::::. :. : .: .. : : :: .. :
CCDS21 ARGLDIPEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEE---LGFLRYL-
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 SGENRGPILLPYQFRMEEIEGFRYRCRDAMRS--VTKQAIREARLKEIKEELLHSEKLKT
... : : ..: .: .. . . ... ... .:: . :. :: ::
CCDS21 -KQSKVP-LSEFDFSWSKISDIQSQLEKLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHS--LKQ
550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 YFEDNPRDLQLLRHDLPLHPAVVKPHLGHVPDYLVPPALRGLVRPH--KKRKKLSSSCRK
: : .:.: :... . ::: . : . :..:. ...
CCDS21 IF--NVNNLNL-------------PQVALSFGFKVPPFVDLNVNSNEGKQKKRGGGGGFG
600 610 620 630 640
530 540
pF1KB5 AKRAKSQNPLRSFKHKGKKFRPTAKPS
...:. . . ::: .::
CCDS21 YQKTKKVEKSKIFKHISKKSSDSRQFSH
650 660 670
>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa)
initn: 384 init1: 148 opt: 452 Z-score: 502.6 bits: 103.6 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 525; 27.7% identity (59.9% similar) in 401 aa overlap (9-409:255-622)
10 20 30
pF1KB5 MEDSEALGFEHMGLDPRLLQAVTDLGWSRPTLIQEKAI
: :.:.: .:.. . ...:: :: ...
CCDS32 TNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGV
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 PLALEGKDLLARARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELARQA
:.:: :.:... :.::::::::. ::: .. .: : .. .... ::.:: .:
CCDS32 PVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEP--GDGPIAVIVCPTRELCQQI
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 QSMIQQLATYCARDVRVANVSAAEDSVSQRAVLMEKPDVVVGTPSRILSHLQQDSLKLRD
.. .... : ..: . : .. . : .:.: ..:: ::.:...:... . .:.
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. :: :::: .:..::: ...:. :. :..:.:::: . .. : . :: .:. .
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.: . . ... :. . .. .:. : : :. ::::. . .: :
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.: . .:.:.. : ..::.:.. ..:::.
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.:::.:. ...:.:.:. ... :: :::.::.. :.. :.. : .. :
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. . : : :.
CCDS32 DLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENM
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..:. ...: .::. . . . .::. : .. . ....:: : ... :
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340 350 360 370 380 390
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400 410 420 430 440 450
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.: . . . : .: ...:. : . .:.::
CCDS44 ELLTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDL------------------
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.:::.:. .. :.:...: . ..::.::.:::. : . ..: : :
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40 50 60 70 80 90
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CCDS83 LAYQTFEVLRKVGK--NHDFSAGLIIGGKD-LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETV
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:.. : :..::.:::: ....:: . ..... .::. :..:.::: ...:. : .: :
CCDS83 SFHATD-LQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSL
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pF1KB5 HNPVTLKLQE-SQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTL-ER
.:: . ..: .. : :.: .::: .. :. .::..:. : .. ::..: .. :
CCDS83 KNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQ-KISVLYSFLR-SHLKKKSIVFFSSCKEV
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280 290 300 310 320
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CCDS83 QYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDI------------
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CCDS83 ---------------AARGLDFPAVNWVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLIL
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CCDS83 LPSEK---AMVQQLL--QKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVS
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CCDS11 WLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRA-MFSATFAYDVEQWCKLNLDNVI
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CCDS11 ------ALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGNKGKAITFFTEDDKPL
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CCDS11 LRSVANVIQ-QAGCPV--P-----EYIKGFQKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKCFLE
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. : :
CCDS11 KAKDKQKKVTGQNSKKKVALEDKS
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CCDS87 RDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQ
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CCDS87 NRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEE
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CCDS87 TYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTV
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CCDS87 TDV-------------------------AG--RGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIG
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CCDS87 RTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]