Result of FASTA (omim) for
pF1KB5066
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5066, 575 aa
1>>>pF1KB5066 575 - 575 aa - 575 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8675+/-0.000539; mu= 13.4520+/- 0.033
mean_var=254.4048+/-50.038, 0's: 0 Z-trim(117.4): 2090 B-trim: 116 in 2/49
Lambda= 0.080410
statistics sampled from 26971 (29354) to 26971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 8.600
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Ho ( 575) 4024 480.9 4.8e-135
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1099 141.5 6.6e-33
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1099 141.5 6.6e-33
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1099 141.5 6.6e-33
NP_872439 (OMIM: 616181) zinc finger protein 713 [ ( 443) 1093 140.7 9.5e-33
NP_008892 (OMIM: 194525) zinc finger protein 19 [H ( 458) 1069 137.9 6.7e-32
XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 457) 1067 137.7 7.8e-32
NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 i ( 457) 1067 137.7 7.8e-32
XP_011533135 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1055 136.3 2.1e-31
XP_011533136 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1055 136.3 2.1e-31
NP_001273699 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 520) 1032 133.7 1.4e-30
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1030 133.6 1.9e-30
NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 1023 132.6 2.7e-30
NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 1023 132.6 2.7e-30
XP_011515622 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1021 132.4 3.3e-30
XP_016869365 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1021 132.4 3.3e-30
NP_001139137 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 570) 1021 132.5 3.6e-30
XP_016882228 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1021 132.5 3.6e-30
XP_005258907 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1021 132.5 3.6e-30
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1013 131.6 6.6e-30
NP_006626 (OMIM: 604755) zinc finger protein 460 i ( 562) 998 129.8 2.3e-29
XP_016881665 (OMIM: 604755) PREDICTED: zinc finger ( 555) 991 129.0 3.9e-29
NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 15 ( 437) 983 127.9 6.6e-29
XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 981 127.7 7.8e-29
XP_011525380 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_016882427 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001240728 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_011525378 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001073376 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304047 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001240730 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304050 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_016882428 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304049 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304042 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_016882425 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304044 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304045 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_061025 (OMIM: 606043) zinc finger protein 331 [ ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304046 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304048 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_016882426 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001240729 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001304043 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
XP_016882429 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001073375 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_001240727 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 975 127.1 1.3e-28
NP_075562 (OMIM: 611903) zinc finger protein 649 [ ( 505) 972 126.8 1.7e-28
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 966 126.2 3.1e-28
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 966 126.2 3.1e-28
>>NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Homo s (575 aa)
initn: 4024 init1: 4024 opt: 4024 Z-score: 2545.4 bits: 480.9 E(85289): 4.8e-135
Smith-Waterman score: 4024; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NCVLSSSPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENSDCHRDSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NCVLSSSPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENSDCHRDSSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGKAFSQNSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 AIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGKAFSQNSSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSLGRHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSLGRHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQRKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 RTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQRKHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 HLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAGQPESRALAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 HLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAGQPESRALAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB5 FDIQKIMQEKNPVHVIGVEEPSVGASMLFDIREST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 FDIQKIMQEKNPVHVIGVEEPSVGASMLFDIREST
550 560 570
>>XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin (549 aa)
initn: 2578 init1: 940 opt: 1099 Z-score: 711.7 bits: 141.5 E(85289): 6.6e-33
Smith-Waterman score: 1212; 39.4% identity (62.6% similar) in 540 aa overlap (23-540:12-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: ::::::.:::::::: ::.:.:. ::::::::.. .
XP_011 MAAQLLTDEALESVTFRDVTVDFTQEEWQQLEPAQKDLYRDVMLENYRN
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 LLSIGPELPKPEV--ISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEP
:.:. : .::. .. .. .: .. : . : :. .. . : : :.:
XP_011 LVSLDWET-RPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SHVTGREGFPTDAPYPTTL--GKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTL
.: : : : . : :. :. . :. .:. . : . :.. . .
XP_011 RGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELK-AFANQGCV--LVPPRLDDPTEKGACPPV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RLRENCVLSS--SPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSE--HNSSLVSQQTGSPGKQPGENS
: .: .: : :.: : ::: . . ..:::...: :..: : .
XP_011 RRGKNFSSTSDLSKPPMPC----EEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGK
: . . .: . .. .::: : ::::.:.. .::::.: ::::.::.: :::
XP_011 TCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQ
:: ..:::.::::::::.::: :..:::.: .. :: ::.: ::::::: : .:::::.:
XP_011 AFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQ
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pF1KB5 NSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSL
: : .:.:::::::::.:. :::.:.... : :: :.:: :.:: :..:::.: .:: :
XP_011 NMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB5 AQHQRKHAGEKPFECRQ-RLIFEQTPALTKHEWT-------EALGCDPPLSQ------DE
:::: : : ::::: . : .. .::.:. : : .. .
XP_011 IQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHP
.: ...:. :..::: : ::..::.:: :: : .:. : . .: .:: :. ::.
XP_011 IVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGE-KPY-RCGQCGKSFIKNSSLTVHQRI
470 480 490 500 510
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pF1KB5 NSRKSSAGGAKAGQPESRALALFDIQKIMQEKNPVHVIGVEEPSVGASMLFDIREST
.. .. .. :. :: :
XP_011 HTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
520 530 540
>>XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin (549 aa)
initn: 2578 init1: 940 opt: 1099 Z-score: 711.7 bits: 141.5 E(85289): 6.6e-33
Smith-Waterman score: 1212; 39.4% identity (62.6% similar) in 540 aa overlap (23-540:12-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: ::::::.:::::::: ::.:.:. ::::::::.. .
XP_016 MAAQLLTDEALESVTFRDVTVDFTQEEWQQLEPAQKDLYRDVMLENYRN
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 LLSIGPELPKPEV--ISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEP
:.:. : .::. .. .. .: .. : . : :. .. . : : :.:
XP_016 LVSLDWET-RPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SHVTGREGFPTDAPYPTTL--GKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTL
.: : : : . : :. :. . :. .:. . : . :.. . .
XP_016 RGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELK-AFANQGCV--LVPPRLDDPTEKGACPPV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RLRENCVLSS--SPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSE--HNSSLVSQQTGSPGKQPGENS
: .: .: : :.: : ::: . . ..:::...: :..: : .
XP_016 RRGKNFSSTSDLSKPPMPC----EEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGK
: . . .: . .. .::: : ::::.:.. .::::.: ::::.::.: :::
XP_016 TCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQ
:: ..:::.::::::::.::: :..:::.: .. :: ::.: ::::::: : .:::::.:
XP_016 AFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSL
: : .:.:::::::::.:. :::.:.... : :: :.:: :.:: :..:::.: .:: :
XP_016 NMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB5 AQHQRKHAGEKPFECRQ-RLIFEQTPALTKHEWT-------EALGCDPPLSQ------DE
:::: : : ::::: . : .. .::.:. : : .. .
XP_016 IQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHP
.: ...:. :..::: : ::..::.:: :: : .:. : . .: .:: :. ::.
XP_016 IVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGE-KPY-RCGQCGKSFIKNSSLTVHQRI
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 NSRKSSAGGAKAGQPESRALALFDIQKIMQEKNPVHVIGVEEPSVGASMLFDIREST
.. .. .. :. :: :
XP_016 HTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
520 530 540
>>XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin (549 aa)
initn: 2578 init1: 940 opt: 1099 Z-score: 711.7 bits: 141.5 E(85289): 6.6e-33
Smith-Waterman score: 1212; 39.4% identity (62.6% similar) in 540 aa overlap (23-540:12-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: ::::::.:::::::: ::.:.:. ::::::::.. .
XP_016 MAAQLLTDEALESVTFRDVTVDFTQEEWQQLEPAQKDLYRDVMLENYRN
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 LLSIGPELPKPEV--ISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEP
:.:. : .::. .. .. .: .. : . : :. .. . : : :.:
XP_016 LVSLDWET-RPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SHVTGREGFPTDAPYPTTL--GKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTL
.: : : : . : :. :. . :. .:. . : . :.. . .
XP_016 RGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELK-AFANQGCV--LVPPRLDDPTEKGACPPV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RLRENCVLSS--SPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSE--HNSSLVSQQTGSPGKQPGENS
: .: .: : :.: : ::: . . ..:::...: :..: : .
XP_016 RRGKNFSSTSDLSKPPMPC----EEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGK
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XP_016 TCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQ
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XP_016 AFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 NSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSL
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XP_016 NMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB5 AQHQRKHAGEKPFECRQ-RLIFEQTPALTKHEWT-------EALGCDPPLSQ------DE
:::: : : ::::: . : .. .::.:. : : .. .
XP_016 IQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHP
.: ...:. :..::: : ::..::.:: :: : .:. : . .: .:: :. ::.
XP_016 IVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGE-KPY-RCGQCGKSFIKNSSLTVHQRI
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 NSRKSSAGGAKAGQPESRALALFDIQKIMQEKNPVHVIGVEEPSVGASMLFDIREST
.. .. .. :. :: :
XP_016 HTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
520 530 540
>>NP_872439 (OMIM: 616181) zinc finger protein 713 [Homo (443 aa)
initn: 1380 init1: 691 opt: 1093 Z-score: 708.9 bits: 140.7 E(85289): 9.5e-33
Smith-Waterman score: 1093; 40.9% identity (67.1% similar) in 435 aa overlap (12-440:19-441)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDV
:. : .: :: .::.:::::::.::: :: :.:. :::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 MLETFGHLLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGL
:::.. .:...: .: :::::.::: : :: :: . :: : : : . : ...
NP_872 MLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNI
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pF1KB5 PEEEPSHVTGREGFPTDAPYPTTLGK--DRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQ
.:. .: : . :. . . :: : . . . ... : :. . :. .:..
NP_872 SDENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKI-TQER
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 GYKTLRLRENCVLSSS--PNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPG
. . .. ::: :.:. . .: : . . :.: .. .:::.:. : . . :
NP_872 SLECNKFAENCNLNSNLMQQRIPSI---KIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPY
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pF1KB5 ENSDCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKE
: :.: . .: : .:. .. .:: ..:::.:.:.. :. . . :::.:: : :
NP_872 EYSECGKIFNQHILLTDHIHTA--EKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDE
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pF1KB5 CGKAFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRA
::: ::: :.::.:::::.::. : :::.: . . .: : :::::::::.:..::.:
NP_872 CGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKA
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pF1KB5 FNQNSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHS
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NP_872 FSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQS
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pF1KB5 SSLAQHQRKHAGEK--PFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPF
. : ::.. :. :: ..:.: . ...:...
NP_872 AHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTV--RHSPSFSST
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pF1KB5 KCNQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGG
>>NP_008892 (OMIM: 194525) zinc finger protein 19 [Homo (458 aa)
initn: 2371 init1: 834 opt: 1069 Z-score: 693.7 bits: 137.9 E(85289): 6.7e-32
Smith-Waterman score: 1075; 38.2% identity (65.2% similar) in 469 aa overlap (12-466:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
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pF1KB5 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELW--------VAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEG
: ..: .::: .:: ::.: : ::: : . :. . : .:... . :
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pF1KB5 LPEEEPSHVTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQG
. ::. . .. .: ..: : . . :. ... .. ..:... . . : .
NP_008 ISEERDGMMS--HGQLKSVPQRTDFPETRNVEKH----QDIPTVKNIQGKVPRIPCARKP
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 YKTLRLRENCVLSSSPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSE------HNSSLVSQQTGSPGK
. . :.: ..: . : .: . ..: .. . :: ::::. .: :.
NP_008 F----ICEEC--GKSFSYFSYYARHQRIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLIRHQRIHTGE
170 180 190 200 210
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pF1KB5 QPGENSDCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYM
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NP_008 RPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQRIHTGEKPYE
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pF1KB5 CKECGKAFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDC
:.:::::: :: :..:..::::.:::.: :::::: ...::. :.::::::::: :. :
NP_008 CNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKPYECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVC
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pF1KB5 GRAFNQNSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGF
:.::: ...: ::.: :. :::. : :::.:: : ::: ::.: : :..:::..
NP_008 GQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFDCVDCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSYVCDECGKAL
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pF1KB5 RHSSSLAQHQRKHAGEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRP
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pF1KB5 FKCNQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAG
NP_008 VLDICRFGLPEFFTPFYW
450
>>XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger pro (457 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: :::::::.::.:::: :.:.:: ::: ::::..::
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pF1KB5 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
:.:.: . ::.:.: :::: : :...: . . . : .: . . . ... .. :.
XP_011 LVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIK-DFSPKNVIYDDSSQ
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pF1KB5 VTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKE-QNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRLR
: . ...: ... .:.... :.: :. .... . .:: .: .. .:..
XP_011 YLIMERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ENC--VLSSSPNPFPEI-----SRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENS
.: .. : . :: :. . :.::..: ::.: : .
XP_011 YGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGK
::.. : . : .... .:::.::.:::.:.. ..:: :.::: :.. :.:..:::
XP_011 DCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 AFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQ
:::..: :..:. :::.:::.: ::::.: . .::: :. ::: . ::::..: .::
XP_011 AFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRC
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pF1KB5 NSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSL
.: : .:.: :.::: : :. ::: :. . :. : ..:: :.:: : .: :.: .: ::
XP_011 HSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSL
350 360 370 380 390 400
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pF1KB5 AQHQRKHAGEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQC
::: :.::::. :. . ... :. : .. .::: : :.. ..
XP_011 ILHQRTHTGEKPYVCK---VCNKS-----FSWSSNL------AKHQRTHTLDNPYEYEN-
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pF1KB5 GKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAGQ
: : : .::
XP_011 --SFNYHSFLTEHQ
450
>>NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 isofo (457 aa)
initn: 2748 init1: 780 opt: 1067 Z-score: 692.5 bits: 137.7 E(85289): 7.8e-32
Smith-Waterman score: 1069; 36.6% identity (64.1% similar) in 473 aa overlap (22-486:3-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: :::::::.::.:::: :.:.:: ::: ::::..::
NP_003 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGH
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pF1KB5 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
:.:.: . ::.:.: :::: : :...: . . . : .: . . . ... .. :.
NP_003 LVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIK-DFSPKNVIYDDSSQ
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pF1KB5 VTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKE-QNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRLR
: . ...: ... .:.... :.: :. .... . .:: .: .. .:..
NP_003 YLIMERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ENC--VLSSSPNPFPEI-----SRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENS
.: .. : . :: :. . :.::..: ::.: : .
NP_003 YGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECK
170 180 190 200 210 220
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pF1KB5 DCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGK
::.. : . : .... .:::.::.:::.:.. ..:: :.::: :.. :.:..:::
NP_003 DCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 AFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQ
:::..: :..:. :::.:::.: ::::.: . .::: :. ::: . ::::..: .::
NP_003 AFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSL
.: : .:.: :.::: : :. ::: :. . :. : ..:: :.:: : .: :.: .: ::
NP_003 HSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSL
350 360 370 380 390 400
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pF1KB5 AQHQRKHAGEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQC
::: :.::::. :. . ... :. : .. .::: : :.. ..
NP_003 ILHQRTHTGEKPYVCK---VCNKS-----FSWSSNL------AKHQRTHTLDNPYEYEN-
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pF1KB5 GKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAGQ
: : : .::
NP_003 --SFNYHSFLTEHQ
450
>>XP_011533135 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger pro (458 aa)
initn: 2748 init1: 780 opt: 1055 Z-score: 684.9 bits: 136.3 E(85289): 2.1e-31
Smith-Waterman score: 1057; 36.5% identity (63.9% similar) in 474 aa overlap (22-486:3-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
: :::::::.::.:::: :.:.:: ::: ::::..::
XP_011 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGH
10 20 30 40
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pF1KB5 LLSI-GPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPS
:.:. : . ::.:.: :::: : :...: . . . : .: . . . ... .. :
XP_011 LVSLAGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIK-DFSPKNVIYDDSS
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 HVTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQSLALKE-QNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRL
. : . ...: ... .:.... :.: :. .... . .:: .: .. .:..
XP_011 QYLIMERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RENC--VLSSSPNPFPEI-----SRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGEN
.: .. : . :: :. . :.::..: ::.: :
XP_011 PYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHEC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SDCHRDSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECG
.::.. : . : .... .:::.::.:::.:.. ..:: :.::: :.. :.:..::
XP_011 KDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCG
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 KAFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFN
::::..: :..:. :::.:::.: ::::.: . .::: :. ::: . ::::..: .::
XP_011 KAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFR
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 QNSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSS
.: : .:.: :.::: : :. ::: :. . :. : ..:: :.:: : .: :.: .: :
XP_011 CHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LAQHQRKHAGEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQ
: ::: :.::::. :. . ... :. : .. .::: : :.. ..
XP_011 LILHQRTHTGEKPYVCK---VCNKS-----FSWSSNL------AKHQRTHTLDNPYEYEN
410 420 430 440
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pF1KB5 CGKCFIQSSHLIRHQITHTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAG
: : : .::
XP_011 ---SFNYHSFLTEHQ
450
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