Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5060, 585 aa
1>>>pF1KB5060 585 - 585 aa - 585 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6127+/-0.000993; mu= 16.8369+/- 0.059
mean_var=69.3552+/-14.086, 0's: 0 Z-trim(104.3): 56 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154005
statistics sampled from 7797 (7851) to 7797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11759.1 LGALS3BP gene_id:3959|Hs108|chr17 ( 585) 3985 895.0 0
CCDS53742.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1121) 462 112.4 3.2e-24
CCDS8578.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1156) 462 112.4 3.3e-24
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 463 112.7 5.3e-24
CCDS44491.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (1785) 452 110.2 2.2e-23
CCDS44490.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2413) 452 110.3 2.9e-23
CCDS32719.1 BTBD17 gene_id:388419|Hs108|chr17 ( 478) 429 104.9 2.5e-22
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 422 103.4 1.2e-21
CCDS8577.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1453) 413 101.5 7.6e-21
CCDS73434.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1463) 413 101.5 7.6e-21
CCDS5585.1 SSC4D gene_id:136853|Hs108|chr7 ( 575) 394 97.1 6.4e-20
CCDS59424.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 ( 951) 395 97.4 8.4e-20
CCDS45162.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 ( 782) 393 97.0 9.7e-20
CCDS46196.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 (1573) 395 97.5 1.3e-19
CCDS7473.1 LOXL4 gene_id:84171|Hs108|chr10 ( 756) 372 92.3 2.4e-18
CCDS5995.1 MSR1 gene_id:4481|Hs108|chr8 ( 451) 368 91.3 2.8e-18
CCDS34864.1 LOXL2 gene_id:4017|Hs108|chr8 ( 774) 364 90.5 8.4e-18
CCDS58137.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 592) 359 89.3 1.4e-17
CCDS58138.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 601) 359 89.4 1.4e-17
CCDS7999.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 668) 359 89.4 1.6e-17
CCDS2124.1 MARCO gene_id:8685|Hs108|chr2 ( 520) 351 87.5 4.4e-17
CCDS6064.1 SCARA5 gene_id:286133|Hs108|chr8 ( 495) 346 86.4 9.1e-17
CCDS74527.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 ( 608) 346 86.5 1.1e-16
CCDS1953.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 ( 753) 346 86.5 1.3e-16
CCDS1171.1 CD5L gene_id:922|Hs108|chr1 ( 347) 274 70.4 4.4e-12
>>CCDS11759.1 LGALS3BP gene_id:3959|Hs108|chr17 (585 aa)
initn: 3985 init1: 3985 opt: 3985 Z-score: 4783.0 bits: 895.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3985; 100.0% identity (100.0% similar) in 585 aa overlap (1-585:1-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTVCDNLWDLTDASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTVCDNLWDLTDASV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALGFCGHTVILTANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALGFCGHTVILTANL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFHKLASAYGARQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFHKLASAYGARQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GYCASLFAILLPQDPSFQMPLDLYAYAVATGDALLEKLCLQFLAWNFEALTQAEAWPSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GYCASLFAILLPQDPSFQMPLDLYAYAVATGDALLEKLCLQFLAWNFEALTQAEAWPSVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TDLLQLLLPRSDLAVPSELALLKAVDTWSWGERASHEEVEGLVEKIRFPMMLPEELFELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TDLLQLLLPRSDLAVPSELALLKAVDTWSWGERASHEEVEGLVEKIRFPMMLPEELFELQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FNLSLYWSHEALFQKKTLQALEFHTVPFQLLARYKGLNLTEDTYKPRIYTSPTWSAFVTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FNLSLYWSHEALFQKKTLQALEFHTVPFQLLARYKGLNLTEDTYKPRIYTSPTWSAFVTD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SSWSARKSQLVYQSRRGPLVKYSSDYFQAPSDYRYYPYQSFQTPQHPSFLFQDKRVSWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSWSARKSQLVYQSRRGPLVKYSSDYFQAPSDYRYYPYQSFQTPQHPSFLFQDKRVSWSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VYLPTIQSCWNYGFSCSSDELPVLGLTKSGGSDRTIAYENKALMLCEGLFVADVTDFEGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VYLPTIQSCWNYGFSCSSDELPVLGLTKSGGSDRTIAYENKALMLCEGLFVADVTDFEGW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB5 KAAIPSALDTNSSKSTSSFPCPAGHFNGFRTVIRPFYLTNSSGVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAAIPSALDTNSSKSTSSFPCPAGHFNGFRTVIRPFYLTNSSGVD
550 560 570 580
>>CCDS53742.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1121 aa)
initn: 1096 init1: 459 opt: 462 Z-score: 548.3 bits: 112.4 E(32554): 3.2e-24
Smith-Waterman score: 462; 47.3% identity (76.0% similar) in 129 aa overlap (19-147:714-842)
10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTV
...:..::..::. :::::...:.:::.
CCDS53 GNQSQTLSSCNSSSLGPTRPTIPEESAVACIESGQLRLVNGGGRCAGRVEIYHEGSWGTI
690 700 710 720 730 740
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 CDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGW
::. :::.:: :::: :: .: .: : : ::.:.::: :::..:.: :. . .:.: ::
CCDS53 CDDSWDLSDAHVVCRQLGCGEAINATGSAHFGEGTGPIWLDEMKCNGKESRIWQCHSHGW
750 760 770 780 790 800
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALG
..::::..::::.:.. : . ::: . ..:
CCDS53 GQQNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSEASREACAGRLEVFYNGAWGTVGKSSMSETTVGVV
810 820 830 840 850 860
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFH
CCDS53 CRQLGCADKGKINPASLDKAMSIPMWVDNVQCPKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWI
870 880 890 900 910 920
>--
initn: 390 init1: 390 opt: 399 Z-score: 472.7 bits: 98.4 E(32554): 5.2e-20
Smith-Waterman score: 399; 52.4% identity (78.1% similar) in 105 aa overlap (21-125:926-1030)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTVCD
:. .:: .: .. .:::::.. :.::::::
CCDS53 PKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSCSGRVEIWHGGSWGTVCD
900 910 920 930 940 950
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLK
. ::: ::.:::. :: : .:. .: ::::.::: :.::.: :.:.:: :: . : .
CCDS53 DSWDLDDAQVVCQQLGCGPALKAFKEAEFGQGTGPIWLNEVKCKGNESSLWDCPARRWGH
960 970 980 990 1000 1010
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALGFC
:.: :..::.: ::.
CCDS53 SECGHKEDAAVNCTDISVQKTPQKATTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>--
initn: 1007 init1: 373 opt: 385 Z-score: 455.8 bits: 95.3 E(32554): 4.5e-19
Smith-Waterman score: 385; 42.6% identity (68.1% similar) in 141 aa overlap (20-154:152-292)
10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG---DMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWG
.:: .:::. :: .::.:: ..:.::
CCDS53 GNESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMRLTRGGNMCSGRIEIKFQGRWG
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 TVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSL
::::. ... :::.:: : .:.. : . ::.::::: .:.. :.:.:..: .::
CCDS53 TVCDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFSGSSNFGEGSGPIWFDDLICNGNESALWNCKHQ
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GWLKSNCRHERDAGVVCTNETR-STHTLDLSRELSEALGQIFDSQRG--CDLSISVNVQG
:: : :: : .::::.:.. . : . .: : : : :... : ::
CCDS53 GWGKHNCDHAEDAGVICSKGADLSLRLVDGVTECSGRLEVRFQGEWGTICDDGWDSYDAA
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSS
CCDS53 VACKQLGCPTAVTAIGRVNASKGFGHIWLDSVSCQGHEPAIWQCKHHEWGKHYCNHNEDA
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 350 init1: 274 opt: 360 Z-score: 425.8 bits: 89.7 E(32554): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 360; 43.8% identity (68.0% similar) in 128 aa overlap (1-123:24-151)
10 20 30
pF1KB5 MTPPRLFWVWLL----VAGTQGVNDGDMRLADGGATN
..: . : :: :... : .: ..::.::
CCDS53 MSKLRMVLLEDSGSADFRRHFVNLSPFTITVVLLLSACFVTSSLGGTDKELRLVDGENKC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 QGRVEIFYRGQWGTVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQC
.::::. . .:::::.: :.. .::.: :: .: .: : : . ::: : .:.:.:
CCDS53 SGRVEVKVQEEWGTVCNNGWSMEAVSVICNQLGCPTAIKAPGWANSSAGSGRIWMDHVSC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TGTEASLADCKSLGWLK-SNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRG
:.:..: ::: :: : ::: :..::::.:
CCDS53 RGNESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMRLTRGGNMCSGRIEIKFQGRW
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 CDLSISVNVQGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYF
CCDS53 GTVCDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFSGSSNFGEGSGPIWFDDLICNGNESALWNCKH
190 200 210 220 230 240
>>CCDS8578.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1156 aa)
initn: 1096 init1: 459 opt: 462 Z-score: 548.1 bits: 112.4 E(32554): 3.3e-24
Smith-Waterman score: 462; 47.3% identity (76.0% similar) in 129 aa overlap (19-147:714-842)
10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTV
...:..::..::. :::::...:.:::.
CCDS85 GNQSQTLSSCNSSSLGPTRPTIPEESAVACIESGQLRLVNGGGRCAGRVEIYHEGSWGTI
690 700 710 720 730 740
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 CDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGW
::. :::.:: :::: :: .: .: : : ::.:.::: :::..:.: :. . .:.: ::
CCDS85 CDDSWDLSDAHVVCRQLGCGEAINATGSAHFGEGTGPIWLDEMKCNGKESRIWQCHSHGW
750 760 770 780 790 800
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALG
..::::..::::.:.. : . ::: . ..:
CCDS85 GQQNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSEASREACAGRLEVFYNGAWGTVGKSSMSETTVGVV
810 820 830 840 850 860
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFH
CCDS85 CRQLGCADKGKINPASLDKAMSIPMWVDNVQCPKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWI
870 880 890 900 910 920
>--
initn: 390 init1: 390 opt: 399 Z-score: 472.4 bits: 98.4 E(32554): 5.4e-20
Smith-Waterman score: 399; 52.4% identity (78.1% similar) in 105 aa overlap (21-125:926-1030)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTVCD
:. .:: .: .. .:::::.. :.::::::
CCDS85 PKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSCSGRVEIWHGGSWGTVCD
900 910 920 930 940 950
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLK
. ::: ::.:::. :: : .:. .: ::::.::: :.::.: :.:.:: :: . : .
CCDS85 DSWDLDDAQVVCQQLGCGPALKAFKEAEFGQGTGPIWLNEVKCKGNESSLWDCPARRWGH
960 970 980 990 1000 1010
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALGFC
:.: :..::.: ::.
CCDS85 SECGHKEDAAVNCTDISVQKTPQKATTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>--
initn: 1007 init1: 373 opt: 385 Z-score: 455.6 bits: 95.3 E(32554): 4.7e-19
Smith-Waterman score: 385; 42.6% identity (68.1% similar) in 141 aa overlap (20-154:152-292)
10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG---DMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWG
.:: .:::. :: .::.:: ..:.::
CCDS85 GNESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMRLTRGGNMCSGRIEIKFQGRWG
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 TVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSL
::::. ... :::.:: : .:.. : . ::.::::: .:.. :.:.:..: .::
CCDS85 TVCDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFSGSSNFGEGSGPIWFDDLICNGNESALWNCKHQ
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GWLKSNCRHERDAGVVCTNETR-STHTLDLSRELSEALGQIFDSQRG--CDLSISVNVQG
:: : :: : .::::.:.. . : . .: : : : :... : ::
CCDS85 GWGKHNCDHAEDAGVICSKGADLSLRLVDGVTECSGRLEVRFQGEWGTICDDGWDSYDAA
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSS
CCDS85 VACKQLGCPTAVTAIGRVNASKGFGHIWLDSVSCQGHEPAIWQCKHHEWGKHYCNHNEDA
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 350 init1: 274 opt: 360 Z-score: 425.6 bits: 89.7 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 360; 43.8% identity (68.0% similar) in 128 aa overlap (1-123:24-151)
10 20 30
pF1KB5 MTPPRLFWVWLL----VAGTQGVNDGDMRLADGGATN
..: . : :: :... : .: ..::.::
CCDS85 MSKLRMVLLEDSGSADFRRHFVNLSPFTITVVLLLSACFVTSSLGGTDKELRLVDGENKC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 QGRVEIFYRGQWGTVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQC
.::::. . .:::::.: :.. .::.: :: .: .: : : . ::: : .:.:.:
CCDS85 SGRVEVKVQEEWGTVCNNGWSMEAVSVICNQLGCPTAIKAPGWANSSAGSGRIWMDHVSC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TGTEASLADCKSLGWLK-SNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRG
:.:..: ::: :: : ::: :..::::.:
CCDS85 RGNESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMRLTRGGNMCSGRIEIKFQGRW
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 CDLSISVNVQGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYF
CCDS85 GTVCDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFSGSSNFGEGSGPIWFDDLICNGNESALWNCKH
190 200 210 220 230 240
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CCDS44 SPISLESTLESTVAEGSLIPSESTLESTVAEGSDSGLALRLVNGDGRCQGRVEILYRGSW
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CCDS44 GTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAWFGQGSGPIALDDVRCSGHESYLWSCPH
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CCDS44 TVCDDSWTIQEAEVVCRQLGCGRAVSALGNAYFGSGSGPITLDDVECSGTESTLWQCRNR
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CCDS44 GWFSHNCNHREDAGVICSGNHLSTPAPFLNITRPNTDYSCGGFLSQPSGDFSSPFYPGNY
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CCDS44 TVGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMLAP
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pF1KB5 GRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLD
: : ::::::::.::.:.:.:.:. : .: :::. :: : .::::.:.. :
CCDS44 GNARFGQGSGPIVLDDVRCSGNESYLWSCPHNGWLSHNCGHSEDAGVICSGPESSLALRL
540 550 560 570 580 590
140 150 160 170 180 190
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CCDS44 VNGGDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPI
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10 20 30 40 50
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.::..:: :::::..:::.::::::. :
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: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
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.: .::::.:.
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10 20 30 40
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:.: : ... .::..:: :::::..::
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: :::. :: :..::::.:. .... : . :
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:.: : ... .::..:: :::::..::
CCDS44 NCGHSEDAGVICSASQSRPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR
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:.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .
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: :::. :: :..::::.:. .... : . :
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:: : . . : :.: : ... .::..:
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: :::::..:.:.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::
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.:.:.: :. : .: :::. :: : .::::.:. ...: : . :
CCDS44 DVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNCGHSEDAGVICSASQSRPTPSPDTWPTSHASTAGSES
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:: : : : : ... .::..:: .:
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:::..:::.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.:
CCDS44 RVEVLYRGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSG
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.:. : .: ::: :: :..::::.:. .. : :
CCDS44 NESYLWSCPHKGWLTHNCGHHEDAGVICSATQINSTTTDWWHPTTTTTARPSSNCGGFLF
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CCDS44 YASGTFSSPSYPAYYPNNAKCVWEIEVNSGYRINLGFSNLKLEAHHNCSFDYVEIFDGSL
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.::..:: .::::..:::.::::::. :
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: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: ::: ::
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: .::::.:. ..: : . :
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.::..:: .::::..:.:.::::::. :
CCDS44 CSASQSQPTPSPDTWPTSRASTAGSESTLALRLVNGGDRCRGRVEVLYQGSWGTVCDDYW
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: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
CCDS44 DTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAQFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNC
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:..::::.:. ...:: :
CCDS44 GHHEDAGVICSAAQSQSTPRPDTWLTTNLPALTVGSESSLALRLVNGGDRCRGRVEVLYR
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.: ..: .::..: . ::::::.:::.:
CCDS44 SPISLESTLESTVAEGSLIPSESTLESTVAEGSDSGLALRLVNGDGRCQGRVEILYRGSW
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:::::. :: .::.:::: :: : .: : : :::::::: ::.:.:.: :. : .:
CCDS44 GTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAWFGQGSGPIALDDVRCSGHESYLWSCPH
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pF1KB5 LGWLKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGED
:::. :: : .::::.:.
CCDS44 NGWLSHNCGHGEDAGVICSAAQPQSTLRPESWPVRISPPVPTEGSESSLALRLVNGGDRC
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10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATN---QGRVEIFYRGQWG
.:. .::.. ... :::::.. : ::
CCDS44 TSSYNRMTIHFRSDISFQNTGFLAWYNSFPSDATLRLVNLNSSYGLCAGRVEIYHGGTWG
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::::. : . .: :::: :: :..::: : ::.::::: ::.:.:.:::..: .:..
CCDS44 TVCDDSWTIQEAEVVCRQLGCGRAVSALGNAYFGSGSGPITLDDVECSGTESTLWQCRNR
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::.. :: :..::::.:... :: . :...: .. : :: . :.:
CCDS44 GWFSHNCNHREDAGVICSGNHLSTPAPFLNITRPNTDYSCGGFLSQPSGDFSSPFYPGNY
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pF1KB5 DALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSV
CCDS44 PNNAKCVWDIEVQNNYRVTVIFRDVQLEGGCNYDYIEVFDGPYRSSPLIARVCDGARGSF
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.::..:: :::::..:::.::::::. :
CCDS44 SCPHNGWLSHNCGHSEDAGVICSGPESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSW
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: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: . :::. ::
CCDS44 DTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPNNGWLSHNC
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CCDS44 GHHEDAGVICSAAQSRSTPRPDTLSTITLPPSTVGSESSLTLRLVNGSDRCQGRVEVLYR
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.::..:: :::::..:::.::::::. :
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340 350 360 370 380 390
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: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
CCDS44 DTSDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGYESYLWSCPHNGWLSHNC
400 410 420 430 440 450
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.: .::::.:.
CCDS44 QHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR
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.::..:: :::::..:::.::::::. :
CCDS44 CSVSQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSW
840 850 860 870 880 890
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: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
CCDS44 DTSDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGYESYLWSCPHNGWLSHNC
900 910 920 930 940 950
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALGFCGHT
.: .::::.:.
CCDS44 QHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYQ
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pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG-DMRLADGGATNQGRVEIFYR
:.: : ... .::..:: :::::..::
CCDS44 NCGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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CCDS44 GSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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CCDS44 CPHNGWLSHNCGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITL
CCDS44 QGRVEVLYRGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRC
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG-DMRLADGGATNQGRVEIFYR
:.: : ... .::..:: :::::..::
CCDS44 NCGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR
1340 1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KB5 GQWGTVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLAD
:.::::::. :: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .
CCDS44 GSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWS
1400 1410 1420 1430 1440 1450
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 CKSLGWLKSNCRHERDAGVVCT-NETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNV
: :::. :: :..::::.:. .... : . :
CCDS44 CPHNGWLSHNCGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSRASTAGSESTLALRLVNGGDRC
1460 1470 1480 1490 1500 1510
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITL
CCDS44 RGRVEVLYQGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAQFGQGSGPIVLDDVRC
1520 1530 1540 1550 1560 1570
>--
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Smith-Waterman score: 447; 55.4% identity (78.6% similar) in 112 aa overlap (24-134:733-844)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTVCDNLW
.::..:. :::::..:::.::::::. :
CCDS44 AAQSRSTPRPDTLSTITLPPSTVGSESSLTLRLVNGSDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSW
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pF1KB5 DLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNC
: .::.:::: :: ::.: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
CCDS44 DTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNC
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:..::::.:. ...: : . :
CCDS44 GHHEDAGVICSVSQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGS
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10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG-DMRLADGGATNQGRVEIFYR
:.: : ... .::..:: :::::..::
CCDS44 NCGHSEDAGVICSASQSRPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR
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:.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .
CCDS44 GSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWS
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: :::. :: :..::::.:. .... : . :
CCDS44 CPHNGWLSHNCGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRC
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pF1KB5 QGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITL
CCDS44 QGRVEVLYRGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRC
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10 20
pF1KB5 MTP-PRLFWVWLLVAGTQGVNDG-DMRLADG
:: : . . : :.: : ... .::..:
CCDS44 WSCPHNGWLSHNCQHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSESSLALRLVNG
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pF1KB5 GATNQGRVEIFYRGQWGTVCDNLWDLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLD
: :::::..:.:.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::
CCDS44 GDRCQGRVEVLYQGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFGQGSGPIVLD
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pF1KB5 EVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAGVVCT-NETRSTHTLDLSRELSEALGQIFD
.:.:.: :. : .: :::. :: : .::::.:. ...: : . :
CCDS44 DVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNCGHSEDAGVICSASQSRPTPSPDTWPTSHASTAGSES
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:: : . . : :.: : ... .::..:
CCDS44 WSCPHNGWLSHNCQHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSESSLALRLVNG
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: :::::..:::.::::::. :: .::.:::: :: : : : : ::::::::.::
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pF1KB5 EVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDS
.:.:.:.:. : .: :::. :: : .::::.:.. :
CCDS44 DVRCSGNESYLWSCPHNGWLSHNCGHSEDAGVICSGPESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLY
560 570 580 590 600 610
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pF1KB5 QRGCDLSISVNVQGEDALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLL
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10 20 30
pF1KB5 MTPPRLFWVWL---LVAGTQGVNDG-DMRLADGGATNQG
:: : : : : ... .::..:: .:
CCDS44 GWLSHNCGHHEDAGVICSAAQSQSTPRPDTWLTTNLPALTVGSESSLALRLVNGGDRCRG
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:::..:::.::::::. :: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.:
CCDS44 RVEVLYRGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSG
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pF1KB5 TEASLADCKSLGWLKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDL
.:. : .: ::: :: :..::::.:. .. : :
CCDS44 NESYLWSCPHKGWLTHNCGHHEDAGVICSATQINSTTTDWWHPTTTTTARPSSNCGGFLF
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CCDS44 YASGTFSSPSYPAYYPNNAKCVWEIEVNSGYRINLGFSNLKLEAHHNCSFDYVEIFDGSL
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.::..:: .::::..:::.::::::. :
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: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: ::: ::
CCDS44 DTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAQFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLTHNC
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: .::::.:. ..: : . :
CCDS44 GHSEDAGVICSAPQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGS
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.::..:: .::::..:.:.::::::. :
CCDS44 CSASQSQPTPSPDTWPTSRASTAGSESTLALRLVNGGDRCRGRVEVLYQGSWGTVCDDYW
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: .::.:::: :: : .: : : ::::::::.::.:.:.: :. : .: :::. ::
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:..::::.:. ...:: :
CCDS44 GHHEDAGVICSAAQSQSTPRPDTWLTTNLPALTVGSESSLALRLVNGGDRCRGRVEVLYR
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pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDG-DMRLADGGATNQGRVEIFYRGQW
.: ..: .::..: . ::::::.:::.:
CCDS44 SPISLESTLESTVAEGSLIPSESTLESTVAEGSDSGLALRLVNGDGRCQGRVEILYRGSW
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:::::. :: .::.:::: :: : .: : : :::::::: ::.:.:.: :. : .:
CCDS44 GTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAWFGQGSGPIALDDVRCSGHESYLWSCPH
130 140 150 160 170 180
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:::. :: : .::::.:.
CCDS44 NGWLSHNCGHGEDAGVICSAAQPQSTLRPESWPVRISPPVPTEGSESSLALRLVNGGDRC
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>--
initn: 404 init1: 404 opt: 420 Z-score: 492.7 bits: 103.2 E(32554): 4e-21
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10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATN---QGRVEIFYRGQWG
.:. .::.. ... :::::.. : ::
CCDS44 TSSYNRMTIHFRSDISFQNTGFLAWYNSFPSDATLRLVNLNSSYGLCAGRVEIYHGGTWG
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::::. : . .: :::: :: :..::: : ::.::::: ::.:.:.:::..: .:..
CCDS44 TVCDDSWTIQEAEVVCRQLGCGRAVSALGNAYFGSGSGPITLDDVECSGTESTLWQCRNR
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::.. :: :..::::.:... :: . :...: .. : :: . :.:
CCDS44 GWFSHNCNHREDAGVICSGNHLSTPAPFLNITRPNTDYSCGGFLSQPSGDFSSPFYPGNY
1970 1980 1990 2000 2010 2020
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pF1KB5 DALGFCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSV
CCDS44 PNNAKCVWDIEVQNNYRVTVIFRDVQLEGGCNYDYIEVFDGPYRSSPLIARVCDGARGSF
2030 2040 2050 2060 2070 2080
>>CCDS32719.1 BTBD17 gene_id:388419|Hs108|chr17 (478 aa)
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110 120 130 140 150 160
pF1KB5 DCKSLGWLKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNV
... :. . . : ... . . :. . :..
CCDS32 WGSFWAMLTLVGLVTHAAQRADVGGEAAGTSINHSQAVLQRLQELLRQGNASDVVLRVQA
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pF1KB5 QGEDALG-FCGHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAE---CVPMVRDLLRYFYSRRI
: : . : .: ..: . : :. : :: . .: : :. . ..::.: ..
CCDS32 AGTDEVRVFHAHRLLLGLHSE---LFLELLSNQSEAVLQEPQDCAAVFDKFIRYLYCGEL
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. :... .:.::. ::. .:: :. . : . : . : :::.::: :.
CCDS32 TVLLTQAIPLHRLATKYGVSSLQRGVADYMRAHLAGGAG---PAVGWYHYAVGTGDEALR
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. ::::::::. :.. . : .: .:: :: ::::.. .:: :..:...: :
CCDS32 ESCLQFLAWNLSAVAASTEWGAVSPELLWQLLQRSDLVLQDELELFHALEAWLGRARPPP
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.: .. ::.::. : .::.:: . : ::: .::.. :..
CCDS32 AVAERALRAIRYPMIPPAQLFQLQARSAALARHGPAVADLLLQAYQFHAASPLHYAKF--
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.... ... :: : .:.:.: ... . . :... .:.. ::
CCDS32 FDVNGSAFLPRNYLAPAWGAPWVINNPARDDRSTS--FQTQLGPSGHDAGRRVTWNVLFS
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pF1KB5 YYPYQSFQTPQHPSFLFQDKRVSWSLVYLPTIQSCWNYGFSCSSDELPVLGLTKSGGSDR
CCDS32 PRWLPVSLRPVYADAAGTALPAARPEDGRPRLVVTPASSGGDAAGVSFQKTVLVGARQQG
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>>CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 (875 aa)
initn: 420 init1: 420 opt: 422 Z-score: 501.9 bits: 103.4 E(32554): 1.2e-21
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.::: :.....::::... ::::::::. :
CCDS37 EKDIWQGGVCPQKMAAAVTCSFSHGPTFPIIRLAGGSSVHEGRVELYHAGQWGTVCDDQW
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: .:: :.:: ::. . ..: .: ::.::::.:::::.:::.: :. .: . .: . ::
CCDS37 DDADAEVICRQLGLSGIAKAWHQAYFGEGSGPVMLDEVRCTGNELSIEQCPKSSWGEHNC
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:..:::: :: : .. : .. :. ... .: : ::
CCDS37 GHKEDAGVSCTPLTDGVIRLAGGKGSHEGRLEVYYRGQWGTVCDDGWTELNTYVVCRQLG
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pF1KB5 GHTVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFHKL
CCDS37 FKYGKQASANHFEESTGPIWLDDVSCSGKETRFLQCSRRQWGRHDCSHREDVSIACYPGG
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 429 init1: 395 opt: 395 Z-score: 469.5 bits: 97.4 E(32554): 7.8e-20
Smith-Waterman score: 395; 52.0% identity (75.0% similar) in 100 aa overlap (24-123:500-599)
10 20 30 40 50
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.:: :: ..::::.: :::::.::. :
CCDS37 WGRHDCSHREDVSIACYPGGEGHRLSLGFPVRLMDGENKKEGRVEVFINGQWGTICDDGW
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10 20 30 40
pF1KB5 MTPPRLFWVWLLVAGTQGVNDGDMRLADGGATNQGRVEIFYRGQWGTV
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CCDS73 CDDGWDLSDAHVVCQKLGCGVAFNATVSAHFGEGSGPIWLDDLNCTGMESHLWQCPSRGW
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110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LKSNCRHERDAGVVCTNETRSTHTLDLSRELSEALGQIFDSQRGCDLSISVNVQGEDALG
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CCDS73 GQHDCRHKEDAGVICSEFTALRLYSETETESCAGRLEVFYNGTWGSVGRRNITTAIAGIV
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pF1KB5 DLTDASVVCRALGFENATQALGRAAFGQGSGPIMLDEVQCTGTEASLADCKSLGWLKSNC
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CCDS73 DLAEAEVVCQQLGCGSALAALRDASFGQGTGTIWLDDMRCKGNESFLWDCHAKPWGQSDC
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CCDS73 GHKEDAGVRCSGQ--SLKSLNASSGHLALILSSIFGLLLLVLFILFLTWCRVQKQKHLPL
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KB5 TVILTANLEAQALWKEPGSNVTMSVDAECVPMVRDLLRYFYSRRIDITLSSVKCFHKLAS
CCDS73 RVSTRRRGSLEENLFHEMETCLKREDPHGTRTSDDTPNHGCEDASDTSLLGVLPASEATK
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CCDS73 HNCVHREDVIVTCSGDATWGLRLVGGSNRCSGRLEVYFQGRWGTVCDDGWNSKAAAVVCS
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CCDS73 ALWECQHREWGSHNCYHGEDVGVNCYGKSLTR----VGRQGEANLGLRLVDGNNSCSGRV
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:. :
CCDS73 EVKFQERWGTICDDGWNLNTAAVVCRQLGCPSSFISSGVVNSPAVLRPIWLDDILCQGNE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]