Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5030, 284 aa
1>>>pF1KB5030 284 - 284 aa - 284 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7937+/-0.000801; mu= 12.5326+/- 0.048
mean_var=64.5425+/-13.022, 0's: 0 Z-trim(107.4): 22 B-trim: 118 in 1/50
Lambda= 0.159644
statistics sampled from 9515 (9535) to 9515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 ( 284) 1968 461.7 2.6e-130
CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 ( 295) 523 128.9 4.2e-30
CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 ( 295) 523 128.9 4.2e-30
CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 ( 295) 501 123.9 1.4e-28
CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 296) 499 123.4 1.9e-28
CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 302) 493 122.0 5.1e-28
CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 295) 489 121.1 9.5e-28
CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 ( 296) 487 120.6 1.3e-27
CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 ( 294) 473 117.4 1.2e-26
CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 ( 304) 470 116.7 2e-26
CCDS12724.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 350) 436 108.9 5.3e-24
CCDS12723.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 365) 436 108.9 5.5e-24
CCDS12707.1 SULT2A1 gene_id:6822|Hs108|chr19 ( 285) 423 105.9 3.5e-23
CCDS33182.1 SULT6B1 gene_id:391365|Hs108|chr2 ( 265) 380 96.0 3.1e-20
CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 307) 295 76.4 2.8e-14
CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 217) 269 70.4 1.3e-12
>>CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 (284 aa)
initn: 1968 init1: 1968 opt: 1968 Z-score: 2452.9 bits: 461.7 E(32554): 2.6e-130
Smith-Waterman score: 1968; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
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CCDS14 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPGLDIIKELTSPRLIKSHLPYRFLPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPGLDIIKELTSPRLIKSHLPYRFLPSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWFEHVQ
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CCDS14 LHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWFEHVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHCHQLVDQCCNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHCHQLVDQCCNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB5 EALPVGRGRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALPVGRGRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDFYL
250 260 270 280
>>CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 603 init1: 371 opt: 523 Z-score: 654.0 bits: 128.9 E(32554): 4.2e-30
Smith-Waterman score: 604; 36.7% identity (63.3% similar) in 275 aa overlap (24-280:17-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
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CCDS10 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPG----LDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
..... .. ::.: .. . : ..: :: .:: :. .:. ::::::::: .
CCDS10 VSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
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CCDS10 LPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHC------
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CCDS10 QHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 ------HQLVDQCCNAEAL-PVGR-GRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
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CCDS10 KNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRS
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YL
CCDS10 EL
>>CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 603 init1: 371 opt: 523 Z-score: 654.0 bits: 128.9 E(32554): 4.2e-30
Smith-Waterman score: 604; 36.7% identity (63.3% similar) in 275 aa overlap (24-280:17-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
:: : . . . .: .::.:. : :::::::.
CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPG----LDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
..... .. ::.: .. . : ..: :: .:: :. .:. ::::::::: .
CCDS32 VSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
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CCDS32 LPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHC------
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CCDS32 QHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 ------HQLVDQCCNAEAL-PVGR-GRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
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CCDS32 KNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRS
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YL
CCDS32 EL
>>CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 476 init1: 378 opt: 501 Z-score: 626.6 bits: 123.9 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 575; 34.2% identity (63.6% similar) in 275 aa overlap (24-280:17-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
:: : . . . .: .::.:. : :::::::.
CCDS10 MELIQDISRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPG----LDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
..... .. ::.: .. : ..: ::. :: .. .:. .:::.:.::: .
CCDS10 VSQILDMIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKVPGIPSGMETLKNTPAPRLLKTHLPLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
::. : . ::.:.::: ::..::::.:.. ... . ::.. : ..:: ...::::.
CCDS10 LPQTLLDQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVYPHPGTWESFLEKFMAGEVSYGSWY
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHC------
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CCDS10 QHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDLMVEHTSFKEMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 -HQLVD------QCCNAEALPVGR-GRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
. ... . . : : : .: :: :::..::.:: : .::. :.:.:
CCDS10 KNPMTNYTTVRREFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAKKMAGCSLSFRS
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YL
CCDS10 EL
>>CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 (296 aa)
initn: 496 init1: 324 opt: 499 Z-score: 624.1 bits: 123.4 E(32554): 1.9e-28
Smith-Waterman score: 569; 32.7% identity (66.2% similar) in 281 aa overlap (18-280:12-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
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CCDS20 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEY---PQP-GLDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
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CCDS20 IQEIVDMIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
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CCDS20 LPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHC------
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CCDS20 DHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 -HQLVDQCCNAEALP-------VGRGRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
. .... .... . .: :: ::. :::..::.:: .:..:: ...:
CCDS20 ENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCM
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YL
CCDS20 EL
>>CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 (302 aa)
initn: 608 init1: 366 opt: 493 Z-score: 616.4 bits: 122.0 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 579; 34.0% identity (61.3% similar) in 300 aa overlap (1-282:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
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CCDS20 MALHDMEDFTFDGTKRLSVNYVKGILQPTDTCDIWDKIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTW
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQP----GLDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
::.: :... .: .. ...: ::. : ::. . . :::..:.:::...
CCDS20 TQEIVELIQNEGDVEKSKRAPTHQRFPFLEMKIPSLGSGLEQAHAMPSPRILKTHLPFHL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
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CCDS20 LPPSLLEKNCKIIYVARNPKDNMVSYYHFQRMNKALPAPGTWEEYFETFLAGKVCWGSWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHCH-QLVD
:::. .:: . .:.: ::::... ...::.:.: . : :. .... ...
CCDS20 EHVKGWWEAKDKHRILYLFYEDMKKNPKHEIQKLAEFIGKKLDDKVLDKIVHYTSFDVMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB5 QC--CNAEALP-----------VGRGRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
: : ..: . .: :: :: :::..::.:: ::.:: ::: :
CCDS20 QNPMANYSSIPAEIMDHSISPFMRKGAVGDWKKHFTVAQNERFDEDYKKKMTDTRLTFHF
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YL
CCDS20 QF
>>CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 554 init1: 317 opt: 489 Z-score: 611.6 bits: 121.1 E(32554): 9.5e-28
Smith-Waterman score: 570; 34.5% identity (62.9% similar) in 275 aa overlap (24-280:17-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEFHGVRLPPFCRGKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSGTSL
:: : . . . .: .::.:. : :::::::.
CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 LQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPG----LDIIKELTSPRLIKSHLPYRF
..... .. ::.: .. : ..: ::. :: .. .:. .:::.:.::: .
CCDS32 VSQILDMIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKAPGIPSGMETLKDTPAPRLLKTHLPLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGYGSWF
::. : . ::.:.::: ::..::::.:.. .. ::.. : ..:: ...::::.
CCDS32 LPQTLLDQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGSWY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHC------
.::::.:: ::.: ::::... .... .:.: : . .. ...:
CCDS32 QHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKEMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 ------HQLVDQCCNAEAL-PVGR-GRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDLTFDF
. : : ... : : : .: :: :::..::.:: : .::. :.:.:
CCDS32 KNPMTNYTTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRS
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YL
CCDS32 EL
>>CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 (296 aa)
initn: 581 init1: 339 opt: 487 Z-score: 609.1 bits: 120.6 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 571; 34.2% identity (63.7% similar) in 292 aa overlap (11-280:3-292)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAESEAETPSTPGEFESKYFEF-HGVRLPPFCR--GKMEEIANFPVRPSDVWIVTYPKSG
.: .. : ... :: : : .. :.: .: ::.:. :.::::::
CCDS35 MLSPKDILRKDLKLVHG--YPMTCAFASNWEKIEQFHSRPDDIVIATYPKSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TSLLQEVVYLVSQGADPDEIGLMNIDEQLPVLEYPQPGLDI--IKELT---SPRLIKSHL
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CCDS35 TTWVSEIIDMILNDGDIEKCKRGFITEKVPMLEMTLPGLRTSGIEQLEKNPSPRIVKTHL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PYRFLPSDLHNGDSKVIYMARNPKDLVVSYYQFHRSLRTMSYRGTFQEFCRRFMNDKLGY
: .::... ... :.::.::: ::. ::::.: . . ::..:. ..:.. :..:
CCDS35 PTDLLPKSFWENNCKMIYLARNAKDVSVSYYHFDLMNNLQPFPGTWEEYLEKFLTGKVAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GSWFEHVQEFWEHRMDSNVLFLKYEDMHRDLVTMVEQLARFLGVSCDKAQLEALTEHCHQ
:::: ::...:... . .::: ::::... .... ::: . . :. . .:
CCDS35 GSWFTHVKNWWKKKEEHPILFLYYEDMKENPKEEIKKIIRFLEKNLNDEILDRIIHHTSF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 LV---DQCCNAEALPVG-----------RGRVGLWKDIFTVSMNEKFDLVYKQKMGKCDL
: . : ::. .: .: ::. :::..::::: .:. .:.: :
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CCDS35 EI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]