Result of FASTA (omim) for
pF1KB4991
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4991, 311 aa
1>>>pF1KB4991 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6886+/-0.000389; mu= 18.2981+/- 0.024
mean_var=57.2904+/-11.701, 0's: 0 Z-trim(111.1): 52 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.169447
statistics sampled from 19513 (19564) to 19513 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 6.950
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003704 (OMIM: 607125) phospholipid phosphatase ( 311) 2089 519.1 4.4e-147
NP_003702 (OMIM: 607124) phospholipid phosphatase ( 284) 939 238.0 1.7e-62
NP_795714 (OMIM: 607124) phospholipid phosphatase ( 285) 921 233.6 3.6e-61
NP_003703 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase ( 288) 862 219.2 8.1e-57
XP_011526698 (OMIM: 607126) PREDICTED: phospholipi ( 294) 840 213.8 3.4e-55
NP_808211 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase ( 309) 816 207.9 2.1e-53
XP_006714787 (OMIM: 607124) PREDICTED: phospholipi ( 221) 749 191.5 1.4e-48
NP_803545 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase ( 232) 693 177.8 1.9e-44
XP_011540800 (OMIM: 607813) PREDICTED: phospholipi ( 654) 339 91.6 4.8e-18
NP_055654 (OMIM: 607813) phospholipid phosphatase- ( 763) 339 91.6 5.4e-18
NP_001257295 (OMIM: 610391) phospholipid phosphata ( 718) 311 84.7 5.9e-16
XP_011542974 (OMIM: 610626) PREDICTED: phospholipi ( 207) 223 62.9 6.6e-10
XP_011542973 (OMIM: 610626) PREDICTED: phospholipi ( 223) 223 62.9 7e-10
NP_001096029 (OMIM: 610626) phospholipid phosphata ( 264) 223 62.9 8e-10
XP_016869396 (OMIM: 610626) PREDICTED: phospholipi ( 164) 208 59.1 6.9e-09
XP_005273718 (OMIM: 610626) PREDICTED: phospholipi ( 270) 208 59.3 1e-08
NP_115872 (OMIM: 610626) phospholipid phosphatase ( 216) 198 56.8 4.7e-08
NP_001159724 (OMIM: 607813) phospholipid phosphata ( 705) 193 55.9 2.8e-07
NP_001096030 (OMIM: 610626) phospholipid phosphata ( 176) 137 41.8 0.0012
XP_011526619 (OMIM: 610391) PREDICTED: phospholipi ( 746) 143 43.7 0.0014
NP_079164 (OMIM: 610391) phospholipid phosphatase- ( 746) 143 43.7 0.0014
>>NP_003704 (OMIM: 607125) phospholipid phosphatase 3 [H (311 aa)
initn: 2089 init1: 2089 opt: 2089 Z-score: 2761.7 bits: 519.1 E(85289): 4.4e-147
Smith-Waterman score: 2089; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIK
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NP_003 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLKKSRSTIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLKKSRSTIQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB4 IIDRNNHHNMM
:::::::::::
NP_003 IIDRNNHHNMM
310
>>NP_003702 (OMIM: 607124) phospholipid phosphatase 1 is (284 aa)
initn: 911 init1: 810 opt: 939 Z-score: 1242.9 bits: 238.0 E(85289): 1.7e-62
Smith-Waterman score: 939; 56.9% identity (79.8% similar) in 253 aa overlap (33-284:6-256)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY
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NP_003 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAIL-TSRHTPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP
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NP_003 QRGVFCNDESIKYPYKE-DTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC
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NP_003 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT
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NP_003 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI
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NP_003 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT
220 230 240 250 260 270
310
pF1KB4 IDRNNHHNMM
NP_003 TGNHYPSNHQP
280
>>NP_795714 (OMIM: 607124) phospholipid phosphatase 1 is (285 aa)
initn: 886 init1: 846 opt: 921 Z-score: 1219.1 bits: 233.6 E(85289): 3.6e-61
Smith-Waterman score: 921; 53.8% identity (80.6% similar) in 253 aa overlap (33-284:6-257)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY
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NP_795 MFDKTRLPYVALDVLCVLLASMPMAVLKLGQIYPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP
.:::.:.:.::.:: . . :....:: ::. . : .:: :: .: : .: : :.:
NP_795 QRGFFCKDNSINYPYHDS-TVTSTVLILVGVGLPISSIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC
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NP_795 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT
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NP_795 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI
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NP_795 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT
220 230 240 250 260 270
310
pF1KB4 IDRNNHHNMM
NP_795 TGNHYPSNHQP
280
>>NP_003703 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase 2 is (288 aa)
initn: 837 init1: 692 opt: 862 Z-score: 1141.1 bits: 219.2 E(85289): 8.1e-57
Smith-Waterman score: 862; 52.0% identity (79.8% similar) in 252 aa overlap (32-281:3-250)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 QNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKP
.: ... ::..::..:.::: :. : . :
NP_003 MQRRWVFVLLDVLCLLVASLPFAIL-TLVNAP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRSTIQN
:.:::::.:.::.:: . .::. ... .: :. ... . .:: : .: . ::: ..:
NP_003 YKRGFYCGDDSIRYPYRP-DTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDFNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
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NP_003 -YVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEK
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB4 -CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAF
:::. . : ::: ::.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .:: :. .:.
NP_003 VCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFAL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPV
:.: .::::.::: ::::.:. :::::: : ..::.::..
NP_003 YVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLS
210 220 230 240 250 260
300 310
pF1KB4 DIIDRNNHHNMM
NP_003 LTLTLGEADHNHYGYPHSSS
270 280
>>XP_011526698 (OMIM: 607126) PREDICTED: phospholipid ph (294 aa)
initn: 804 init1: 692 opt: 840 Z-score: 1111.9 bits: 213.8 E(85289): 3.4e-55
Smith-Waterman score: 840; 50.8% identity (77.9% similar) in 258 aa overlap (32-281:3-256)
10 20 30 40 50
pF1KB4 QNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFM------AGLPFLIIE
.: ... ::..::.. :.::: :.
XP_011 MQRRWVFVLLDVLCLLVGFSSPPASLPFAIL-
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TSTIKPYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KS
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XP_011 TLVNAPYKRGFYCGDDSIRYPYRP-DTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYS
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RSTIQNPYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEG
:: ..: ::::.:: .: :::: :.:::.::.:: ::::::.::.::.::.:..:::
XP_011 RSDFNN-YVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 YIQNYR-CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFT
:.: . :::. . : ::: ::.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .::
XP_011 YVQLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFF
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LIMMAFYTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRK
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XP_011 LVAFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELE
210 220 230 240 250 260
300 310
pF1KB4 EILSPVDIIDRNNHHNMM
XP_011 RKPSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS
270 280 290
>>NP_808211 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase 2 is (309 aa)
initn: 785 init1: 694 opt: 816 Z-score: 1079.9 bits: 207.9 E(85289): 2.1e-53
Smith-Waterman score: 816; 53.2% identity (79.3% similar) in 237 aa overlap (47-281:39-271)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 GGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPYHRGFYCNDESIKYP
:.::: :. : . ::.:::::.:.::.::
NP_808 SRGQHPPPRQQEVCAEGPRARLHPAPPGLGASLPFAIL-TLVNAPYKRGFYCGDDSIRYP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 LKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRSTIQNPYVAALYKQVGCFLF
. .::. ... .: :. ... . .:: : .: . ::: ..: ::::.:: .: :::
NP_808 YRP-DTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDFNN-YVAAVYKVLGTFLF
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 GCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR-CRGDDSKVQEARKS
: :.:::.::.:: ::::::.::.::.::.:..::: :.: . :::. . : ::: :
NP_808 GAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLS
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 FFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYTGLSRVSDHKHHPS
:.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .:: :. .:.:.: .::::.::: :
NP_808 FYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWS
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 DVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDIIDRNNHHNMM
:::.:. :::::: : ..::.::..
NP_808 DVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGY
250 260 270 280 290 300
>>XP_006714787 (OMIM: 607124) PREDICTED: phospholipid ph (221 aa)
initn: 712 init1: 693 opt: 749 Z-score: 993.4 bits: 191.5 E(85289): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 749; 60.8% identity (81.7% similar) in 186 aa overlap (100-284:8-193)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNPYVAALYK
:: :: .: : .: : :.: :.:..::
XP_006 MCSACCWIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYK
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRCRGDDSKV
.: :::: : :::.::::: ::::::::::.::.::.:.::::.:::. : :::. .:
XP_006 AIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERV
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYTGLSRVSD
.:.: ::.:::.::::: ::...::::::. :::::: ::: :. ...:.:::::::
XP_006 KEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSD
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDIIDRNNHH
.::: ::::.:. :::::: .. .:::.:: .:..
XP_006 YKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPS
160 170 180 190 200 210
310
pF1KB4 NMM
XP_006 NHQP
220
>>NP_803545 (OMIM: 607126) phospholipid phosphatase 2 is (232 aa)
initn: 668 init1: 668 opt: 693 Z-score: 919.1 bits: 177.8 E(85289): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 693; 54.1% identity (79.6% similar) in 196 aa overlap (88-281:1-194)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TIKPYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRS
. .: :. ... . .:: : .: . :::
NP_803 MAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 TIQNPYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYI
..: ::::.:: .: :::: :.:::.::.:: ::::::.::.::.::.:..::: :.
NP_803 DFNN-YVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YV
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QNYR-CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLI
: . :::. . : ::: ::.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .:: :.
NP_803 QLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLV
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 MMAFYTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEI
.:.:.: .::::.::: ::::.:. :::::: : ..::.::..
NP_803 AFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERK
150 160 170 180 190 200
300 310
pF1KB4 LSPVDIIDRNNHHNMM
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210 220 230
>>XP_011540800 (OMIM: 607813) PREDICTED: phospholipid ph (654 aa)
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: .. . :: .:: . .::: ..
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: : :.::.::.:.....: :.:. :: . : :.: . .. .:::: : ::... .
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. .:. .:... .: ...::.::: ::.:. .. ::.:....:.:: :: :: :.
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.: . .. :.... . .. :.:
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210 220 230 240 250 260
>>NP_055654 (OMIM: 607813) phospholipid phosphatase-rela (763 aa)
initn: 417 init1: 133 opt: 339 Z-score: 444.1 bits: 91.6 E(85289): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 407; 28.3% identity (61.6% similar) in 307 aa overlap (15-292:42-345)
10 20 30 40
pF1KB4 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLF-C
. : . ... . : .: .:. . :. :
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50 60 70 80 90
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.... ::.: ..: :...:: : :: : :.:...: : :.: .: ...
NP_055 FYFVELPILASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAIPFLMLLSLA
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pF1KB4 IVIAILAIITGEFYRIYYLKKSRSTIQ------------NPYVAALYKQVGCFLFGCAIS
.. ..:..:: :.: :. . : .. . :: .:: .
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.::: ..: : :.::.::.:.....: :.:. :: . : :.: . .. .::::
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310 320 330 340 350 360
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311 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]