Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4991
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4991, 311 aa
1>>>pF1KB4991 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1423+/-0.000886; mu= 15.9202+/- 0.053
mean_var=58.9608+/-11.870, 0's: 0 Z-trim(105.0): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.167029
statistics sampled from 8190 (8217) to 8190 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 ( 311) 2089 511.8 2.7e-145
CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 284) 939 234.7 6.5e-62
CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 285) 921 230.3 1.3e-60
CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 288) 862 216.1 2.5e-56
CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 309) 816 205.1 5.8e-53
CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 232) 693 175.4 3.8e-44
CCDS6751.1 PLPPR1 gene_id:54886|Hs108|chr9 ( 325) 394 103.4 2.5e-22
CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 316) 377 99.3 4.2e-21
CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 321) 377 99.3 4.2e-21
CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 ( 763) 339 90.3 5.1e-18
CCDS58636.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 ( 718) 311 83.5 5.2e-16
CCDS12258.1 PLPPR2 gene_id:64748|Hs108|chr19 ( 343) 238 65.8 5.4e-11
CCDS59352.1 PLPPR2 gene_id:64748|Hs108|chr19 ( 427) 238 65.8 6.5e-11
>>CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 2089 init1: 2089 opt: 2089 Z-score: 2722.1 bits: 511.8 E(32554): 2.7e-145
Smith-Waterman score: 2089; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIK
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CCDS60 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLKKSRSTIQN
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CCDS60 PYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLKKSRSTIQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
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CCDS60 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFY
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CCDS60 CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB4 IIDRNNHHNMM
:::::::::::
CCDS60 IIDRNNHHNMM
310
>>CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (284 aa)
initn: 911 init1: 810 opt: 939 Z-score: 1225.1 bits: 234.7 E(32554): 6.5e-62
Smith-Waterman score: 939; 56.9% identity (79.8% similar) in 253 aa overlap (33-284:6-256)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY
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CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAIL-TSRHTPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP
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CCDS34 QRGVFCNDESIKYPYKE-DTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC
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CCDS34 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT
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CCDS34 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI
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CCDS34 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT
220 230 240 250 260 270
310
pF1KB4 IDRNNHHNMM
CCDS34 TGNHYPSNHQP
280
>>CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (285 aa)
initn: 886 init1: 846 opt: 921 Z-score: 1201.6 bits: 230.3 E(32554): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 921; 53.8% identity (80.6% similar) in 253 aa overlap (33-284:6-257)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY
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CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLASMPMAVLKLGQIYPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP
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CCDS34 QRGFFCKDNSINYPYHDS-TVTSTVLILVGVGLPISSIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC
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CCDS34 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT
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CCDS34 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI
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CCDS34 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT
220 230 240 250 260 270
310
pF1KB4 IDRNNHHNMM
CCDS34 TGNHYPSNHQP
280
>>CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (288 aa)
initn: 837 init1: 692 opt: 862 Z-score: 1124.7 bits: 216.1 E(32554): 2.5e-56
Smith-Waterman score: 862; 52.0% identity (79.8% similar) in 252 aa overlap (32-281:3-250)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 QNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKP
.: ... ::..::..:.::: :. : . :
CCDS12 MQRRWVFVLLDVLCLLVASLPFAIL-TLVNAP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRSTIQN
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CCDS12 YKRGFYCGDDSIRYPYRP-DTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDFNN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR
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CCDS12 -YVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEK
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB4 -CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAF
:::. . : ::: ::.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .:: :. .:.
CCDS12 VCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFAL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPV
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CCDS12 YVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLS
210 220 230 240 250 260
300 310
pF1KB4 DIIDRNNHHNMM
CCDS12 LTLTLGEADHNHYGYPHSSS
270 280
>>CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 785 init1: 694 opt: 816 Z-score: 1064.3 bits: 205.1 E(32554): 5.8e-53
Smith-Waterman score: 816; 53.2% identity (79.3% similar) in 237 aa overlap (47-281:39-271)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 GGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPYHRGFYCNDESIKYP
:.::: :. : . ::.:::::.:.::.::
CCDS12 SRGQHPPPRQQEVCAEGPRARLHPAPPGLGASLPFAIL-TLVNAPYKRGFYCGDDSIRYP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 LKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRSTIQNPYVAALYKQVGCFLF
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CCDS12 YRP-DTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDFNN-YVAAVYKVLGTFLF
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 GCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYR-CRGDDSKVQEARKS
: :.:::.::.:: ::::::.::.::.::.:..::: :.: . :::. . : ::: :
CCDS12 GAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLS
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 FFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYTGLSRVSDHKHHPS
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CCDS12 FYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWS
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 DVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDIIDRNNHHNMM
:::.:. :::::: : ..::.::..
CCDS12 DVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGY
250 260 270 280 290 300
>>CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (232 aa)
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Smith-Waterman score: 693; 54.1% identity (79.6% similar) in 196 aa overlap (88-281:1-194)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TIKPYHRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-KSRS
. .: :. ... . .:: : .: . :::
CCDS45 MAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 TIQNPYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYI
..: ::::.:: .: :::: :.:::.::.:: ::::::.::.::.::.:..::: :.
CCDS45 DFNN-YVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YV
40 50 60 70 80
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pF1KB4 QNYR-CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLI
: . :::. . : ::: ::.:::.::.:: :..:.::.:::. :. :::::: .:: :.
CCDS45 QLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLV
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 MMAFYTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEI
.:.:.: .::::.::: ::::.:. :::::: : ..::.::..
CCDS45 AFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERK
150 160 170 180 190 200
300 310
pF1KB4 LSPVDIIDRNNHHNMM
CCDS45 PSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS
210 220 230
>>CCDS6751.1 PLPPR1 gene_id:54886|Hs108|chr9 (325 aa)
initn: 399 init1: 253 opt: 394 Z-score: 514.4 bits: 103.4 E(32554): 2.5e-22
Smith-Waterman score: 458; 31.0% identity (59.4% similar) in 323 aa overlap (21-311:2-321)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQNYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAG---LPFLIIETS
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CCDS67 MAVGNNTQRSYSIIPCFIFVEL--VIMAGTVLLAYYFECTD
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TIKPYHRGFYCNDESI--KYPLKTGET-INDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLKKS
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CCDS67 TFQVHIQGFFCQDGDLMKPYPGTEEESFITPLVLYCVLAATPTAIIFIGEI-SMYFIKST
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB4 RSTI--------------QNPYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLS
: .. :: . . . .: : :: .. :.. ..: :.: :.::.
CCDS67 RESLIAQEKTILTGECCYLNPLLRRIIRFTGVFAFGLFATDIFVNAGQVVTGHLTPYFLT
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB4 VCNPDFSQINCS--EGYIQNYR-CRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQAR
::.:.... .:. . .:.: : :: ...::.:: : ::..:.:. :: ..:. .
CCDS67 VCKPNYTSADCQAHHQFINNGNICTGDLEVIEKARRSFPSKHAALSIYSALYATMYITST
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 FTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDL
. ...:: .:.: . . :: :::.:::....: :::.::: :. :: . . :
CCDS67 IKTKSSRLAKPVLCLGTLCTAFLTGLNRVSEYRNHCSDVIAGFILGTAVALFLGMCVVHN
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310
pF1KB4 FK-TKTTLSLPAPAIRK--------EILSPVDIIDRNNHHNMM
:: :. . : : : . .: ::.. .. .:: :
CCDS67 FKGTQGSPSKPKPEDPRGVPLMAFPRIESPLETLSAQNHSASMTEVT
280 290 300 310 320
>>CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 361 init1: 237 opt: 377 Z-score: 492.4 bits: 99.3 E(32554): 4.2e-21
Smith-Waterman score: 413; 30.2% identity (61.8% similar) in 262 aa overlap (44-281:18-277)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 SKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAG---LPFLIIETSTIKPYHRGFYCND
..::: : . . :.:. .::.:.:
CCDS30 MPLLPAALTSSMLYFQMVIMAGTVMLAYYFEYTDTFTVNVQGFFCHD
10 20 30 40
80 90 100 110
pF1KB4 ESIKYPLKTGE---TINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIYYLK-------KSRSTIQ-
. . : : .. ..: ... . .:.::.:: .. :. ....::
CCDS30 SAYRKPYPGPEDSSAVPPVLLYSLAAGVPVLVIIVGETA-VFCLQLATRDFENQEKTILT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 ------NPYVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSE
:: : . .: . :: .. :.. ..: : : ::::..:.:... ..:..
CCDS30 GDCCYINPLVRRTVRFLGIYTFGLFATDIFVNAGQVVTGNLAPHFLALCKPNYTALGCQQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB4 GYIQ----NYRCRGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPL
: : . : :. . ...:::.: : .:..:.:. .::..:. . .:.:: .:.
CCDS30 -YTQFISGEEACTGNPDLIMRARKTFPSKEAALSVYAAMYLTMYITNTIKAKGTRLAKPV
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LQFTLIMMAFYTGLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAP
: . :. .:: :::.::.....: :::.::: : .: .: : . :: .
CCDS30 LCLGLMCLAFLTGLNRVAEYRNHWSDVIAGFLVGISIAVFLVVCVVNNFKGRQAENEHIH
230 240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KB4 AIRKEILSPVDIIDRNNHHNMM
CCDS30 MDNLAQMPMISIPRVESPLEKNHITAFAEVT
290 300 310
>>CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 (321 aa)
initn: 361 init1: 237 opt: 377 Z-score: 492.3 bits: 99.3 E(32554): 4.2e-21
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20 30 40 50 60 70
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]