Result of FASTA (omim) for
pF1KB4990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4990, 493 aa
1>>>pF1KB4990 493 - 493 aa - 493 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0135+/-0.000393; mu= 13.6402+/- 0.024
mean_var=65.2862+/-12.754, 0's: 0 Z-trim(111.1): 26 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.158732
statistics sampled from 19541 (19562) to 19541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 9.950
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 493) 3182 737.9 1.6e-212
NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 405) 2623 609.8 4.5e-174
NP_872617 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 441) 2144 500.2 5.1e-141
NP_001229849 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 398) 2136 498.3 1.6e-140
NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability ( 487) 643 156.4 1.7e-37
XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 600 146.6 1.6e-34
NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing famil ( 507) 600 146.6 1.6e-34
XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 600 146.6 1.6e-34
XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 600 146.6 1.6e-34
NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-bindin ( 481) 530 130.6 1e-29
XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 455) 409 102.8 2.1e-21
XP_016884229 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 450) 407 102.4 2.9e-21
NP_000069 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl ester ( 493) 367 93.2 1.8e-18
XP_006721187 (OMIM: 118470,143470) PREDICTED: chol ( 266) 187 52.0 2.5e-06
NP_872325 (OMIM: 615718) BPI fold-containing famil ( 614) 185 51.6 7.7e-06
NP_001273014 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl est ( 433) 179 50.2 1.4e-05
NP_079503 (OMIM: 614108) BPI fold-containing famil ( 458) 177 49.7 2.1e-05
>>NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer protein (493 aa)
initn: 3182 init1: 3182 opt: 3182 Z-score: 3936.6 bits: 737.9 E(85289): 1.6e-212
Smith-Waterman score: 3182; 100.0% identity (100.0% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB4 RASTAPTPSTAAV
:::::::::::::
NP_006 RASTAPTPSTAAV
490
>>NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer prot (405 aa)
initn: 2623 init1: 2623 opt: 2623 Z-score: 3246.2 bits: 609.8 E(85289): 4.5e-174
Smith-Waterman score: 2623; 100.0% identity (100.0% similar) in 405 aa overlap (89-493:1-405)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINA
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRF
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 LLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAF
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 FPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHD
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LDMLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDMLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA
340 350 360 370 380 390
480 490
pF1KB4 DVRASTAPTPSTAAV
:::::::::::::::
NP_001 DVRASTAPTPSTAAV
400
>>NP_872617 (OMIM: 172425) phospholipid transfer protein (441 aa)
initn: 2140 init1: 2140 opt: 2144 Z-score: 2652.8 bits: 500.2 E(85289): 5.1e-141
Smith-Waterman score: 2722; 89.2% identity (89.5% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_872 FYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFL----------
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFLL
::::::::::::::::::
NP_872 ------------------------------------------KVYDFLSTFITSGMRFLL
120
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
370 380 390 400 410 420
490
pF1KB4 RASTAPTPSTAAV
:::::::::::::
NP_872 RASTAPTPSTAAV
430 440
>>NP_001229849 (OMIM: 172425) phospholipid transfer prot (398 aa)
initn: 2136 init1: 2136 opt: 2136 Z-score: 2643.6 bits: 498.3 E(85289): 1.6e-140
Smith-Waterman score: 2366; 80.7% identity (80.7% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDLRGKEGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASA
:::::::
NP_001 FYYNISE-----------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFLL
::::::::::::::::::
NP_001 ------------------------------------------KVYDFLSTFITSGMRFLL
70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFP
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLD
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLLRATYFGSIVLLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQI
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADV
330 340 350 360 370 380
490
pF1KB4 RASTAPTPSTAAV
:::::::::::::
NP_001 RASTAPTPSTAAV
390
>>NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability-inc (487 aa)
initn: 483 init1: 205 opt: 643 Z-score: 794.3 bits: 156.4 E(85289): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 643; 27.2% identity (64.3% similar) in 459 aa overlap (20-462:34-484)
10 20 30 40
pF1KB4 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETI
:: .:...:.:. ..:.: :..::. :
NP_001 NMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAVNPGVVVRISQKGLDYASQQGTAALQKELKRI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 TIPD----LRGKE-GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQ
::: .. :. :. .:.. . . :.:: ::.... :. : ..:.::.. . . .
NP_001 KIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANIKISGKWK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LLYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDP-AGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKK
:. .: .. : ::.:: . :.:. .: .:. .. ::.. .. .:. .. . :
NP_001 AQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPTSGKPTITCSSCSSHINSVHVHISKS--K
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 VYDFLSTF---ITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLM
: ... : : :..: .:.:.: . .. . :. ..:.:: ...: ..::.:.:.
NP_001 VGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKIDSVAGINYGLV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB4 KDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQ---EEERMVYVAFSEFFFDSAM
:.... .::....: :. ...: : . : .. ..::::...:..::..:
NP_001 APPATTAETLDVQMKGEFYSENHHN---PPPFAPPVMEFPAAHDRMVYLGLSDYFFNTAG
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 ESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIVLLSPAVIDS-P-LKLELRVLA--PP
: .::.:.. : : .:.. . : . .::... : : . : .:....: : ::
NP_001 LVYQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGTFL---PEVAKKFPNMKIQIHVSASTPP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 RCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRF
. ...:.: :. ...: : :.. ..: . : . : ... ... : .: : :.
NP_001 HLSVQPTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESNRLVGELKLDRL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 RIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHA
. .:: . . . :: .. .. : :.: .::. .: .: : ... . :. :
NP_001 LLELKHSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFPLPTPARVQLYNVVLQPHQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB4 GFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
.:: .:::.
NP_001 NFLLFGADVVYK
480
>>XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 484 init1: 351 opt: 600 Z-score: 740.8 bits: 146.6 E(85289): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 600; 24.8% identity (61.8% similar) in 476 aa overlap (3-464:9-478)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALFGALFLALL--AGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
:.: ..: : ..... .:: : :.:..::. : :....:: :. .:
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTIYPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKKLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 DLRGKEG-------HFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQL
:: :.:. . ::.:..:.. ... .. : : : . .... .. .
XP_011 DLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDWGF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVY
.: : : . :: . . :.:. :. .. .: :..:. :..:.: .. .:
XP_011 ESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSVLY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTV-LLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPV
. .. . . . ::...::.. :. : ::. :.:. : ...:. . .::::...:
XP_011 NSFAEPMEKPILKNLNEMLCPII--ASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSPE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 ASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEER--MVYVAFSEFFFDSAMESYFR
. . ::....:.:.:: .: . : . : . :. :.:....:.:: :: ..:
XP_011 ITENYLDLNLKGVFYPL--ENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV--LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPS
::.... : ... . . . . .:... . ....:. ... . :: ...:.
XP_011 AGVFNVTLSTEEISNHF--VQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMVRIMATEPPIINLQPG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHS
. :... ::. . : .. . :: . : :. ... :. : .:.: :::. .:
XP_011 NFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 ALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGA
.. .. .. :...:..::.:. : . .: . :. . ::. . ::: :..
XP_011 NRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLIST
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB4 DLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
::..
XP_011 DLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing family C (507 aa)
initn: 484 init1: 351 opt: 600 Z-score: 740.8 bits: 146.6 E(85289): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 600; 24.8% identity (61.8% similar) in 476 aa overlap (3-464:9-478)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALFGALFLALL--AGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
:.: ..: : ..... .:: : :.:..::. : :....:: :. .:
NP_777 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTIYPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKKLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 DLRGKEG-------HFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQL
:: :.:. . ::.:..:.. ... .. : : : . .... .. .
NP_777 DLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDWGF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVY
.: : : . :: . . :.:. :. .. .: :..:. :..:.: .. .:
NP_777 ESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSVLY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTV-LLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPV
. .. . . . ::...::.. :. : ::. :.:. : ...:. . .::::...:
NP_777 NSFAEPMEKPILKNLNEMLCPII--ASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSPE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 ASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEER--MVYVAFSEFFFDSAMESYFR
. . ::....:.:.:: .: . : . : . :. :.:....:.:: :: ..:
NP_777 ITENYLDLNLKGVFYPL--ENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV--LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPS
::.... : ... . . . . .:... . ....:. ... . :: ...:.
NP_777 AGVFNVTLSTEEISNHF--VQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMVRIMATEPPIINLQPG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHS
. :... ::. . : .. . :: . : :. ... :. : .:.: :::. .:
NP_777 NFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 ALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGA
.. .. .. :...:..::.:. : . .: . :. . ::. . ::: :..
NP_777 NRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLIST
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB4 DLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
::..
NP_777 DLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 484 init1: 351 opt: 600 Z-score: 740.8 bits: 146.6 E(85289): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 600; 24.8% identity (61.8% similar) in 476 aa overlap (3-464:9-478)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALFGALFLALL--AGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
:.: ..: : ..... .:: : :.:..::. : :....:: :. .:
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTIYPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKKLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 DLRGKEG-------HFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQL
:: :.:. . ::.:..:.. ... .. : : : . .... .. .
XP_011 DLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDWGF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVY
.: : : . :: . . :.:. :. .. .: :..:. :..:.: .. .:
XP_011 ESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSVLY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTV-LLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPV
. .. . . . ::...::.. :. : ::. :.:. : ...:. . .::::...:
XP_011 NSFAEPMEKPILKNLNEMLCPII--ASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSPE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 ASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEER--MVYVAFSEFFFDSAMESYFR
. . ::....:.:.:: .: . : . : . :. :.:....:.:: :: ..:
XP_011 ITENYLDLNLKGVFYPL--ENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV--LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPS
::.... : ... . . . . .:... . ....:. ... . :: ...:.
XP_011 AGVFNVTLSTEEISNHF--VQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMVRIMATEPPIINLQPG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHS
. :... ::. . : .. . :: . : :. ... :. : .:.: :::. .:
XP_011 NFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 ALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGA
.. .. .. :...:..::.:. : . .: . :. . ::. . ::: :..
XP_011 NRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLIST
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB4 DLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
::..
XP_011 DLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 484 init1: 351 opt: 600 Z-score: 740.8 bits: 146.6 E(85289): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 600; 24.8% identity (61.8% similar) in 476 aa overlap (3-464:9-478)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALFGALFLALL--AGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
:.: ..: : ..... .:: : :.:..::. : :....:: :. .:
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTIYPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKKLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 DLRGKEG-------HFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQL
:: :.:. . ::.:..:.. ... .. : : : . .... .. .
XP_011 DLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDWGF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVY
.: : : . :: . . :.:. :. .. .: :..:. :..:.: .. .:
XP_011 ESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSVLY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTV-LLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPV
. .. . . . ::...::.. :. : ::. :.:. : ...:. . .::::...:
XP_011 NSFAEPMEKPILKNLNEMLCPII--ASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSPE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 ASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEER--MVYVAFSEFFFDSAMESYFR
. . ::....:.:.:: .: . : . : . :. :.:....:.:: :: ..:
XP_011 ITENYLDLNLKGVFYPL--ENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV--LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPS
::.... : ... . . . . .:... . ....:. ... . :: ...:.
XP_011 AGVFNVTLSTEEISNHF--VQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMVRIMATEPPIINLQPG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHS
. :... ::. . : .. . :: . : :. ... :. : .:.: :::. .:
XP_011 NFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 ALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGA
.. .. .. :...:..::.:. : . .: . :. . ::. . ::: :..
XP_011 NRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLIST
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB4 DLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
::..
XP_011 DLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-binding pr (481 aa)
initn: 408 init1: 274 opt: 530 Z-score: 654.6 bits: 130.6 E(85289): 1e-29
Smith-Waterman score: 530; 24.6% identity (59.7% similar) in 467 aa overlap (6-466:14-480)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.:
NP_004 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY
:. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : ..
NP_004 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 WFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDF
:: : ...:..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ..
NP_004 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST
. . : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :..
NP_004 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ
. :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.
NP_004 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV
. .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ...
NP_004 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA
. .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . .
NP_004 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK
:.: :. .. .: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
NP_004 AELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
430 440 450 460 470 480
470 480 490
pF1KB4 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
NP_004 V
493 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:20:35 2016 done: Fri Nov 4 03:20:36 2016
Total Scan time: 9.950 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]