Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4976
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4976, 418 aa
1>>>pF1KB4976 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5458+/-0.000725; mu= 16.7236+/- 0.044
mean_var=76.4914+/-15.023, 0's: 0 Z-trim(110.0): 14 B-trim: 5 in 1/52
Lambda= 0.146645
statistics sampled from 11308 (11320) to 11308 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 418) 2776 596.5 1.6e-170
CCDS31640.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 410) 2704 581.2 6.1e-166
CCDS11050.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 409) 2150 464.0 1.2e-130
CCDS11051.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 394) 1865 403.7 1.6e-112
CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 406) 1720 373.0 2.8e-103
CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX ( 388) 1545 336.0 3.8e-92
CCDS58504.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 430) 1514 329.5 3.9e-90
CCDS59276.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 330) 1479 322.0 5.3e-88
CCDS46545.1 SAG gene_id:6295|Hs108|chr2 ( 405) 1475 321.2 1.1e-87
CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 217) 1064 234.1 1e-61
>>CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 (418 aa)
initn: 2776 init1: 2776 opt: 2776 Z-score: 3174.9 bits: 596.5 E(32554): 1.6e-170
Smith-Waterman score: 2776; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB4 PHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
370 380 390 400 410
>>CCDS31640.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 (410 aa)
initn: 2716 init1: 2204 opt: 2704 Z-score: 3092.7 bits: 581.2 E(32554): 6.1e-166
Smith-Waterman score: 2704; 98.1% identity (98.1% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS31 ASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG--------DVAVELPFTLMHPKPKEEP
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB4 PHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
360 370 380 390 400 410
>>CCDS11050.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 2079 init1: 1870 opt: 2150 Z-score: 2459.3 bits: 464.0 E(32554): 1.2e-130
Smith-Waterman score: 2150; 76.4% identity (91.6% similar) in 415 aa overlap (1-407:1-407)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
CCDS11 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS11 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS11 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS11 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
CCDS11 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
:::::...::::.:.:::.:::.::::::::::: ::.:::::.::::::...
CCDS11 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHDH
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 -P---PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGS
: :. .::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
CCDS11 IPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
360 370 380 390 400
pF1KB4 PQLNNR
>>CCDS11051.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (394 aa)
initn: 1978 init1: 1589 opt: 1865 Z-score: 2133.6 bits: 403.7 E(32554): 1.6e-112
Smith-Waterman score: 2023; 73.5% identity (88.0% similar) in 415 aa overlap (1-407:1-392)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: :::: :.:::::
CCDS11 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS11 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS11 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS11 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
CCDS11 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
:::::...::::.:.:::.:::.::::::::::: ::.:::::.::::::...
CCDS11 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHDH
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 -P---PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGS
: :. .::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
CCDS11 IPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PQLNNR
>>CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 1800 init1: 1589 opt: 1720 Z-score: 1967.7 bits: 373.0 E(32554): 2.8e-103
Smith-Waterman score: 1994; 71.4% identity (85.2% similar) in 427 aa overlap (1-407:1-404)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: :::: :.:::::
CCDS58 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS58 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS58 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS58 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
CCDS58 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
:::::...::::.:.:::.:::.::::::::::: ::.:::::.::::::...
CCDS58 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHDH
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB4 -------------PP---HREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMK
:: .::...::::::::.::: ::::::::::: ::::::
CCDS58 IPLPRPQSAPTPTPPLPVPPAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMK
340 350 360 370 380 390
410
pF1KB4 DDKEEEEDGTGSPQLNNR
:: ...
CCDS58 DDDYDDQLC
400
>>CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX (388 aa)
initn: 1546 init1: 1129 opt: 1545 Z-score: 1767.9 bits: 336.0 E(32554): 3.8e-92
Smith-Waterman score: 1545; 61.9% identity (85.6% similar) in 360 aa overlap (6-364:2-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.:::::::::::: :...: ::::
CCDS14 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYLKCRKLFVMLTCA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB4 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKK-PLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
:::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::...
CCDS14 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
::::::::::::::.:: ::.:.:::.::::: :: . ::. ::::.::::.:: . :
CCDS14 VTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : .
CCDS14 PGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQIT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ...::.:: . .::::::::::::::::
CCDS14 DVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
:::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::.::::..:::.::::..:.::::..:
CCDS14 LASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PPHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
:
CCDS14 AASSEDIVIEEFTRKGEEESQKAVEAEGDEGS
360 370 380
>>CCDS58504.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (430 aa)
initn: 1454 init1: 1245 opt: 1514 Z-score: 1731.8 bits: 329.5 E(32554): 3.9e-90
Smith-Waterman score: 2098; 72.7% identity (87.2% similar) in 436 aa overlap (1-407:1-428)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
CCDS58 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFE-
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: :
CCDS58 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KB4 --------------------IPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKI
:: ::::::::::::::::::::::.:..::::..::::
CCDS58 RMPLPSEGQGAGAGTVSGVGIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 HKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNV
::::::::::::::.:::.:::::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..:::
CCDS58 HKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 HVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFL
:::::..:::::::.:::::::::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:
CCDS58 HVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 ANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDL
..::::::::::::::::::::::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::
CCDS58 SDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG-----
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 ASSDVAVELPFTLMHPKPKEE-P---PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDF
::.:::::.::::::... : :. .::...::::::::.::: :::::::::
CCDS58 ---DVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDF
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KB4 ARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
:: :::::::: ...
CCDS58 ARLRLKGMKDDDYDDQLC
420 430
>>CCDS59276.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 1479; 80.5% identity (94.6% similar) in 261 aa overlap (1-260:1-261)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
CCDS59 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS59 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
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pF1KB4 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS59 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
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pF1KB4 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS59 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
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240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : ::
CCDS59 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQREGGCQQGGAGNPGVLQGQGEAGGVSRRGCLCGAAFCS
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>>CCDS46545.1 SAG gene_id:6295|Hs108|chr2 (405 aa)
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Smith-Waterman score: 1508; 57.4% identity (80.7% similar) in 404 aa overlap (8-408:16-399)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERR
.::: : . ..:.:::.::..::.. :.::::::::::. .: ..
CCDS46 MAASGKTSKSEPNHVIFKKISRDKSVTIYLGNRDYIDHVSQVQPVDGVVLVDPDLVKGKK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 VYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHA
::::::::::::.::.::.:::::.::. . :: .::. . : :.::: :.:::: ..
CCDS46 VYVTLTCAFRYGQEDIDVIGLTFRRDLYFSRVQVYPPVGAASTP-TKLQESLLKKLGSNT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB4 YPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENL---EEKIHKRNSVRLVIR
::: . .: ::::: :::.:.:.::.::::.::::: ... :.:: :..::::.::
CCDS46 YPFLLTFPDYLPCSVMLQPAPQDSGKSCGVDFEVKAFATDSTDAEEDKIPKKSSVRLLIR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVK
:::.:: . :::: ::.. ::.:::::::: .::.::::.::::: :.: :::::.::::
CCDS46 KVQHAPLEMGPQPRAEAAWQFFMSDKPLHLAVSLNKEIYFHGEPIPVTVTVTNNTEKTVK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 KIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLAL
::: :.: :.. :... : :::::::.. : :.::. :. :: :.::::::.::.::
CCDS46 KIKAFVEQVANVVLYSSDYYVKPVAMEEAQEKVPPNSTLTKTLTLLPLLANNRERRGIAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 DGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPF
:::.:::::::::::...:: .: .:::.:::..::::.:: :.::.:.::.::.:.::
CCDS46 DGKIKHEDTNLASSTIIKEGIDRTVLGILVSYQIKVKLTVS--GFLGELTSSEVATEVPF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 TLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDG
::::.:.. : .:. :.:: :::.:::. :: . .: ..:
CCDS46 RLMHPQPED-------PAKESYQDANL----------VFEEFARHNLKDAGEAEEGKRDK
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410
pF1KB4 TGSPQLNNR
CCDS46 NDVDE
>>CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (217 aa)
initn: 1004 init1: 795 opt: 1064 Z-score: 1221.6 bits: 234.1 E(32554): 1e-61
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170 180 190 200 210 220
pF1KB4 NSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVT
:::. ::::::::::.::::::..::::::
CCDS82 MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVT
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANN
::..:::::::.:::::::::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:
CCDS82 NNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDN
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 REKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASS
:::::::::::::::::::::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::
CCDS82 REKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------
100 110 120 130 140
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pF1KB4 DVAVELPFTLMHPKPKEE-P---PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQ
::.:::::.::::::... : :. .::...::::::::.::: :::::::::::
CCDS82 DVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARL
150 160 170 180 190 200
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pF1KB4 RLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
:::::::: ...
CCDS82 RLKGMKDDDYDDQLC
210
418 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:19:23 2016 done: Fri Nov 4 03:19:23 2016
Total Scan time: 2.970 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]